Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Паркин представляет собой убиквитинлигазу E3 с 465 остатками, которая играет важную роль в убиквитинировании - процессе, посредством которого молекулы ковалентно метятся убиквитином (Ub) и направляются на деградацию в протеасомах или лизосомах . Убиквитинирование включает последовательное действие трех ферментов. Во-первых, фермент, активирующий убиквитин E1, связывается с неактивным Ub в эукариотических клетках через тиоэфирную связь и мобилизует его в АТФ-зависимом процессе. Затем Ub переносится на фермент , конъюгирующий с убиквитином E2, прежде чем он будет конъюгирован с целевым белком через E3убиквитинлигаза . [5] Существует множество лигаз E3, которые различаются по структуре и субстратной специфичности, что позволяет избирательно нацеливать белки на внутриклеточную деградацию.

В частности, паркин распознает белки на внешней мембране митохондрий при клеточном поражении и опосредует очищение поврежденных митохондрий посредством аутофагии и протеасомных механизмов. [6] Паркин также увеличивает выживаемость клеток, подавляя как митохондриально-зависимый, так и независимый апоптоз . Мутации связаны с дисфункцией митохондрий, что приводит к гибели нейронов при болезни Паркинсона [7] и аберрантному метаболизму при онкогенезе . [8]

Структура [ править ]

Паркин является белком , который в организме человека кодируется PARK2 геном . [9] [10] Точная функция этого белка неизвестна; однако белок является компонентом мультипротеинового комплекса убиквитин-лигаза E3, который, в свою очередь, является частью убиквитин-протеасомной системы, которая обеспечивает нацеливание белков на деградацию . [ необходима цитата ] Известно, что мутации в этом гене вызывают семейную форму болезни Паркинсона, известную как аутосомно-рецессивная ювенильная болезнь Паркинсона (AR-JP). Более того, описано, что паркин необходим для митофагии (аутофагии митохондрий).

Однако неясно , как потеря функции белка паркина приводит к гибели дофаминергических клеток при этом заболевании. Преобладающая гипотеза состоит в том, что паркин помогает расщеплять один или несколько белков, токсичных для дофаминергических нейронов. [ необходима цитата ] Предполагаемые субстраты паркина включают синфилин-1 , CDC-rel1, циклин E , тРНК-синтазу p38, Pael-R , синаптотагмин XI, sp22 и сам паркин (см. также убиквитинлигазу ). Кроме того, Паркин содержит С-концевой мотив, который связывает домены PDZ.. Было показано, что паркин связывается PDZ-зависимым образом с доменом PDZ, содержащим белки CASK и PICK1 .

A. Принципиальная схема, показывающая расположение функциональных доменов паркина B. Мультяшное изображение паркина в его аутоингибированном состоянии с каталитическим цистеином в RING2, закрытым RING0, в то время как линкер Ubl и REP предотвращает связывание E2 с RING1. RING0, RING1, IBR и RING2 каждый координируют два иона Zn (приблизительное расположение обозначено серыми кружками) для структурной стабильности, что приводит к стехиометрии 8 Zn2 + / паркин.

Подобно другим членам семейства лигаз E3 RING-between-RING (RBR), паркин обладает двумя доменами RING-finger и областью между RING (IBR). RING1 образует сайт связывания для Ub-конъюгированного фермента E2, в то время как RING2 содержит каталитический остаток цистеина (Cys431), который отщепляет Ub от E2 и временно связывает его с E3 через тиоэфирную связь. [6] Переносу Ub помогают соседние остатки гистидина His433, который принимает протон от Cys431 для его активации, и глутамат Glu444, который участвует в автоубиквитинировании. [11] Вместе они образуют каталитическую триаду , сборка которой необходима для активации паркина. [12]Паркин также содержит N-концевой Ub-подобный домен (Ubl) для распознавания специфического субстрата , уникальный домен RING0 и область репрессора (REP), которая тонически подавляет активность лигазы.

В условиях покоя плотно свернутая конформация паркина делает его неактивным, поскольку доступ к каталитическому остатку RING2 стерически блокируется RING0, в то время как связывающий домен E2 на RING1 блокируется Ubl и REP. [6] Активация стимулов нарушает эти междоменные взаимодействия и вызывает коллапс паркина вдоль интерфейса RING1-RING0. [12] Активный сайт RING2 направлен к E2-Ub, связанному с RING1, облегчая образование промежуточного Ub-тиоэфира. Активация Паркин требует фосфорилирование из серина Ser65 в UBL по серин / треонин киназа , PINK1 . Добавление заряженного фосфата дестабилизируетгидрофобные взаимодействия между Ubl и соседними подобластями, снижающие аутоингибиторные эффекты этого N-концевого домена. [13] Было обнаружено, что миссенс-мутации Ser65Ala устраняют связывание Ub-паркина, в то же время ингибируя рекрутирование паркина в поврежденные митохондрии. [14] PINK1 также фосфорилирует Ub по Ser65, ускоряя его выделение из E2 и увеличивая его сродство к паркину. [13]

Хотя структурные изменения после фосфорилирования не определены, кристаллизация паркина выявила катионный карман в RING0, образованный остатками лизина и аргинина Lys161, Arg163 и Lys211, который формирует предполагаемый сайт связывания фосфата. [15] Принимая во внимание, что RING0 является уникальным для паркина и что его гидрофобный интерфейс с RING1 закапывает Cys431 в неактивном паркине, [14] нацеливание фосфорилированных Ub и / или Ubl на эту связывающую нишу может быть критическим для разрушения аутоингибиторных комплексов во время активации паркина.

