PARP2

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
3KCZ , 3KJD , 4PJV , 4TVJ , 4ZZX , 4ZZY , 5DSY , 5D5K

Идентификаторы

Псевдонимы

PARP2 , ADPRT2, ADPRTL2, ADPRTL3, ARTD2, PARP-2, pADPRT-2, поли (АДФ-рибоза) полимераза 2

Внешние идентификаторы

OMIM : 607725 MGI : 1341112 HomoloGene : 4004 GeneCards : PARP2

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 14 (человека) ^[1]

Группа	14q11.2	Начинать	20 343 615 п.н. ^[1]
Группа	14q11.2	Конец	20 357 904 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 14 (мышь) ^[2]

Группа	14 26,25 см \| 14 C1	Начинать	50 807 841 п.н. ^[2]
Группа	14 26,25 см \| 14 C1	Конец	50 821 301 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• активность трансферазы • связывание с ДНК • связывание с белком GO: 0001948 • активность ДНК-лигазы (АТФ) • активность трансферазы, перенос гликозильных групп • активность NAD + ADP-рибозилтрансферазы • активность белка ADP-рибозилазы • активность NAD ДНК ADP-рибозилтрансферазы
Сотовый компонент	• цитоплазма • ядрышко • ядро • нуклеоплазма
Биологический процесс	• лигирование ДНК, участвующее в репарации ДНК • удлинение отстающей цепи • ADP-рибозилирование белка • репарация ДНК • внешний апоптотический сигнальный путь • эксцизионная репарация оснований • пептидил-серин ADP-рибозилирование • положительная регуляция роста клеток, участвующих в развитии клеток сердечной мышцы • отрицательная регулирование смерти нейронов • двухцепочечный ремонт разрыва • белка поли-АДФ-рибозилирования • ДНК АДФ-рибозилирования • клеточного ответ на повреждениях ДНК раздражитель
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


10038


11546

Ансамбль


ENSG00000129484


ENSMUSG00000036023

UniProt


Q9UGN5


O88554

RefSeq (мРНК)


NM_001042618 NM_005484


NM_009632

RefSeq (белок)


NP_001036083 NP_005475


NP_033762

Расположение (UCSC)

Chr 14: 20.34 - 20.36 Мб

Chr 14: 50,81 - 50,82 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Поли [АДФ-рибоза] полимеразы 2 представляет собой фермент , который у человека кодируется PARP2 геном . ^[5]^[6]^[7] Это один из ферментов семейства PARP .

Функция [ править ]

Этот ген кодирует поли (АДФ-рибозил) трансферазу-подобный 2 белок , который содержит каталитический домен и способен катализировать реакцию поли (АДФ-рибозилирования). Этот белок имеет каталитический домен, который гомологичен домену поли (АДФ-рибозил) трансферазы , но не имеет N-концевого ДНК-связывающего домена, который активирует С-концевой каталитический домен поли (АДФ-рибозил) трансферазы. Основные остатки в N-концевой области этого белка могут обладать потенциальными ДНК-связывающими свойствами и могут участвовать в нацеливании белка на ядро и / или ядрышко . Обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^[7]

У растений вида Arabidopsis thaliana PARP2 играет более значительную роль, чем PARP1, в защитных реакциях на повреждение ДНК и бактериальном патогенезе. ^[8] PARP2 растений несет N-концевые ДНК-связывающие мотивы SAP, а не ДНК-связывающие мотивы Zn-finger белков PARP1 растений и животных. ^[8]

Препараты-ингибиторы PARP [ править ]

Некоторые противораковые препараты- ингибиторы PARP (в первую очередь нацеленные на PARP1) также ингибируют PARP2, например нирапариб .

