PAX2

Идентификаторы

PAX2 , PAPRS, FSGS7, парный ящик 2

Внешние идентификаторы

OMIM : 167409 MGI : 97486 HomoloGene : 2968 GeneCard : PAX2

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 10 (человека) ^[1]

Группа	10q24.31	Начинать	100 735 603 п.н. ^[1]
Группа	10q24.31	Конец	100 829 941 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 19 (мышь) ^[2]

Группа	19 C3 \| 19 38,09 см	Начинать	44 756 045 п.н. ^[2]
Группа	19 C3 \| 19 38,09 см	Конец	44 837 871 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ДНК • супероксид-генерирующей NADPH - оксидазы • транскрипционный фактор связывания • GO: связывание 0001158 ядро промотора проксимальная область ДНК-последовательность конкретных • ГО: связывание 0001948 белок • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции активность, специфическая к РНК-полимеразе II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
Сотовый компонент	• Аппарат Гольджи • центриолярный сателлит • центр организации микротрубочек • комплекс белок-ДНК • ядрышко • лизосома • ядро клетки • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс	• клеточный ответ на перекись водорода • клеточный ответ на глюкозу стимул • развития улитка • Развитие Предпочка • клеточный ответ на ретиноевой кислоты • регулирование метанефрической нефрона канальцев дифференцировки эпителиальных клеток • развитие животных органа • развитие мочеточника • дифференцировки клеток • отрицательное регулирование цистеин-типа активность эндопептидазы, участвующая в апоптотическом процессе • положительная регуляция ветвления, участвующая в морфогенезе зачатка мочеточника • регуляция транскрипции, ДНК-темплейт • положительная регуляция дифференцировки метанефрических DCT-клеток • регуляция размера метанефроса • аксоногенез • передача сигналов протеинкиназы B • негативная регуляция процесса апоптоза мезенхимальных клеток, участвующих в морфогенезе метанефрального нефрона • негативная регуляция процесса апоптоза, участвующего в развитии метанефрического собирательного протока • позитивная регуляция эпителиальных клеток пролиферация • морфогенез зрительного нерва • спецификация пронефрического поля • положительная регуляция мезенхимального перехода в эпителиальный, участвующая в морфогенезе метанефроса • дифференцировка метанефрических мезенхимальных клеток • старение • развитие метанефрального эпителия • переход от мезенхимы к эпителию, участвующий в морфогенезе метанефроса • отрицательная регуляция апоптотического процесса • дифференцировка глиальных клеток • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • развитие пигментного эпителия сетчатки • формирование нефриального протока • транскрипция, шаблонная ДНК • стволовые клетки дифференцировка • развитие метанефрических дистальных извитых канальцев • метаболический процесс активных форм кислорода • отрицательная регуляция процесса апоптоза мезенхимальных клеток, участвующего в развитии метанефроса • развитие мезонефроса • структурная организация зрительного нерва • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста • образование канальцев метанефрального нефрона • позитивная регуляция развития метанефрических клубочков • многоклеточный развитие организма • ветвление, участвующее в морфогенезе зачатка мочеточника • закрытие нервной трубки • реакция на уровни питательных веществ • отрицательная регуляция процесса апоптоза, вовлеченная в развитие канальцев метанефрона нефрона • созревание мочеточника • морфогенез внутреннего уха • морфогенез улитки • позитивная регуляция формирования зрительного нерва • позитивная регуляция пролиферации клеток • морфогенез зрительного бокала, участвующий в развитии глазного типа камеры • развитие мочеполовой системы • определение судьбы клеток • негативная регуляция запрограммированной гибели клеток • формирование вестибулокохлеарного нерва • развитие глаз по типу камеры • развитие метанефрических собирательных протоков • негативная регуляция метаболического процесса активных форм кислорода • спецификация судьбы мезодермальных клеток • негативная регуляция транскрипции, шаблонная ДНК • развитие метанефрической мезенхимы • развитие зрительной перекреста • развитие зрительного нерва • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • зрительное восприятие • негативная регуляция цитолиза • морфогенез мозга • переход от мезенхимы к эпителию • окислительно-восстановительный процесс
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


5076


18504

Ансамбль


ENSG00000075891


ENSMUSG00000004231

UniProt


Q02962 Q5SZP1


P32114

RefSeq (мРНК)

NM_003990 NM_000278 NM_001304569 NM_003987 NM_003988
NM_003989 NM_001374303


NM_011037

RefSeq (белок)