Функция [ править ]

Митофагия [ править ]

Паркин играет решающую роль в митофагии и очищении от активных форм кислорода . [16] Митофагия - это устранение поврежденных митохондрий в аутофагосомах и зависит от цикла положительной обратной связи, включающего синергетическое действие паркина и PINK1. После тяжелого клеточного поражения снижение потенциала митохондриальной мембраны предотвращает импорт PINK1 в митохондриальный матрикс и вызывает его агрегацию на внешней митохондриальной мембране (OMM). [17] Паркин рекрутируется в митохондрии после деполяризации.и фосфорилируется PINK1, который одновременно фосфорилирует Ub, предварительно конъюгированный с белками митохондриальной мембраны. Фосфорилирование PINK1 и Ub облегчает активацию паркина и дальнейшую сборку моно- и поли-Ub цепей. [13] Учитывая близость этих цепей к PINK1, дальнейшее фосфорилирование Ub по Ser65 вероятно, усиливая мобилизацию паркина и убиквитинирование субстрата в самоусиливающемся цикле . [6]

Субстраты паркина включают митофузины Mfn1 и Mfn2, которые представляют собой большие ГТФазы, которые способствуют слиянию митохондрий в динамические тубулярные комплексы, которые максимизируют эффективность окислительного фосфорилирования . [18] Однако при повреждении митохондрий необходимо разрушение слитых белков, чтобы отделить их от сети посредством деления митохондрий и предотвратить повреждение здоровых митохондрий. [19] Следовательно, паркин необходим перед митофагией, так как он убихинирует Mfn1 / 2, маркируя его для протеасомной деградации. Протеомные исследования выявили дополнительные белки OMM в качестве субстратов паркина, включая белок деления FIS, его адаптер TBC1D15 и транслоказу. TOMM20 и TOMM70, которые облегчают перемещение белков, таких как PINK1, через OMM. [20] Miro (или RHOT1 / RHOT2 ) является белком OMM, критически важным для транспорта аксонов , и может быть убиквитинирован и нацелен на протеасомную деградацию паркином. [21] Распад Miro вызывает заметное снижение миграции скомпрометированных митохондрий по аксонам нейронов гиппокампа мышей , [22] усиливая важность паркина в отделении дефектных митохондрий от их функционирующих аналогов и ограничивая пространственное распространение митохондриальной дисфункции до аутофагии.

Во время митофагии паркин нацелен на VDAC1 , потенциал-управляемый анионный канал, который претерпевает конформационные изменения при деполяризации митохондриальной мембраны, открывая цитозольный домен для убиквитинирования. [17] Подавление экспрессии VDAC1 в клетках HeLa значительно снижает рекрутирование паркина в деполяризованные митохондрии и их последующий клиренс, [23] подчеркивая критическую роль VDAC1 как селективного маркера повреждения митохондрий и инициатора митофагии. После конъюгации Ub паркин рекрутирует рецепторы аутофагии, такие как p62, TAX1BP1 и CALCOCO2 , облегчая сборку аутофагосом, которые переваривают дефектные митохондрии. [20]

Выживание клеток [ править ]

Посредством активации передачи сигналов NF-κB паркин увеличивает выживаемость и защищает клетки от вызванного стрессом апоптоза. При клеточном поражении паркин активирует каталитическую субъединицу HOIP другой лигазы E3 LUBAC. HOIP запускает сборку линейных Ub- полимеров на эссенциальном модуляторе NF-κB (NEMO), усиливая транскрипцию митохондриальной GTPase OPA1 . [24] Повышенная трансляция OPA1 поддерживает структуру крист и снижает высвобождение цитохрома С из митохондрий, ингибируя апоптоз, опосредованный каспазой . Важно отметить, что паркин активизирует HOIP с большей эффективностью.чем другие факторы, связанные с LUBAC, HOIL-1 и Sharpin [25], это означает, что мобилизация паркина значительно повышает устойчивость к умеренным стрессорам .

Паркин обладает аффинностью связывания ДНК и вызывает дозозависимое снижение транскрипции и активности проапоптотического фактора р53 . Трансфекция из p53 промотора с усеченными версиями паркина в SH-SY5Y нейронов показало , что Parkin непосредственно связывается с p53 промотора через его RING1 домена. [26] И наоборот, паркин может быть мишенью транскрипции p53 в клетках легких H460, где он опосредует супрессорное действие p53 опухоли . [8] Учитывая его роль в митохондриальном гомеостазе , паркин помогает р53 поддерживать митохондриальное дыхание , ограничивая при этом поглощение глюкозы и производство лактата , тем самым предотвращая проявление эффекта Варбурга во время онкогенеза. [27] Паркин дополнительно повышает уровень цитозольного глутатиона и защищает от окислительного стресса , характеризуя его как критический опухолевый супрессор с антигликолитическими и антиоксидантными свойствами. [8]

Клиническое значение [ править ]

Болезнь Паркинсона [ править ]

PARK2 ( OMIM * 602544 ) - это ген паркина, который может вызывать форму аутосомно-рецессивной ювенильной болезни Паркинсона ( OMIM 600116 ) из-за мутации в белке паркина. Эта форма генетической мутации может быть одной из наиболее распространенных известных генетических причин раннего начала болезни Паркинсона . В одном исследовании пациентов с началом болезни Паркинсона до 40 лет (10% всех пациентов с БП) 18% имели мутации паркина, а 5% - гомозиготные мутации. [28] Пациенты с аутосомно-рецессивным семейным анамнезом паркинсонизма с гораздо большей вероятностью несут мутации паркина, если возраст начала заболевания меньше 20 лет (80% против 28% с началом заболевания старше 40 лет). [29]

У пациентов с мутациями паркина (PARK2) тельца Леви отсутствуют . У таких пациентов развивается синдром, очень напоминающий спорадическую форму БП; однако у них, как правило, появляются симптомы в гораздо более молодом возрасте. У людей мутации с потерей функции в гене паркина PARK2 участвуют в 50% наследственных и 15% спорадических форм болезни Паркинсона (БП) с ювенильным началом . [16] Хотя БП традиционно рассматривается как нейродегенеративное состояние с поздним началом, характеризующееся обогащенными альфа-синуклеином тельцами Леви , аутосомно-рецессивнымБП, вызванная мутациями паркина, часто возникает рано и не имеет убиквитинированных белковых отложений, патогномоничных для спорадической БП. [21] Паркин-мутант ПД может также включать потерю норадренергических нейронов в голубом пятне наряду с отличительным признаком дегенерации дофаминергических нейронов в черной субстанции Парс компактов (SNPC). [30] Тем не менее, его симптомы напоминают симптомы идиопатического БП, у пациентов наблюдаются тремор в покое , постуральная нестабильность и брадикинезия . [7]

