• ДНК - связывающий • иона кальция связывания • связывания РНК - полимераза регуляторной область последовательности-специфическая ДНК II • гомодимеризации активности белка • GO: 0001131, ГО: 0001151, ГО: 0001130, ГО: 0001204 ДНК-связывающей активность фактора транскрипции • ГО: 0001077, ГО : 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II • связывание фактора транскрипции • связывание с белком GO: 0001948 • активность гетеродимеризации протеина • связывание с АТФ • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II
Сотовый компонент
• внутриклеточная мембраносвязанная органелла • ядро клетки • цитозоль • нуклеоплазма • комплекс факторов связывания ядра
Биологический процесс
• развитие нейронов периферической нервной системы • дифференцировка миелоидных клеток • регуляция транскрипции по шаблону ДНК • дифференцировка хондроцитов • оссификация • негативная регуляция дифференцировки гранулоцитов • пролиферация гемопоэтических стволовых клеток • транскрипция, шаблон ДНК • позитивная регуляция ангиогенеза • позитивная регуляция транскрипции , ДНК-шаблон • положительная регуляция продукции интерлейкина-2 • позитивная регуляция дифференцировки гранулоцитов • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция опосредованного цитокинами сигнального пути • регуляция сигнального пути Wnt • регуляция внутриклеточного сигнального пути рецептора эстрогена • регуляция регуляторной дифференцировки Т-клеток • регуляция дифференцировки кератиноцитов • регуляция дифференцировки миелоидных клеток • регуляция дифференцировки мегакариоцитов • регуляция сигнального пути рецептора В-клеток • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток • регуляция сборки двухклеточных плотных соединений • гематопоэз • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • негативная регуляция дифференцировки CD4-позитивных, альфа-бета Т-клеток • позитивная регуляция дифференцировки CD8-позитивных альфа-бета Т-клеток • негативная регуляция экспрессия генов • дифференциация нейронов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
861
12394
Ансамбль
ENSG00000159216
ENSMUSG00000022952
UniProt
Q01196
Q03347
RefSeq (мРНК)
NM_001001890 NM_001122607 NM_001754
NM_001111021 NM_001111022 NM_001111023 NM_009821
RefSeq (белок)
NP_001001890 NP_001116079 NP_001745
н / д
Расположение (UCSC)
Chr 21: 34.79 - 36 Мб
Chr 16: 92,6 - 92,83 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Рунт связанных транскрипционный фактор 1 ( RUNX1 ) , также известный как острый миелоидный лейкоз 1 белка (AML1) или основной-связывающий фактор субъединицы альфа-2 (CBFA2) представляет собой белок , который у человека кодируется Runx1 гена . [5] [6]
RUNX1 является фактором транскрипции , который регулирует дифференцировку из гемопоэтических стволовых клеток в зрелые клетки крови. [7] Кроме того, он играет важную роль в развитии нейронов, передающих боль. [8] Он принадлежит к семейству генов фактора транскрипции Runt-related (RUNX), которые также называют основным связывающим фактором-α (CBFα). Белки RUNX образуют гетеродимерный комплекс с CBFβ, который придает комплексу повышенное связывание с ДНК и стабильность.
Хромосомные транслокации с участием гена RUNX1 связаны с несколькими типами лейкемии, включая M2 AML . [9] Мутации в RUNX1 участвуют в случаях рака груди . [10]
Содержание
1 Ген и белок
2 Открытие и характеристика RUNX1
3 Нокаут мыши
4 Участие в гемопоэзе
5 Мутации и острый миелоидный лейкоз
6 Участие в развитии волосяных фолликулов
7 взаимодействий
8 См. Также
9 ссылки
10 Дальнейшее чтение
11 Внешние ссылки
Ген и белок [ править ]
У человека ген RUNX1 имеет длину 260 тыс. Пар оснований (т.п.н.) и расположен на хромосоме 21 (21q22.12). Ген может транскрибироваться с 2 альтернативных промоторов : промотора 1 (дистальный) или промотора 2 (проксимальный). В результате могут быть синтезированы различные изоформы RUNX1, чему способствует альтернативный сплайсинг . Полноразмерный белок RUNX1 кодируется 12 экзонами . Среди экзонов есть два определенных домена, а именно домен гомологии runt (RHD) или домен runt (экзоны 2, 3 и 4) и домен трансактивации (TAD) (экзон 6). Эти домены необходимы RUNX1 для обеспечения связывания ДНК и белок-белковых взаимодействий соответственно. Транскрипция RUNX1 регулируется 2энхансеры (регуляторный элемент 1 и регуляторный элемент 2), и эти тканеспецифические энхансеры обеспечивают связывание лимфоидных или эритроидных регуляторных белков, поэтому активность гена RUNX1 очень активна в гематопоэтической системе .