NP_000269 NP_001291498 NP_003978 NP_003979 NP_003980
NP_003981 NP_001361232

NP_035167 NP_001355672 NP_001355673 NP_001355674 NP_001355675
NP_001355676 NP_001355677 NP_001355678 NP_001355679 NP_001355680

Расположение (UCSC)

Chr 10: 100,74 - 100,83 Мб

Chr 19: 44,76 - 44,84 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Соединенный гена коробки 2 , также известный как Pax2 является белком , который в организме человека кодируется Pax2 геном . ^[5]^[6]

Функция [ править ]

Гены Pax, или гены, содержащие парные коробки, играют важную роль в развитии и пролиферации множества клеточных линий, развитии органов, а также развитии и организации центральной нервной системы. ^[7] Ген фактора транскрипции Pax2 играет важную роль в регионализированном эмбриологическом развитии центральной нервной системы. У млекопитающих мозг развит в трех областях: передний мозг, средний мозг и задний мозг. ^[8] Градиенты концентрации фактора роста фибробластов 8 (FGF8) и семейства сайтов интеграции MMTV бескрылого типа, члена 1 (Wnt1) контролируют экспрессию Pax2 во время развития среднего мозга или среднего мозга. ^[9]Подобное формирование паттерна во время эмбриологического развития можно наблюдать у «базальных хордовых или асцидий», у которых организация центральной нервной системы у асцидий личинок также контролируется генами факторов роста фибробластов. ^[8] Ген Pax2 кодирует фактор транскрипции, который, по-видимому, играет важную роль в организации областей среднего и заднего мозга и, самое раннее, может быть обнаружен по обе стороны от предельной борозды, которая разделяет двигательные и сенсорные нервные ядра. ^[7]^[10]

PAX2 кодирует парный бокс- ген 2, один из многих человеческих гомологов гена prd Drosophila melanogaster. Центральным признаком этого семейства генов фактора транскрипции является консервативный ДНК-связывающий парный бокс-домен. Считается, что PAX2 является мишенью подавления транскрипции геном-супрессором опухоли WT1 . Pax 2 представляет собой фактор транскрипции, контролируемый сигнальными молекулами Wnt1 и Fgf8. Pax2 вместе с другими факторами транскрипции Pax5, Pax8, En1 и En 2 экспрессируются через границу Otx2-Gbx2 в средней части заднего мозга. Эти факторы транскрипции работают с сигнальными молекулами Wnt1 и Fgf8, чтобы поддерживать организатор MHB.. MHB контролирует развитие среднего мозга и мозжечка. Pax2 - это самый ранний из известных генов, который экспрессируется через границу Otx2-Gbx2. Он сначала экспрессируется на стадии поздней примитивной полоски и экспрессируется в узком кольце с центром в MHB во время сомитогенеза. Экспрессия трансгена в средней части заднего мозга и развивающейся почки направляется Pax2. Есть три различных MHB-специфических энхансера в восходящей области Pax2. Экспрессия MHB, начиная со стадии четырех сомитов и далее, направляется двумя поздними энхансерами в проксимальных и дистальных областях Pax2. Ранний энхансер, расположенный в промежуточной области, активирует область среднего заднего мозга эмбрионов поздней гаструлы. Активация Pax2, Pax5 и Pax8 является консервативной особенностью всех позвоночных.

Клиническое значение [ править ]

Патологически было продемонстрировано, что Pax2 активирует промотор гена фактора роста гепатоцитов (HGF), и было показано, что оба они играют роль в раке простаты человека. ^[11]

Было показано, что мутации в PAX2 приводят к колобомам зрительного нерва и почечной гипоплазии . Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множеству вариантов транскриптов. ^[12] Pax2 и Pax8 также необходимы для образования пронефроса и последующих структур почек. Pax2 и Pax8 регулируют экспрессию Gata3. Без этих генов возникают мутации в мочеполовой системе.