В то время как митохондрии необходимы для генерации АТФ в любой эукариотической клетке , катехоламинергические нейроны особенно зависят от своей правильной функции для очистки от активных форм кислорода, продуцируемых метаболизмом дофамина, и для обеспечения высоких энергетических потребностей синтеза катехоламинов. [17] Их восприимчивость к окислительному повреждению и метаболическому стрессу делает катехоламинергические нейроны уязвимыми к нейротоксичности, связанной с аберрантной регуляцией митохондриальной активности, что, как предполагается, происходит как при наследственной, так и при идиопатической БП. Например, повышенный окислительный стресс в нейронах, скелетных мышцах и тромбоцитах , соответствующий пониженной активности комплекса Iв цепи переноса электронов были обнаружены у пациентов с БП [31], в то время как делеции в митохондриальном геноме были обнаружены в SNpc. [32]

В соответствии с его важной ролью в контроле качества митохондрий, более 120 патогенных мутаций, вызывающих PD, были охарактеризованы на паркине. [6] Такие мутации могут быть наследственными или стохастическими и связаны со структурной нестабильностью, сниженной каталитической эффективностью и аберрантным связыванием субстрата и убиквитинированием. [7] Мутации обычно можно разделить на три группы в зависимости от их местоположения. Во-первых, кластеры вокруг Zn-координирующих остатков на RING и IBR могут нарушить структурную целостность и ухудшить катализ . [12] Второй класс мутаций, включая Thr240Arg, влияет на остатки внутри и вокруг сайта связывания E2 и изменяет аутоингибирование RING1 посредством REP. [33]Наконец, мутации Cys431Phe и Gly430Asp нарушают активность лигазы в каталитическом сайте и значительно снижают функцию паркина. [6]

Открытие множества немитохондриальных субстратов паркина усиливает важность паркина в гомеостазе нейронов, помимо его роли в регуляции митохондрий. Мощные нейропротекторные способности паркина ослаблять дофаминергическую нейротоксичность, набухание митохондрий и эксайтотоксичность были продемонстрированы на культурах клеток, сверхэкспрессирующих паркин [7], хотя существование таких механизмов на физиологических уровнях паркина in vivo еще не подтверждено. Другой субстрат паркина, синфилин-1 (кодируемый SNCAIP ), представляет собой взаимодействующий с альфа-синуклеином белок, который обогащен в ядре телец Леви и убиквитинируется паркином способом, устраняемым семейными PD-ассоциированными мутациями. [34]Паркин может способствовать агрегации альфа-синуклеина и синфилина-1 в тельца Леви, которые конъюгированы с Lys63-связанными поли-Ub цепями и направлены на аутофагическую деградацию. [35] Таким образом, мутации паркина подавляют этот механизм, что приводит к токсическому накоплению растворимых белков, что приводит к перегрузке протеасомы. Агрегация белков вызывает нейрональную токсичность, что объясняет отсутствие убиквитинированных телец Леви при паркин-мутантном БП. Точно так же, родное Parkin уменьшает гибель SH-SY5Y нейроны ubiquitinating другие компоненты LEWY тела, такие как р38 субъединицы аминоацил-тРНК - синтетазы комплекс [36] , и далеко вверх по течению элемент-связывающий белок 1 [37]путем добавления Lys48-связанных цепей поли-Ub и направления их на протеасомную деградацию. Паркин также влияет на транспорт аксонов и слияние везикул посредством убиквитинирования тубулина и синаптотагмина XI ( SYT11 ) соответственно, придавая ему модулирующую роль в функции синапсов . [7]

Наконец, паркин защищает дофаминергические нейроны от цитотоксичности, индуцированной PD-миметиком 6-OHDA , опосредованной подавлением экспрессии нейронального p53 и его последующей активацией апоптотического каскада. [26] Несколько PD-ассоциированных мутаций паркина локализованы в RING1 и могут нарушать его способность связывать и подавлять промотор p53 , что приводит к усилению экспрессии p53. [38] Паркин-мутантные пациенты PD также демонстрирует четырехкратный повышение в р53 иммунореактивности , [26] инсинуируя , что выход из строя паркин-опосредованного апоптоза анти-может быть вовлечен в этиологии PD.

Опухоль [ править ]

В соответствии с мощными противоопухолевыми способностями паркина отрицательные мутации и делеции были зарегистрированы в различных опухолях. Например, количество копий PARK2 было снижено в 85% образцов глиобластомы, в то время как рак легких был связан с гетерозиготной делецией PARK2 в локусе 6q25-q27. [39] Дефицит паркина дополнительно снижает выживаемость без заболевания у мышей, облученных инфракрасным излучением, без увеличения заболеваемости опухолями , предполагая, что дефицит паркина увеличивает восприимчивость к опухолевым событиям, а не инициирует образование опухоли. [8] Точно так же хромосомные разрывы в PARK2.подавляет экспрессию каркасного белка афадина при раке молочной железы , тем самым нарушая целостность эпителия , увеличивая метастатический потенциал и ухудшая общий прогноз . [40] Гаплонедостаточная экспрессия PARK2 , обусловленная уменьшением числа копий или гиперметилированием ДНК , была дополнительно обнаружена при спонтанном колоректальном раке, где она ускоряла все стадии развития аденомы кишечника на моделях мышей. [41] Таким образом, паркин является мощным модулятором опухолевой прогрессии, не вызывая непосредственно онкогенеза.

