Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
рибонуклеозид-дифосфатредуктаза
Идентификаторы
Номер ЕС1.17.4.1
Количество CAS9047-64-7sy
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
BRENDABRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmigo / QuickGO
Поиск
ЧВКстатьи
PubMedстатьи
NCBIбелки

Рибонуклеотидредуктаза ( RNR ), также известная как рибонуклеотиддифосфатредуктаза ( rNDP ), представляет собой фермент, который катализирует образование дезоксирибонуклеотидов из рибонуклеотидов . [1] Он катализирует это образование, удаляя 2'-гидроксильную группу рибозного кольца нуклеозиддифосфатов. Это восстановление производит дезоксирибонуклеотиды. [2] Дезоксирибонуклеотиды, в свою очередь, используются в синтезе ДНК . Реакция, катализируемая RNR, строго сохраняется у всех живых организмов. [3]Кроме того, RNR играет критическую роль в регулировании общей скорости синтеза ДНК, так что соотношение ДНК и массы клетки поддерживается на постоянном уровне во время деления клеток и репарации ДНК . [4] Несколько необычной особенностью фермента RNR является то, что он катализирует реакцию, протекающую по свободнорадикальному механизму действия. [5] [6] Субстратами для RNR являются ADP , GDP , CDP и UDP . dTDP (дезокситимидиндифосфат) синтезируется другим ферментом ( тимидилаткиназой ) из dTMP (дезокситимидинмонофосфат).

Структура [ править ]

Рибонуклеотидредуктазы делятся на три класса. Ферменты RNR класса I состоят из большой альфа-субъединицы и малых бета-субъединиц, которые связываются с образованием активного гетеродимерного тетрамера . Уменьшая NDP до 2'-dNDP, фермент катализирует синтез de novo дезоксирибонуклеотидов (dNTP), которые являются предшественниками синтеза ДНК и необходимы для пролиферации клеток . [7] RNR класса II образуют 5'-дезоксиаденозильный радикал путем гомолитического расщепления связи C-Co в аденозилкобаламине. Кроме того, RNR класса III содержат стабильный глицильный радикал. [8]

Люди несут RNR класса I. Альфа-субъединица кодируется геном RRM1, в то время как существуют две изоформы бета-субъединицы, кодируемые генами RRM2 и RRM2B:

полипептид рибонуклеотидредуктазы M1
Идентификаторы
СимволRRM1
Ген NCBI6240
HGNC10451
OMIM180410
RefSeqNM_001033
UniProtP23921
Прочие данные
Номер ЕС1.17.4.1
LocusChr. 11 стр. 15,5–15,4
Ищи
СтруктурыШвейцарская модель
ДоменыИнтерПро
полипептид рибонуклеотидредуктазы M2
Идентификаторы
СимволRRM2
Ген NCBI6241
HGNC10452
OMIM180390
RefSeqNM_001034
UniProtP31350
Прочие данные
Номер ЕС1.17.4.1
LocusChr. 2 п25-п24
Ищи
СтруктурыШвейцарская модель
ДоменыИнтерПро
рибонуклеотидредуктаза M2 B (индуцибельная TP53)
Идентификаторы
СимволRRM2B
Ген NCBI50484
HGNC17296
OMIM604712
RefSeqNM_015713
UniProtQ9NTD8
Прочие данные
Номер ЕСEC: 1.17.4.1
LocusChr. 8 q23.1
Ищи
СтруктурыШвейцарская модель
ДоменыИнтерПро

Каждый альфа- мономер класса I состоит из трех доменов : [9]

  • один преимущественно спиральный домен, содержащий 220 N-концевых остатков,
  • вторая большая десятицепочечная α / β структура, содержащая 480 остатков,
  • и третья небольшая пятицепочечная α / β структура, содержащая 70 остатков.