Неверная экспрессия Pax2 часто наблюдается при пролиферативных нарушениях почек. Например, Pax2 высоко экспрессируется при поликистозной болезни почек (PKD), опухоли Вильмса (WT) и почечно-клеточной карциноме (RCC). ^[13] Экспрессия Pax2 при этих заболеваниях проявляется в цикличности топливных элементов, ингибирует гибель клеток и придает устойчивость к химиотерапии. ^[13] Благодаря своей роли в этих заболеваниях, Pax2 является привлекательной терапевтической мишенью, и был исследован ряд методов ингибирования его активности. Фактически, недавно была идентифицирована малая молекула, способная нарушать опосредованную Pax2 транскрипцию, блокируя связывание Pax2 с ДНК. ^[14]^[15]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PAX2 взаимодействует с PAXIP1 . ^[16]

См. Также [ править ]

Гены pax

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000075891 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004231 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Pilz AJ, Поуви S, Gruss Р, Эбботт СМ (1993). «Картирование человеческих гомологов мышей, содержащих парные коробки». Геном млекопитающих . 4 (2): 78–82. DOI : 10.1007 / BF00290430 . PMID 8431641 . S2CID 30845070 .
^ Стейплтон Р, Weith А, Urbánek Р, Kozmik Z, Busslinger М (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семьи, PAX-9». Генетика природы . 3 (4): 292–8. DOI : 10.1038 / ng0493-292 . PMID 7981748 . S2CID 21338655 .
^ а б Мансури А., Грусс П. (2013). «Пакс Джин». В Хьюз К., Малой К. (ред.). Энциклопедия генетики Бреннера (2-е изд.). Сан-Диего: Elsevier Science. С. 246–248. DOI : 10.1016 / B978-0-12-374984-0.01128-1 . ISBN 978-0-08-096156-9.
^ а б Имаи К.С., Сато Н., Сато Y (2002). «Региональные экспрессии генов в центральной нервной системе асцидийного эмбриона». Механизмы развития . 119 Дополнение 1: S275–7. DOI : 10.1016 / S0925-4773 (03) 00128-X . PMID 14516697 . S2CID 16714343 .
^ GeneCard для WNT1
Перейти ↑ Nolte J (2009). Человеческий мозг: введение в его функциональную анатомию (6-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Мосби / Эльзевир. п. 685. ISBN 978-0-323-04131-7.
^ Уэда Т, Ито С, Сираиси Т, Танигучи Х, Каюкава Н, Наканиси Х и др. (2015). «PAX2 способствовал инвазии клеток рака простаты посредством регуляции транскрипции HGF в модели in vitro» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни . 1852 (11): 2467–73. DOI : 10.1016 / j.bbadis.2015.08.008 . PMID 26296757 .
^ "Entrez Gene: PAX2 парный бокс-ген 2" .
^ a b Шарма Р., Санчес-Феррас О, Бушар М (2015). «Гены Pax в развитии, заболеваниях и регенерации почек». Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 44 : 97–106. DOI : 10.1016 / j.semcdb.2015.09.016 . PMID 26410163 .
^ Grimley Е, Ляо С, Ranghini Е, Nikolovska-Coleska Z, Дресслер G (2017). «Ингибирование активации транскрипции Pax2 с помощью небольшой молекулы, которая нацелена на домен связывания ДНК» . ACS Химическая биология . 12 (3): 724–734. DOI : 10.1021 / acschembio.6b00782 . PMC 5761330 . PMID 28094913 .
^ Grimley E, Dressler GR (2018). «Являются ли белки Pax потенциальными терапевтическими мишенями при заболевании почек и раке?» . Kidney International . 94 (2): 259–267. DOI : 10.1016 / j.kint.2018.01.025 . PMC 6054895 . PMID 29685496 .
↑ Lechner MS, Levitan I, Dressler GR (июль 2000 г.). «PTIP, новый белок, содержащий домен BRCT, взаимодействует с Pax2 и связан с активным хроматином» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (14): 2741–51. DOI : 10.1093 / NAR / 28.14.2741 . PMC 102659 . PMID 10908331 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Noll M (август 1993 г.). «Эволюция и роль генов Pax». Текущее мнение в области генетики и развития . 3 (4): 595–605. DOI : 10.1016 / 0959-437X (93) 90095-7 . PMID 8241771 .
Даль Э., Косеки Х., Баллинг Р. (сентябрь 1997 г.). «Гены Pax и органогенез». BioEssays . 19 (9): 755–65. DOI : 10.1002 / bies.950190905 . PMID 9297966 . S2CID 23755557 .
Eccles MR, He S, Legge M, Kumar R, Fox J, Zhou C., French M, Tsai RW (2003). «Гены PAX в развитии и болезни: роль PAX2 в развитии урогенитального тракта». Международный журнал биологии развития . 46 (4): 535–44. PMID 12141441 .