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что паркин (лигаза) взаимодействует с:

  • Альфа-синуклеин , [42] [43]
  • КАСКА , [44]
  • CUL1 , [45]
  • FBXW7 [45] и
  • GPR37 , [46] [47]
  • HSPA1A , [46]
  • HSPA8 , [46]
  • Вспомогательный компонент мультисинтетазного комплекса р38 , [48]
  • PDCD2 , [49]
  • 5 СЕНТЯБРЯ , [50] [51]
  • SNCAIP , [34]
  • STUB1 , [46]
  • SYT11 , [52] и
  • Ubiquitin C . [43] [53]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000185345 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023826 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Pickart CM, Eddins MJ (ноябрь 2004). «Убиквитин: структуры, функции, механизмы». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток . 1695 (1–3): 55–72. DOI : 10.1016 / j.bbamcr.2004.09.019 . PMID 15571809 . 
  6. ^ Б с д е е Seirafi М, Козлы G, Геринг K (июнь 2015). «Структура и функции Паркина» . Журнал FEBS . 282 (11): 2076–88. DOI : 10.1111 / febs.13249 . PMC 4672691 . PMID 25712550 .  
  7. ^ а б в г д Доусон TM , Доусон В.Л. (2014). «Роль паркина в семейной и спорадической болезни Паркинсона» . Расстройства движения . 25 (Дополнение 1): S32-9. DOI : 10.1002 / mds.22798 . PMC 4115293 . PMID 20187240 .  
  8. ^ а б в г Чжан С., Линь М., Ву Р., Ван Х, Ян Б., Левин А.Дж., Ху В., Фэн З. (2011). «Паркин, ген-мишень p53, опосредует роль p53 в метаболизме глюкозы и эффекте Варбурга» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (39): 16259–64. Bibcode : 2011PNAS..10816259Z . DOI : 10.1073 / pnas.1113884108 . PMC 3182683 . PMID 21930938 .  
  9. ^ Kitada Т, S Asakawa, Хаттори Н, Matsumine Н, Ямамура Y, Minoshima S, Yokochi М, Mizuno Y, Shimizu N (апрель 1998 г.). «Мутации в гене паркина вызывают аутосомно-рецессивный ювенильный паркинсонизм». Природа . 392 (6676): 605–8. Bibcode : 1998Natur.392..605K . DOI : 10,1038 / 33416 . PMID 9560156 . S2CID 4432261 .  
  10. ^ Matsumine Н, Ямамура Y, Хаттори Н, Кобаяши Т, Т Kitada, Yoritaka А, Mizuno Y (апрель 1998 г.). «Микроделеция D6S305 в семье аутосомно-рецессивного ювенильного паркинсонизма (PARK2)». Геномика . 49 (1): 143–6. DOI : 10.1006 / geno.1997.5196 . PMID 9570960 . 
  11. ^ Trempe ДФ, Sauvé В, Гренир К, Seirafi М, Тан МОИ, Ménade М, Аль-Абдул-Вахид S, Krett Дж, Вонг К, Козлов О, Нагар Б, ФОН Е.А., Геринг К (июнь 2013 г. ). «Структура паркина раскрывает механизмы активации убиквитинлигазы». Наука . 340 (6139): 1451–5. Bibcode : 2013Sci ... 340.1451T . DOI : 10.1126 / science.1237908 . PMID 23661642 . S2CID 206548928 .  
  12. ^ a b c Riley BE, Lougheed JC, Callaway K, Velasquez M, Brecht E, Nguyen L, Shaler T, Walker D, Yang Y, Regnstrom K, Diep L, Zhang Z, Chiou S, Bova M, Artis DR, Yao Н., Бейкер Дж, Йеднок Т., Джонстон Дж. А. (2013). «Структура и функция убиквитинлигазы Паркин E3 раскрывают аспекты лигаз RING и HECT» . Nature Communications . 4 : 1982. Bibcode : 2013NatCo ... 4.1982R . DOI : 10.1038 / ncomms2982 . PMC 3709503 . PMID 23770887 .  
  13. ^ a b c Кояно Ф, Окатсу К., Косако Х, Тамура Й, Го Е, Кимура М, Кимура Й, Цучия Х, Йошихара Х, Хирокава Т, Эндо Т, Фон EA, Тремпе Дж. Ф., Саэки Й, Танака К., Мацуда N (июнь 2014 г.). «Убиквитин фосфорилируется PINK1 для активации паркина». Природа . 510 (7503): 162–6. Bibcode : 2014Natur.510..162K . DOI : 10,1038 / природа13392 . PMID 24784582 . S2CID 4390259 .  
  14. ^ а б Игучи М., Кудзюро Ю., Окацу К., Кояно Ф., Косако Х., Кимура М., Сузуки Н., Учияма С., Танака К., Мацуда Н. (июль 2013 г.). «Катализируемый паркином перенос убиквитин-сложный эфир запускается PINK1-зависимым фосфорилированием» . Журнал биологической химии . 288 (30): 22019–32. DOI : 10.1074 / jbc.M113.467530 . PMC 3724655 . PMID 23754282 .  
  15. ^ Wauer T, командер D (июль 2013). «Структура домена лигазы паркина человека в аутоингибированном состоянии» . Журнал EMBO . 32 (15): 2099–112. DOI : 10.1038 / emboj.2013.125 . PMC 3730226 . PMID 23727886 .  
  16. ^ a b Ольшевская, Диана Анжелика; Линч, Тим (2015). «Поможет ли Кристал Паркин понять будущее болезни Паркинсона?» . Границы неврологии . 6 : 35. DOI : 10,3389 / fneur.2015.00035 . PMC 4338761 . PMID 25759682 .  
  17. ^ a b c Durcan TM, Fon EA (май 2015 г.). «Три« П »митофагии: PARKIN, PINK1 и посттрансляционные модификации» . Гены и развитие . 29 (10): 989–99. DOI : 10,1101 / gad.262758.115 . PMC 4441056 . PMID 25995186 .  
  18. ^ Youle RJ, ван дер Bliek AM (август 2012). «Митохондриальное деление, слияние и стресс» . Наука . 337 (6098): 1062–5. Bibcode : 2012Sci ... 337.1062Y . DOI : 10.1126 / science.1219855 . PMC 4762028 . PMID 22936770 .  
