Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
RPS27A
Белок RPS27A PDB 1aar.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2KTF , 2L0F , 2L0T , 2XK5 , 3AXC , 3NHE , 3NOB , 3PHW , 3TBL , 4UG0 , 4V6X , 5AJ0 , 4R62 , 5FLX , 4UJD , 4KZZ , 4UJC , 3J7P , 4KZY , 4DJ5 , 4D , 4D , 4D , 4D , 4D

Идентификаторы
ПсевдонимыRPS27A , CEP80, HEL112, S27A, UBA80, UBC, UBCEP1, UBCEP80, рибосомный белок S27a
Внешние идентификаторыOMIM : 191343 MGI : 1925544 HomoloGene : 37715 GeneCards : RPS27A
Расположение гена ( человек )
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человека) [1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение RPS27A
Геномное расположение RPS27A
Группа2п16.1Начинать55 231 903 п.н. [1]
Конец55 235 853 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Группа11 | 11 A3.3Начинать29 545 846 п.н. [2]
Конец29 548 109 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание с ионами металлов
• структурная составляющая рибосомы
• связывание с белком GO: 0001948
• связывание с РНК
• белковая метка
• связывание убиквитин-протеин-лигазы
Сотовый компонент• цитоплазма
• мембрана эндоцитарных везикул
• цитозоль
• мембрана
• ядро клетки
• рибосома
• миелин
• цитозольная малая субъединица рибосомы
• ядрышко
• внеклеточная экзосома
• клеточная мембрана
• нуклеоплазма
• малая субъединица рибосомы
• мембрана эндосомы
• внеклеточная
• внешняя мембрана митохондрий
• эндоплазматическая ретракция отсек
• везикула
• мембрана эндоплазматического ретикулума
• клетка-хозяин
Биологический процесс• реакция на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла
• негативная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста
• межцепочечная репарация поперечных связей
• эксцизионная репарация нуклеотидов, распознавание повреждений ДНК
• позитивная регуляция канонического сигнального пути Wnt
• Опосредованный фактором некроза опухоли сигнальный путь
• регуляция продукции интерферона типа I
• TRIF-зависимый сигнальный путь толл-подобных рецепторов
• сигнальный путь рецептора Fc-эпсилон
• эндосомный транспорт
• глобальная эксцизионная репарация генома
• Передача сигналов NIK / NF-kappaB
• G2 / M переход митотического клеточного цикла
• стресс-активируемый каскад MAPK
• сигнальный путь бета-рецептора трансформирующего фактора роста
• макроаутофагия
• негативная регуляция канонического пути передачи сигнала Wnt
• реакция на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК
• нуклеотид - репарация эксцизии, заполнение пробелов в ДНК
• вирусная транскрипция
• безошибочный синтез транслезии
• регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли
• стимулирующий сигнальный путь рецептора лектина С-типа
• отрицательная регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста
• SRP-зависимое нацеливание котрансляционного белка на мембрану
• каскад JNK
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию
• эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК
• I-kappaB киназа / NF передача сигналов -kappaB
• врожденная иммунная система
• путь передачи сигналов Notch
• регуляция стабильности мРНК
• полиубиквитинирование белков
• негативная регуляция апоптотического процесса
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• сборка вириона
• активация активности MAPK
• позитивная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB
• комплексно-зависимый катаболический процесс, стимулирующий анафазу
• негативная регуляция продукции интерферона типа I
• ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, нонсенс-опосредованный распад
• связывание нуклеотидов домен олигомеризации, содержащий сигнальный путь
• метаболический процесс клеточного белка
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса
• GO: 0019067 жизненный цикл вируса
• MyD88-зависимый путь передачи сигнала толл-подобного рецептора
• подверженный ошибкам синтез трансфузии
• МАРК каскад
• фибробластов рецептор фактора роста сигнальный путь
• ионный трансмембранный транспорт
• гликоген биосинтетического процесс
• положительного регулирование апоптотической процесса
• инициация трансляция
• положительное регулирование I-kappaB киназы / NF-kappaB сигнализация
• translesion синтез
• транскрипция в сочетании нуклеотида-эксцизионная репарация
• Путь передачи сигналов Т-клеточного рецептора
• Независимый от MyD88 сигнальный путь толл-подобного рецептора
• Положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• Регулирование передачи сигнала медиатором класса p53
• положительная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста
• сигнальный путь Wnt
• эксцизионная репарация нуклеотидов, раскручивание дуплекса ДНК
• эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-к повреждению
• биосинтез белка
• процессинг рРНК
• сигнальный путь ERBB2
• передача сигналов Wnt путь, планарная полярность клеток пути
• нуклеотид-эксцизионная репарация, preincision комплекс сборка
• протеасома-опосредованная убиквитин-зависимого белок процесса катаболического
• откидных белок
• отрицательное регулирование / M перехода G2 митотического клеточный цикл
• убиквитинирование белков
• деубиквитинирование белков
• SCF-зависимый протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс
• проникновение бактерии в хозяйскую клетку
• трансмембранный транспорт
• регуляция некроптотического процесса
• мембранная организация
• тримминг маннозы в эндоплазматическом ретикулуме
• клеточный гомеостаз ионов железа
• регуляция гемопоэтических стволовых клеток дифференцировка
• нацеливание белка на пероксисому
• цитокин-опосредованный сигнальный путь
• зависимый от модификации катаболический процесс белка
• сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-1
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6233

78294

Ансамбль

ENSG00000143947

ENSMUSG00000020460

UniProt

P62979

P62983

RefSeq (мРНК)