Экклс М.Р., Уоллис Л.Дж., Фидлер А.Э., Спурр Н.К., Гудфеллоу П.Дж., Рив А.Э. (май 1992 г.). «Экспрессия гена PAX2 в почках плода человека и опухоли Вильмса». Рост и дифференциация клеток . 3 (5): 279–89. PMID 1378753 .
Sanyanusin P, Schimmenti LA, McNoe LA, Ward TA, Pierpont ME, Sullivan MJ, Dobyns WB, Eccles MR (апрель 1995 г.). «Мутация гена PAX2 в семье с колобомами зрительного нерва, почечными аномалиями и пузырно-мочеточниковым рефлюксом». Генетика природы . 9 (4): 358–64. DOI : 10.1038 / ng0495-358 . PMID 7795640 . S2CID 29180124 .
Уорд Т.А., Небель А., Рив А.Е., Экклс М.Р. (сентябрь 1994 г.). «Альтернативные формы матричной РНК и открытые рамки считывания в дополнительной консервативной области гена PAX-2 человека». Рост и дифференциация клеток . 5 (9): 1015–21. PMID 7819127 .
Стэплтон П., Вейт А., Урбанек П., Козмик З., Басслингер М. (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семьи, PAX-9». Генетика природы . 3 (4): 292–8. DOI : 10.1038 / ng0493-292 . PMID 7981748 . S2CID 21338655 .
Pilz AJ, Povey S, Gruss P, Abbott CM (1993). «Картирование человеческих гомологов генов, содержащих парные коробки». Геном млекопитающих . 4 (2): 78–82. DOI : 10.1007 / BF00290430 . PMID 8431641 . S2CID 30845070 .
Саньянусин П., Макнои Л.А., Салливан М.Дж., Уивер Р.Г., Экклс М.Р. (ноябрь 1995 г.). «Мутация PAX2 у двух братьев и сестер с почечно-колобомным синдромом». Молекулярная генетика человека . 4 (11): 2183–4. DOI : 10.1093 / HMG / 4.11.2183 . PMID 8589702 .
Саньянусин П., Норриш Дж. Х., Уорд Т. А., Небель А., Макно Л. А., Экклс М. Р. (июль 1996 г.). «Геномная структура гена PAX2 человека». Геномика . 35 (1): 258–61. DOI : 10.1006 / geno.1996.0350 . PMID 8661132 .
Дехби М., Гахремани М., Лехнер М., Дресслер Дж., Пеллетье Дж. (Август 1996 г.). «Фактор транскрипции парного бокса, PAX2, положительно модулирует экспрессию гена-супрессора опухоли Вильмса (WT1)». Онкоген . 13 (3): 447–53. PMID 8760285 .
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Schimmenti LA, Cunliffe HE, McNoe LA, Ward TA, French MC, Shim HH, Zhang YH, Proesmans W., Leys A, Byerly KA, Braddock SR, Masuno M, Imaizumi K, Devriendt K, Eccles MR (апрель 1997 г.). «Дальнейшее определение синдрома почечной колобомы у пациентов с крайней вариабельностью фенотипа и идентичными мутациями PAX2» . Американский журнал генетики человека . 60 (4): 869–78. PMC 1712484 . PMID 9106533 .
Нарахара К., Бейкер Э., Ито С., Йокояма Ю., Ю. С., Хьюитт Д., Сазерленд Г. Р., Экклс М. Р., Ричардс Р. И. (март 1997 г.). «Локализация точки останова 10q в гене PAX2 у пациента с транслокацией de novo t (10; 13) и колобомой-почечной болезнью зрительного нерва» . Журнал медицинской генетики . 34 (3): 213–6. DOI : 10.1136 / jmg.34.3.213 . PMC 1050895 . PMID 9132492 .
Тавассоли К., Рюгер В., Хорст Дж. (Декабрь 1997 г.). «Альтернативный сплайсинг в PAX2 генерирует новую рамку считывания и расширенную консервативную кодирующую область на карбокси-конце». Генетика человека . 101 (3): 371–5. DOI : 10.1007 / s004390050644 . PMID 9439670 . S2CID 43590139 .
Стейнер CK, Канлифф HE, Ward TA, Eccles MR (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика человеческого промотора PAX2» . Журнал биологической химии . 273 (39): 25472–9. DOI : 10.1074 / jbc.273.39.25472 . PMID 9738017 .
Devriendt K, Matthijs G, Van Damme B, Van Caesbroeck D, Eccles M, Vanrenterghem Y, Fryns JP, Leys A (август 1998 г.). «Миссенс-мутация и гексануклеотидная дупликация в гене PAX2 в двух неродственных семьях с почечно-колобомным синдромом (MIM 120330)». Генетика человека . 103 (2): 149–53. DOI : 10.1007 / s004390050798 . PMID 9760197 . S2CID 8930257 .
Schimmenti LA, Shim HH, Wirtschafter JD, Panzarino VA, Kashtan CE, Kirkpatrick SJ, Wargowski DS, France TD, Michel E, Dobyns WB (2000). «Гомонуклеотидные экспансия и мутации сокращения PAX2 и включение мальформации Киари 1 как часть почечно-колобомного синдрома». Мутация человека . 14 (5): 369–76. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (199911) 14: 5 <369 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-E . PMID 10533062 .