  19. ^ Туиг G, Elorza А, Молина AJ, Мохамед Н, Викстрем JD, Уолцер G, Stiles л, Хэйг С.Е., Кац S, Лас - G, Алрой Дж, Ву М, Py Б. Ф., Юань Дж, Deeney JT, Corkey ВЕ, Shirihai ОС (январь 2008 г.). «Деление и селективное слияние управляют сегрегацией и удалением митохондрий посредством аутофагии» . Журнал EMBO . 27 (2): 433–46. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601963 . PMC 2234339 . PMID 18200046 .  
  20. ^ a b Сарраф С.А., Раман М., Гуарани-Перейра В., Сова М.Э., Хаттлин Е.Л., Гайги С.П., Харпер Дж. В. (апрель 2013 г.). «Пейзаж PARKIN-зависимого убиквитилома в ответ на митохондриальную деполяризацию» . Природа . 496 (7445): 372–6. Bibcode : 2013Natur.496..372S . DOI : 10,1038 / природа12043 . PMC 3641819 . PMID 23503661 .  
  21. ^ a b Нарендра Д., Уокер Дж. Э., Юл Р. (ноябрь 2012 г.). «Контроль качества митохондрий, опосредованный PINK1 и Паркин: ссылки на паркинсонизм» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 4 (11): a011338. DOI : 10.1101 / cshperspect.a011338 . PMC 3536340 . PMID 23125018 .  
  22. ^ Shlevkov Е, Т Крамер, Schapansky Дж, Lavoie МДж, Шварц TL (октябрь 2016). «Сайты фосфорилирования миро регулируют рекрутирование паркина и подвижность митохондрий» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (41): E6097 – E6106. DOI : 10.1073 / pnas.1612283113 . PMC 5068282 . PMID 27679849 .  
  23. ^ Гейслер S, Holmström KM, Skujat D, Fiesel FC, Rothfuss OC, Kahle PJ, Springer W (февраль 2010). «Митофагия, опосредованная PINK1 / паркином, зависит от VDAC1 и p62 / SQSTM1». Природа клеточной биологии . 12 (2): 119–31. DOI : 10.1038 / ncb2012 . PMID 20098416 . S2CID 26096413 .  
  24. ^ Aleksaniants GD (2013). «[Использование бальнео-, пелоидной и сантиметровой терапии в комплексном лечении больных с ограниченной склеродермией]» . Вестник Дерматологии и Венерологии . 32 (6): 58–60. DOI : 10.1038 / emboj.2013.70 . PMC 3630365 . PMID 23531882 .  
  25. ^ Müller-Rischart AK, Pilsl A, Beaudette P, Patra M, Hadian K, Funke M, Peis R, Deinlein A, Schweimer C, Kuhn PH, Lichtenthaler SF, Motori E, Hrelia S, Wurst W, Trümbach D, Langer T , Krappmann D, Dittmar G, Tatzelt J, Winklhofer KF (март 2013 г.). «Паркин с лигазой E3 поддерживает целостность митохондрий за счет увеличения линейного убиквитинирования NEMO» . Молекулярная клетка . 49 (5): 908–21. DOI : 10.1016 / j.molcel.2013.01.036 . PMID 23453807 . 
  26. ^ a b c da Costa CA, Sunyach C, Giaime E, West A, Corti O, Brice A, Safe S, Abou-Sleiman PM, Wood NW, Takahashi H, Goldberg MS, Shen J, Checler F (ноябрь 2009 г.). «Транскрипционная репрессия p53 паркином и нарушение мутациями, связанными с аутосомно-рецессивной ювенильной болезнью Паркинсона» . Природа клеточной биологии . 11 (11): 1370–5. DOI : 10.1038 / ncb1981 . PMC 2952934 . PMID 19801972 .  
  27. ^ Матоба S, Kang JG, Патиньо WD, Wragg A, Бем M, Гаврилова O, Херли PJ, Bunz F, Hwang PM (июнь 2006). «p53 регулирует митохондриальное дыхание». Наука . 312 (5780): 1650–3. Bibcode : 2006Sci ... 312.1650M . DOI : 10.1126 / science.1126863 . PMID 16728594 . S2CID 36668814 .  
  28. ^ Poorkaj P, Орехх JG, Джеймс D, Gancher S, Bird TD, Steinbart E, Шелленберг GD, Payami H (август 2004). «Анализ мутации паркина у пациентов клиники с [скорректированной] болезнью Паркинсона с ранним началом» . Американский журнал медицинской генетики. Часть A . 129A (1): 44–50. DOI : 10.1002 / ajmg.a.30157 . PMID 15266615 . S2CID 85058092 .  
  29. ^ Lohmann E, Periquet M, Bonifati V, Wood NW, De Michele G, Bonnet AM, Fraix V, Broussolle E, Horstink MW, Vidailhet M, Verpillat P, Gasser T, Nicholl D, Teive H, Raskin S, Rascol O, Дестее А., Руберг М., Гаспарини Ф., Меко Дж., Аджид Ю., Дурр А., Брайс А. (август 2003 г.). «Насколько фенотипические вариации можно отнести к генотипу паркина?». Анналы неврологии . 54 (2): 176–85. DOI : 10.1002 / ana.10613 . PMID 12891670 . S2CID 6411438 .  
  30. Перейти ↑ Ishikawa A, Takahashi H (ноябрь 1998 г.). «Клинические и невропатологические аспекты аутосомно-рецессивного ювенильного паркинсонизма». Журнал неврологии . 245 (11 приложение 3): P4-9. DOI : 10.1007 / pl00007745 . PMID 9808334 . S2CID 28670790 .  
  31. ^ Кини PM, Се J, Capaldi RA, Bennett JP (май 2006). «Митохондриальный комплекс I головного мозга при болезни Паркинсона имеет окислительно поврежденные субъединицы, функционально нарушен и неправильно собран» . Журнал неврологии . 26 (19): 5256–64. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.0984-06.2006 . PMC 6674236 . PMID 16687518 .  
  32. ^ Бендер А., Кришнан К.Дж., Моррис С.М., Тейлор Г.А., Рив А.К., Перри Р.Х., Ярос Э., Хершсон Дж. С., Беттс Дж., Клопсток Т., Тейлор Р. В., Тернбулл Д. М. (май 2006 г.). «Высокий уровень делеций митохондриальной ДНК в нейронах черного вещества при старении и болезни Паркинсона». Генетика природы . 38 (5): 515–7. DOI : 10.1038 / ng1769 . PMID 16604074 . S2CID 13956928 .  