Белок RUNX1 состоит из 453 аминокислот. Как фактор транскрипции (TF), его способность связывать ДНК кодируется доменом runt (остатки 50 - 177), который гомологичен семейству p53 . Рент-домен RUNX1 связывается с основной консенсусной последовательностью TGTGGNNN (где NNN может представлять либо TTT, либо TCA). [11] Распознавание ДНК достигается за счет петель 12-ти нитевого β-ствола и С-конца «хвоста» (остатки 170–177), которые зажимают сахарный фосфатный остов и входят в большую и малую бороздки ДНК. Специфичность достигается за счет установления прямых или опосредованных водой контактов с основаниями. RUNX1 может связывать ДНК как мономер, но его аффинность связывания ДНК увеличивается в 10 раз, если он гетеродимеризуется с основным связывающим фактором β (CBFβ), также через домен runt. Фактически, семейство RUNX часто называют α-субъединицами, вместе со связыванием общей β-субъединицы CBFβ, RUNX может вести себя как гетеродимерные факторы транскрипции, вместе называемые основными факторами связывания (CBF).
Консенсусный сайт связывания CBF был идентифицирован как последовательность PyGPyGGTPy длиной 7 п.н. Py обозначает пиримидин, который может быть цитозином или тимином . [12]
Открытие и характеристика RUNX1 [ править ]
Nusslein-Volhard и Wieschaus открыли фактор транскрипции RUNX в скрининге, который проводился для выявления мутаций, которые влияют на количество и полярность сегментов у дрозофилы. [13] Мутация, которая привела к дефектам формирования паттерна пресегментации и появлению зародышей, была названа runt . После этого открытия ген сегментации дрозофилы runt был клонирован Gergen et al. Хотя было продемонстрировано, что белок, кодируемый runt, демонстрирует ядерную транслокацию, еще не было установлено, что этот белок является фактором транскрипции. [14] Впоследствии, в 1991 г., Оки и др. клонировал человеческий RUNX1ген; Было обнаружено, что RUNX1 перестраивается в ДНК лейкозных клеток у пациентов с ОМЛ t (8; 21) (q22; q22). [15] Однако функция RUNX1 человека не была установлена. Вскоре после открытия белка runt дрозофилы и белка RUNX1 человека была обнаружена функция RUNX1. Runx1 очищали как специфичный для последовательности ДНК-связывающий белок, который регулировал специфичность заболевания вирусом мышиного лейкоза Молони. [16] Кроме того, Ито и др. очищенный Runx2, гомолог Runx1. [17] Очищенные факторы транскрипции состояли из двух субъединиц, ДНК-связывающей цепи CBFα (RUNX1 или RUNX2) и не связывающейся ДНК субъединицы, называемой основным связывающим фактором β (CBFβ); аффинность связывания RUNX1 и RUNX2 была значительно увеличена за счет ассоциации с CBFβ. [17][18] [19]
Нокаут мыши [ править ]
Эмбрионы мышей с гомозиготными мутациями по RUNX1 погибли примерно через 12,5 дней. У эмбрионов отсутствовал гемопоэз печени плода. [20]
Подобные эксперименты, проведенные другой исследовательской группой, показали, что эмбрионы с нокаутом умирают между 11,5 и 12,5 днями эмбрионального развития из-за кровотечения в центральной нервной системе (ЦНС). [21]
Участие в гемопоэзе [ править ]
В этом разделе не процитировать любые источники . Пожалуйста, помогите улучшить этот раздел , добавив цитаты из надежных источников . Материал, не полученный от источника, может быть оспорен и удален . ( Ноябрь 2011 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения )
RUNX1 играет решающую роль в (дефинитивном) гематопоэзе взрослых во время эмбрионального развития. Он экспрессируется во всех гемопоэтических участках, которые способствуют образованию гемопоэтических стволовых клеток и клеток-предшественников ( HSPC ), включая желточный мешок, аллантоис , плаценту, парааортальную спланхноплевру (P-Sp; (висцеральный мезодермальный слой), аорта-гонады). - мезонефрос (AGM), пупочные и желточные артерии. HSPC образуются через гемогенный эндотелий., особая группа эндотелиальных клеток, разбросанных по кровеносным сосудам, которые могут дифференцироваться в гемопоэтические клетки. Возникновение HSPCs часто изучают на моделях мышей и рыбок данио, в которых HSPCs появляются как «внутриаортальные» кластеры, которые прикрепляются к вентральной стенке дорсальной аорты. RUNX1 или CBF принимает участие в этом процессе, опосредуя переход эндотелиальной клетки в гематопоэтическую клетку. Появляется все больше доказательств того, что RUNX1 также может быть важным во время примитивного гематопоэза. Это связано с тем, что у мышей с нокаутом RUNX1 примитивные эритроциты проявляли дефектную морфологию, а размер популяции бластных клеток был существенно уменьшен, за исключением отсутствия HSPCs, что могло бы привести к эмбриональной летальности к эмбриональному дню (E) 11,5 - 12,5.