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PARP2 взаимодействует с XRCC1 . ^[9]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000129484 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036023 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Johansson M (май 1999 г.). «Семейство генов поли (АДФ-рибозы) полимеразы человека (ADPRTL): клонирование кДНК двух новых гомологов поли (АДФ-рибозы) полимеразы». Геномика . 57 (3): 442–5. DOI : 10.1006 / geno.1999.5799 . PMID 10329013 .
^ Yélamos J, Schreiber V, Dantzer F (апрель 2008). «К специфическим функциям поли (АДФ-рибоза) полимеразы-2». Тенденции в молекулярной медицине . 14 (4): 169–78. DOI : 10.1016 / j.molmed.2008.02.003 . PMID 18353725 .
^ a b «Ген Entrez: семейство полимераз PARP2 поли (АДФ-рибоза), член 2» .
^ a b Song J, Keppler BD, Wise RR, Bent AF (май 2015 г.). «PARP2 является преобладающей поли (АДФ-рибозой) полимеразой при повреждении ДНК арабидопсиса и иммунных ответах» . PLoS Genetics . 11 (5): e1005200. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1005200 . PMC 4423837 . PMID 25950582 .
^ Шрайбер В, Amé JC, Долле Р, Шульц Я, Ринальди В, Fraulob В, Ménissier-де - Мурсия, J - де - Мурсия G (июнь 2002 г.). «Поли (АДФ-рибоза) полимераза-2 (PARP-2) необходима для эффективной репарации ДНК с эксцизией оснований в сочетании с PARP-1 и XRCC1» . Журнал биологической химии . 277 (25): 23028–36. DOI : 10.1074 / jbc.M202390200 . PMID 11948190 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Bashford CL, Chance B, Lloyd D, Poole RK (январь 1980 г.). «Колебания окислительно-восстановительных состояний в синхронно делящихся культурах Acanthamoeba castellanii и Schizosaccharomyces pombe» . Биофизический журнал . 29 (1): 1–11. Bibcode : 1980BpJ .... 29 .... 1B . DOI : 10.1016 / S0006-3495 (80) 85114-9 . PMC 1328658 . PMID 7260241 .
Бергаммер Х., Эбнер М., Маркштайнер Р., Ауэр Б. (апрель 1999 г.). «pADPRT-2: новый ген полимеризующейся (АДФ-рибозил) трансферазы млекопитающих, родственный усеченным гомологам pADPRT у растений и Caenorhabditis elegans» . Письма FEBS . 449 (2–3): 259–63. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 00448-2 . PMID 10338144 .
Amé JC, Rolli V, Schreiber V, Niedergang C, Apiou F, Decker P, Muller S, Höger T., Ménissier-de Murcia J, de Murcia G (июнь 1999 г.). «PARP-2, новая поли (АДФ-рибоза) полимераза, зависимая от повреждений ДНК млекопитающих» . Журнал биологической химии . 274 (25): 17860–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.25.17860 . PMID 10364231 .
Тем не менее IH, Винс П., Коуэлл JK (декабрь 1999). «Идентификация нового гена (ADPRTL1), кодирующего потенциальный белок поли (АДФ-рибозил) трансферазы». Геномика . 62 (3): 533–6. DOI : 10.1006 / geno.1999.6024 . PMID 10644454 .
Schreiber V, Amé JC, Dollé P, Schultz I, Rinaldi B, Fraulob V, Ménissier-de Murcia J, de Murcia G (июнь 2002 г.). «Поли (АДФ-рибоза) полимераза-2 (PARP-2) необходима для эффективной репарации ДНК с эксцизией оснований в сочетании с PARP-1 и XRCC1» . Журнал биологической химии . 277 (25): 23028–36. DOI : 10.1074 / jbc.M202390200 . PMID 11948190 .
Саксена А., Вонг Л.Х., Калицис П., Эрл Э., Шаффер Л.Г., Чу К.Х. (сентябрь 2002 г.). «Поли (АДФ-рибоза) полимераза 2 локализуется в активных центромерах млекопитающих и взаимодействует с PARP-1, Cenpa, Cenpb и Bub3, но не с Cenpc» . Молекулярная генетика человека . 11 (19): 2319–29. DOI : 10.1093 / HMG / 11.19.2319 . PMID 12217960 .
Маланга М., Althaus FR (февраль 2004 г.). «Поли (АДФ-рибоза) реактивирует остановившуюся топоизомеразу I ДНК и вызывает повторное запечатывание разрыва цепи ДНК» . Журнал биологической химии . 279 (7): 5244–8. DOI : 10.1074 / jbc.C300437200 . PMID 14699148 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р., Кусида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
Маеда Y, Хантер TC, Loudy DE, Davé V, Schreiber V, Whitsett JA (апрель 2006 г.). «PARP-2 взаимодействует с TTF-1 и регулирует экспрессию сурфактантного белка-B» . Журнал биологической химии . 281 (14): 9600–6. DOI : 10.1074 / jbc.M510435200 . PMID 16461352 .
Chevanne M, Calia C, Zampieri M, Cecchinelli B, Caldini R, Monti D, Bucci L, Franceschi C, Caiafa P (июнь 2007 г.). «Окислительная репарация повреждений ДНК и экспрессия parp 1 и parp 2 в иммортализованных вирусом Эпштейна-Барра В-лимфоцитах от молодых субъектов, старых субъектов и долгожителей». Исследования омоложения . 10 (2): 191–204. DOI : 10,1089 / rej.2006.0514 . PMID 17518695 .
Лян Ю.К., Сюй Ц.Й., Яо Ю.Л., Ян В.М. (февраль 2013 г.). «PARP-2 регулирует гены, связанные с клеточным циклом, посредством деацетилирования и метилирования гистонов независимо от поли (АДФ-рибозилирования)». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 431 (1): 58–64. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2012.12.092 . PMID 23291187 .
Сонг Дж., Кепплер Б.Д., Мудрый Р.Р., Бент А.Ф. (май 2015 г.). «PARP2 является преобладающей поли (АДФ-рибозой) полимеразой при повреждении ДНК арабидопсиса и иммунных ответах» . PLoS Genetics . 11 (5): e1005200. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1005200 . PMC 4423837 . PMID 25950582 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение человеческого гена PARP2 в браузере генома UCSC .
Подробная информация о человеческом гене PARP2 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене в хромосоме 14 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000129484 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036023 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10329013-5] Johansson M (май 1999 г.). «Семейство генов поли (АДФ-рибозы) полимеразы человека (ADPRTL): клонирование кДНК двух новых гомологов поли (АДФ-рибозы) полимеразы». Геномика . 57 (3): 442–5. DOI : 10.1006 / geno.1999.5799 . PMID 10329013 .