NM_002954
NM_001135592
NM_001177413

NM_001033865
NM_024277

RefSeq (белок)

NP_001129064
NP_001170884
NP_002945

NP_001029037
NP_077239

Расположение (UCSC)Chr 2: 55.23 - 55.24 МбChr 11: 29.55 - 29.55 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

40S рибосомных белков S27a является белком , который в организме человека кодируется RPS27A гена . [5] [6]

Убиквитин , высококонсервативный белок, который играет главную роль в нацеливании клеточных белков на деградацию протеосомой 26S , синтезируется как белок-предшественник, состоящий либо из цепей полиубиквитина, либо из одного убиквитина, слитого с неродственным белком. Этот ген кодирует гибридный белок, состоящий из убиквитина на N-конце и рибосомного белка S27a на C-конце . При экспрессии в дрожжах белок подвергается посттрансляционному процессингу с образованием свободного мономера убиквитина и рибосомного белка S27a. Рибосомный белок S27a является компонентом 40S субъединицы рибосомы.и принадлежит к семейству рибосомных белков S27AE. Он содержит домены « цинковые пальцы» С4-типа и расположен в цитоплазме . В геноме присутствуют псевдогены, производные от этого гена. Как и рибосомный белок S27a, рибосомный белок L40 также синтезируется как гибридный белок с убиквитином; аналогично рибосомный белок S30 синтезируется как гибридный белок с убиквитиноподобным белком fubi. [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000143947 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020460 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Kenmochi N, Кавагути T, Розен S, Davis E Гудман N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (август 1998). «Карта 75 генов рибосомных белков человека» . Genome Res . 8 (5): 509–23. DOI : 10.1101 / gr.8.5.509 . PMID 9582194 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: рибосомный белок S27a RPS27A» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Шерсть И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Biochem. Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. DOI : 10.1139 / o95-101 . PMID  8722009 .
  • Адамс С.М., Шарп М.Г., Уокер Р.А. и др. (1992). «Дифференциальная экспрессия генов, связанных с трансляцией, в доброкачественных и злокачественных опухолях груди человека» . Br. J. Рак . 65 (1): 65–71. DOI : 10.1038 / bjc.1992.12 . PMC  1977345 . PMID  1370760 .
  • Pancré V, Pierce RJ, Fournier F, et al. (1991). «Влияние убиквитина на функции тромбоцитов: возможная идентичность с лимфокином, подавляющим активность тромбоцитов (PASL)». Евро. J. Immunol . 21 (11): 2735–41. DOI : 10.1002 / eji.1830211113 . PMID  1657614 .
  • Канаяма Х., Танака К., Аки М. и др. (1992). «Изменения в экспрессии генов протеасом и убиквитина в раковых клетках почек человека». Cancer Res . 51 (24): 6677–85. PMID  1660345 .
  • Мония Б.П., Эккер Д.Д., Джонналагадда С. и др. (1989). «Синтез генов, экспрессия и обработка белков удлинения карбоксила убиквитина человека». J. Biol. Chem . 264 (7): 4093–103. PMID  2537304 .
  • Редман К.Л., Рехштайнер М (1989). «Идентификация длинного удлинения убиквитина как рибосомного белка S27a». Природа . 338 (6214): 438–40. Bibcode : 1989Natur.338..438R . DOI : 10.1038 / 338438a0 . PMID  2538756 . S2CID  4360107 .
  • Лунд П.К., Моатс-Статс Б.М., Симмонс Дж. Г. и др. (1985). «Анализ нуклеотидной последовательности кДНК, кодирующей человеческий убиквитин, показывает, что убиквитин синтезируется как предшественник». J. Biol. Chem . 260 (12): 7609–13. PMID  2581967 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. J. Biochem . 239 (1): 144–9. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID  8706699 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Киршнер LS, Стратакис CA (2000). «Структура человеческого гена слияния убиквитина Uba80 (RPS27a) и один из его псевдогенов» . Biochem. Биофиз. Res. Commun . 270 (3): 1106–10. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2568 . PMID  10772958 .
  • Петерсен Б.О., Вагенер С., Маринони Ф. и др. (2000). «Протеолиз CDC6 млекопитающих, регулируемый клеточным циклом и ростом клеток, зависит от APC-CDH1» . Genes Dev . 14 (18): 2330–43. DOI : 10,1101 / gad.832500 . PMC  316932 . PMID  10995389 .
  • Болтон Д., Эванс П.А., Стотт К., Бродхерст Р.В. (2002). «Структура и свойства димерного N-концевого фрагмента убиквитина человека». J. Mol. Биол . 314 (4): 773–87. DOI : 10.1006 / jmbi.2001.5181 . PMID  11733996 .
  • Йошихама М., Уэчи Т., Асакава С. и др. (2002). "Гены рибосомных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов" . Genome Res . 12 (3): 379–90. DOI : 10.1101 / gr.214202 . PMC  155282 . PMID  11875025 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Коэн Б.Д., Барито Дж. Т., Магенис Л. М., Диас Дж. А. (2003). «Регулирование резидентности клеточной поверхности рецептора фоллитропина по пути убиквитин-протеасома» . Эндокринология . 144 (10): 4393–402. DOI : 10.1210 / en.2002-0063 . PMID  12960054 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Ли Х, Сет А (2004). «Комплекс RNF11: Smurf2 опосредует убиквитинирование белка AMSH» . Онкоген . 23 (10): 1801–8. DOI : 10.1038 / sj.onc.1207319 . PMID  14755250 .