На молекулярном уровне экспрессия гена RUNX1 активируется интронным цис-регуляторным элементом RUNX1 (энхансер +23 RUNX1). Этот энхансер +23 RUNX1 содержит консервативные мотивы, которые стимулируют связывание различных регуляторов гемопоэза, таких как Gata2 , факторы ETS (Fli-1, Elf-1, PU.1) и комплекс SCL / Lmo2 / Ldb1, а также сам RUNX1, действующий. в петле саморегулирования. Как упоминалось ранее, основная роль RUNX1 заключается в модулировании судьбы гематопоэтических клеток. Этого можно добиться за счет связывания с тромбопоэтином.(TPO) рецептор / промотор c-Mpl, за которым следует рекрутирование активаторов транскрипции или репрессоров, чтобы способствовать переходу гемогенного эндотелия в HSC или дифференцировке в клоны более низких гематопоэтических иерархий. RUNX1 также может модулировать свой собственный уровень, регулируя экспрессию Smad6, чтобы нацелиться на протеолиз . [22]
Мутации и острый миелоидный лейкоз [ править ]
В этом разделе не процитировать любые источники . Пожалуйста, помогите улучшить этот раздел , добавив цитаты из надежных источников . Материал, не полученный от источника, может быть оспорен и удален . ( Ноябрь 2011 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения )
Широкий спектр гетерозиготных мутаций зародышевой линии в RUNX1 был связан с семейным заболеванием тромбоцитов, легким нарушением свертываемости крови, связанным с высокой частотой миелоидного лейкоза. [23] По крайней мере 39 форм соматической мутации RUNX1 вовлечены в различные миелоидные злокачественные новообразования. Примеры варьируются от точечных мутаций RUNX1, полученных в результате облучения низкой дозой, приводящих к миелодиспластическим новообразованиям или миелоидным новообразованиям, связанным с терапией, до хромосомной транслокации гена RUNX1 с геном ETO / MTG8 / RUNX1T1, расположенным на хромосоме 8q22, t (8; 21), генерирование гибридного белка AML-ETO, классифицируемого как острый миелоидный лейкоз (AML) M2.
В t (8; 21) точки разрыва часто встречаются в интроне 5-6 RUNX1 и интроне 1b-2 ETO, создавая химерные транскрипты, которые наследуют домен runt от RUNX1, и все области гомологии Nervy (NHR) 1-4 от ETO. . Как следствие, AML-ETO сохраняет способность связываться с генами-мишенями RUNX1, в то же время действуя как репрессор транскрипции посредством рекрутирования корепрессоров и гистоновых деацетилаз , что является внутренней функцией ETO. Онкогенный потенциал AML-ETO проявляется потому, что он блокирует дифференцировку и способствует самообновлению бластных клеток, что приводит к массивному накоплению бластов (> 20%) в костном мозге. Это дополнительно характеризуется гистологически наличием стержней Ауэра иэпигенетически путем ацетилирования лизина по остаткам 24 и 43. Другие действия AML-ETO, которые могут индуцировать лейкемогенез, включают подавление фермента репарации ДНК 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы ( OGG1 ) и повышение уровня внутриклеточных активных форм кислорода , заставляя клетки экспрессировать AML-ETO более подвержен дополнительным генетическим мутациям.
