• трансферазная активность • РНК - полимераза регуляторной область ДНК последовательности специфических II связывание • GO: 0001104 транскрипции coregulator активность • ГО: связывание 0001948 белка • трансферазной активности, перенос ацильных групп • гистонацетилтрансферазы активности • циклина-зависимый белок серин / треонин киназа ингибитор активность • связывание протеинкиназы • связывание хроматина • активность лизин-N-ацетилтрансферазы, действующая на ацетилфосфат в качестве донора • активность коактиватора транскрипции GO: 0001105 • связывание фактора транскрипции • гистондеацетилаза связывания • ацетилтрансферазы • GO: 0032403 макромолекулярных комплекс связывание • пептид-лизин-N-ацетилтрансфераза активность • диамин N-ацетилтрансфераза
Сотовый компонент
• I Полоса • нуклеоплазме • PCAF сложный • гистонацетилтрансфераза комплекс • А полосы • актомиозин • кинетохор • Ada2 / Gcn5 / Ada3 активатора транскрипции комплекс • клеточного ядра • Цитоплазма • центросома • микротрубочек организации центр • цитоскелета • макромолекулярный комплекса
Биологический процесс
• Путь передачи сигналов Notch • регуляция ADP-рибозилирования белка • позитивная регуляция экспрессии генов, эпигенетика • ремоделирование хроматина • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • негативная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • ритмический процесс • N-конец ацетилирование пептидил-лизина • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ацетилирование гистонов • остановка клеточного цикла • ацетилирование гистона H3 • клеточный ответ на инсулиновый стимул • ацетилирование гистона H3-K9 • клеточный цикл • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • вирусный процесс GO: 0022415 • ацетилирование пептидил-лизина • негативная регуляция клеточной пролиферации • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • внутреннее ацетилирование пептидил-лизина • регуляция дифференцировки мегакариоцитов • ацетилирование белков • позитивная регуляция транскрипции мишени рецептора Notch • развитие сердца • позитивная регуляция сигнального пути Notch • отрицательная регуляция репликации центриолей • развитие конечностей • деубиквитинирование белков
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
8850
18519
Ансамбль
ENSG00000114166
ENSMUSG00000000708
UniProt
Q92831
Q9JHD1
RefSeq (мРНК)
NM_003884
NM_001190846 NM_020005
RefSeq (белок)
NP_003875
NP_001177775 NP_064389
Расположение (UCSC)
Chr 3: 20.04 - 20.15 Мб
Chr 17: 53,57 - 53,67 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Фактор, связанный с P300 / CBP ( PCAF ), также известный как K (лизин) ацетилтрансфераза 2B ( KAT2B ), представляет собой ген человека и коактиватор транскрипции, связанный с p53 .
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура
2 Функция
3 Регламент
4 Взаимодействие с белками
5 мишеней
6 взаимодействий
7 См. Также
8 ссылки
9 Внешние ссылки
10 Дальнейшее чтение
Структура [ править ]
Несколько доменов PCAF могут действовать независимо или в унисон, чтобы обеспечить выполнение его функций. PCAF имеет отдельные домены ацетилтрансферазы и убиквитинлигазы E3, а также бромодомен для взаимодействия с другими белками. PCAF также обладает сайтами для собственного ацетилирования и убиквитинирования. [5]
Функция [ править ]
CBP и p300 представляют собой большие ядерные белки, которые связываются со многими специфическими для последовательности факторами, участвующими в росте и / или дифференцировке клеток, включая c-jun и аденовирусный онкобелок E1A. Белок, кодируемый геном PCAF, ассоциируется с p300 / CBP. Он обладает активностью связывания in vitro и in vivo с CBP и p300 и конкурирует с E1A за сайты связывания в p300 / CBP. Он обладает гистонацетилтрансферазной активностью с коровыми гистонами и ядерными частицами нуклеосом , что указывает на то, что этот белок играет непосредственную роль в регуляции транскрипции. [6]
Регламент [ править ]
Ацетилтрансферазы активность и клеточное местоположение PCAF регулируются посредством ацетилирования самого PCAF. PCAF может быть аутоацетилирован (ацетилирован сам по себе) или с помощью p300 . Ацетилирование приводит к миграции в ядро и усиливает его ацетилтрансферазную активность. [7] PCAF взаимодействует с HDAC3 и деацетилируется им , что приводит к снижению активности ацетилтрансферазы PCAF и цитоплазматической локализации. [8]
Взаимодействие с белками [ править ]
PCAF образует комплексы с многочисленными белками, которые регулируют его активность. Например, PCAF рекрутируется ATF [9] для ацетилирования гистонов и способствует транскрипции генов-мишеней ATF4.