В Pfam второй домен интерпретируется как два отдельных домена:

  • более короткий полностью альфа-N-концевой домен,
  • и более длинный бочкообразный С-концевой домен.
Рибонуклеотидредуктаза
N-концевой
Кристаллографическая структура белка рибонуклеотидредуктазы R1E из S. typhimurium . Белок окрашен в цвет радуги ( N-конец = синий, C-конец = красный), в то время как dATP изображен в виде палочек, а комплексный ион магния - в виде серой сферы. [10]
Идентификаторы
СимволRR_N
PfamPF08343
ИнтерПроIPR013554
SCOP21peq / SCOPe / SUPFAM
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры
PDB1pem , 1peo , 1peq , 1peu , 2bq1
Рибонуклеотидредуктаза
полностью альфа-домен
Структура белка рибонуклеотидредуктазы R1 (альфа-субъединица I класса). [11]
Идентификаторы
СимволRibonuc_red_lgN
PfamPF00317
ИнтерПроIPR013509
PROSITEPDOC00084
SCOP21rlr / SCOPe / SUPFAM
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры
PDB1pem , 1peo , 1peq , 1peu , 1r1r , 2r1r , 3r1r , 4r1r , 5r1r , 6r1r , 7r1r
Бочкообразный
домен рибонуклеотидредуктазы
Структура белка рибонуклеотидредуктазы R1E из Salmonella typhimurium . [10]
Идентификаторы
СимволRibonuc_red_lgC
PfamPF02867
Клан пфамCL0339
ИнтерПроIPR000788
PROSITEPDOC00084
SCOP21rlr / SCOPe / SUPFAM
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры
PDB1pem , 1peo , 1peq , 1peu , 1r1r , 2r1r , 3r1r , 4r1r , 5r1r , 6r1r , 7r1r

Малая цепь рибонуклеотидредуктазы
Структура белка рибонуклеотидредуктазы Escherichia coli R2. [12]
Идентификаторы
СимволRibonuc_red_sm
PfamPF00268
ИнтерПроIPR000358
PROSITEPDOC00317
SCOP21риб / СФЕРА / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры
PDB1av8 , 1biq , 1h0n , 1h0o , 1jk0 , 1jpr , 1jqc , 1kgn , 1kgo , 1kgp , 1mrr , 1mxr , 1oqu , 1pfr , 1pim , 1piu , 1piy , 1piz , 1pj0 , 1pj1 , 1pm2 , 1r2f , 1r65 , 1rib , 1rnr , 1rsr ,1rsv , 1smq , 1sms , 1syy , 1uzr , 1w68 , 1w69 , 1xik , 1xsm , 1yfd , 2alx , 2av8 , 2bq1 , 2r2f

Субъединица бета класса I обычно содержит биметаллический центр и стабильный тирозильный радикал . У человека бета-субъединица зависит от кофактора ди-железа. В E. coli тирозильный радикал расположен в положении 122 (Y122), обеспечивая стабильный радикал для субъединиц RNR2 класса I. [13] В A. aegypti этот тирозильный радикал находится в положении 184 (Y184). [14] Тирозильный радикал глубоко похоронен внутри белка в гидрофобной среде, расположенной близко к центру железа, который используется для стабилизации тирозильного радикала. В структуре двух μ-оксо-связанных железов преобладают лиганды, которые служат сайтами связывания железа: четыре карбоксилата [ аспартат (D146),глутамат (E177, E240 и E274)] и два гистидина (H180 и H277). [14] Ассоциация происходит между C-концом RNR2 и C-концом RNR1. [9] Ферментативная активность зависит от ассоциации субъединиц RNR1 и RNR2. Активный центр состоит из активных дитиольных групп из RNR1, а также из диферрического центра и тирозильного радикала из субъединицы RNR2.