Участие в развитии волосяных фолликулов [ править ]
Впервые было обнаружено, что Runx1 экспрессируется в коже эмбриона мыши. [24] Он экспрессируется в эпителиальном компартменте, чтобы контролировать активацию волосяного фолликула от телогена к анагену посредством активации Wnt singaling и уровней Lef1 [25]. В то же время он экспрессируется в дерме, где он подавляет те же мишени, что способствует эмбриогенному развитию. стержня волоса и фолликулов. [26] В человеческом волосяном фолликуле паттерны экспрессии аналогичны мышиному, что указывает на то, что он играет аналогичную роль. [27] Помимо развития волосяных фолликулов, Runx1 также участвует в развитии рака кожи и эпителия. [27] [28] Таким образом, в поведении Runx1 есть сходство между тканями.
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что RUNX1 взаимодействует с:
C-Fos , [29] [30]
C-июн , [29] [30]
SUV39H1 [31]
TLE1 , [32] и
VDR . [33]
Stat3 [27]
См. Также [ править ]
RUNX2
RUNX3
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000159216 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022952 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Entrez: фактор транскрипции RUNX1, связанный с runt (острый миелоидный лейкоз 1; онкоген aml1)» .
^ Аврамопулос Д, Т Кокс, Blaschak JE, Чакраварти А, Antonarakis SE (октябрь 1992 г.). «Картирование сцепления гена AML1 на хромосоме 21 человека с использованием полиморфизма ДНК в 3'-нетранслируемой области». Геномика . 14 (2): 506–7. DOI : 10.1016 / S0888-7543 (05) 80253-8 . PMID 1427868 .
^ Окуда Т, Нисимура М, Накао М, Фуджит Y (октябрь 2001 г.). «RUNX1 / AML1: центральный игрок в гемопоэзе». Международный журнал гематологии . 74 (3): 252–7. DOI : 10.1007 / bf02982057 . PMID 11721959 . S2CID 5918511 .
^ Chen CL, Метла DC, Liu Y, де Nooij JC, Li Z, Cen C, Самед О.А., Джесселл Т.М., Woolf CJ, Ma Q (февраль 2006). «Runx1 определяет фенотип ноцицептивного сенсорного нейрона и необходим для термической и нейропатической боли». Нейрон . 49 (3): 365–77. DOI : 10.1016 / j.neuron.2005.10.036 . PMID 16446141 . S2CID 16070223 .
^ Asou N (февраль 2003). «Роль фактора транскрипции домена Runt AML1 / RUNX1 в лейкемогенезе и его клинические последствия». Критические обзоры в онкологии / гематологии . 45 (2): 129–50. DOI : 10.1016 / S1040-8428 (02) 00003-3 . PMID 12604126 .
^ Bowers SR, Calero-Nieto FJ, Valeaux S, Fernandez-Fuentes N, Cockerill PN (октябрь 2010 г.). «Runx1 связывается как димерный комплекс с перекрывающимися сайтами Runx1 в палиндромном элементе в энхансере GM-CSF человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (18): 6124–34. DOI : 10.1093 / NAR / gkq356 . PMC 2952845 . PMID 20483917 .
^ Мельникова И.Н., Crute BE, Wang S, Speck NA (апрель 1993 г.). «Специфичность последовательности фактора связывания ядра» . Журнал вирусологии . 67 (4): 2408–11. DOI : 10,1128 / JVI.67.4.2408-2411.1993 . PMC 240414 . PMID 8445737 .
^ Nüsslein-Фольхард, C, Wieschaus, E (октябрь 1980). «Мутации, влияющие на количество сегментов и полярность у дрозофилы». Природа . 287 (5785): 795–801. Bibcode : 1980Natur.287..795N . DOI : 10.1038 / 287795a0 . PMID 6776413 . S2CID 4337658 .
^ Кания, М., Боннер, А. С., Даффи, JB, Джерджен, в JP (октябрь 1990 г.). «Ген runt сегментации дрозофилы кодирует новый ядерный регуляторный белок, который также экспрессируется в развивающейся нервной системе» . Genes Dev . 4 (10): 1701–1713. DOI : 10,1101 / gad.4.10.1701 . PMID 2249771 .
^ Миёси, Н, Shimizu, К, Kozu, Т, Maseki, N, Канеко, Y, Охки, М (декабрь 1991). «Точки разрыва t (8; 21) на хромосоме 21 при остром миелоидном лейкозе сгруппированы в пределах ограниченной области одного гена AML1» . Proc Natl Acad Sci USA . 88 (23): 10431–10434. Bibcode : 1991PNAS ... 8810431M . DOI : 10.1073 / pnas.88.23.10431 . PMC 52942 . PMID 1720541 .
