Репликационный белок А2

RPA2

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1DPU , 1L1O , 1QUQ , 1Z1D , 2PI2 , 2PQA , 2Z6K , 3KDF , 4MQV , 4OU0

Идентификаторы

Псевдонимы

RPA2 , REPA2, RP-A p32, RP-A p34, RPA32, белок репликации A2

Внешние идентификаторы

OMIM : 179836 MGI : 1339939 HomoloGene : 37712 GeneCards : RPA2

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 1 (человека) ^[1]

Группа	1п35.3	Начинать	27 891 524 п.н. ^[1]
Группа	1п35.3	Конец	27 914 746 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 4 (мышь) ^[2]

Группа	4 \| 4 D2.3	Начинать	132 768 332 п.н. ^[2]
Группа	4 \| 4 D2.3	Конец	132 778 752 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ДНК • белок N-конец связывание • связывания одноцепочечной ДНК • поврежденная ДНК связывания • ГО: 0001948 связывания белки • фермент связывания • белок фосфатазов связывание • убиквитиным белка лигаза связывания • связывание G-богатая цепь теломерной ДНК • двухцепочечной ДНК связывание • связывание с последовательностью ДНК
Сотовый компонент	• место двухцепочечного разрыва • тело PML • нуклеоплазма • хромосома, теломерная область • комплекс фактора репликации ДНК A • хроматин • ядро • тело ядра • конденсированная ядерная хромосома
Биологический процесс	• ремонт нуклеотид-иссечение, заполнение зазора ДНК • рекомбинация ДНК • interstrand ремонт поперечных связей • регулирование ремонта разрыва двойной нити с помощью гомологичной рекомбинации • безошибочное синтез translesion • фазы G1 • подверженных ошибки синтеза translesion • клеточного ответа на повреждение ДНК стимул • репликация ДНК • сигнализация контрольной точки митотического повреждения ДНК G1 • регулировка контрольной точки повреждения ДНК • регулирование клеточного ответа на тепло • восстановление несоответствия • синтез трансфузии • транскрипцией в сочетании нуклеотид-эксцизионной репарации • нуклеотид-эксцизионной репарации ДНК Разрез • ответ повреждение ДНК, обнаружение повреждений ДНК • ремонт основного иссечение • нуклеотид-эксцизионной репарации • нуклеотид-эксцизионной репарации, preincision комплексная стабилизация • регулирование сигнальной трансдукции с помощью р53 класс медиатор • репарация ДНК • двухцепочечный ремонт разрыва посредством гомологичной рекомбинации • ремонта нуклеотида-эксцизионного, preincision сложной сборки • нуклеотида-эксцизионной репарации ДНК, разрез, 5'-к поражению • нуклеотид-эксцизионной репарация ДНК надрез, 3'-к поражение • локализации белка на хромосому • теломер обслуживание • теломер обслуживание через пол-консервативную репликацию • G1 S переход / митотический клеточный цикл • теломер обслуживания через рекомбинацию • топологическое изменение ДНК • ДНК размотки , участвующий в репликации ДНК • митотической рекомбинация • теломер обслуживание через теломеразу • обратные мейотическая рекомбинация • образование гетеродуплекса • положительная регуляция активности геликазы
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6118


19891

Ансамбль


ENSG00000117748


ENSMUSG00000028884

UniProt


P15927


Q62193

RefSeq (мРНК)


NM_001286076 NM_001297558 NM_002946 NM_001355128 NM_001355129


NM_011284

RefSeq (белок)


NP_001273005 NP_001284487 NP_002937 NP_001342057 NP_001342058


н / д

Расположение (UCSC)

Chr 1: 27,89 - 27,91 Мб

Chr 4: 132,77 - 132,78 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Белок репликации 32 кДа субъединицы представляет собой белок , который у человека кодируется RPA2 гена . ^[5]^[6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что RPA2 взаимодействует с:

Циклин О , ^[7]
ДНК-PKcs , ^[8]
Ku70 , ^[8]
MEN1 , ^[9]
RPA3 , ^[10]^[11]
Репликационный белок A1 , ^[8]^[10]
STAT3 , ^[12]
TP53BP1 ^[13] и
Урацил-ДНК-гликозилаза . ^[14]

См. Также [ править ]

Одноцепочечный связывающий белок
Репликационный белок А
Репликационный белок A1
Репликационный белок A3

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000117748 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028884 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Келли TJ (март 1993). «Клонирование, сверхэкспрессия и геномное картирование 14-кДа субъединицы человеческого белка репликации А» . Журнал биологической химии . 268 (9): 6131–8. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 53229-4 . PMID 8454588 .
^ «Энтрез Ген: Репликационный белок А2 RPA2, 32 кДа» .
^ Otterlei МЫ, Warbrick Е, Nagelhus Т.А., Хауг Т, Slupphaug G, Акберите М, Аас П.А., Steinsbekk К, Бакка О, ОН Krokan (июль 1999). «Пострепликативная эксцизионная репарация оснований в очагах репликации» . Журнал EMBO . 18 (13): 3834–44. DOI : 10.1093 / emboj / 18.13.3834 . PMC 1171460 . PMID 10393198 .
^ a b c Шао Р.Г., Цао С.Х., Чжан Х., Кон К.В., Уолд М.С., Помьер Y (март 1999 г.). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином индуцирует фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK» . Журнал EMBO . 18 (5): 1397–406. DOI : 10.1093 / emboj / 18.5.1397 . PMC 1171229 . PMID 10064605 .
^ Суходолец К.Е., Хикман А.Б., Агарвал С.К., Суходолец М.В., Обунгу В.Х., Новотный Е.А., Крабтри Дж. С., Чандрасекхараппа С. К., Коллинз Ф. С., Шпигель А. М., Бернс А. Л., Маркс С. Дж. (Январь 2003 г.). «32-килодальтонная субъединица репликационного белка А взаимодействует с менином, продуктом гена-супрессора опухоли MEN1» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (2): 493–509. DOI : 10.1128 / mcb.23.2.493-509.2003 . PMC 151531 . PMID 12509449 .
^ a b Бочкарева Е., Королев С., Лис-Миллер С. П., Бочкарев А. (апрель 2002 г.). «Структура ядра тримеризации RPA и его роль в многоступенчатом ДНК-связывающем механизме RPA» . Журнал EMBO . 21 (7): 1855–63. DOI : 10.1093 / emboj / 21.7.1855 . PMC 125950 . PMID 11927569 .
^ Бочкарева E, Frappier L, Эдвардс М., Бочкарев A (февраль 1998). «Субъединица RPA32 репликационного белка А человека содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен» . Журнал биологической химии . 273 (7): 3932–6. DOI : 10.1074 / jbc.273.7.3932 . PMID 9461578 .
Перейти ↑ Kim J, Kim D, Chung J (2000). «Репликационный белок субъединицы 32 кДа (RPA p32) связывает SH2-домен STAT3 и регулирует его транскрипционную активность». Cell Biology International . 24 (7): 467–73. DOI : 10,1006 / cbir.2000.0525 . PMID 10875894 . S2CID 23783745 .
↑ Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (август 2005 г.). «53BP1 связан с репликационным белком А и необходим для гиперфосфорилирования RPA2 после повреждения ДНК» . Онкоген . 24 (35): 5423–30. DOI : 10.1038 / sj.onc.1208710 . PMID 15856006 .
