Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Панкреатическая рибонуклеаза
РНКаза A.png
Структура РНКазы А
Идентификаторы
Номер ЕС3.1.27.5
Количество CAS9001-99-4
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
BRENDABRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmigo / QuickGO
Поиск
ЧВКстатьи
PubMedстатьи
NCBIбелки
Панкреатическая рибонуклеаза
Идентификаторы
СимволРНКазаА
PfamPF00074
ИнтерПроIPR001427
УМНАЯSM00092
PROSITEPDOC00118
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры
PDBPDB : 11ba PDB : 11bg PDB : 1A2W PDB : 1a4y PDB : 1a5p PDB : 1a5q PDB : 1afk PDB : 1afl PDB : 1afu PDB : 1agi

Панкреатические рибонуклеазы ( EC 3.1.27.5 , РНКазы , РНКазы I , РНКазы А , панкреатической РНКазы , рибонуклеазы I , эндорибонуклеазу I , рибонуклеиновой фосфатазы , щелочной рибонуклеазы , рибонуклеазы , ген гликопротеина ев , Ceratitis capitata щелочной рибонуклеазы , SLSG гликопротеины , ген S локус-специфический гликопротеины , гликопротеины , ассоциированные с S-генотипом , рибонуклеат 3'-пиримидино-олигонуклеотидогидролаза )пиримидин- специфические эндонуклеазы, обнаруженные в большом количестве в поджелудочной железе некоторых млекопитающих и некоторых рептилий . [1]

В частности, ферменты участвуют в эндонуклеолитического расщепления 3'-phosphomono нуклеотидов и 3'-phosphooligonucleotides , заканчивающихся в СР или с 2' , 3'-циклических фосфорных промежуточных продуктов . Рибонуклеаза может раскручивать спираль РНК, образуя комплекс с одноцепочечной РНК; комплекс возникает в результате расширенного многосайтового катион-анионного взаимодействия между остатками лизина и аргинина фермента и фосфатными группами нуклеотидов.

Известные члены семьи [ править ]

Бычьей панкреатической рибонуклеазы является наиболее изученным членом семьи и служил в качестве модельной системы в работе , связанной с сворачивания белка , дисульфидных связей формирования, белковая кристаллография и спектроскопии и динамики белков . [2] Геном человека содержит 8 генов, которые имеют общую структуру и функцию с рибонуклеазой поджелудочной железы крупного рогатого скота, с 5 дополнительными псевдогенами. Такая структура и динамика этих ферментов связаны с их разнообразными биологическими функциями. [3]

Другие белки, принадлежащие к суперсемейству панкреатических рибонуклеаз, включают: рибонуклеазы семенных пузырьков крупного рогатого скота и мозга; несекреторные рибонуклеазы почек; [4] рибонуклеазы печеночного типа; [5] ангиогенин , который вызывает васкуляризацию нормальных и злокачественных тканей; эозинофильный катионный белок [6] цитотоксин и гельминтотоксин с рибонуклеазной активностью; и рибонуклеаза печени лягушки и лектин, связывающий сиаловую кислоту. Последовательность рибонуклеаз поджелудочной железы содержит четыре консервативных дисульфидных связи и три аминокислотных остатка, участвующих в каталитической активности. [7]

Гены человека [ править ]

Гены человека, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:

  • ANG ,
  • RNASE1 , RNASE10, RNASE12, RNASE2 , RNASE3 , RNASE4 , RNASE6 , RNASE7 и RNASE8.