[pmid18353725-6] Yélamos J, Schreiber V, Dantzer F (апрель 2008). «К специфическим функциям поли (АДФ-рибоза) полимеразы-2». Тенденции в молекулярной медицине . 14 (4): 169–78. DOI : 10.1016 / j.molmed.2008.02.003 . PMID 18353725 .

[entrez-7] «Ген Entrez: семейство полимераз PARP2 поли (АДФ-рибоза), член 2» .

[Song2015-8] Song J, Keppler BD, Wise RR, Bent AF (май 2015 г.). «PARP2 является преобладающей поли (АДФ-рибозой) полимеразой при повреждении ДНК арабидопсиса и иммунных ответах» . PLoS Genetics . 11 (5): e1005200. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1005200 . PMC 4423837 . PMID 25950582 .

[pmid11948190-9] Шрайбер В, Amé JC, Долле Р, Шульц Я, Ринальди В, Fraulob В, Ménissier-де - Мурсия, J - де - Мурсия G (июнь 2002 г.). «Поли (АДФ-рибоза) полимераза-2 (PARP-2) необходима для эффективной репарации ДНК с эксцизией оснований в сочетании с PARP-1 и XRCC1» . Журнал биологической химии . 277 (25): 23028–36. DOI : 10.1074 / jbc.M202390200 . PMID 11948190 .

[1]