Другие остатки RNR2, такие как аспартат (D273), триптофан (W48) и тирозин (Y356), дополнительно стабилизируют тирозильный радикал в активном центре, тем самым обеспечивая перенос электронов. [9] Эти остатки помогают переносить радикальный электрон от тирозина (Y122) из ​​RNR2 к цистеину (C439) из RNR1. Перенос электрона начинается с тирозина RNR2 (Y122) и продолжается в RNR2 на триптофан (W48), который отделен от тирозина RNR1 (Y731) на 2,5 нанометра . Перенос электронов от RNR2 к RNR1 происходит через тирозин (от Y356 до Y731) и продолжается через тирозин (Y730) к цистеину (C439) в активном сайте. [15]Сайт-ориентированные мутации первичной структуры RNR указывают на то, что все вышеперечисленные остатки участвуют в передаче свободного радикала на большие расстояния к активному сайту. [9]

У комаров A. aegypti RNR1 сохраняет большинство важных аминокислотных остатков, включая аспартат (D64) и валин (V292 или V284), которые необходимы для аллостерической регуляции ; остатки пролина (P210 и P610), лейцина (L453 и L473) и метионина (M603), которые расположены в гидрофобном активном сайте; остатки цистеина (C225, C436 и C451), которые участвуют в удалении атома водорода и переносе радикального электрона в активном центре; цистеин (C225 и C436), аспарагин(N434) и глутаматные (E441) остатки, которые связывают рибонуклеотидный субстрат; остатки тирозина (Y723 и Y743), которые определяют перенос радикалов; и остатки цистеина (C838 и C841), которые используются для регенерации дитиоловых групп в активном центре. [14]

Функция [ править ]

Механизм катализатора превращения рибонуклеотидов в дезоксирибонуклеотиды. (адаптировано из Nelson & Cox, 2000). (1) перенос электрона на субъединице RNR2 активирует остаток цистеина RNR1 в активном центре со свободным радикалом; (2) свободный радикал образует стабильный радикал на C-3, а радикал цистеина удаляет атом водорода; (3) катион образуется на C-2 путем переноса водорода из дитиольной группы и стабилизируется радикалом, что приводит к потере H2O из C-2; ( 4) водород переносится из дитиольной группы для восстановления катиона С-2; (5) радикал C-3 восстанавливается водородом, удаленным на стадии 2, и образуется тирозильный радикал; (6)редоксины передают два водорода дисульфидной группе, которая восстанавливает исходную конфигурацию.

Фермент рибонуклеотидредуктаза (RNR) катализирует синтез dNDP de novo. [16] Катализ рибонуклеозид-5'-дифосфатов (NDP) включает восстановление у 2'-углерода рибозо-5-фосфата с образованием восстановленных 2'-дезоксипроизводным 2'-дезоксирибонуклеозид-5'-дифосфатов (dNDPs). Это снижение начинается с образования свободных радикалов. После однократного восстановления для RNR требуются электроны, пожертвованные дитиольными группами белка тиоредоксина . Регенерация тиоредоксина происходит, когда никотинамидадениндинуклеотидфосфат ( НАДФН ) обеспечивает два атома водорода, которые используются для восстановления дисульфидных групп тиоредоксина.

Три класса RNR имеют схожие механизмы восстановления NDP, но отличаются доменом, который генерирует свободный радикал, конкретным металлом в структуре металлопротеина и донорами электронов. Все классы используют свободнорадикальную химию. [9] Редуктазы класса I используют центр железа с превращением двухвалентного железа в трехвалентное для образования тирозильных свободных радикалов. Восстановление субстратов NDP происходит в аэробных условиях. Редуктазы класса I делятся на IA и IB из-за различий в регуляции. Редуктазы класса IA ​​распространены у эукариот , эубактерий , бактериофагов и вирусов.. Редуктазы класса IB обнаружены у эубактерий. Редуктазы класса IB могут также использовать радикал, образующийся при стабилизации биядерного марганцевого центра. Редуктазы класса II образуют свободный радикал 5'-дезоксиаденозил-радикал из кобаламина (кофермент B12) и имеют более простую структуру, чем редуктазы класса I и класса III. Восстановление NDP или рибонуклеотид-5'-трифосфатов (NTP) происходит либо в аэробных, либо в анаэробных условиях. Редуктазы класса II распространены в архебактериях , эубактериях и бактериофагах. Редуктазы класса III используют радикал глицина, образованный с помощью S-аденозилметионина.и центр железной серы. Снижение NTP ограничивается анаэробными условиями. Редуктазы класса III распространены в архебактериях, эубактериях и бактериофагах. [9] [14] Организмы не ограничиваются одним классом ферментов. Например, у E. coli есть RNR класса I и класса III.

