RAB5A

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1N6H , 1N6I , 1N6K , 1N6L , 1N6N , 1N6O , 1N6P , 1N6R , 1R2Q , 1TU3 , 1TU4 , 3MJH , 4Q9U

Идентификаторы

Псевдонимы

RAB5A , RAB5, член семейства онкогенов RAS

Внешние идентификаторы

OMIM : 179512 MGI : 105926 HomoloGene : 68142 GeneCards : RAB5A

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 3 (человек) ^[1]

Группа	3п24.3	Начинать	19 947 097 п.н. ^[1]
Группа	3п24.3	Конец	19 985 175 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 17 (мышь) ^[2]

Группа	17 C \| 17 27,82 см	Начинать	53 479 234 п.н. ^[2]
Группа	17 C \| 17 27,82 см	Конец	53 507 680 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• нуклеотид связывания • связывание ВВП • GTP связывания • GO: связывание белка 0001948 • активность ГТФ • гуанил нуклеотид связывания
Сотовый компонент	• цитоплазма • аксон конец • эндосома • проекция клеток • мембрана • синаптической везикулы • меланосома • рябить • клеточная мембрана • эндоцитотических везикулы • аксон • нейрональных клетки тело • Терминал Bouton • дендритов • somatodendritic отсек • ранней эндосома • фагоцитарной везикула • актиновый цитоскелет • мембраны рафт • цитоплазматическая сторона ранней мембраны эндосомы • Внеклеточный экзос • цитоплазматических везикул • фагоцитарной везикула мембрана • цитозоль • эндосома мембрана • клатриновая везикула мембрана • ранняя эндосома мембрана • ранняя фагосома • постсинаптического раннего эндосомы • привязанных компоненты синаптической мембраны везикул
Биологический процесс	• регулирование эндоцитоза • регулирование филоподий сборки • эндоцитоз • Свертывание крови • рецепторов интернализации участвует в канонической Wnt сигнального пути • регулирования аутофагосом сборки • синаптических везикул рециркуляции • начале эндосомы в конце эндосомы транспорта • транспорт • транспортный белок • положительное регулирование экзоцитоза • регуляция экзоцитоза синаптических везикул • регуляция размера эндосом • репликация вирусной РНК генома • фагоцитоз • процесс биосинтеза фосфатидилинозитола • организация мембраны • посттрансляционная модификация • внутриклеточный транспорт белка • передача сигнала Rab-белка • регулирование долговременной синаптической пластичности нейронов • клиренс бета-амилоида путем трансцитоза
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


5868


271457

Ансамбль


ENSG00000144566


ENSMUSG00000017831

UniProt


P20339


Q9CQD1

RefSeq (мРНК)


NM_004162 NM_001292048


NM_025887

RefSeq (белок)


NP_001278977 NP_004153


NP_080163

Расположение (UCSC)

Chr 3: 19.95 - 19.99 Мб

Chr 17: 53,48 - 53,51 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Ras-родственный белок Rab-5A представляет собой белок , который у человека кодируется RAB5A гена . ^[5]^[6]

Функция [ править ]

RAB5A локализуется в ранних эндосомах, где он участвует в рекрутировании RAB7A и созревании этих компартментов до поздних эндосом. ^[7] Он стимулирует созревание эндосом, транспортируя вакуолярные (H +) - АТФазы (V-АТФазы) от сети транс-Гольджи к эндоцитарным пузырькам. ^[8]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что RAB5A взаимодействует с:

CHML , ^[9]^[10]
RABEP1 , ^[11]^[12]^[13]^[14]
SDCBP , ^[15] и
ZFYVE20 ^[16]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000144566 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017831 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Руссо-Merck М.Ф., Zahraoui А, Touchot Н, Тавитян А, Бергер Р (февраль 1991). «Присвоение хромосом четырех генов RAB, связанных с RAS». Генетика человека . 86 (4): 350–4. DOI : 10.1007 / BF00201831 . PMID 1999336 . S2CID 30730416 .
^ «Энтрез Ген: RAB5A RAB5A, член семейства онкогенов RAS» .
^ Huotari J, Хелениус A (август 2011). «Созревание эндосом» . Журнал EMBO . 30 (17): 3481–500. DOI : 10.1038 / emboj.2011.286 . PMC 3181477 . PMID 21878991 .
Перейти ↑ Zhang C, Li A, Zhang X, Xiao H (март 2011 г.). «Новый белковый комплекс TIP30 регулирует передачу сигналов рецептора EGF и эндоцитарную деградацию» . Журнал биологической химии . 286 (11): 9373–81. DOI : 10.1074 / jbc.M110.207720 . PMC 3058969 . PMID 21252234 .
^ Анант JS, Денуайе л, Machius М, Demeler В, Хансен JC, Уэстовер КД, Deisenhofer Дж, Сеабра МС (сентябрь 1998). «Механизм геранилгеранилирования Rab: образование каталитического тройного комплекса». Биохимия . 37 (36): 12559–68. DOI : 10.1021 / bi980881a . PMID 9730828 .
^ Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (январь 1994). «REP-2, белок сопровождения Rab, кодируемый геном, подобным хориидеремии». Журнал биологической химии . 269 (3): 2111–7. PMID 8294464 .
^ Xiao GH, Shoarinejad F, Jin F, Golemis EA, Енг RS (март 1997). «Продукт гена туберозного склероза 2, туберин, функционирует как белок, активирующий ГТФазу Rab5 (GAP), при модуляции эндоцитоза» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6097–100. DOI : 10.1074 / jbc.272.10.6097 . PMID 9045618 .
^ Витале G, Рыбин В, Christoforidis S, Thornqvist Р, Маккэффри М, Штенмарк Н, Zerial М (апрель 1998 г.). «Определенные Rab-связывающие домены опосредуют взаимодействие Rabaptin-5 с GTP-связанными Rab4 и Rab5» . Журнал EMBO . 17 (7): 1941–51. DOI : 10.1093 / emboj / 17.7.1941 . PMC 1170540 . PMID 9524117 .
^ Штенмарк Н, Витале О, Ульрих О, Zerial М (ноябрь 1995). «Рабаптин-5 является прямым эффектором малой GTPase Rab5 при слиянии эндоцитарных мембран». Cell . 83 (3): 423–32. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90120-5 . PMID 8521472 . S2CID 18768939 .
^ Valsdottir R, Хасимото Н, Ashman К, Т Koda, Сторри В, Т Нильссон (ноябрь 2001 г.). «Идентификация рабаптина-5, rabex-5 и GM130 как предполагаемых эффекторов rab33b, регулятора ретроградного обмена между аппаратом Гольджи и ER». Письма FEBS . 508 (2): 201–9. DOI : 10.1016 / s0014-5793 (01) 02993-3 . PMID 11718716 . S2CID 21545088 .
^ Tomoda T, Ким JH, Zhan C, Hatten ME (март 2004). «Роль Unc51.1 и его партнеров по связыванию в росте аксонов ЦНС» . Гены и развитие . 18 (5): 541–58. DOI : 10,1101 / gad.1151204 . PMC 374236 . PMID 15014045 .
↑ Nielsen E, Christoforidis S, Uttenweiler-Joseph S, Miaczynska M, Dewitte F, Wilm M, Hoflack B, Zerial M (октябрь 2000 г.). «Рабеносин-5, новый эффектор Rab5, образует комплекс с hVPS45 и рекрутируется в эндосомы через домен пальца FYVE» . Журнал клеточной биологии . 151 (3): 601–12. DOI : 10,1083 / jcb.151.3.601 . PMC 2185588 . PMID 11062261 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Буччи К., Партон Р., Мазер И. Х., Стунненберг Х., Саймонс К., Хофлак Б., Зериал М. (сентябрь 1992 г.). «Малая GTPase rab5 функционирует как регуляторный фактор в раннем эндоцитозном пути» . Cell . 70 (5): 715–28. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (92) 90306-W . PMID 1516130 .
Zahraoui A, Touchot N, Chardin P, Tavitian A (июль 1989 г.). «Гены Rab человека кодируют семейство GTP-связывающих белков, связанных с продуктами YPT1 и SEC4 дрожжей, участвующими в секреции». Журнал биологической химии . 264 (21): 12394–401. PMID 2501306 .
Фарнсворт CC, Seabra MC, Ericsson LH, Gelb MH, Glomset JA (декабрь 1994 г.). «Rab геранилгеранилтрансфераза катализирует геранилгеранилирование соседних цистеинов в малых GTPases Rab1A, Rab3A и Rab5A» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (25): 11963–7. DOI : 10.1073 / pnas.91.25.11963 . PMC 45356 . PMID 7991565 .
Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (январь 1994 г.). «REP-2, белок сопровождения Rab, кодируемый геном, подобным хориидеремии». Журнал биологической химии . 269 (3): 2111–7. PMID 8294464 .
Стенмарк Х., Витале Г., Ульрих О., Зериал М. (ноябрь 1995 г.). «Рабаптин-5 является прямым эффектором малой GTPase Rab5 при слиянии эндоцитарных мембран». Cell . 83 (3): 423–32. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90120-5 . PMID 8521472 . S2CID 18768939 .