↑ Wang, S, Speck, NA (январь 1992 г.). «Очистка фактора связывания ядра, белка, который связывает консервативный центр ядра в усилителях вируса лейкемии мышей» . Mol Cell Biol . 12 (1): 89–102. DOI : 10,1128 / MCB.12.1.89 . PMC 364072 . PMID 1309596 .
↑ a b Камачи Y, Огава Е., Асано М., Исида С., Мураками И., Сатаке М., Ито Ю., Шигесада К. (октябрь 1990 г.). «Очистка мышиного ядерного фактора, который связывается с ядрами A и B энхансера полиомавируса» . J Virol . 64 (10): 4808–4819. DOI : 10,1128 / JVI.64.10.4808-4819.1990 . PMC 247969 . PMID 2168969 .
Перейти ↑ Ogawa E, Inuzuka M, Maruyama M, Satake M, Naito-Fujimoto M, Ito Y, Shigesada K (май 1993). «Молекулярное клонирование и характеристика PEBP2 бета, гетеродимерного партнера нового ДНК-связывающего белка PEBP2 альфа, связанного с коротышками дрозофилы». Вирусология . 194 (1): 314–331. DOI : 10.1006 / viro.1993.1262 . PMID 8386878 .
↑ Wang, S, Wang, Q, Crute, BE, Melnikova, IN, Keller, SR, Speck, NA (июнь 1993 г.). «Клонирование и характеристика субъединиц Т-клеточного рецептора и фактора связывания ядра энхансера вируса лейкемии мышей» . Mol Cell Biol . 13 (6): 3324–39. DOI : 10,1128 / MCB.13.6.3324 . PMC 359789 . PMID 8497254 .
^ Окуда Т, ван Deursen Дж, Хиберт SW, Grosveld G, Даунинг JR (январь 1996). «AML1, мишень множественных хромосомных транслокаций при лейкемии человека, необходим для нормального кроветворения в печени плода». Cell . 84 (2): 321–30. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80986-1 . PMID 8565077 . S2CID 14180316 .
↑ Wang Q, Stacy T, Binder M, Marin-Padilla M, Sharpe AH, Speck NA (апрель 1996). «Нарушение гена Cbfa2 вызывает некроз и кровотечение в центральной нервной системе и блокирует окончательный гемопоэз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (8): 3444–9. Bibcode : 1996PNAS ... 93.3444W . DOI : 10.1073 / pnas.93.8.3444 . PMC 39628 . PMID 8622955 .
^ Кнежевич К, Би Т, Уилсон К., Джейнс МЕ, Кинстон S, S Polderdijk, Колба-Kokocinski А, Ottersbach К, Pencovich Н, Гронер У, де Брейна M, Göttgens B, Pimanda JE (июль 2011 г.). «Реостат Runx1-Smad6 контролирует активность Runx1 во время эмбрионального гематопоэза» . Молекулярная и клеточная биология . 31 (14): 2817–26. DOI : 10.1128 / MCB.01305-10 . PMC 3133398 . PMID 21576367 .
^ Суд, Раман; Камикубо, Ясухико; Лю, Пол (8 февраля 2017 г.). «Роль RUNX1 в гематологических злокачественных новообразованиях» . Кровь . 129 (15): 2070–2082. DOI : 10.1182 / кровь-2016-10-687830 . PMC 5391618 . PMID 28179279 .
^ Северная Т.Е., де Брейна М.Ф., Stacy T, L, Talebian Lind Е, Робин С Binder М, Е, Dzierzak Спек Н.А. (май 2002 г.). «Экспрессия Runx1 отмечает долгосрочное повторное заселение гемопоэтических стволовых клеток в эмбрионе мышей среднего возраста». Иммунитет . 16 (5): 661–72. DOI : 10.1016 / s1074-7613 (02) 00296-0 . PMID 12049718 .
^ Осорио KM, Ли SE, McDermitt DJ, Waghmare SK, Чжан Ю. В., Ву HN, Tumbar T (март 2008). «Runx1 модулирует активацию стволовых клеток волосяного фолликула, но не вызванную травмой» . Развитие . 135 (6): 1059–68. DOI : 10.1242 / dev.012799 . PMID 18256199 .
