RFC5

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1LFS

Идентификаторы

Псевдонимы

RFC5 , RFC36, субъединица 5 фактора репликации C

Внешние идентификаторы

OMIM : 600407 MGI : 1919401 HomoloGene : 6730 GeneCards : RFC5

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 12 (человека) ^[1]

Группа	12q24.23	Начинать	118 013 588 п.н. ^[1]
Группа	12q24.23	Конец	118 033 130 п.н. ^[1]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Онтология генов
Молекулярная функция	• нуклеотид связывания • ДНК связывания • GO: 0043142 одноцепочечной ДНК хеликаза активность • ГО: 0001948 белок , связывающий • связывание АТФ • фермент связывания • Зажим ДНК загрузчика активность
Сотовый компонент	• Комплекс фактора репликации ДНК C • RFC-подобный комплекс Ctf18 • нуклеоплазма • ядро клетки
Биологический процесс	• ремонт нуклеотид-иссечение, ДНК заполнение зазора • безошибочного синтез translesion • подвержены ошибкам синтез translesion • положительной регуляция ДНК-направленной ДНК - полимеразной активности • translesion синтез • транскрипция в сочетании нуклеотида-эксцизионная репарация • ремонт нуклеотида-иссечение, рассечение ДНК • ответа повреждения ДНК, обнаружение повреждений ДНК • ремонт нуклеотид-эксцизионного, разрез ДНК, 5'-к поражению • ДНК репликации • репарации ДНК • теломер обслуживания через пол-консервативной репликация • репликации ДНК ДНК-зависимую • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


5985


72151

Ансамбль


ENSG00000111445


ENSMUSG00000029363

UniProt


P40937


Q9D0F6

RefSeq (мРНК)

NM_001130112 NM_001130113 NM_001206801 NM_007370 NM_181578
NM_001346815


NM_028128

RefSeq (белок)

NP_001123584 NP_001123585 NP_001193730 NP_001333744 NP_031396
NP_853556


NP_082404

Расположение (UCSC)

Chr 12: 118.01 - 118.03 Мб

н / д

PubMed поиск

^[2]

^[3]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Фактор репликации С субъединицей 5 представляет собой белка , который у человека кодируется RFC5 геном . ^[4]^[5]

Функция [ править ]

Для удлинения примированных ДНК-матриц с помощью ДНК-полимеразы дельта и ДНК-полимеразы эпсилон требуются дополнительные белки, ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA) и фактор репликации C (RFC). RFC, также называемый активатором 1, представляет собой белковый комплекс, состоящий из пяти отдельных субъединиц 140, 40, 38, 37 и 36 кДа. Этот ген кодирует субъединицу 36 кДа. Эта субъединица может взаимодействовать с С-концевой областью PCNA. Он образует основной комплекс с субъединицами 38 и 40 кДа. Основной комплекс обладает ДНК-зависимой АТФазной активностью, которая, как было обнаружено, стимулируется PCNA в системе in vitro. Альтернативно сращиваниеСообщалось о вариантах транскриптов, кодирующих разные изоформы. ^[5]

Взаимодействия [ править ]

RFC5 взаимодействует с:

BRD4 , ^[6]
CHTF18 , ^[7]
PCNA , ^[8]^[9]^[10]
RFC2 , ^[8]^[11] и
RFC4 . ^[8]^[11]^[12]^[13]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000111445 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Окумура К, Ноги М, Тагучи Н, декан FB, Чен М, пан ZQ, гурвицева Дж, Сираторьте А, Мураки Y, Озава К (январь 1995). «Присвоение генов субъединиц 36,5 кД (RFC5), 37 кД (RFC4), 38 кД (RFC3) и 40 кДа (RFC2) человеческого фактора репликации C полосам хромосом 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 и 7q11.23 ". Геномика . 25 (1): 274–8. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80135-9 . PMID 7774928 .
^ a b «Ген Entrez: фактор репликации RFC5 C (активатор 1) 5, 36,5 кДа» .
↑ Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Скиортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (18): 6509–20. DOI : 10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002 . PMC 135621 . PMID 12192049 .
^ Бермудез В.П., МАНИВА Y, Таппин я, Ozato К, Yokomori К, J Гурвица (сентябрь 2003). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (18): 10237–42. DOI : 10.1073 / pnas.1434308100 . PMC 193545 . PMID 12930902 .
^ a b c Cai J, Гиббс E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J (июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц человеческого фактора репликации C p40, p37 и p36, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента» . Журнал биологической химии . 272 (30): 18974–81. DOI : 10.1074 / jbc.272.30.18974 . PMID 9228079 .
^ Mossi R, Йонссон ZO, Allen BL, Хардин SH, Hubscher U (январь 1997). «Фактор репликации C взаимодействует с C-концевой стороной ядерного антигена пролиферирующих клеток» . Журнал биологической химии . 272 (3): 1769–76. DOI : 10.1074 / jbc.272.3.1769 . PMID 8999859 .
↑ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA» . Журнал биологической химии . 277 (43): 40362–7. DOI : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID 12171929 .
^ a b Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (сентябрь 1998 г.). «Гидролиз АТФ, катализируемый фактором репликации С человека, требует участия множества субъединиц» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (20): 11607–12. DOI : 10.1073 / pnas.95.20.11607 . PMC 21688 . PMID 9751713 .
^ Руала ДФ, Венкатесан К, Хао Т, Hirozane-Kishikawa Т, Dricot А, Ли Н, Беррис Г.Ф., Джиббонс ФО, Дрезе М, Ayivi-Guedehoussou Н, Klitgord Н, Саймон С, Boxem М, Мильштейн S, Розенберг J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Перейти ↑ Ellison V, Stillman B (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой активностью АТФазы» . Журнал биологической химии . 273 (10): 5979–87. DOI : 10.1074 / jbc.273.10.5979 . PMID 9488738 .

Дальнейшее чтение [ править ]

О'Доннелл М., Онраст Р., Дин Ф. Б., Чен М., Гурвиц Дж. (Январь 1993 г.). «Гомология дополнительных белков репликативных полимераз - E. coli для человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (1): 1–3. DOI : 10.1093 / nar / 21.1.1 . PMC 309057 . PMID 8441605 .
Ульманн Ф., Цай Дж., Флорес-Розас Х., Дин Ф. Б., Финкельштейн Дж., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июнь 1996 г.). «Восстановление человеческого фактора репликации С из его пяти субъединиц in vitro» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (13): 6521–6. DOI : 10.1073 / pnas.93.13.6521 . PMC 39056 . PMID 8692848 .
Мосси Р., Йонссон З.О., Аллен Б.Л., Хардин С.Х., Хюбшер Ю. (январь 1997 г.). «Фактор репликации C взаимодействует с C-концевой стороной ядерного антигена пролиферирующих клеток» . Журнал биологической химии . 272 (3): 1769–76. DOI : 10.1074 / jbc.272.3.1769 . PMID 8999859 .
Куек Т.П., Чо Х., Мальдонадо Э., Мейер Дж., Рейнберг Д., Петерлин Б.М. (апрель 1997 г.). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с холоферментом РНК-полимеразы II» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (4): 1817–23. DOI : 10.1128 / mcb.17.4.1817 . PMC 232028 . PMID 9121429 .
Цай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц человеческого фактора репликации C p40, p37 и p36, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента» . Журнал биологической химии . 272 (30): 18974–81. DOI : 10.1074 / jbc.272.30.18974 . PMID 9228079 .
Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (декабрь 1997 г.). «Идентификация белков репликации ДНК и клеточного цикла, которые взаимодействуют с PCNA» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (24): 5041–6. DOI : 10.1093 / NAR / 25.24.5041 . PMC 147130 . PMID 9396813 .
Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой активностью АТФазы» (PDF) . Журнал биологической химии . 273 (10): 5979–87. DOI : 10.1074 / jbc.273.10.5979 . PMID 9488738 . S2CID 17647091 .
Цай Дж, Яо Н., Гиббс Э., Финкельштейн Дж., Филлипс Б., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Сентябрь 1998 г.). «Гидролиз АТФ, катализируемый фактором репликации С человека, требует участия множества субъединиц» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (20): 11607–12. DOI : 10.1073 / pnas.95.20.11607 . PMC 21688 . PMID 9751713 .
Чжан Г., Гиббс Э., Кельман З., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Март 1999 г.). «Исследования взаимодействий между фактором репликации С человека и ядерным антигеном пролиферирующих клеток человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (5): 1869–74. DOI : 10.1073 / pnas.96.5.1869 . PMC 26703 . PMID 10051561 .
Линдси-Больц Л.А., Бермудес В.П., Гурвиц Дж., Санкар А. (сентябрь 2001 г.). «Очистка и характеристика комплексов Rad в контрольной точке повреждения ДНК человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (20): 11236–41. DOI : 10.1073 / pnas.201373498 . PMC 58713 . PMID 11572977 .
Гриффит Дж. Д., Линдси-Больц Л. А., Санкар А. (май 2002 г.). «Структуры человеческого Rad17-фактор репликации C и контрольных точек Rad 9-1-1, визуализированные с помощью глицеринового спрея / низковольтной микроскопии» . Журнал биологической химии . 277 (18): 15233–6. DOI : 10.1074 / jbc.C200129200 . PMID 11907025 .
Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA» . Журнал биологической химии . 277 (43): 40362–7. DOI : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID 12171929 .
Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (18): 6509–20. DOI : 10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002 . PMC 135621 . PMID 12192049 .
Венцловас К., Колвин М.Э., Телен депутат (октябрь 2002 г.). «Анализ взаимодействий на основе молекулярного моделирования в RFC-зависимом процессе зажима» . Белковая наука . 11 (10): 2403–16. DOI : 10.1110 / ps.0214302 . PMC 2373712 . PMID 12237462 .
Меркл С.Дж., Карниц Л.М., Генри-Санчес Д.Т., Чен Дж. (Август 2003 г.). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении когезии сестринских хроматид» . Журнал биологической химии . 278 (32): 30051–6. DOI : 10.1074 / jbc.M211591200 . PMID 12766176 .
Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (18): 10237–42. DOI : 10.1073 / pnas.1434308100 . PMC 193545 . PMID 12930902 .
Цзоу Л., Лю Д., Элледж С.Дж. (ноябрь 2003 г.). «Репликация белка А-опосредованного рекрутирования и активации комплексов Rad17» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (24): 13827–32. DOI : 10.1073 / pnas.2336100100 . PMC 283506 . PMID 14605214 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000111445 - Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7774928-4] Окумура К, Ноги М, Тагучи Н, декан FB, Чен М, пан ZQ, гурвицева Дж, Сираторьте А, Мураки Y, Озава К (январь 1995). «Присвоение генов субъединиц 36,5 кД (RFC5), 37 кД (RFC4), 38 кД (RFC3) и 40 кДа (RFC2) человеческого фактора репликации C полосам хромосом 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 и 7q11.23 ". Геномика . 25 (1): 274–8. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80135-9 . PMID 7774928 .