Vita F, Soranzo MR, Borelli V, Bertoncin P, Zabucchi G (сентябрь 1996 г.). «Субклеточная локализация малой GTPase Rab5a в покоящихся и стимулированных нейтрофилах человека». Экспериментальные исследования клеток . 227 (2): 367–73. DOI : 10.1006 / excr.1996.0286 . PMID 8831575 .
Сяо Г.Х., Шоаринеджад Ф., Джин Ф., Големис Э.А., Йунг Р.С. (март 1997 г.). «Продукт гена туберозного склероза 2, туберин, функционирует как белок, активирующий ГТФазу Rab5 (GAP), при модуляции эндоцитоза» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6097–100. DOI : 10.1074 / jbc.272.10.6097 . PMID 9045618 .
Симонсен А., Липпе Р., Кристофоридис С., Голлье Дж. М., Бреч А., Каллаган Дж., То Б. Х., Мерфи С., Зериал М., Стенмарк Н. (июль 1998 г.). «EEA1 связывает функцию PI (3) K с Rab5 регуляцией слияния эндосом». Природа . 394 (6692): 494–8. DOI : 10.1038 / 28879 . PMID 9697774 . S2CID 4305220 .
Анант Дж. С., Деснойерс Л., Мачиус М., Демелер Б., Хансен Дж. К., Вестовер К. Д., Дайзенхофер Дж., Сибра М.С. (сентябрь 1998 г.). «Механизм геранилгеранилирования Rab: образование каталитического тройного комплекса». Биохимия . 37 (36): 12559–68. DOI : 10.1021 / bi980881a . PMID 9730828 .
Bucci C, Chiariello M, Lattero D, Maiorano M, Bruni CB (май 1999 г.). «Клонирование взаимодействия и характеристика кДНК, кодирующей пренилированный человеческий акцептор Rab (PRA1)». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 258 (3): 657–62. DOI : 10.1006 / bbrc.1999.0651 . PMID 10329441 .
Каллаган Дж., Никсон С., Буччи С., То Б. Х., Стенмарк Х (октябрь 1999 г.). «Прямое взаимодействие EEA1 с Rab5b» . Европейский журнал биохимии / FEBS . 265 (1): 361–6. DOI : 10.1046 / j.1432-1327.1999.00743.x . PMID 10491193 .
Шишева А., Чинни С.Р., Демарко С. (сентябрь 1999 г.). «Общая роль ингибитора диссоциации GDP 2 в высвобождении белков Rab через мембрану: модуляции его функциональных взаимодействий с помощью структурных модификаций in vitro и in vivo». Биохимия . 38 (36): 11711–21. DOI : 10.1021 / bi990200r . PMID 10512627 .
Масуда Е.С., Ло Й., Янг К., Шен М., Росси А.Б., Хуанг BC, Ю С., Беннетт М.К., Паян Д.Г., Шеллер Р.Х. (март 2000 г.) «Rab37 представляет собой новую GTPase, специфичную для тучных клеток, локализованную в секреторных гранулах». Письма FEBS . 470 (1): 61–4. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01288-6 . PMID 10722846 . S2CID 38218555 .
Хоффенберг С., Лю X, Николова Л., Холл Х.С., Дай В., Боун Р. Э., Дики Б. Ф., Барбьери М. А., Абаллай А., Шталь П. Д., Нолл Б. Дж. (Август 2000 г.). «Новый заякоренный в мембране взаимодействующий белок Rab5, необходимый для гомотипического слияния эндосом» . Журнал биологической химии . 275 (32): 24661–9. DOI : 10.1074 / jbc.M909600199 . PMID 10818110 .
Нильсен Э., Кристофоридис С., Уттенвейлер-Йозеф С., Миачинска М., Девитт Ф., Вильм М., Хофлак Б., Зериал М. (октябрь 2000 г.). «Рабеносин-5, новый эффектор Rab5, образует комплекс с hVPS45 и рекрутируется в эндосомы через домен пальца FYVE» . Журнал клеточной биологии . 151 (3): 601–12. DOI : 10,1083 / jcb.151.3.601 . PMC 2185588 . PMID 11062261 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Lanzetti L, Rybin V, Malabarba MG, Christoforidis S, Scita G, Zerial M, Di Fiore PP (ноябрь 2000 г.). «Белок Eps8 координирует передачу сигналов рецептора EGF через Rac и передачу через Rab5». Природа . 408 (6810): 374–7. DOI : 10.1038 / 35042605 . PMID 11099046 . S2CID 4405293 .
Вольф Р. М., Уилкс Дж. Дж., Чао М. В., Реш М. Д. (октябрь 2001 г.). «Фосфорилирование тирозина p190 RhoGAP с помощью Fyn регулирует дифференцировку олигодендроцитов». Журнал нейробиологии . 49 (1): 62–78. DOI : 10.1002 / neu.1066 . PMID 11536198 .
Сейчрист Дж. Л., Ляпорт С. А., Дейл Л. Б., Бабва А. В., Карон М. Г., Анборг П. Н., Фергюсон СС (январь 2002 г.). «Ассоциация Rab5 с рецептором ангиотензина II типа 1A способствует связыванию Rab5 GTP и везикулярному слиянию» . Журнал биологической химии . 277 (1): 679–85. DOI : 10.1074 / jbc.M109022200 . PMID 11682489 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000144566 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017831 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1999336-5] Руссо-Merck М.Ф., Zahraoui А, Touchot Н, Тавитян А, Бергер Р (февраль 1991). «Присвоение хромосом четырех генов RAB, связанных с RAS». Генетика человека . 86 (4): 350–4. DOI : 10.1007 / BF00201831 . PMID 1999336 . S2CID 30730416 .