Цели [ править ]
Существуют различные белки-мишени ацетилтрансферазной активности PCAF, включая факторы транскрипции, такие как Fli1 , [10] p53 [11] и многочисленные остатки гистонов. Hdm2 , сам по себе убиквитинлигаза, нацеленная на p53, также является мишенью для убиквитин-лигазной активности PCAF. [5]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что PCAF взаимодействует с:
BRCA2 , [12] [13]
CTNNB1 , [14]
CREBBP , [15] [16]
EVI1 , [17]
HNF1A , [18]
IRF1 , [19]
IRF2 , [19] [20]
KLF13 , [21]
Mdm2 [22]
Myc , [23]
NCOA1 , [24]
POLR2A , [16]
RBPJ , [25]
TCF3 , [26]
TRRAP , [23] [27] и
TWIST1 . [28]
См. Также [ править ]
Корегулятор транскрипции
Ацетилтрансфераза
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000114166 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000708 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b Линарес Л.К., Кирнан Р., Трибуле Р., Шабл-Бессия С., Латрей Д., Кювье О., Лакруа М., Ле Кам Л., Кук О, Бенкиран М. (март 2007 г.). «Внутренняя убиквитинирующая активность PCAF контролирует стабильность онкобелка Hdm2». Nat. Cell Biol . 9 (3): 331–8. DOI : 10.1038 / ncb1545 . PMID 17293853 . S2CID 205286563 .
^ Сантос-Роза H, Valls E, Kouzarides T, Мартинес-Балбас M (август 2003 г.). «Механизмы аутоацетилирования P / CAF» . Nucleic Acids Res . 31 (15): 4285–92. DOI : 10.1093 / NAR / gkg655 . PMC 169960 . PMID 12888487 .
↑ Grégoire S, Xiao L, Nie J, Zhang X, Xu M, Li J, Wong J, Seto E, Yang XJ (февраль 2007 г.). «Гистоновая деацетилаза 3 взаимодействует с фактором усиления миоцитов 2 и деацетилирует их» . Мол. Клетка. Биол . 27 (4): 1280–95. DOI : 10.1128 / MCB.00882-06 . PMC 1800729 . PMID 17158926 .
^ Chérasse Y, Маурин переменный ток, Chaveroux С, Жусом С, Карраро В, Парри л, Девэлы С, Шамбоном С, Fafournoux Р, Брюа А (2007). «Фактор, связанный с p300 / CBP (PCAF), является кофактором ATF4 для регулируемой аминокислотами транскрипции CHOP» . Nucleic Acids Res . 35 (17): 5954–65. DOI : 10.1093 / NAR / gkm642 . PMC 2034469 . PMID 17726049 .
^ Асано Y, Czuwara Дж, Trojanowska М (ноябрь 2007 г.). «Трансформирующий фактор роста-бета регулирует ДНК-связывающую активность фактора транскрипции Fli1 посредством зависимого от фактора p300 / CREB-связывающего белка ацетилирования» . J. Biol. Chem . 282 (48): 34672–83. DOI : 10.1074 / jbc.M703907200 . PMID 17884818 .
^ Лю L, Scolnick DM, Trievel RC, Zhang HB, Марморштейн R, Halazonetis TD, Berger SL (февраль 1999). «Сайты p53, ацетилированные in vitro PCAF и p300, ацетилируются in vivo в ответ на повреждение ДНК» . Мол. Клетка. Биол . 19 (2): 1202–9. DOI : 10,1128 / MCB.19.2.1202 . PMC 116049 . PMID 9891054 .
↑ Lin HR, Ting NS, Qin J, Lee WH (сентябрь 2003 г.). «Специфическое для фазы M фосфорилирование BRCA2 поло-подобной киназой 1 коррелирует с диссоциацией комплекса BRCA2-P / CAF» . J. Biol. Chem . 278 (38): 35979–87. DOI : 10.1074 / jbc.M210659200 . PMID 12815053 .
^ Фукса Р, Милнер Дж, Kouzarides Т (ноябрь 1998 г.). «BRCA2 ассоциируется с ацетилтрансферазной активностью при связывании с P / CAF» . Онкоген . 17 (19): 2531–4. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202475 . PMID 9824164 .
↑ Ge X, Jin Q, Zhang F, Yan T, Zhai Q (январь 2009 г.). «PCAF ацетилирует {бета} -катенин и улучшает его стабильность» . Мол. Биол. Cell . 20 (1): 419–27. DOI : 10,1091 / mbc.E08-08-0792 . PMC 2613091 . PMID 18987336 .