^ Осорио KM, Лиля KC, Tumbar T (апрель 2011). «Runx1 регулирует появление и поддержание стволовых клеток взрослого волосяного фолликула из отдельных участков кожи эмбриона» . Журнал клеточной биологии . 193 (1): 235–50. DOI : 10,1083 / jcb.201006068 . PMC 3082184 . PMID 21464233 .
^ a b c Scheitz CJ, Lee TS, McDermitt DJ, Tumbar T (ноябрь 2012 г.). «Определение управляемой тканевыми стволовыми клетками сигнальной оси Runx1 / Stat3 при эпителиальном раке» . Журнал EMBO . 31 (21): 4124–39. DOI : 10.1038 / emboj.2012.270 . PMC 3492731 . PMID 23034403 .
↑ Hoi CS, Lee SE, Lu SY, McDermitt DJ, Osorio KM, Piskun CM, Peters RM, Paus R, Tumbar T (май 2010 г.). «Runx1 напрямую способствует пролиферации стволовых клеток волосяных фолликулов и образованию эпителиальных опухолей в коже мышей» . Молекулярная и клеточная биология . 30 (10): 2518–36. DOI : 10.1128 / MCB.01308-09 . PMC 2863705 . PMID 20308320 .
^ a b Hess J, Porte D, Munz C, Angel P (июнь 2001 г.). «AP-1 и Cbfa / runt физически взаимодействуют и регулируют зависимую от паратироидного гормона экспрессию MMP13 в остеобластах через новый составной элемент 2 / AP-1, специфичный для остеобластов» . Журнал биологической химии . 276 (23): 20029–38. DOI : 10.1074 / jbc.M010601200 . PMID 11274169 .
^ a b D'Alonzo RC, Selvamurugan N, Karsenty G, Partridge NC (январь 2002 г.). «Физическое взаимодействие факторов активатора белка-1 c-Fos и c-Jun с Cbfa1 для активации промотора коллагеназы-3» . Журнал биологической химии . 277 (1): 816–22. DOI : 10.1074 / jbc.M107082200 . PMID 11641401 .
^ Чакраборти S Синха KK, Сенюк V, Nucifora G (август 2003). «SUV39H1 взаимодействует с AML1 и отменяет трансактивность AML1. AML1 метилируется in vivo» . Онкоген . 22 (34): 5229–37. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206600 . PMID 12917624 .
^ Леванон D, Goldstein RE Бернштейн Y, Тан H, D Гольденберг, Stifani S, Paroush Z, Гронер Y (сентябрь 1998). «Репрессия транскрипции с помощью AML1 и LEF-1 опосредуется корепрессорами TLE / Groucho» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (20): 11590–5. Bibcode : 1998PNAS ... 9511590L . DOI : 10.1073 / pnas.95.20.11590 . PMC 21685 . PMID 9751710 .
^ Пуччетти Э, Обрадович Д., Байссерт Т, Бьянкини А, Уошберн Б, Кьярадонна Ф, Берер С., Хельцер Д., Оттманн О.Г., Пеликчи П.Г., Нерви С., Рутхардт М. (декабрь 2002 г.). «Продукты транслокации, связанные с AML, блокируют дифференцировку, вызванную витамином D (3), за счет секвестрации рецептора витамина D (3)». Исследования рака . 62 (23): 7050–8. PMID 12460926 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Nucifora G, Rowley JD (июль 1995 г.). «AML1 и транслокации 8; 21 и 3; 21 при остром и хроническом миелоидном лейкозе» . Кровь . 86 (1): 1–14. DOI : 10.1182 / blood.V86.1.1.bloodjournal8611 . PMID 7795214 .
Перри К., Элдор А., Сорек Х. (март 2002 г.). «Runx1 / AML1 при лейкемии: нарушение связи с различными белками-партнерами». Исследование лейкемии . 26 (3): 221–8. DOI : 10.1016 / S0145-2126 (01) 00128-X . PMID 11792409 .
Имаи О, Курокава М., Идзуцу К., Хангаиси А., Маки К., Огава С., Чиба С., Митани К., Хираи Х (март 2002 г.). «Мутационный анализ гена AML1 у пациентов с миелодиспластическим синдромом». Лейкемия и лимфома . 43 (3): 617–21. DOI : 10.1080 / 10428190290012155 . PMID 12002768 . S2CID 45854670 .
