Paraburkholderia - это род Proteobacteria, которые представляют собой грамотрицательные , слегка изогнутые палочки , подвижные посредством жгутиков . Сообщалось, что они колонизируют эндофитные ткани гибридной ели ( Picea glauca x engelmannii ) и сосны ложняковой с сильным потенциалом для осуществления биологической фиксации азота и стимулирования роста растений. [1] [2] [3] В отличие отвидов Burkholderia , представители Paraburkholderia обычно не связаны с инфекцией человека. Парабурхольдериячлены образуют монофилетическую кладу в пределах семейства Burkholderiaceae , что и побудило их выделить как род, независимый от видов Burkholderia , в сочетании с обнаружением надежных сохраненных сигнатурных инделей, которые уникальны для видов Paraburkholderia и отсутствуют у представителей рода Burkholderia. . [4] Эти CSI отличают этот род от всех других бактерий. Кроме того, CSI, которые, как было установлено, являются общими для видов Burkholderia , отсутствуют у Paraburkholderia , что свидетельствует об отдельных линиях. [5]
Парабурхольдерия | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Протеобактерии |
Класс: | Бетапротеобактерии |
Заказ: | Burkholderiales |
Семья: | Burkholderiaceae |
Род: | Paraburkholderia Sawana et al . 2014 г. |
Сохранившиеся сигнатурные индели также были обнаружены в пределах рода Paraburkholderia . [4] Эти CSI проводятся параллельно с филогеномным анализом, который указывает на две монофилетические клады в пределах рода; в одной кладе обитают безымянные и Candidatus Paraburkholderia, в то время как в другой клады входят экологические Paraburkholderia , обычно используемые в сельскохозяйственных целях. [6] CSI были обнаружены исключительно для каждой из этих клад и не были обнаружены специфическими для какой-либо другой комбинации видов Paraburkholderia , обеспечивая дополнительный уровень филогенетического разрешения на уровне рода. [4] [5]
Разновидность
Paraburkholderia включает следующие виды: [4] [7]
- Paraburkholderia atlantica [8]
- Paraburkholderia acidipaludis
- Paraburkholderia aromaticivorans
- Paraburkholderia aspalathi
- Paraburkholderia azotifigens
- Paraburkholderia bannensis
- Paraburkholderia bryophila
- Paraburkholderia caballeronis
- Paraburkholderia caffeinilytica
- Paraburkholderia caledonica
- Paraburkholderia caribensis
- Paraburkholderia caryophylli
- Paraburkholderia denitrificans
- Paraburkholderia diazotrophica
- Paraburkholderia dilworthii
- Paraburkholderia dipogonis
- Paraburkholderia eburnea
- Paraburkholderia elongata [9]
- Paraburkholderia endofungorum
- Paraburkholderia ferrariae
- Paraburkholderia franconis [8]
- Парабуркхолдерия грибовидная
- Paraburkholderia ginsengisoli
- Paraburkholderia ginsengiterrae
- Paraburkholderia graminis
- Paraburkholderia guartelaensis [10]
- Paraburkholderia heleia
- Paraburkholderia hiiakae
- Paraburkholderia Hospita
- Paraburkholderia humisilvae
- Paraburkholderia jirisanensis
- Paraburkholderia kirstenboschensis
- Paraburkholderia insulsa
- Paraburkholderia kururiensis
- Paraburkholderia madseniana [11]
- Paraburkholderia megapolitana
- Paraburkholderia Metalliresistens
- Paraburkholderia metrosideri
- Paraburkholderia mimosarum
- Paraburkholderia monticola
- Paraburkholderia nodosa
- Paraburkholderia oxyphila
- Paraburkholderia pallidirosea
- Paraburkholderia paradisi
- Paraburkholderia peleae
- Paraburkholderia phenazinium
- Paraburkholderia phenoliruptrix
- Paraburkholderia phymatum
- Paraburkholderia phytofirmans
- Paraburkholderia piptadeniae
- Paraburkholderia rhizosphaerae
- Paraburkholderia rhizoxinica
- Paraburkholderia rhynchosiae
- Paraburkholderia ribeironis
- Paraburkholderia sabiae
- Paraburkholderia sacchari
- Paraburkholderia sartisoli
- Paraburkholderia sediminicola
- Paraburkholderia silvatlantica
- Paraburkholderia soli
- Paraburkholderia solisilvae
- Paraburkholderia solitsugae [12]
- Paraburkholderia sprentiae
- Paraburkholderia steynii [13]
- Paraburkholderia strydomiana [13]
- Paraburkholderia susongensis
- Парабурхолдерия симбиотическая
- Paraburkholderia terrae
- Paraburkholderia terricola
- Paraburkholderia tropica
- Paraburkholderia tuberum
- Paraburkholderia unamae
- Paraburkholderia xenovorans
- Paraburkholderia youngii [14]
Рекомендации
- ^ Пури, Padda КП, Chanway CP (2020-01-01). «Могут ли естественные эндофитные азотфиксирующие бактерии гибридной белой ели поддерживать рост бореальных лесных деревьев на почвах, крайне бедных питательными веществами?» . Биология и биохимия почвы . 140 : 107642. DOI : 10.1016 / j.soilbio.2019.107642 . ISSN 0038-0717 .
- ^ Пури А., Падда КП, Чануэй КП (2018-12-15). «Доказательства наличия эндофитных диазотрофных бактерий в лесной сосне и гибридных деревьях белой ели, растущих на почвах с различным питательным статусом в регионе Западный Чилкотин в Британской Колумбии, Канада». Экология и управление лесами . 430 : 558–565. DOI : 10.1016 / j.foreco.2018.08.049 . ISSN 0378-1127 .
