полинуклеотид-аденилилтрансфераза | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
ЕС нет. | 2.7.7.19 | |||||||
№ CAS | 9026-30-6 | |||||||
Базы данных | ||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | |||||||
BRENDA | BRENDA запись | |||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | |||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | |||||||
MetaCyc | метаболический путь | |||||||
ПРИАМ | профиль | |||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | |||||||
|
В энзимологии , A полинуклеотид adenylyltransferase ( ЕС 2.7.7.19 ) представляет собой фермент , который катализирует в химическую реакцию
- АТФ + РНК-3'OH пирофосфат + RNApA-3'OH
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются АТФ и РНК , а двумя его продуктами являются пирофосфат и РНК с дополнительным аденозиновым нуклеотидом на 3'-конце.
Гены человека с этой активностью включают TUT1 , MTPAP , PAPOLA , PAPOLB , PAPOLG , TENT2 , TENT4A , TENT4B , TENT5C , TENT5D .
Именование [ править ]
Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз , в частности к тем, которые переносят фосфорсодержащие нуклеотидные группы ( нуклеотидилтрансферазы ). Систематическое название данного фермента класса АТФ: полинуклеотид adenylyltransferase .
Другие широко используемые имена включают:
- Полимераза NTP
- Фермент аденилирования РНК
- AMP полинуклеотидилексотрансфераза
- АТФ-полинуклеотид-аденилилтрансфераза
- АТФ: полинуклеотидилексотрансфераза
- Поли (А) полимераза
- Поли (А) синтетаза
- Полиаденилат нуклеотидилтрансфераза
- Полиаденилат-полимераза
- Полиаденилатсинтетаза
- Полимераза полиадениловой кислоты
- Полиадениловая полимераза
- Терминальная рибоаденилаттрансфераза
- Поли (А) гидролаза
- Факторы образования РНК
- PF1
- Аденозинтрифосфат: аденилилтрансфераза рибонуклеиновой кислоты
Функция [ править ]
Этот фермент отвечает за добавление 3'- полиаденинового хвоста к недавно синтезированной молекуле пре- мессенджера РНК (пре-мРНК) в процессе транскрипции гена . Белок является последней добавкой к большому белковому комплексу, который также содержит более мелкие сборки, известные как фактор специфичности расщепления и полиаденилирования (CPSF) и фактор стимуляции расщепления (CtSF), и его связывание является необходимым предварительным условием для расщепления 3'-конца пре-мРНК. После расщепления 3'-сигнальной области, которая управляет сборкой комплекса, полиаденилатполимераза (PAP) добавляет полиадениновый хвост к новому 3'-концу.
Скорость, с которой PAP добавляет аденин- нуклеотиды , зависит от присутствия другого регуляторного белка, PABPII (полиаденин-связывающий белок II). Первые несколько нуклеотидов, добавленных PAP, добавляются очень медленно, но короткий полиадениновый хвост затем связывается PABPII, что увеличивает скорость добавления аденина с помощью PAP. Последний хвост составляет около 200-250 адениновых нуклеотидов.
ППА фосфорилируются путем митоза способствующего фактора , ключевым регулятором клеточного цикла . Высокий уровень фосфорилирования снижает активность PAP.
Структурные исследования [ править ]
По состоянию на конец 2007 г. было решено 27 структур для этого класса ферментов с кодами доступа PDB 1AV6 , 1B42 , 1BKY , 1EAM , 1EQA , 1F5A , 1FA0 , 1JSZ , 1JTE , 1JTF , 1P39 , 1Q78 , 1Q79 , 1V39 , 1VFG , 1VP3 , 1VP9 , 1VPT , 2GA9 , 2GAF , 2HHP , 2O1P, 2Q66 , 2VP3 , 3MAG , 3MCT и 4DCG .
Ссылки [ править ]
- Август Дж. Т., Ортис П. Дж., Гурвиц Дж. (Декабрь 1962 г.). «Рибонуклеиновая кислота-зависимое включение рибонуклеотидов. I. Очистка и свойства фермента». J. Biol. Chem . 237 : 3786–93. PMID 13965521 .
- Эдмондс М., Абрамс Р. (1960). «Биосинтез полинуклеотидов: образование последовательности аденилатных единиц из аденозинтрифосфата ферментом из ядер тимуса» . J. Biol. Chem . 235 (4): 1142–1149.
- Готтесман ME, Канеллакис ES (1966). «Концевые нуклеотидилтрансферазы ядер тимуса теленка». J. Biol. Chem . 241 (19): 4339–52. PMID 4288534 .
- Krakow Js; Coutsogeorgopoulos C; Канеллакис Е.С. (1962). «Исследования по включению дезоксирибонуклеиновой кислоты». Биохим. Биофиз. Acta . 55 (5): 639–50. DOI : 10.1016 / 0006-3002 (62) 90842-9 . PMID 14459258 .
- Ман Р.Дж., Уолтер Т.Дж. (1971). «Трансферная РНК-праймированная синтез олигоаденилата в проростках кукурузы. II. Специфичность праймера, субстрата и металла и размер продукта». Биохим. Биофиз. Acta . 247 (1): 113–21. DOI : 10.1016 / 0005-2787 (71) 90814-8 . PMID 4946277 .
- Шелдон Р., Джураль С., Кейтс Дж. (1972). «Обнаружение последовательностей полиадениловой кислоты в вирусной и эукариотической РНК (поли (U) -целлюлозные колонки-поли (U) фильтры-стекловолокно-клетки HeLa-бактериофаг Т4)» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 69 (2): 417–21. DOI : 10.1073 / pnas.69.2.417 . PMC 426470 . PMID 4501121 .
- Колган Д.Ф., Мурти К.Г., Привес С., Мэнли Дж. Л. (ноябрь 1996 г.). «Связанная с клеточным циклом регуляция поли (А) полимеразы путем фосфорилирования». Природа . 384 (6606): 282–5. Bibcode : 1996Natur.384..282C . DOI : 10.1038 / 384282a0 . PMID 8918882 . S2CID 4304275 .