^ Тини М, Benecke А, SJ Эм, Torchia Дж, Эванс Р. М., Шамбон Р (февраль 2002 г.). «Ассоциация ацетилазы CBP / p300 и тиминовой ДНК-гликозилазы связывает репарацию ДНК и транскрипцию». Мол. Cell . 9 (2): 265–77. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00453-7 . PMID 11864601 .
^ a b Чо Х, Орфаниды G, Сун X, Ян XJ, Огрызко V, Лис E, Nakatani Y, Reinberg D (сентябрь 1998 г.). «Комплекс человеческой РНК-полимеразы II, содержащий факторы, изменяющие структуру хроматина» . Мол. Клетка. Биол . 18 (9): 5355–63. DOI : 10,1128 / MCB.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .
^ Чакраборти S, Сенюк В, Sitailo S, Чи Y, Nucifora G (ноябрь 2001 г.). «Взаимодействие EVI1 с цАМФ-чувствительным элементом, связывающим белок-связывающий белок (CBP) и p300 / CBP-связанный фактор (P / CAF), приводит к обратимому ацетилированию EVI1 и совместной локализации в ядерных спеклах» . J. Biol. Chem . 276 (48): 44936–43. DOI : 10.1074 / jbc.M106733200 . PMID 11568182 .
^ Soutoglou Е, G Papafotiou, Katrakili N, Talianidis я (апрель 2000 г.). «Активация транскрипции ядерным фактором-1 гепатоцитов требует синергизма между множественными белками-коактиваторами» . J. Biol. Chem . 275 (17): 12515–20. DOI : 10.1074 / jbc.275.17.12515 . PMID 10777539 .
^ a b Масуми А., Ван И.М., Лефевр Б., Ян XJ, Накатани Ю., Озато К. (март 1999 г.). «Гистонацетилаза PCAF представляет собой коактиватор семейства IRF, индуцируемый форболовым эфиром, который обеспечивает повышенную чувствительность к интерферону» . Мол. Клетка. Биол . 19 (3): 1810–20. DOI : 10,1128 / MCB.19.3.1810 . PMC 83974 . PMID 10022868 .
↑ Masumi A, Ozato K (июнь 2001 г.). «Коактиватор p300 ацетилирует регуляторный фактор-2 интерферона в клетках U937 после обработки сложным эфиром форбола» . J. Biol. Chem . 276 (24): 20973–80. DOI : 10.1074 / jbc.M101707200 . PMID 11304541 .
↑ Song CZ, Keller K, Murata K, Asano H, Stamatoyannopoulos G (март 2002 г.). «Функциональное взаимодействие между коактиваторами CBP / p300, PCAF и фактором транскрипции FKLF2» . J. Biol. Chem . 277 (9): 7029–36. DOI : 10.1074 / jbc.M108826200 . PMC 2808425 . PMID 11748222 .
↑ Jin Y, Zeng SX, Dai MS, Yang XJ, Lu H (август 2002). «MDM2 ингибирует ацетилирование p53, опосредованное PCAF (p300 / CREB-связывающий белок-ассоциированный фактор)» . J. Biol. Chem . 277 (34): 30838–43. DOI : 10.1074 / jbc.M204078200 . PMID 12068014 .
^ a b Лю X, Tesfai J, Evrard YA, Dent SY, Martinez E (май 2003 г.). «Трансформационный домен c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . J. Biol. Chem . 278 (22): 20405–12. DOI : 10.1074 / jbc.M211795200 . PMC 4031917 . PMID 12660246 .
^ Spencer TE, Jenster G, Burcin MM, Allis CD, Чжоу J, Миссэн CA, McKenna NJ, Onate SA, Tsai SY, Tsai MJ, О'Мэлли BW (сентябрь 1997). «Коактиватор-1 стероидного рецептора представляет собой гистонацетилтрансферазу». Природа . 389 (6647): 194–8. Bibcode : 1997Natur.389..194S . DOI : 10,1038 / 38304 . PMID 9296499 . S2CID 4404530 .
^ Kurooka Н, Хондзё Т (июнь 2000). «Функциональное взаимодействие между внутриклеточной областью notch1 мыши и гистоновыми ацетилтрансферазами PCAF и GCN5» . J. Biol. Chem . 275 (22): 17211–20. DOI : 10.1074 / jbc.M000909200 . PMID 10747963 .