  33. ^ Симура Н, Хаттори N, S Кубо, Mizuno Y, Asakawa S, S Minoshima, Shimizu N, Иваи К, Т Тиба, Танака К, Т Сузуки (июль 2000 г.). «Продукт гена семейной болезни Паркинсона, паркин, представляет собой убиквитин-протеин-лигазу». Генетика природы . 25 (3): 302–5. DOI : 10.1038 / 77060 . PMID 10888878 . S2CID 8135537 .  
  34. ^ а б Чунг К.К., Чжан И, Лим К.Л., Танака Ю., Хуанг Х, Гао Дж., Росс Калифорния, Доусон В.Л., Доусон TM (октябрь 2001 г.). «Паркин убиквитинирует белок, взаимодействующий с альфа-синуклеином, синфилин-1: последствия для образования телец Леви при болезни Паркинсона». Природная медицина . 7 (10): 1144–50. DOI : 10.1038 / nm1001-1144 . PMID 11590439 . S2CID 12487644 .  
  35. Tan JM, Wong ES, Kirkpatrick DS, Pletnikova O, Ko HS, Tay SP, Ho MW, Troncoso J, Gygi SP, Lee MK, Dawson VL, Dawson TM, Lim KL (февраль 2008 г.). «Убиквитинирование, связанное с лизином 63, способствует образованию и аутофагическому очищению от белковых включений, связанных с нейродегенеративными заболеваниями» . Молекулярная генетика человека . 17 (3): 431–9. DOI : 10,1093 / HMG / ddm320 . PMID 17981811 . 
  36. ^ Корти О, Хампе С, Koutnikova Н, Р Darios, Jacquier S, Prigent А, Робинсон Дж, Прадье л, Ruberg М, Миранд М, Hirsch Е, Руни Т, Фурнье А, Брис А (июнь 2003 г.). «Субъединица p38 комплекса аминоацил-тРНК синтетазы представляет собой субстрат Паркина: связывающий биосинтез белка и нейродегенерацию» . Молекулярная генетика человека . 12 (12): 1427–37. DOI : 10,1093 / HMG / ddg159 . PMID 12783850 . 
  37. ^ Ко HS, Ким SW, Sriram SR, Dawson VL, Dawson TM (июнь 2006). «Идентификация далеко идущего вверх по течению элемента связывающего белка-1 в качестве подлинного субстрата Паркина» . Журнал биологической химии . 281 (24): 16193–6. DOI : 10.1074 / jbc.C600041200 . PMID 16672220 . 
  38. ^ Хаттори Н, Matsumine Н, Asakawa S, Kitada Т, Yoshino Н, Elibol В, Брукес AJ, Ямамура Y, Кобаяши Т, Ван М, Yoritaka А, Minoshima S, Shimizu N, Mizuno Y (август 1998 г.). «Точечные мутации (Thr240Arg и Gln311Stop) [коррекция Thr240Arg и Ala311Stop] в гене Паркина». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 249 (3): 754–8. DOI : 10.1006 / bbrc.1998.9134 . PMID 9731209 . 
  39. ^ Veeriah S, Тейлор Б., Мэн S, Фан Ж, Ильмаз Е, Vivanco я, Janakiraman М, Шульц Н, Ханрахан AJ, Пао Вт, Ladanyi М, шлифовальные станки С, Heguy А, Голландия ЕК, Пати ПБ, Mischel ПС , Liau Л., Клоугези Т.Ф. , Меллингхофф И.К., Солит Д.Б., Чан Т.А. (январь 2010 г.). «Соматические мутации гена PARK2, связанного с болезнью Паркинсона, в глиобластоме и других злокачественных новообразованиях человека» . Генетика природы . 42 (1): 77–82. DOI : 10.1038 / ng.491 . PMC 4002225 . PMID 19946270 .  
  40. ^ Letessier A, Гарридо-Урбани S, Ginestier C, Fournier G, Esterni B, Monville F, Adélaide J, Geneix J, Xerri L, Dubreuil P, Viens P, Charafe-Jauffret E, Jacquemier J, Birnbaum D, Lopez M, Chaffanet M (январь 2007 г.). «Коррелированный разрыв в PARK2 / FRA6E и потеря экспрессии белка AF-6 / Afadin связаны с плохим исходом при раке груди» . Онкоген . 26 (2): 298–307. DOI : 10.1038 / sj.onc.1209772 . PMID 16819513 . 
  41. ^ Poulogiannis G, Макинтайр RE, Димитриади M, приложения JR, Wilson CH, Ichimura K, Л F, Cantley LC, Уилли AH, Adams DJ, Арендс MJ (август 2010). «Делеции PARK2 часто возникают при спорадическом колоректальном раке и ускоряют развитие аденомы у мутантных мышей Apc» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (34): 15145–50. Bibcode : 2010PNAS..10715145P . DOI : 10.1073 / pnas.1009941107 . PMC 2930574 . PMID 20696900 .  
  42. ^ Чой Р, Гольц Н, Снайдер Н, Чонг М, Petrucelli л, Харди J, Спаркман Д, Е Кокрэн, Ли Дж, Wolozin Б (сентябрь 2001 г.). «Совместная ассоциация паркина и альфа-синуклеина». NeuroReport . 12 (13): 2839–43. DOI : 10.1097 / 00001756-200109170-00017 . PMID 11588587 . S2CID 83941655 .  
  43. ^ a b Кавахара К., Хашимото М., Бар-Он П., Хо Г.Дж., Экипаж Л., Мизуно Н., Рокенштейн Е., Имам С.З., Маслия Е. (март 2008 г.). «Агрегаты альфа-синуклеина влияют на растворимость и распределение паркина: роль в патогенезе болезни Паркинсона» . Журнал биологической химии . 283 (11): 6979–87. DOI : 10.1074 / jbc.M710418200 . PMID 18195004 . 
  44. Fallon L, Moreau F, Croft BG, Labib N, Gu WJ, Fon EA (январь 2002 г.). «Паркин и CASK / LIN-2 связываются посредством PDZ-опосредованного взаимодействия и совместно локализованы в липидных рафтах и ​​постсинаптических плотностях в головном мозге» . Журнал биологической химии . 277 (1): 486–91. DOI : 10.1074 / jbc.M109806200 . PMID 11679592 . 