^ Nagelhus Т.А., Хауг Т, Синг К. К., К. Ф. Кешав, Скорпен Ж, Otterlei М, Бхарати S, Линдмо Т, Benichou S, Benarous R, Krokan ОН (март 1997). «Последовательность в N-концевой области урацил-ДНК-гликозилазы человека, гомологичная XPA, взаимодействует с C-концевой частью субъединицы 34 кДа репликационного белка A» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6561–6. DOI : 10.1074 / jbc.272.10.6561 . PMID 9045683 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Датта А., Стиллман Б. (июнь 1992 г.). «Киназы семейства cdc2 фосфорилируют фактор репликации ДНК клетки человека, RPA, и активируют репликацию ДНК» . Журнал EMBO . 11 (6): 2189–99. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05278.x . PMC 556686 . PMID 1318195 .
Эрдайл Л.Ф., Уолд М.С., Келли Т.Дж. (февраль 1990 г.). «Первичная структура субъединицы 32 кДа репликационного белка А человека» . Журнал биологической химии . 265 (6): 3177–82. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 39750-9 . PMID 2406247 .
Ли Л., Лу Х, Петерсон, Калифорния, Легерски Р.Дж. (октябрь 1995 г.). «Взаимодействие между фактором репарации ДНК XPA и репликационным белком А, по-видимому, необходимо для эксцизионной репарации нуклеотидов» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (10): 5396–402. DOI : 10.1128 / mcb.15.10.5396 . PMC 230789 . PMID 7565690 .
Umbricht CB, Griffin CA, Hawkins AL, Grzeschik KH, O'Connell P, Leach R, Green ED, Kelly TJ (март 1994). «Геномное картирование с высоким разрешением трех генов человеческого белка репликации А (RPA1, RPA2 и RPA3)». Геномика . 20 (2): 249–57. DOI : 10.1006 / geno.1994.1161 . PMID 8020972 .
Нагельхус Т.А., Хауг Т., Сингх К.К., Кешав К.Ф., Скорпен Ф., Оттерлей М., Бхарати С., Линдмо Т., Бенишоу С., Бенарус Р., Крокан Х.Э. (март 1997 г.). «Последовательность в N-концевой области урацил-ДНК-гликозилазы человека, гомологичная XPA, взаимодействует с C-концевой частью субъединицы 34 кДа репликационного белка A» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6561–6. DOI : 10.1074 / jbc.272.10.6561 . PMID 9045683 .
Amacker M, Hottiger M, Mossi R, Hübscher U (март 1997 г.). «Белок нуклеокапсида ВИЧ-1 и белок репликации А влияют на синтез ДНК смещения цепи лентивирусной обратной транскриптазы». СПИД . 11 (4): 534–6. PMID 9084803 .
Ню Х, Эрдджумент-Бромаж Х, Пан З. К., Ли Ш., Темпст П., Гурвиц Дж. (Май 1997 г.). «Картирование аминокислотных остатков в субъединице p34 одноцепочечного ДНК-связывающего белка человека, фосфорилированного ДНК-зависимой протеинкиназой и киназой Cdc2 in vitro» . Журнал биологической химии . 272 (19): 12634–41. DOI : 10.1074 / jbc.272.19.12634 . PMID 9139719 .
Зерник-Кобак М., Васуниа К., Коннелли М., Андерсон К.В., Диксон К. (сентябрь 1997 г.). «Сайты УФ-индуцированного фосфорилирования субъединицы p34 репликационного белка А из клеток HeLa» . Журнал биологической химии . 272 (38): 23896–904. DOI : 10.1074 / jbc.272.38.23896 . PMID 9295339 .
Бочкарева Е., Фраппье Л., Эдвардс А.М., Бочкарев А. (февраль 1998 г.). «Субъединица RPA32 репликационного белка А человека содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен» . Журнал биологической химии . 273 (7): 3932–6. DOI : 10.1074 / jbc.273.7.3932 . PMID 9461578 .
Шао Р.Г., Цао С.Х., Чжан Х., Кон К.В., Уолд М.С., Помье Й. (март 1999 г.). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином индуцирует фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK» . Журнал EMBO . 18 (5): 1397–406. DOI : 10.1093 / emboj / 18.5.1397 . PMC 1171229 . PMID 10064605 .