Харт С.М., Форони Л. (декабрь 2002 г.). «Основные гены фактора связывания и лейкемия человека». Haematologica . 87 (12): 1307–23. PMID 12495904 .
Мишо Дж, Скотт HS, Эшер Р. (2003). «AML1 взаимосвязанные пути лейкемогенеза». Исследование рака . 21 (1): 105–36. DOI : 10.1081 / CNV-120018821 . PMID 12643014 . S2CID 19586636 .
Ганли П., Уокер Л.С., Моррис К.М. (январь 2004 г.). «Семейные мутации фактора транскрипции RUNX1 (AML1, CBFA2) предрасполагают к развитию острого миелоидного лейкоза». Лейкемия и лимфома . 45 (1): 1–10. DOI : 10.1080 / 1042819031000139611 . PMID 15061191 . S2CID 10770839 .
Ямада Р., Токухиро С., Чанг X, Ямамото К. (сентябрь 2004 г.). «SLC22A4 и RUNX1: идентификация чувствительных к RA генов». Журнал молекулярной медицины . 82 (9): 558–64. DOI : 10.1007 / s00109-004-0547-у . PMID 15184985 . S2CID 9156168 .
Харада Х, Харада Й, Кимура А (сентябрь 2006 г.). «Влияние соматических мутаций в гене AML1 / RUNX1 на миелодиспластический синдром (МДС): будущие направления молекулярной терапии МДС». Текущие цели противораковых препаратов . 6 (6): 553–65. DOI : 10,2174 / 156800906778194595 . PMID 17017876 .
Внешние ссылки [ править ]
Белок RUNX1 +, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q01196 (фактор транскрипции 1, связанный с Runt человека) в PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q03347 (фактор транскрипции 1, связанный с Mouse Runt) в PDBe-KB .
vтеPDB галерея
1cmo : РАСПОЗНАВАНИЕ И ГЕТЕРОДИМЕРИЗАЦИЯ ДНК ИММУНОГЛОБУЛИНА MOTIF ДЛЯ РАЙНТ-ДОМЕНА PEBP2 / CBF
1co1 : ПАКЕТ CBFA
1e50 : КОМПЛЕКС AML1 / CBF
1ean : ДОМЕН RUNX1 RUNT ПРИ РАЗРЕШЕНИИ 1.25A: СТРУКТУРНЫЙ ПЕРЕКЛЮЧАТЕЛЬ И СПЕЦИАЛЬНО СВЯЗАННЫЕ ИОНЫ ХЛОРИДА МОДУЛИРУЮТ связывание ДНК
1eao : ДОМЕН RUNX1 RUNT ПРИ РАЗРЕШЕНИИ 1.25A: СТРУКТУРНЫЙ ПЕРЕКЛЮЧАТЕЛЬ И СПЕЦИАЛЬНО СВЯЗАННЫЕ ИОНЫ ХЛОРИДА МОДУЛИРУЮТ СВЯЗЬ ДНК
1eaq : RUNX1 RUNT DOMAIN ПРИ РАЗРЕШЕНИИ 1.25A: СТРУКТУРНЫЙ ПЕРЕКЛЮЧАТЕЛЬ И СПЕЦИАЛЬНО СВЯЗАННЫЕ ИОНЫ ХЛОРИДА МОДУЛИРУЮТ связывание ДНК
1h9d : КОМПЛЕКС AML1 / CBF-BETA / ДНК
1hjb : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ДОМЕНА RUNX-1 / AML1 / CBFALPHA И ДИМЕРИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ C / EBPBETA BZIP С ФРАГМЕНТОМ ДНК ИЗ ПРОМОТЕРА CSF-1R
1hjc : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА RUNX-1 / AML1 / CBFALPHA RUNT-ДОМЕНА, СВЯЗАННАЯ С ФРАГМЕНТОМ ДНК ИЗ ПРОМОТЕРА CSF-1R
1io4 : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА RUNX-1 / AML1 / CBFALPHA RUNT DOMAIN-CBFBETA CORE DOMAIN HETERODIMER И C / EBPBETA BZIP HOMODIMER, СВЯЗАННАЯ С ФРАГМЕНТОМ ДНК ИЗ ПРОМОТЕРА CSF-1R
1ljm : узнавание ДНК опосредуется конформационным переходом и изгибом ДНК
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) TEA домен
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТ
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
Т1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также недостаточность фактора транскрипции / корегулятора