Внешние ссылки [ править ]

GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о синдроме почечной колобомы
PAX2 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000075891 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004231 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8431641-5] Pilz AJ, Поуви S, Gruss Р, Эбботт СМ (1993). «Картирование человеческих гомологов мышей, содержащих парные коробки». Геном млекопитающих . 4 (2): 78–82. DOI : 10.1007 / BF00290430 . PMID 8431641 . S2CID 30845070 .

[pmid7981748-6] Стейплтон Р, Weith А, Urbánek Р, Kozmik Z, Busslinger М (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семьи, PAX-9». Генетика природы . 3 (4): 292–8. DOI : 10.1038 / ng0493-292 . PMID 7981748 . S2CID 21338655 .

[Mansouri_2013-7] а б Мансури А., Грусс П. (2013). «Пакс Джин». В Хьюз К., Малой К. (ред.). Энциклопедия генетики Бреннера (2-е изд.). Сан-Диего: Elsevier Science. С. 246–248. DOI : 10.1016 / B978-0-12-374984-0.01128-1 . ISBN 978-0-08-096156-9.

[Imai_2001-8] а б Имаи К.С., Сато Н., Сато Y (2002). «Региональные экспрессии генов в центральной нервной системе асцидийного эмбриона». Механизмы развития . 119 Дополнение 1: S275–7. DOI : 10.1016 / S0925-4773 (03) 00128-X . PMID 14516697 . S2CID 16714343 .

[9] GeneCard для WNT1

[10] Перейти ↑ Nolte J (2009). Человеческий мозг: введение в его функциональную анатомию (6-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Мосби / Эльзевир. п. 685. ISBN 978-0-323-04131-7.

[pmid26296757-11] Уэда Т, Ито С, Сираиси Т, Танигучи Х, Каюкава Н, Наканиси Х и др. (2015). «PAX2 способствовал инвазии клеток рака простаты посредством регуляции транскрипции HGF в модели in vitro» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни . 1852 (11): 2467–73. DOI : 10.1016 / j.bbadis.2015.08.008 . PMID 26296757 .

[entrez-12] "Entrez Gene: PAX2 парный бокс-ген 2" .

[pmid26410163-13] Шарма Р., Санчес-Феррас О, Бушар М (2015). «Гены Pax в развитии, заболеваниях и регенерации почек». Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 44 : 97–106. DOI : 10.1016 / j.semcdb.2015.09.016 . PMID 26410163 .

[pmid28094913-14] Grimley Е, Ляо С, Ranghini Е, Nikolovska-Coleska Z, Дресслер G (2017). «Ингибирование активации транскрипции Pax2 с помощью небольшой молекулы, которая нацелена на домен связывания ДНК» . ACS Химическая биология . 12 (3): 724–734. DOI : 10.1021 / acschembio.6b00782 . PMC 5761330 . PMID 28094913 .

[pmid29685496-15] Grimley E, Dressler GR (2018). «Являются ли белки Pax потенциальными терапевтическими мишенями при заболевании почек и раке?» . Kidney International . 94 (2): 259–267. DOI : 10.1016 / j.kint.2018.01.025 . PMC 6054895 . PMID 29685496 .

[pmid10908331-16] Lechner MS, Levitan I, Dressler GR (июль 2000 г.). «PTIP, новый белок, содержащий домен BRCT, взаимодействует с Pax2 и связан с активным хроматином» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (14): 2741–51. DOI : 10.1093 / NAR / 28.14.2741 . PMC 102659 . PMID 10908331 .

[1]