Цитотоксичность [ править ]

Некоторые члены семейства рибонуклеаз поджелудочной железы обладают цитотоксическим действием. Клетки млекопитающих защищены от этих воздействий благодаря их чрезвычайно высокому сродству к ингибитору рибонуклеазы (RI), который защищает клеточную РНК от разрушения рибонуклеазами поджелудочной железы. [8] Рибонуклеазы поджелудочной железы, которые не ингибируются RI, примерно так же токсичны, как альфа-сарцин , дифтерийный токсин или рицин . [9]

Два панкреатические рибонуклеаз , выделенные из ооцитов в Северных леопардовых лягушках - amphinase и ranpirnase - не ингибируются RI и показать дифференциальную цитотоксичность против опухолевых клеток. [10] Ранпирназа изучалась в клиническом испытании фазы III как кандидат на лечение мезотелиомы , но испытание не продемонстрировало статистической значимости в отношении основных конечных точек. [11]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Бейнтема JJ, ван - дер - Лан JM (1986). «Сравнение структуры рибонуклеазы поджелудочной железы черепахи с таковой рибонуклеаз млекопитающих» . FEBS Lett . 194 (2): 338–343. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (86) 80113-2 . PMID  3940901 . S2CID  21907373 .
  2. ^ Marshall GR, Feng JA, Кюстер DJ (2008). «Назад в будущее: рибонуклеаза А» . Биополимеры . 90 (3): 259–77. DOI : 10.1002 / bip.20845 . PMID 17868092 . S2CID 2905312 .  
  3. ^ Нарайянан С, Бернарда Д.Н., Bafna К, Д Ганье, Chennubhotla CS, Доусет N, Агаруол ПК (март 2018). «Сохранение динамики, связанной с биологической функцией в суперсемействе ферментов» . Структура . 26 (3): 426–436. DOI : 10.1016 / j.str.2018.01.015 . PMC 5842143 . PMID 29478822 .  
  4. ^ Розенберг HF, Tenen DG, Аккерман SJ (1989). «Молекулярное клонирование нейротоксина человеческого эозинофила: члена семейства генов рибонуклеазы» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 86 (12): 4460–4464. DOI : 10.1073 / pnas.86.12.4460 . PMC 287289 . PMID 2734298 .  
  5. ^ Hofsteenge Дж, Matthies R, камень SR (1989). «Первичная структура рибонуклеазы из печени свиньи, нового члена надсемейства рибонуклеаз». Биохимия . 28 (25): 9806–9813. DOI : 10.1021 / bi00451a040 . PMID 2611266 . 
  6. ^ Розенберг HF, Аккерман SJ, Tenen DG (1989). «Катионный белок эозинофила человека. Молекулярное клонирование цитотоксина и гельминтотоксина с рибонуклеазной активностью» . J. Exp. Med . 170 (1): 163–176. DOI : 10,1084 / jem.170.1.163 . PMC 2189377 . PMID 2473157 .  
  7. Перейти ↑ Raines RT (1998). «Рибонуклеаза А». Chem. Ред . 98 (3): 1045–1066. DOI : 10.1021 / cr960427h . PMID 11848924 . 
  8. ^ Gaur, D; Сваминатан, S; Батра, JK (6 июля 2001 г.). «Взаимодействие рибонуклеазы поджелудочной железы человека с ингибитором рибонуклеазы человека. Создание цитотоксических вариантов, устойчивых к ингибиторам» . Журнал биологической химии . 276 (27): 24978–84. DOI : 10,1074 / jbc.m102440200 . PMID 11342552 . 
  9. ^ Саксена, SK; Рыбак С.М.; Винклер, G; Мид, HM; McGray, P; Youle, RJ; Акерман, EJ (5 ноября 1991 г.). «Сравнение РНКаз и токсинов при инъекции в ооциты Xenopus». Журнал биологической химии . 266 (31): 21208–14. PMID 1939163 . 
  10. Перейти ↑ Lee JE, Raines RT (2008). «Рибонуклеазы как новые химиотерапевтические средства: пример ранпирназы» . BioDrugs . 22 (1): 53–58. DOI : 10.2165 / 00063030-200822010-00006 . PMC 2802594 . PMID 18215091 .  
  11. ^ "Годовой отчет Alfacell 2009" (PDF) . Дата обращения 2 февраля 2015 .
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001427