Оттерлей М., Варбрик Э., Нагельхус Т.А., Хауг Т., Слуппхауг Г., Акбари М., Аас ПА, Стейнсбек К., Бакке О., Крокан Х.Э. (июль 1999 г.). «Пострепликативная эксцизионная репарация оснований в очагах репликации» . Журнал EMBO . 18 (13): 3834–44. DOI : 10.1093 / emboj / 18.13.3834 . PMC 1171460 . PMID 10393198 .
Бочкарев A, Бочкарева E, Frappier L, Edwards AM (август 1999 г.). «Кристаллическая структура комплекса субъединиц репликационного белка А RPA32 и RPA14 раскрывает механизм связывания одноцепочечной ДНК» . Журнал EMBO . 18 (16): 4498–504. DOI : 10.1093 / emboj / 18.16.4498 . PMC 1171524 . PMID 10449415 .
Лао Й, Гомес XV, Рен Й, Тейлор Дж. С., Уолд М.С. (февраль 2000 г.). «Взаимодействие белка репликации А с ДНК. III. Молекулярные основы распознавания поврежденной ДНК». Биохимия . 39 (5): 850–9. DOI : 10.1021 / bi991704s . PMID 10653628 .
Костелло Дж. Ф., Фрювальд МС, Смираглия Д. Дж., Раш Л. Дж., Робертсон Г. П., Гао Х, Райт Ф. А., Ферамиско Д. Д., Пелтомяки П., Ланг Дж. К., Шуллер Д. Е., Ю. Л., Bloomfield CD, Калиджури М. А., Йетс А., Нишикава Р. H, Петрелли, штат Нью-Джерси, Чжан Х, О'Дорисио, М.С., Хелд, Вашингтон, Кавени, В.К., Пласс С. (февраль 2000 г.). «Аберрантное метилирование CpG-островков имеет неслучайные и специфичные для опухолевого типа паттерны». Генетика природы . 24 (2): 132–8. DOI : 10.1038 / 72785 . PMID 10655057 . S2CID 6273676 .
Ким Дж, Ким Д, Чанг Дж (2000). «Репликационный белок субъединицы 32 кДа (RPA p32) связывает SH2-домен STAT3 и регулирует его транскрипционную активность». Cell Biology International . 24 (7): 467–73. DOI : 10,1006 / cbir.2000.0525 . PMID 10875894 . S2CID 23783745 .
Cho JM, Song DJ, Bergeron J, Benlimame N, Wold MS, Alaoui-Jamali MA (сентябрь 2000 г.). «RBT1, новый коактиватор транскрипции, связывает вторую субъединицу репликационного белка А» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (18): 3478–85. DOI : 10.1093 / NAR / 28.18.3478 . PMC 110737 . PMID 10982866 .
Кисть GS, Келли Т.Дж. (октябрь 2000 г.). «Фосфорилирование белка репликации большой субъединицы в ответе контрольной точки Saccharomyces cerevisiae» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (19): 3725–32. DOI : 10.1093 / NAR / 28.19.3725 . PMC 110765 . PMID 11000264 .
Мер Г., Бочкарев А., Гупта Р., Бочкарева Е., Фраппье Л., Инглес С.Дж., Эдвардс А.М., Чазин В.Дж. (октябрь 2000 г.). «Структурная основа для распознавания белков репарации ДНК UNG2, XPA и RAD52 фактором репликации RPA». Cell . 103 (3): 449–56. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 00136-7 . PMID 11081631 . S2CID 16640087 .
Habel JE, Ohren JF, Borgstahl GE (февраль 2001 г.). «Динамический светорассеивающий анализ полноразмерного димера RPA14 / 32 человека: очистка, кристаллизация и самоассоциация» . Acta Crystallographica Раздел D . 57 (Pt 2): 254–9. DOI : 10.1107 / S0907444900015225 . PMID 11173472 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000117748 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028884 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8454588-5] Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Келли TJ (март 1993). «Клонирование, сверхэкспрессия и геномное картирование 14-кДа субъединицы человеческого белка репликации А» . Журнал биологической химии . 268 (9): 6131–8. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 53229-4 . PMID 8454588 .