- ^ Пури А., Падда КП, Чануэй КП (26 августа 2020 г.). «Поддержание роста деревьев сосны в почвенных условиях с ограничением питательных веществ с помощью полезных для растений бактерий» . PLOS ONE . 15 (8): e0238055. DOI : 10.1371 / journal.pone.0238055 . PMC 7449467 . PMID 32845898 .
- ^ а б в г Савана А, Адеолу М., Гупта Р.С. (2014). «Молекулярные сигнатуры и филогеномный анализ рода Burkholderia: предложение о разделении этого рода на измененный род Burkholderia, содержащий патогенные организмы, и новый род Paraburkholderia gen. Nov., Укрывающий экологические виды» . Границы генетики . 5 : 429. DOI : 10,3389 / fgene.2014.00429 . PMC 4271702 . PMID 25566316 .
- ^ а б Гупта Р.С. (июль 2016 г.). «Влияние геномики на понимание эволюции и классификации микробов: важность взглядов Дарвина на классификацию» . FEMS Microbiology Reviews . 40 (4): 520–53. DOI : 10.1093 / femsre / fuw011 . PMID 27279642 .
- ^ Эстрада-де-лос-Сантос П., Винуеса П., Мартинес-Агилар Л., Хирш А.М., Кабальеро-Мелладо Дж. (Июль 2013 г.). «Филогенетический анализ видов буркхолдерий методом анализа мультилокусных последовательностей». Современная микробиология . 67 (1): 51–60. DOI : 10.1007 / s00284-013-0330-9 . PMID 23404651 . S2CID 14190412 .
- ^ Орен А., генеральный менеджер Гаррити (сентябрь 2017 г.). «Список новых имен и новых комбинаций, ранее эффективно, но не действительно опубликованных» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 67 (9): 3140–3143. DOI : 10.1099 / ijs.0.000317 . PMC 5817221 . PMID 28891789 .
- ^ а б Paulitsch F, Dall'Agnol RF, Delamuta JR, Ribeiro RA, da Silva Batista JS, Hungria M (2020). « Paraburkholderia atlantica sp. Nov. И Paraburkholderia franconis sp. Nov., Два новых азотфиксирующих клубеньковых вида, выделенные из почв атлантических лесов в Бразилии» . Arch Microbiol . 202 (6): 1369–1380. DOI : 10.1007 / s00203-020-01843-ш . PMID 32166359 . S2CID 212682253 .
- ^ Вильгельм Р.К., Сайл К.Т., Мартинес К.Э., Карас, округ Колумбия, Ньюман Д.Д., Бакли Д.Х. (август 2020 г.). «Paraburkholderia solitsugae sp. Nov. И Paraburkholderia elongata sp. Nov., Бактерии, разлагающие фенольную кислоту, выделенные из лесной почвы и исправленное описание Paraburkholderia madseniana» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (9): 5093–5105. DOI : 10.1099 / ijsem.0.004387 . PMID 32809929 .
- ^ Паулич Ф., Фузинатто Далл'Аньол Р., Марсон Деламута-младший, Аугусто Рибейро Р., да Силва Батиста Дж. С., Хунгрия М. (2019). « Paraburkholderia guartelaensis sp. Nov., Азотфиксирующий вид, выделенный из клубеньков Mimosa gymnas в экотоне, который считается горячей точкой биоразнообразия в Бразилии» . Arch Microbiol . 201 (10): 1435–1446. DOI : 10.1007 / s00203-019-01714-Z . PMID 31428824 . S2CID 201058116 .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Вильгельм Р.К., Мерфи С.Дж., Ферианск Н.М., Карас Д.К., Дерито С.М., Ньюман Д.Д., Бакли Д.Х. (март 2020 г.). «Paraburkholderia madseniana sp. Nov., Бактерия, разлагающая фенольную кислоту, выделенная из кислой лесной почвы» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (3): 2137–2146. DOI : 10.1099 / ijsem.0.004029 . PMID 32027304 .
- ^ Вильгельм Р.К., Сайл К.Т., Мартинес К.Э., Карас, округ Колумбия, Ньюман Д.Д., Бакли Д.Х. (август 2020 г.). «Paraburkholderia solitsugae sp. Nov. И Paraburkholderia elongata sp. Nov., Бактерии, разлагающие фенольную кислоту, выделенные из лесной почвы и исправленное описание Paraburkholderia madseniana» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (9): 5093–5105. DOI : 10.1099 / ijsem.0.004387 . PMID 32809929 .
- ^ а б Beukes CW, Steenkamp ET, van Zyl E, Avontuur J, Chan WY, Hassen AI и др. (Сентябрь 2019 г.). " Paraburkholderia strydomiana sp. Nov. И Paraburkholderia steynii sp. Nov .: Ризобиальные симбионты бобового растения Hypocalyptus sophoroides ". Антони ван Левенгук . 112 (9): 1369–1385. DOI : 10.1007 / s10482-019-01269-5 . PMID 31053961 . S2CID 143432118 .
- ^ Мавима Л., Беукес С. В., Палмер М., Де Мейер С. Е., Джеймс Е. К., Малук М., Гросс Е., Буэно-дос-Рейс Ф, Авонтуур Д. Р., Чан В. Ю., Вентер С. Н., Стинкамп ИТ (2020). « Paraburkholderia youngii sp. Nov. И ' Paraburkholderia atlantica ' - бразильские и мексиканские ризобии, ассоциированные с мимозой, которые ранее были известны как Paraburkholderia tuberum sv. Mimosae » . Syst Appl Microbiol . DOI : 10.1016 / j.syapm.2020.126152 . PMID 33276286 .