PRDX3

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
5JCG

Идентификаторы

Псевдонимы

PRDX3 , AOP-1, AOP1, HBC189, MER5, PRO1748, SP-22, prx-III, пероксиредоксин 3

Внешние идентификаторы

OMIM : 604769 MGI : 88034 HomoloGene : 4944 GeneCards : PRDX3

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 10 (человека) ^[1]

Группа	10q26.11	Начинать	119 167 720 п.н. ^[1]
Группа	10q26.11	Конец	119 178 812 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 19 (мышь) ^[2]

Группа	19 D3 \| 19 56,52 см	Начинать	60 864 051 п.н. ^[2]
Группа	19 D3 \| 19 56,52 см	Конец	60 874 556 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• активность пероксидазы • цистеина тип ингибитор эндопептидазы активность участвует в апоптотическом процессе • киназа связывание • белок С-конце связывания • GO: связывание 0001948 белка • антиоксидантный активности • гидроперекись алкил редуктаза • пероксиредоксина активности • оксидоредуктазы активности • протеинкиназы связывания • тиоредоксин пероксидазы активность • идентичное связывание с белками
Сотовый компонент	• цитозоль • миелин • митохондриальный матрикс • митохондрия • киназный комплекс IkappaB • цитоплазма • эндосома • ранняя эндосома • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс	• дифференцировка миелоидных клеток • окисление пептидил-цистеина • организация митохондрий • негативная регуляция апоптотического процесса • ответ на окислительный стресс • регуляция потенциала митохондриальной мембраны • клеточный ответ на активные формы кислорода • ответ на липополисахарид • развитие материнской плаценты • положительная регуляция NF- активность фактора транскрипции kappaB • положительное регулирование пролиферации клеток • катаболический процесс перекиси водорода • окислительно-восстановительный процесс • реакция на перекись водорода • негативная регуляция активности киназы • негативная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующая в процессе апоптоза • клеточная детоксикация окислителей • окислительно-восстановительный гомеостаз клеток • апоптотический процесс • клеточный ответ на окислительный стресс
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


10935


11757

Ансамбль


ENSG00000165672


ENSMUSG00000024997

UniProt


P30048


P20108

RefSeq (мРНК)


NM_001302272 NM_006793 NM_014098


NM_007452

RefSeq (белок)


NP_001289201 NP_006784


NP_031478

Расположение (UCSC)

Chr 10: 119.17 - 119.18 Мб

Chr 19: 60,86 - 60,87 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Тиоредоксин-зависимая перекись редуктазы, митохондриальный представляет собой фермент , который у человека кодируется PRDX3 геном . ^[5]^[6]^[7] Это член семейства антиоксидантных ферментов пероксиредоксинов .

Функция [ править ]

Этот ген кодирует белок с антиоксидантной функцией и локализован в митохондрии . Этот ген демонстрирует значительное сходство нуклеотидной последовательности с геном, кодирующим субъединицу C22 алкилгидропероксидредуктазы Salmonella typhimurium. Экспрессия этого генного продукта в E. coli, дефицитной по гену C22-субъединицы, спасала устойчивость бактерий к алкилгидропероксиду. Гены человека и мыши высококонсервативны, и они сопоставляются с областями, синтеничными между хромосомами мыши и человека. Сравнение последовательностей с недавно клонированными гомологами млекопитающих предполагает, что эти гены состоят из семейства, которое отвечает за регуляцию клеточной пролиферации ,дифференциация и антиоксидантные функции. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие две разные изоформы. ^[7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PRDX3 взаимодействует с MAP3K13 . ^[8]

Клиническое значение [ править ]

Было продемонстрировано, что сывороточный пероксиредоксин 3 может быть ценным биомаркером для диагностики и оценки гепатоцеллюлярной карциномы ^[9]. Было показано, что белки пероксиредоксина защищают клетки рака молочной железы MCF-7 от токсичности, опосредованной доксорубицином. ^[10] Кроме того, было показано, что пероксиредоксин 3 сверхэкспрессируется при раке простаты и способствует выживанию раковых клеток, защищая клетки от повреждений, вызванных окислительным стрессом . ^[11]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000165672 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024997 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Tsuji K, Copeland NG, Jenkins NA, Obinata M (май 1995). «Антиоксидантный белок млекопитающих дополняет мутацию алкилгидропероксидредуктазы (ahpC) в Escherichia coli» . Биохим. Дж . 307 (2): 377–81. DOI : 10.1042 / bj3070377 . PMC 1136659 . PMID 7733872 .
^ Watabe S, Hiroi Т, Ямамото Y, Фудзиока Y, Hasegawa Н, Н Яго, Такахаши С.Ю. (декабрь 1997). «SP-22 - это тиоредоксин-зависимая пероксидредуктаза в митохондриях» . Евро. J. Biochem . 249 (1): 52–60. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1997.t01-1-00052.x . PMID 9363753 .
^ a b «Ген Энтреза: пероксиредоксин 3 PRDX3» .
↑ Masaki M, Ikeda A, Shiraki E, Oka S, Kawasaki T (январь 2003 г.). «Смешанная линейная киназа LZK и антиоксидантный протеин-1 синергетически активируют NF-kappaB» . Евро. J. Biochem . 270 (1): 76–83. DOI : 10.1046 / j.1432-1033.2003.03363.x . PMID 12492477 .
^ Ши Л., Ву LL, Ян JR, Чен XF, Чжан Y, Чен ZQ, Лю CL, Чи SY, Чжэн JY, Хуанг HX, Yu FJ, Лин XY (2014) «Пероксиредоксин3 в сыворотке крови - полезный биомаркер для ранней диагностики и оценки прогноза гепатоцеллюлярной карциномы у китайских пациентов» . Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака . 15 (7): 2979–86. DOI : 10,7314 / apjcp.2014.15.7.2979 . PMID 24815434 .
^ Макдональд С, Muhlbauer Дж, Перлматтер G, Taparra К, Фелэн С.А. (июль 2014). «Белки пероксиредоксина защищают клетки рака молочной железы MCF-7 от токсичности, вызванной доксорубицином» . Международный журнал онкологии . 45 (1): 219–26. DOI : 10.3892 / ijo.2014.2398 . PMID 24789097 .
↑ Whitaker HC, Patel D, Howat WJ, Warren AY, Kay JD, Sangan T, Marioni JC, Mitchell J, Aldridge S, Luxton HJ, Massie C, Lynch AG, Neal DE (август 2013 г.). «Пероксиредоксин-3 сверхэкспрессируется при раке простаты и способствует выживанию раковых клеток, защищая клетки от окислительного стресса» . Британский журнал рака . 109 (4): 983–93. DOI : 10.1038 / bjc.2013.396 . PMC 3749568 . PMID 23880827 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Hochstrasser DF, Frutiger S, Paquet N, Bairoch A, Ravier F, Pasquali C, Sanchez JC, Tissot JD, Bjellqvist B, Vargas R (1992). «Карта белков печени человека: справочная база данных, созданная путем микросеквенирования и сравнения гелей». Электрофорез . 13 (12): 992–1001. DOI : 10.1002 / elps.11501301201 . PMID 1286669 . S2CID 23518983 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Ши С.Ф., Ву Й.Х., Хунг СН, Ян Х.Й., Лин Дж.Й. (2001). «Абрин вызывает гибель клеток, инактивируя тиол-специфический антиоксидантный белок» . J. Biol. Chem . 276 (24): 21870–7. DOI : 10.1074 / jbc.M100571200 . PMID 11285261 .
Сузуки Х, Фукуниси Й, Кагава И, Сайто Р., Ода Х, Эндо Т, Кондо С., Боно Х, Окадзаки Й, Хаяшизаки Й (2001). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши» . Genome Res . 11 (10): 1758–65. DOI : 10.1101 / gr.180101 . PMC 311163 . PMID 11591653 .
Ким С.Х., Фунтулакис М., Кэрнс Н., Любек Г. (2001). Уровни белка подтипов пероксиредоксина человека в мозге пациентов с болезнью Альцгеймера и синдромом Дауна . J. Neural Transm. Дополн . С. 223–35. DOI : 10.1007 / 978-3-7091-6262-0_18 . ISBN 978-3-211-83704-7. PMID 11771746 .
Рабийуд Т., Хеллер М., Гаснье Ф., Люче С., Рей С., Эберсольд Р., Бенахмед М., Луизо П., Лунарди Дж. (2002). «Протеомический анализ клеточного ответа на окислительный стресс. Доказательства переокисления пероксиредоксинов in vivo в их активном центре» . J. Biol. Chem . 277 (22): 19396–401. DOI : 10.1074 / jbc.M106585200 . PMID 11904290 .
Вонзи Д.Р., Целлер К.И., Данг CV (2002). «Целевой ген c-Myc PRDX3 необходим для митохондриального гомеостаза и неопластической трансформации» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (10): 6649–54. DOI : 10.1073 / pnas.102523299 . PMC 124457 . PMID 12011429 .
Вагнер Э, Люче С., Пенна Л., Шевалле М., Ван Дорсселер А., Лейз-Вагнер Э, Рабийуд Т. (2002). «Метод обнаружения чрезмерного окисления цистеинов: пероксиредоксины окисляются in vivo в цистеине в активном центре во время окислительного стресса» . Биохим. Дж . 366 (Pt 3): 777–85. DOI : 10.1042 / BJ20020525 . PMC 1222825 . PMID 12059788 .
Шен К., Натан С. (2002). «Неизбыточная антиоксидантная защита множественными пероксиредоксинами с двумя цистеинами в клетках рака простаты человека» . Мол. Med . 8 (2): 95–102. DOI : 10.1007 / BF03402079 . PMC 2039972 . PMID 12080185 .
Масаки М, Икеда А, Шираки Э, Ока С, Кавасаки Т (2003). «Смешанная линейная киназа LZK и антиоксидантный протеин-1 синергетически активируют NF-kappaB» . Евро. J. Biochem . 270 (1): 76–83. DOI : 10.1046 / j.1432-1033.2003.03363.x . PMID 12492477 .
Чой Дж. Х., Ким Т. Н., Ким С., Пэк Ш., Ким Дж. Х., Ли С. Р., Ким Дж. Р. (2003). «Сверхэкспрессия митохондриальной тиоредоксинредуктазы и пероксиредоксина III в гепатоцеллюлярных карциномах». Anticancer Res . 22 (6A): 3331–5. PMID 12530083 .
Krapfenbauer K, Engidawork E, Cairns N, Fountoulakis M, Lubec G (2003). «Аберрантная экспрессия подтипов пероксиредоксина при нейродегенеративных расстройствах». Brain Res . 967 (1–2): 152–60. DOI : 10.1016 / S0006-8993 (02) 04243-9 . PMID 12650976 . S2CID 854144 .
Чанг Т.С., Чо С.С., Пак С., Ю С., Кан С.В., Ри С.Г. (2004). «Пероксиредоксин III, митохондрион-специфическая пероксидаза, регулирует передачу сигналов апоптоза митохондриями» . J. Biol. Chem . 279 (40): 41975–84. DOI : 10.1074 / jbc.M407707200 . PMID 15280382 .
Лю Л., Ян Ц., Юань Дж., Чен Х, Сюй Дж., Вэй И, Ян Дж, Линь Г, Ю Л (2005). «RPK118, белок, содержащий домен PX, взаимодействует с пероксиредоксином-3 через домены псевдокиназы». Мол. Ячейки . 19 (1): 39–45. PMID 15750338 .

Эта статья о гене на хромосоме 10 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000165672 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024997 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7733872-5] Tsuji K, Copeland NG, Jenkins NA, Obinata M (май 1995). «Антиоксидантный белок млекопитающих дополняет мутацию алкилгидропероксидредуктазы (ahpC) в Escherichia coli» . Биохим. Дж . 307 (2): 377–81. DOI : 10.1042 / bj3070377 . PMC 1136659 . PMID 7733872 .

[pmid9363753-6] Watabe S, Hiroi Т, Ямамото Y, Фудзиока Y, Hasegawa Н, Н Яго, Такахаши С.Ю. (декабрь 1997). «SP-22 - это тиоредоксин-зависимая пероксидредуктаза в митохондриях» . Евро. J. Biochem . 249 (1): 52–60. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1997.t01-1-00052.x . PMID 9363753 .

[entrez-7] «Ген Энтреза: пероксиредоксин 3 PRDX3» .

[pmid12492477-8] Masaki M, Ikeda A, Shiraki E, Oka S, Kawasaki T (январь 2003 г.). «Смешанная линейная киназа LZK и антиоксидантный протеин-1 синергетически активируют NF-kappaB» . Евро. J. Biochem . 270 (1): 76–83. DOI : 10.1046 / j.1432-1033.2003.03363.x . PMID 12492477 .

[Shi_2014-9] Ши Л., Ву LL, Ян JR, Чен XF, Чжан Y, Чен ZQ, Лю CL, Чи SY, Чжэн JY, Хуанг HX, Yu FJ, Лин XY (2014) «Пероксиредоксин3 в сыворотке крови - полезный биомаркер для ранней диагностики и оценки прогноза гепатоцеллюлярной карциномы у китайских пациентов» . Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака . 15 (7): 2979–86. DOI : 10,7314 / apjcp.2014.15.7.2979 . PMID 24815434 .

[10] Макдональд С, Muhlbauer Дж, Перлматтер G, Taparra К, Фелэн С.А. (июль 2014). «Белки пероксиредоксина защищают клетки рака молочной железы MCF-7 от токсичности, вызванной доксорубицином» . Международный журнал онкологии . 45 (1): 219–26. DOI : 10.3892 / ijo.2014.2398 . PMID 24789097 .

[11] Whitaker HC, Patel D, Howat WJ, Warren AY, Kay JD, Sangan T, Marioni JC, Mitchell J, Aldridge S, Luxton HJ, Massie C, Lynch AG, Neal DE (август 2013 г.). «Пероксиредоксин-3 сверхэкспрессируется при раке простаты и способствует выживанию раковых клеток, защищая клетки от окислительного стресса» . Британский журнал рака . 109 (4): 983–93. DOI : 10.1038 / bjc.2013.396 . PMC 3749568 . PMID 23880827 .

[1]