[6] «Энтрез Ген: Репликационный белок А2 RPA2, 32 кДа» .

[pmid10393198-7] Otterlei МЫ, Warbrick Е, Nagelhus Т.А., Хауг Т, Slupphaug G, Акберите М, Аас П.А., Steinsbekk К, Бакка О, ОН Krokan (июль 1999). «Пострепликативная эксцизионная репарация оснований в очагах репликации» . Журнал EMBO . 18 (13): 3834–44. DOI : 10.1093 / emboj / 18.13.3834 . PMC 1171460 . PMID 10393198 .

[pmid10064605-8] Шао Р.Г., Цао С.Х., Чжан Х., Кон К.В., Уолд М.С., Помьер Y (март 1999 г.). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином индуцирует фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK» . Журнал EMBO . 18 (5): 1397–406. DOI : 10.1093 / emboj / 18.5.1397 . PMC 1171229 . PMID 10064605 .

[pmid12509449-9] Суходолец К.Е., Хикман А.Б., Агарвал С.К., Суходолец М.В., Обунгу В.Х., Новотный Е.А., Крабтри Дж. С., Чандрасекхараппа С. К., Коллинз Ф. С., Шпигель А. М., Бернс А. Л., Маркс С. Дж. (Январь 2003 г.). «32-килодальтонная субъединица репликационного белка А взаимодействует с менином, продуктом гена-супрессора опухоли MEN1» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (2): 493–509. DOI : 10.1128 / mcb.23.2.493-509.2003 . PMC 151531 . PMID 12509449 .

[pmid11927569-10] Бочкарева Е., Королев С., Лис-Миллер С. П., Бочкарев А. (апрель 2002 г.). «Структура ядра тримеризации RPA и его роль в многоступенчатом ДНК-связывающем механизме RPA» . Журнал EMBO . 21 (7): 1855–63. DOI : 10.1093 / emboj / 21.7.1855 . PMC 125950 . PMID 11927569 .

[pmid9461578-11] Бочкарева E, Frappier L, Эдвардс М., Бочкарев A (февраль 1998). «Субъединица RPA32 репликационного белка А человека содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен» . Журнал биологической химии . 273 (7): 3932–6. DOI : 10.1074 / jbc.273.7.3932 . PMID 9461578 .

[pmid10875894-12] Перейти ↑ Kim J, Kim D, Chung J (2000). «Репликационный белок субъединицы 32 кДа (RPA p32) связывает SH2-домен STAT3 и регулирует его транскрипционную активность». Cell Biology International . 24 (7): 467–73. DOI : 10,1006 / cbir.2000.0525 . PMID 10875894 . S2CID 23783745 .

[pmid15856006-13] Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (август 2005 г.). «53BP1 связан с репликационным белком А и необходим для гиперфосфорилирования RPA2 после повреждения ДНК» . Онкоген . 24 (35): 5423–30. DOI : 10.1038 / sj.onc.1208710 . PMID 15856006 .

[pmid9045683-14] Nagelhus Т.А., Хауг Т, Синг К. К., К. Ф. Кешав, Скорпен Ж, Otterlei М, Бхарати S, Линдмо Т, Benichou S, Benarous R, Krokan ОН (март 1997). «Последовательность в N-концевой области урацил-ДНК-гликозилазы человека, гомологичная XPA, взаимодействует с C-концевой частью субъединицы 34 кДа репликационного белка A» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6561–6. DOI : 10.1074 / jbc.272.10.6561 . PMID 9045683 .

[1]