  45. ^ a b Старополи Дж. Ф., Макдермотт С., Мартинат С., Шульман Б., Демирева Е., Абелиович А. (март 2003 г.). «Паркин является компонентом SCF-подобного комплекса убиквитинлигазы и защищает постмитотические нейроны от каинатной эксайтотоксичности». Нейрон . 37 (5): 735–49. DOI : 10.1016 / s0896-6273 (03) 00084-9 . PMID 12628165 . S2CID 17024826 .  
  46. ↑ a b c d Имаи Й, Сода М, Хатакеяма С., Акаги Т., Хашикава Т., Накаяма К.И., Такахаши Р. (июль 2002 г.). «CHIP связан с паркином, геном, ответственным за семейную болезнь Паркинсона, и усиливает его активность убиквитинлигазы». Молекулярная клетка . 10 (1): 55–67. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (02) 00583-X . PMID 12150907 . 
  47. Imai Y, Soda M, Inoue H, Hattori N, Mizuno Y, Takahashi R (июнь 2001 г.). «Развернутый предполагаемый трансмембранный полипептид, который может привести к стрессу эндоплазматического ретикулума, является субстратом Паркина». Cell . 105 (7): 891–902. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (01) 00407-х . PMID 11439185 . S2CID 721363 .  
  48. ^ Корти О, Хампе С, Koutnikova Н, Р Darios, Jacquier S, Prigent А, Робинсон Дж, Прадье л, Ruberg М, Миранд М, Hirsch Е, Руни Т, Фурнье А, Брис А (июнь 2003 г.). «Субъединица p38 комплекса аминоацил-тРНК синтетазы представляет собой субстрат Паркина: связывающий биосинтез белка и нейродегенерацию» . Молекулярная генетика человека . 12 (12): 1427–37. DOI : 10,1093 / HMG / ddg159 . PMID 12783850 . 
  49. ^ Fukae J, S Сато, Сиба - К, Сато К, Мори Н, Шарп ПА, Mizuno Y, Хаттори N (февраль 2009 г.). «Изоформа 1 запрограммированной клеточной смерти-2 убиквитинируется паркином и увеличивается в черной субстанции пациентов с аутосомно-рецессивной болезнью Паркинсона». Письма FEBS . 583 (3): 521–5. DOI : 10.1016 / j.febslet.2008.12.055 . ЛВП : 1721,1 / 96274 . PMID 19146857 . S2CID 7121769 .  
  50. ^ Чой Р, Снайдер Н, Petrucelli л, Theisler С, Чонг М, Чжан У, Лим К, Чанг К. К., Кьоу К, Д Adamio л, Ли Дж, Кокрэн Е, Баузер R, Dawson ТМ, Wolozin Б (октябрь 2003 г. ). «SEPT5_v2 представляет собой белок, связывающий паркин». Исследование мозга. Молекулярное исследование мозга . 117 (2): 179–89. DOI : 10.1016 / s0169-328x (03) 00318-8 . PMID 14559152 . 
  51. ^ Лю М, Aneja R, X ВС, Се S, Ван H, Wu X, Dong JT, Li M, Joshi HC, Чжоу J (декабрь 2008). «Паркин регулирует экспрессию Eg5 посредством зависимой от убиквитинирования Hsp70 инактивации NH2-концевой киназы c-Jun» . Журнал биологической химии . 283 (51): 35783–8. DOI : 10.1074 / jbc.M806860200 . PMID 18845538 . 
  52. ^ Хюинь DP, Scoles DR, Нгуен D, Pulst SM (октябрь 2003). «Аутосомно-рецессивный продукт гена ювенильной болезни Паркинсона, паркин, взаимодействует с синаптотагмином XI и убиквитинирует его» . Молекулярная генетика человека . 12 (20): 2587–97. DOI : 10,1093 / HMG / ddg269 . PMID 12925569 . 
  53. Yu F, Zhou J (июль 2008 г.). «Паркин убиквитинируется Nrdp1 и устраняет окислительный стресс, вызванный Nrdp1». Письма неврологии . 440 (1): 4–8. DOI : 10.1016 / j.neulet.2008.05.052 . PMID 18541373 . S2CID 2169911 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Сайто М., Мацумине Х., Танака Х., Исикава А., Мацубаяси С., Хаттори Ю., Мидзуно Ю., Цудзи С. (январь 1997 г.). «[Клинические характеристики и анализ сцепления аутосомно-рецессивной формы ювенильного паркинсонизма (AR-JP)]». Нихон Риншо. Японский журнал клинической медицины . 55 (1): 83–8. PMID  9014427 .
  • Фишман П.С., Ойлер Г.А. (июль 2002 г.). «Значение гена и белка паркина в понимании болезни Паркинсона». Текущие отчеты по неврологии и неврологии . 2 (4): 296–302. DOI : 10.1007 / s11910-002-0004-7 . PMID  12044248 . S2CID  21068281 .
  • Такахаши Р. (июнь 2002 г.). «[Функция Паркина]». Сэйкагаку. Журнал Японского биохимического общества . 74 (6): 471–6. PMID  12138708 .
  • West AB, Maidment NT (март 2004 г.). «Генетика паркин-сцепленного заболевания». Генетика человека . 114 (4): 327–36. DOI : 10.1007 / s00439-003-1074-6 . PMID  14727181 . S2CID  23264061 .
  • Мата И.Ф., Локхарт П.Дж., Фаррер М.Дж. (апрель 2004 г.). «Паркинская генетика: одна модель болезни Паркинсона» . Молекулярная генетика человека . 13 ТУ № 1 (90001): Р127-33. DOI : 10,1093 / HMG / ddh089 . PMID  14976155 .
  • Баптиста MJ, Cookson MR, Miller DW (февраль 2004 г.). «Паркин и альфа-синуклеин: действия противника в патогенезе болезни Паркинсона» . Невролог . 10 (1): 63–72. DOI : 10.1177 / 1073858403260392 . PMID  14987449 . S2CID  84671340 .
  • Кале П.Дж., Хаасс С. (июль 2004 г.). «Как паркин связывает убиквитин с болезнью Паркинсона?» . EMBO Reports . 5 (7): 681–5. DOI : 10.1038 / sj.embor.7400188 . PMC  1299099 . PMID  15229644 .
  • Панкрац Н., Фоуд Т. (апрель 2004 г.). «Генетика болезни Паркинсона» . NeuroRx . 1 (2): 235–42. DOI : 10,1602 / neurorx.1.2.235 . PMC  534935 . PMID  15717024 .