[entrez-5] «Ген Entrez: фактор репликации RFC5 C (активатор 1) 5, 36,5 кДа» .

[pmid12192049-6] Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Скиортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (18): 6509–20. DOI : 10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002 . PMC 135621 . PMID 12192049 .

[pmid12930902-7] Бермудез В.П., МАНИВА Y, Таппин я, Ozato К, Yokomori К, J Гурвица (сентябрь 2003). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (18): 10237–42. DOI : 10.1073 / pnas.1434308100 . PMC 193545 . PMID 12930902 .

[pmid9228079-8] Cai J, Гиббс E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J (июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц человеческого фактора репликации C p40, p37 и p36, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента» . Журнал биологической химии . 272 (30): 18974–81. DOI : 10.1074 / jbc.272.30.18974 . PMID 9228079 .

[pmid8999859-9] Mossi R, Йонссон ZO, Allen BL, Хардин SH, Hubscher U (январь 1997). «Фактор репликации C взаимодействует с C-концевой стороной ядерного антигена пролиферирующих клеток» . Журнал биологической химии . 272 (3): 1769–76. DOI : 10.1074 / jbc.272.3.1769 . PMID 8999859 .

[pmid12171929-10] Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA» . Журнал биологической химии . 277 (43): 40362–7. DOI : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID 12171929 .

[pmid9751713-11] Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (сентябрь 1998 г.). «Гидролиз АТФ, катализируемый фактором репликации С человека, требует участия множества субъединиц» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (20): 11607–12. DOI : 10.1073 / pnas.95.20.11607 . PMC 21688 . PMID 9751713 .

[pmid16189514-12] Руала ДФ, Венкатесан К, Хао Т, Hirozane-Kishikawa Т, Dricot А, Ли Н, Беррис Г.Ф., Джиббонс ФО, Дрезе М, Ayivi-Guedehoussou Н, Klitgord Н, Саймон С, Boxem М, Мильштейн S, Розенберг J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid9488738-13] Перейти ↑ Ellison V, Stillman B (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой активностью АТФазы» . Журнал биологической химии . 273 (10): 5979–87. DOI : 10.1074 / jbc.273.10.5979 . PMID 9488738 .

[1]