^ Bradney C, M Hjelmeland, Komatsu Y, Yoshida M, Yao TP, Чжуан Y (январь 2003). «Регулирование активности E2A с помощью гистоновых ацетилтрансфераз в развитии B-лимфоцитов» . J. Biol. Chem . 278 (4): 2370–6. DOI : 10.1074 / jbc.M211464200 . PMID 12435739 .
↑ Fuchs M, Gerber J, Drapkin R, Sif S, Ikura T, Ogryzko V, Lane WS, Nakatani Y, Livingston DM (август 2001). «Комплекс p400 является важной целью трансформации E1A». Cell . 106 (3): 297–307. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (01) 00450-0 . PMID 11509179 . S2CID 15634637 .
^ Hamamori Y, Sartorelli В, В.Огрызко В, Puri PL, В Г, Ван JY, Накатаните Y, КЕДЕС л (февраль 1999 г.). «Регулирование гистоновых ацетилтрансфераз p300 и PCAF с помощью скручивания белка bHLH и аденовирусного онкопротеина E1A». Cell . 96 (3): 405–13. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80553-X . PMID 10025406 . S2CID 15808193 .
Внешние ссылки [ править ]
Белок PCAF, человеческий, по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
NURSA C105
Дальнейшее чтение [ править ]
Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (2002). «Множественные способы регуляции транскрипции трансактиватором HIV-1 Tat». IUBMB Life . 51 (3): 175–81. DOI : 10.1080 / 152165401753544241 . PMID 11547919 . S2CID 10931640 .
Отт М., Дорр А., Хетцер-Эггер С., Кельке К., Шнольцер М., Хенкляйн П., Коул П., Чжоу М.М., Вердин Е. (2004). Ацетилирование Tat: регуляторный переключатель между ранней и поздней фазами элонгации транскрипции ВИЧ . Новартис найден. Symp . Симпозиумы Фонда Новартис. 259 . С. 182–93, обсуждение 193–6, 223–5. DOI : 10.1002 / 0470862637.ch13 . ISBN 978-0-470-86263-6. PMID 15171254 .
Лиу Л. Я., Херрманн СН, Райс А. П. (2005). «ВИЧ-1 инфекция и регуляция функции Tat в макрофагах». Int. J. Biochem. Cell Biol . 36 (9): 1767–75. DOI : 10.1016 / j.biocel.2004.02.018 . PMID 15183343 .
Гибеллини Д., Витоне Ф, Скьявоне П., Ре MC (2005). «Белок tat ВИЧ-1, пролиферация и выживаемость клеток: краткий обзор». New Microbiol . 28 (2): 95–109. PMID 16035254 .
Hetzer C, Dormeyer W, Schnölzer M, Ott M (2006). «Расшифровка Tat: биология посттрансляционных модификаций HIV Tat». Микробы заражают . 7 (13): 1364–9. DOI : 10.1016 / j.micinf.2005.06.003 . PMID 16046164 .
Перуцци F (2006). «Множественные функции Tat ВИЧ-1: пролиферация против апоптоза». Фронт. Biosci . 11 : 708–17. DOI : 10.2741 / 1829 . PMID 16146763 .
Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (2007). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства» . Med Res Rev . 26 (5): 595–625. DOI : 10.1002 / med.20081 . PMC 7168390 . PMID 16838299 .
Харрич Д., Макмиллан Н., Муньос Л., Аполлони А., Мередит Л. (2007). «Приведут ли разнообразные взаимодействия Tat к новым мишеням для антиретровирусных препаратов?». Текущие цели в отношении лекарств . 7 (12): 1595–606. DOI : 10,2174 / 138945006779025338 . PMID 17168834 .
Доусон SJ, Белый LA (1992). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». J. Infect . 24 (3): 317–20. DOI : 10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4 . PMID 1602151 .
Ян XJ, Огрызко В.В., Нисикава Дж., Ховард Б.Х., Накатани Ю. (1996). «Фактор, связанный с p300 / CBP, который конкурирует с аденовирусным онкобелком E1A». Природа . 382 (6589): 319–24. Bibcode : 1996Natur.382..319Y . DOI : 10.1038 / 382319a0 . PMID 8684459 . S2CID 4328685 .
Огрызко В.В., Шильц Р.Л., Русанова В., Ховард Б.Х., Накатани Ю. (1997). «Коактиваторы транскрипции p300 и CBP представляют собой гистоновые ацетилтрансферазы». Cell . 87 (5): 953–9. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 82001-2 . PMID 8945521 . S2CID 2624456 .