[entrez-6] «Энтрез Ген: RAB5A RAB5A, член семейства онкогенов RAS» .

[7] Huotari J, Хелениус A (август 2011). «Созревание эндосом» . Журнал EMBO . 30 (17): 3481–500. DOI : 10.1038 / emboj.2011.286 . PMC 3181477 . PMID 21878991 .

[8] Перейти ↑ Zhang C, Li A, Zhang X, Xiao H (март 2011 г.). «Новый белковый комплекс TIP30 регулирует передачу сигналов рецептора EGF и эндоцитарную деградацию» . Журнал биологической химии . 286 (11): 9373–81. DOI : 10.1074 / jbc.M110.207720 . PMC 3058969 . PMID 21252234 .

[pmid9730828-9] Анант JS, Денуайе л, Machius М, Demeler В, Хансен JC, Уэстовер КД, Deisenhofer Дж, Сеабра МС (сентябрь 1998). «Механизм геранилгеранилирования Rab: образование каталитического тройного комплекса». Биохимия . 37 (36): 12559–68. DOI : 10.1021 / bi980881a . PMID 9730828 .

[pmid8294464-10] Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (январь 1994). «REP-2, белок сопровождения Rab, кодируемый геном, подобным хориидеремии». Журнал биологической химии . 269 (3): 2111–7. PMID 8294464 .

[pmid9045618-11] Xiao GH, Shoarinejad F, Jin F, Golemis EA, Енг RS (март 1997). «Продукт гена туберозного склероза 2, туберин, функционирует как белок, активирующий ГТФазу Rab5 (GAP), при модуляции эндоцитоза» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6097–100. DOI : 10.1074 / jbc.272.10.6097 . PMID 9045618 .

[pmid9524117-12] Витале G, Рыбин В, Christoforidis S, Thornqvist Р, Маккэффри М, Штенмарк Н, Zerial М (апрель 1998 г.). «Определенные Rab-связывающие домены опосредуют взаимодействие Rabaptin-5 с GTP-связанными Rab4 и Rab5» . Журнал EMBO . 17 (7): 1941–51. DOI : 10.1093 / emboj / 17.7.1941 . PMC 1170540 . PMID 9524117 .

[pmid8521472-13] Штенмарк Н, Витале О, Ульрих О, Zerial М (ноябрь 1995). «Рабаптин-5 является прямым эффектором малой GTPase Rab5 при слиянии эндоцитарных мембран». Cell . 83 (3): 423–32. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90120-5 . PMID 8521472 . S2CID 18768939 .

[pmid11718716-14] Valsdottir R, Хасимото Н, Ashman К, Т Koda, Сторри В, Т Нильссон (ноябрь 2001 г.). «Идентификация рабаптина-5, rabex-5 и GM130 как предполагаемых эффекторов rab33b, регулятора ретроградного обмена между аппаратом Гольджи и ER». Письма FEBS . 508 (2): 201–9. DOI : 10.1016 / s0014-5793 (01) 02993-3 . PMID 11718716 . S2CID 21545088 .

[pmid15014045-15] Tomoda T, Ким JH, Zhan C, Hatten ME (март 2004). «Роль Unc51.1 и его партнеров по связыванию в росте аксонов ЦНС» . Гены и развитие . 18 (5): 541–58. DOI : 10,1101 / gad.1151204 . PMC 374236 . PMID 15014045 .

[pmid11062261-16] Nielsen E, Christoforidis S, Uttenweiler-Joseph S, Miaczynska M, Dewitte F, Wilm M, Hoflack B, Zerial M (октябрь 2000 г.). «Рабеносин-5, новый эффектор Rab5, образует комплекс с hVPS45 и рекрутируется в эндосомы через домен пальца FYVE» . Журнал клеточной биологии . 151 (3): 601–12. DOI : 10,1083 / jcb.151.3.601 . PMC 2185588 . PMID 11062261 .

[1]