• катаболический процесс мРНК с ядерной транскрипцией, нонсенс-опосредованный распад • SRP-зависимая котрансляционная доставка белков на мембрану • вирусная транскрипция • созревание SSU-рРНК из трицистронного транскрипта рРНК (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК) • инициация трансляции • биосинтез белков • процессинг рРНК
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
6202
20116
Ансамбль
ENSG00000142937
ENSMUSG00000047675
UniProt
P62241
P62242
RefSeq (мРНК)
NM_001012
NM_009098
RefSeq (белок)
NP_001003
NP_033124
Расположение (UCSC)
Chr 1: 44,78 - 44,78 Мб
н / д
PubMed поиск
[2]
[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
40S рибосомных белков S8 является белком , который в организме человека кодируется RPS8 гена . [4] [5]
Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой 40S-субъединицы и большой 60S-субъединицы . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок, который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S8E. Он находится в цитоплазме. Наблюдалась повышенная экспрессия этого гена в колоректальных опухолях и полипах толстой кишки по сравнению с подобранной нормальной слизистой оболочкой толстой кишки . Этот ген транскрибируется снебольшие ядрышек РНК генов U38A, U38B, U39, U40 и, которые расположены в четвертой, пятой, первой, второй и интронов, соответственно. Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки , существует множество процессированных псевдогенов этого гена, рассредоточенных по геному. [5]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000142937 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Дэвис Б., Фрид М. (март 1993 г.). «Структура гена рибосомного белка S8, содержащего человеческий интрон, и определение его хромосомного положения в 1p32-p34.1». Геномика . 15 (1): 68–75. DOI : 10.1006 / geno.1993.1011 . PMID 8432552 .
^ a b «Ген Entrez: рибосомный белок S8 RPS8» .
Дальнейшее чтение [ править ]
Шерсть И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Биохим. Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. DOI : 10.1139 / o95-101 . PMID 8722009 .
Пог-Гейле К., Гейзер Дж. Р., Шу М. и др. (1991). «Гены рибосомных белков сверхэкспрессируются при колоректальном раке: выделение клона кДНК, кодирующего рибосомный белок S3 человека» . Мол. Клетка. Биол . 11 (8): 3842–9. DOI : 10.1128 / mcb.11.8.3842 . PMC 361167 . PMID 1712897 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. J. Biochem . 239 (1): 144–9. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID 8706699 .
Николосо М., Ку Л.Х., Мишо Б., Bachellerie JP (1996). «Кодируемые интроном антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников для 2'-O-рибозы метилирования рРНК». J. Mol. Биол . 260 (2): 178–95. DOI : 10.1006 / jmbi.1996.0391 . PMID 8764399 .
Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С. и др. (1998). «Карта 75 генов рибосомных белков человека» . Genome Res . 8 (5): 509–23. DOI : 10.1101 / gr.8.5.509 . PMID 9582194 .
Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол . 12 (1): 1–11. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Бреннер С., Деплюс Р., Диделот С. и др. (2005). «Myc подавляет транскрипцию за счет привлечения корепрессора ДНК-метилтрансферазы» . EMBO J . 24 (2): 336–46. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600509 . PMC 545804 . PMID 15616584 .
Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Люнг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433 ... 77А . DOI : 10,1038 / природа03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Ю Й, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ субъединицы рибосомы 40S человека: нативные и связанные с IRES комплексы HCV» . Protein Sci . 14 (6): 1438–46. DOI : 10.1110 / ps.041293005 . PMC 2253395 . PMID 15883184 .
Ту LC, Ян X, Худ Л., Линь Б. (2007). «Протеомический анализ интерактома регулируемого ниже гена 1 N-myc и его взаимодействия с программой андрогенного ответа в клетках рака простаты» . Мол. Клетка. Протеомика . 6 (4): 575–88. DOI : 10.1074 / mcp.M600249-MCP200 . PMID 17220478 .