Чен Х, Лин Р. Дж., Шильц Р. Л., Чакраварти Д., Нэш А., Надь Л., Привальский М. Л., Накатани Ю., Эванс Р. М. (1997). «Коактиватор ядерного рецептора ACTR представляет собой новую гистонацетилтрансферазу и образует мультимерный активационный комплекс с P / CAF и CBP / p300». Cell . 90 (3): 569–80. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80516-4 . PMID 9267036 . S2CID 15284825 .
Такешита А., Кардона Г.Р., Койбути Н., Суен С.С., Чин В.В. (1997). "TRAM-1, новая молекула активатора рецептора тироидного гормона 160 кДа, проявляет свойства, отличные от коактиватора-1 стероидного рецептора" . J. Biol. Chem . 272 (44): 27629–34. DOI : 10.1074 / jbc.272.44.27629 . PMID 9346901 .
Korzus E, Torchia J, Rose DW, Xu L, Kurokawa R, McInerney EM, Mullen TM, Glass CK, Rosenfeld MG (1998). «Требования к факторам транскрипции для коактиваторов и их функции ацетилтрансферазы». Наука . 279 (5351): 703–7. Bibcode : 1998Sci ... 279..703K . DOI : 10.1126 / science.279.5351.703 . PMID 9445475 .
Puri PL, Sartorelli V, Yang XJ, Hamamori Y, Ogryzko VV, Howard BH, Kedes L, Wang JY, Graessmann A, Nakatani Y, Levrero M (1998). «Различная роль ацетилтрансфераз p300 и PCAF в дифференцировке мышц». Мол. Cell . 1 (1): 35–45. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80005-2 . PMID 9659901 .
Огрызко В.В., Котани Т., Чжан X, Шильц Р.Л., Ховард Т., Ян XJ, Ховард Б.Х., Цинь Дж., Накатани И. (1998). «Гистоноподобные TAF в гистонацетилазном комплексе PCAF». Cell . 94 (1): 35–44. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81219-2 . PMID 9674425 . S2CID 18942972 .
Randhawa GS, Bell DW, Testa JR, Feinberg AP (1998). «Идентификация и картирование гомологов гена модификатора ацетилирования гистонов человека». Геномика . 51 (2): 262–9. DOI : 10.1006 / geno.1998.5370 . PMID 9722949 .
Бенкиран М., Чун Р.Ф., Сяо Х., Огрызко В.В., Ховард Б.Х., Накатани Ю., Джанг К.Т. (1998). «Для активации интегрированного провируса требуется гистонацетилтрансфераза. P300 и P / CAF являются коактиваторами для Tat ВИЧ-1» . J. Biol. Chem . 273 (38): 24898–905. DOI : 10.1074 / jbc.273.38.24898 . PMID 9733796 .
vтеPDB галерея
1cm0 : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА PCAF / COENZYME-A
1jm4 : Структура ЯМР бромодомена P / CAF в комплексе с пептидом Tat ВИЧ-1
1n72 : Структура и лиганд бромодомена гистонацетилтрансферазы
1wug : сложная структура бромодомена PCAF с небольшим химическим лигандом NP1
1wum : Сложная структура бромодомена PCAF с небольшим химическим лигандом NP2.
1zs5 : Оценка на основе структуры селективных и неселективных малых молекул, которые блокируют ассоциацию ТАТ ВИЧ-1 и PCAF
vтеКорегуляторы транскрипции
Коактиваторы
ARA ( 54 , 55 , 70 )
BCAS3
CARM1
p300-CBP ( EP300 , CREBBP )
CRTC ( 1 , 2 , 3 )
КАПИТАНИЕ / ЛОВУШКУ ( MED1 Drip205 / Trap220)
MN1
PCAF
PNRC ( 1 , 2 )
PPARGC ( 1A , 1B )
TGFB1I1 NCOA1 ( SRC-1 )
NCOA2 ( GRIP1 / SRC-2 / TIF2 )
NCOA3 ( AIB / SRC-3 / TRAM-1 )
NCOA4 ( ARA70 )
NCOA5 ( ЦРУ )
NCOA6 ( RAP250 )
NCOA7 ( ERAP140 )
Corepressors
CTBP ( 1 , 2 )
Безволосый гомолог
LCOR
NRIP1 ( RIP140 )
ПЕЛП-1
RCOR1
Руб.
SIN3A
SIN3B
Семейство трехчастных мотивов TRIM ( 24 , 28 , 33 ) NCOR1
NCOR2 ( SMRT )
АТФ-зависимые факторы ремоделирования
Комплекс ремоделирования структуры хроматина (RSC)
SWI / SNF
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .