• проекция клетки • очаговая адгезия • конус роста • рябь • клеточная мембрана • аксон • клеточное соединение • Z диск • актиновая нить • актиновый цитоскелет • подосомы • цитоскелет • ядро клетки • ламеллиподиум • цитоплазма • цитозоль
Биологический процесс
• эпителиальные клетки морфогенез • Развитие кератиноцитов • организация цитоскелета • актина организации цитоскелета • миграции клеток • гомофильной клеточной адгезии с помощью плазматической мембраны адгезии молекулы • аксонов • дендритов себя избегание
Палладии является белком , который в организме человека кодируется PALLD гена . [5] [6] [7] [8] Палладин является компонентом актин- содержащих микрофиламентов, которые контролируют форму, адгезию и сокращение клеток . [8]
СОДЕРЖАНИЕ
1 открытие
2 изоформы
3 Функция
4 Связь болезни
5 взаимодействий
6 Ссылки
7 Дальнейшее чтение
8 Внешние ссылки
Открытие [ править ]
Палладин был независимо охарактеризован двумя исследовательскими группами: сначала в лаборатории Кэрол Оти (в 2000 г.) [6], а затем в лаборатории Олли Карпена (в 2001 г.). [9] Он является частью семейства миотилин-миопалладин-палладин и может играть важную роль в модуляции актинового цитоскелета . [10] Палладин, в отличие от миотилина и миопалладина , которые экспрессируются только в поперечно-полосатых мышцах , повсеместно экспрессируется в клетках мезенхимального происхождения.
Палладин был назван в честь итальянского архитектора эпохи Возрождения Андреа Палладио , что отражает его расположение в архитектурных элементах клетки. [6]
Эукариотический цитоскелет. Палладин является одним из компонентов этого сложного клеточного механизма.
Изоформы [ править ]
У людей, по-видимому, существует семь различных изоформ, некоторые из которых возникают в результате альтернативного сплайсинга . [11] У мышей три основные изоформы палладина возникают из одного гена. Эти изоформы содержат от трех до пяти копий (в зависимости от изоформы) Ig-подобного домена и от одной до двух копий полипролинового домена. [6]
Функция [ править ]
Точная биологическая роль Палладина плохо изучена, но было показано, что он играет роль в организации цитоскелета, эмбриональном развитии, подвижности клеток, формировании рубцов на коже и развитии нервных клеток. [10]
Связь с заболеванием [ править ]
Недавно было продемонстрировано, что РНК палладина сверхэкспрессируется у пациентов с неоплазией поджелудочной железы , и что палладин сверхэкспрессируется и мутирует в наследственную форму рака поджелудочной железы . [12] Мутация палладина, выявленная при семейном раке поджелудочной железы, может быть уникальной для одной североамериканской семьи, поскольку эта же мутация не была обнаружена ни в одной другой европейской или североамериканской популяциях, соответственно, в двух других генетических исследованиях. [13] [14]
Кроме того, Salaria et al. показали, что палладин сверхэкспрессируется в неопухолевой строме рака поджелудочной железы, но очень редко в самих раковых клетках [15], предполагая, что роль палладина в этом заболевании может включать изменения в микроокружении опухоли. Очевидно, что необходимы дополнительные исследования, прежде чем этот белок и его роль в неоплазии можно будет полностью понять.
Мутации, вызывающие заболевание, также были идентифицированы у двух других членов этого семейства генов. Мутации миотилина вызывают форму мышечной дистрофии конечностей, а мутации миопалладина вызывают наследственную форму сердечных заболеваний ( дилатационная кардиомиопатия ).
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что PALLD взаимодействует с EZR . [9]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000129116 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058056 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т, Ишикав К, Suyama М, Кику R, Hirosawa М, Миядзима Н, Танака А, Котань Н, Nomura N, O Охара (июль 1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Res . 6 (1): 63–70. DOI : 10.1093 / dnares / 6.1.63 . PMID 10231032 .
^ a b c d Parast MM, Otey CA (сентябрь 2000 г.). «Характеристика Палладина, нового белка, локализованного в стрессовых волокнах и клеточных адгезиях» . J Cell Biol . 150 (3): 643–56. DOI : 10,1083 / jcb.150.3.643 . PMC 2175193 . PMID 10931874 .
^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder Б., Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных кодирующих белок кДНК человека» . Genome Res . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
^ a b «Ген Entrez: Палладин PALLD, цитоскелетный белок» . nih.gov.
^ a b Mykkänen OM, Grönholm M, Rönty M, Lalowski M, Salmikangas P, Suila H, Carpén O (2001). «Характеристика человеческого палладина, белка, связанного с микрофиламентами» . Мол. Биол. Cell . 12 (10): 3060–73. DOI : 10.1091 / mbc.12.10.3060 . PMC 60155 . PMID 11598191 .
^ a b Otey CA, Rachlin A, Moza M, Arneman D, Carpen O (2005). Семейство актин-ассоциированных каркасов палладин / миотилин / миопалладин . Int. Rev. Cytol . Международный обзор цитологии. 246 . С. 31–58. DOI : 10.1016 / S0074-7696 (05) 46002-7 . ISBN 9780123646507. PMID 16164966 .
^ Рахлин AS, Оти CA (2006). «Идентификация изоформ палладина и характеристика изоформ-специфического взаимодействия между Lasp-1 и палладином» . J. Cell Sci . 119 (Pt 6): 995–1004. DOI : 10,1242 / jcs.02825 . PMID 16492705 .
^ Пог-Geile KL, Chen R, Броннер MP, Crnogorac-Юрчевич T, Мойес KW, Dowen S, Оти CA, Криспин DA, Джордж RD, Виткомб DC, Brentnall TA (2006). «Мутация Палладина вызывает семейный рак поджелудочной железы и предлагает новый механизм рака» . PLOS Med . 3 (12): e516. DOI : 10.1371 / journal.pmed.0030516 . PMC 1751121 . PMID 17194196 .
Перейти ↑ Slater E, Amrillaeva V, Fendrich V, Bartsch D, Earl J, Vitone LJ, Neoptolemos JP, Greenhalf W (2007). «Мутация Палладина вызывает семейный рак поджелудочной железы: отсутствие в европейских семьях» . PLOS Med . 4 (4): e164. DOI : 10.1371 / journal.pmed.0040164 . PMC 1855695 . PMID 17455999 .
^ Zogopoulos G, Rothenmund Н, Эппель А, Аш С, Акбери МР, Хедли Д, Narod С.А., Галлингер S (2007). «Вариант палладина P239S не вызывает значительной доли наследственного или раннего рака поджелудочной железы». Гм. Genet . 121 (5): 635–7. DOI : 10.1007 / s00439-007-0361-z . PMID 17415588 . S2CID 2445261 .
^ Салариа С.Н., Illei Р, Р Шарма, Вальтер К., Клейн А.П., Eshleman JR, Майтра А, Schulick Р, зима Дж, Ouellette М.М., Гоггинс М, Hruban R (2007). «Палладин сверхэкспрессируется в неопухолевой строме инфильтрирующих протоковых аденокарцином поджелудочной железы, но только в редких случаях сверхэкспрессируется в опухолевых клетках» . Cancer Biol. Ther . 6 (3): 324–8. DOI : 10,4161 / cbt.6.3.3904 . PMC 3144721 . PMID 17404500 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Кинг CM, Оливия CW, Кардона Р.А. (1975). «Активация канцерогенных арилгидроксамовых кислот тканями человека». J. Natl. Cancer Inst . 55 (2): 285–7. DOI : 10.1093 / JNCI / 55.2.285 . PMID 1159819 .
Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, et al. (2000). «Идентификация новых генов человека, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans с помощью сравнительной протеомики» . Genome Res . 10 (5): 703–13. DOI : 10.1101 / gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .
Банг М.Л., Мудрый Р.Э., МакЭлхинни А.С. и др. (2001). "Миопалладин, новый саркомерный белок 145 килодальтон с множеством ролей в белковых сборках Z-диска и I-диапазона" . J. Cell Biol . 153 (2): 413–27. DOI : 10.1083 / jcb.153.2.413 . PMC 2169455 . PMID 11309420 .
Mykkänen OM, Grönholm M, Rönty M, et al. (2002). «Характеристика человеческого палладина, белка, связанного с микрофиламентами» . Мол. Биол. Cell . 12 (10): 3060–73. DOI : 10.1091 / mbc.12.10.3060 . PMC 60155 . PMID 11598191 .
Эберле М.А., Пфютцер Р., Пог-Гейле К.Л. и др. (2002). «Новый локус восприимчивости к картам аутосомно-доминантного рака поджелудочной железы на хромосоме 4q32-34» . Являюсь. J. Hum. Genet . 70 (4): 1044–8. DOI : 10.1086 / 339692 . PMC 379100 . PMID 11870593 .
Морияма К., Бонифачино Дж. С. (2003). «Паллидин является компонентом мультибелкового комплекса, участвующего в биогенезе связанных с лизосомами органелл» . Трафик . 3 (9): 666–77. DOI : 10.1034 / j.1600-0854.2002.30908.x . PMID 12191018 . S2CID 29888859 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ли С.Ю., Обата Ю., Йошида М. и др. (2003). «Иммуномический анализ саркомы человека» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 100 (5): 2651–6. DOI : 10.1073 / pnas.0437972100 . PMC 151395 . PMID 12601173 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Рёнти М., Тайвайнен А., Моза М. и др. (2004). «Молекулярный анализ взаимодействия палладина и альфа-актинина». FEBS Lett . 566 (1–3): 30–4. DOI : 10.1016 / j.febslet.2004.04.006 . PMID 15147863 . S2CID 86151740 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта кДНК полной длины NIH: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Хиллиер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С. и др. (2005). «Создание и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека» . Природа . 434 (7034): 724–31. DOI : 10,1038 / природа03466 . PMID 15815621 .
Рёнти М., Тайвайнен А., Моза М. и др. (2005). «Вовлечение палладина и альфа-актинина в нацеливание адаптера киназы Abl / Arg ArgBP2 на актиновый цитоскелет». Exp. Cell Res . 310 (1): 88–98. DOI : 10.1016 / j.yexcr.2005.06.026 . PMID 16125169 .
Шиффман Д., Эллис С.Г., Роуленд С.М. и др. (2005). «Идентификация четырех вариантов генов, связанных с инфарктом миокарда» . Являюсь. J. Hum. Genet . 77 (4): 596–605. DOI : 10.1086 / 491674 . PMC 1275608 . PMID 16175505 .
Бухелифа М., Моза М., Йоханссон Т. и др. (2006). «Богатый пролином белок палладин является связывающим партнером для профилина» . FEBS Дж . 273 (1): 26–33. DOI : 10.1111 / j.1742-4658.2005.05036.x . PMID 16367745 . S2CID 21207885 .
Ронти М.Дж., Лейвонен С.К., Хинц Б. и др. (2007). «Изоформа-специфическая регуляция актин-организующего белка палладина во время индуцированной TGF-бета1 дифференцировки миофибробластов» . J. Invest. Дерматол . 126 (11): 2387–96. DOI : 10.1038 / sj.jid.5700427 . PMID 16794588 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. DOI : 10,1038 / NBT1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Внешние ссылки [ править ]
палладин + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
vтеPDB галерея
2dm2 : Структура раствора первого ig домена палладина человека
2dm3 : Структура раствора второго ig домена палладина человека