  • Suzuki H (сентябрь 2006 г.). «Белковые взаимодействия в мозге млекопитающих» . Журнал физиологии . 575 (Pt 2): 373–7. DOI : 10.1113 / jphysiol.2006.115717 . PMC  1819454 . PMID  16840513 .
  • Хаттори Н., Мачида Ю., Сато С., Нода К., Иидзима-Китами М., Кубо С., Мидзуно Ю. (2006). «Молекулярные механизмы нейродегенерации nigral в Park2 и регуляция белка паркина другими белками». Журнал нейронной передачи. Дополнение . Журнал нейронной передачи. Дополнение. 70 (70): 205–8. DOI : 10.1007 / 978-3-211-45295-0_31 . ISBN 978-3-211-28927-3. PMID  17017530 .
  • Мацумине Х, Сайто М, Симода-Мацубаяси С., Танака Х, Исикава А, Накагава-Хаттори Й, Йокочи М, Кобаяси Т, Игараси С., Такано Х, Санпей К., Коике Р., Мори Х, Кондо Т, Мизутани Й, Шеффер А.А., Ямамура Ю., Накамура С., Кузухара С., Цудзи С., Мидзуно Ю. (март 1997 г.). «Локализация гена аутосомно-рецессивной формы ювенильного паркинсонизма на хромосоме 6q25.2-27» . Американский журнал генетики человека . 60 (3): 588–96. PMC  1712507 . PMID  9042918 .
  • Китада Т., Асакава С., Хаттори Н., Мацумине Х., Ямамура Й., Миношима С., Йокочи М., Мидзуно Ю., Симидзу Н. (апрель 1998 г.). «Мутации в гене паркина вызывают аутосомно-рецессивный ювенильный паркинсонизм». Природа . 392 (6676): 605–8. Bibcode : 1998Natur.392..605K . DOI : 10,1038 / 33416 . PMID  9560156 . S2CID  4432261 .
  • Мацумине Х., Ямамура Й., Хаттори Н., Кобаяси Т., Китада Т., Йоритака А., Мизуно Й. (апрель 1998 г.). «Микроделеция D6S305 в семье аутосомно-рецессивного ювенильного паркинсонизма (PARK2)». Геномика . 49 (1): 143–6. DOI : 10.1006 / geno.1997.5196 . PMID  9570960 .
  • Тассин Дж., Дюрр А., де Брукер Т., Аббас Н., Бонифати В., Де Мишель Г., Боннет А. М., Бруссолле Э, Поллак П., Видайет М., Де Мари М., Маркони Р., Меджбер С., Филла А., Меко Дж., Агид Ю. , Брайс А. (июль 1998 г.). «Связанный с хромосомой 6 аутосомно-рецессивный паркинсонизм с ранним началом: связь в европейских и алжирских семьях, расширение клинического спектра и доказательства небольшой гомозиготной делеции в одной семье. Французская группа исследования болезни Паркинсона и Европейский консорциум по генетике Восприимчивость к болезни Паркинсона » . Американский журнал генетики человека . 63 (1): 88–94. DOI : 10.1086 / 301934 . PMC  1377254 . PMID  9634531 .
  • Хаттори Н., Мацумине Х., Асакава С., Китада Т., Йошино Х., Элибол Б., Брукс А.Дж., Ямамура Й., Кобаяси Т., Ван М., Йоритака А., Миношима С., Симидзу Н., Мизуно Ю. (август 1998 г.). «Точечные мутации (Thr240Arg и Gln311Stop) [коррекция Thr240Arg и Ala311Stop] в гене Паркина». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 249 (3): 754–8. DOI : 10.1006 / bbrc.1998.9134 . PMID  9731209 .
  • Люкинг CB, Аббас Н., Дюрр А., Бонифати В., Боннет А.М., де Брукер Т., Де Мишель Г., Вуд Н.В., Агид И., Брайс А. (октябрь 1998 г.). «Гомозиготные делеции в гене паркина в европейских и североафриканских семьях с аутосомно-рецессивным ювенильным паркинсонизмом. Европейский консорциум по генетической предрасположенности при болезни Паркинсона и Французская группа изучения генетики болезни Паркинсона». Ланцет . 352 (9137): 1355–6. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (05) 60746-5 . PMID  9802278 . S2CID  44409075 .
  • Abbas N, Lücking CB, Ricard S, Dürr A, Bonifati V, De Michele G, Bouley S, Vaughan JR, Gasser T., Marconi R, Broussolle E, Brefel-Courbon C, Harhangi BS, Oostra BA, Fabrizio E, Böhme GA , Pradier L, Wood NW, Filla A, Meco G, Denefle P, Agid Y, Brice A (апрель 1999 г.). «Широкий спектр мутаций в гене паркина ответственен за аутосомно-рецессивный паркинсонизм в Европе. Французская исследовательская группа по генетике болезни Паркинсона и Европейский консорциум по генетической восприимчивости при болезни Паркинсона» . Молекулярная генетика человека . 8 (4): 567–74. DOI : 10.1093 / HMG / 8.4.567 . PMID  10072423 .
  • Сунада Ю., Сайто Ф., Мацумура К., Симидзу Т. (октябрь 1998 г.). «Дифференциальная экспрессия гена паркина в головном мозге человека и периферических лейкоцитах». Письма неврологии . 254 (3): 180–2. DOI : 10.1016 / S0304-3940 (98) 00697-1 . PMID  10214987 . S2CID  32794960 .
  • Шимура Х., Хаттори Н., Кубо С., Йошикава М., Китада Т., Мацумине Х., Асакава С., Миносима С., Ямамура И., Симидзу Н., Мидзуно Ю. (май 1999 г.). «Иммуногистохимическая и субклеточная локализация белка паркина: отсутствие белка у пациентов с аутосомно-рецессивным ювенильным паркинсонизмом». Анналы неврологии . 45 (5): 668–72. DOI : 10.1002 / 1531-8249 (199905) 45: 5 <668 :: AID-ANA19> 3.0.CO; 2-Z . PMID  10319893 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о паркин-типе ювенильной болезни Паркинсона
  • Паркин + белок в предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)