Каталитический восстановительный механизм [ править ]

Механизм реакции РНР .

Механизм, который в настоящее время принят для восстановления рибонуклеотидов до дезоксирибонуклеотидов, изображен на следующей схеме. Первый шаг включает отрыв 3'-H субстрата 1 радикалом Cys439. Впоследствии реакция включает отщепление одной молекулы воды от углерода C-2 'рибонуклеотида, катализируемое Cys225 и Glu441. На третьем этапе происходит перенос атома водорода от Cys225 на углерод C-2 '2'-кетильного радикала 3 после предыдущего переноса протона от Cys462 к Cys225. В конце этой стадии получают анион-радикальный дисульфидный мостик и промежуточный кетон 4 с закрытой оболочкой. Этот интермедиат был идентифицирован во время превращения нескольких 2'-замещенных аналогов субстрата, а также с природным субстратом [17]взаимодействуя с ферментными мутантами. Следующим этапом является окисление анионного дисульфидного мостика с сопутствующим восстановлением субстрата с образованием 5. Спиновая плотность смещается от атомов серы к атому C-3 'субстрата с одновременным переносом протона от Glu441 на углерод C. -3 '. Последний этап является обратным первому этапу и включает перенос водорода от Cys439 к C-3 ', регенерируя исходный радикал и получая конечный продукт 6.

Теоретические модели некоторых этапов этих механизмов с использованием полной модели белка R1 можно найти в исследованиях, проведенных Cerqueira et al. . [18] [19]

Регламент [ править ]

Регулирование класса I RNR. RNR класса I активируются путем связывания АТФ или инактивируются путем связывания dATP с сайтом активности, расположенным на субъединице RNR1. Когда фермент активируется, субстраты восстанавливаются, если соответствующие эффекторы связываются с сайтом специфичности аллостерического субстрата. A = когда dATP или ATP связаны в аллостерическом сайте, фермент принимает UDP и CDP в каталитический сайт; B = когда dGTP связан, ADP входит в каталитический сайт; C = когда dTTP связан, GDP входит в каталитический сайт. Субстраты (рибонуклеотиды UDP, CDP, ADP и GDP) превращаются в dNTP с помощью механизма, включающего образование свободных радикалов.

RNR класса I включает субъединицы RNR1 и RNR2, которые могут связываться с образованием гетеродимерного тетрамера. [5] RNR1 содержит оба аллостерических сайта, опосредуя регуляцию субстратной специфичности и активности. [11] В зависимости от аллостерической конфигурации один из четырех рибонуклеотидов связывается с активным сайтом.

Регулирование RNR предназначено для поддержания сбалансированного количества dNTP. Связывание эффекторных молекул увеличивает или снижает активность РНР. Когда АТФ связывается с сайтом аллостерической активности, он активирует RNR. Напротив, когда dATP связывается с этим сайтом, он деактивирует RNR. [9] Помимо контроля активности, аллостерический механизм также регулирует специфичность субстрата и гарантирует, что фермент производит равное количество каждого dNTP для синтеза ДНК. [9]Во всех классах связывание АТФ или дАТФ с аллостерическим сайтом индуцирует восстановление цитидин-5'-дифосфата (CDP) и уридин-5'-дифосфата (UDP); 2'-дезоксигуанозин-5'-трифосфат (dGTP) индуцирует восстановление аденозин-5'-дифосфата (ADP); и 2'-дезокситимидин-5'-трифосфат (dTTP) индуцирует восстановление гуанозин-5'-дифосфата (GDP) (Рисунок 1).

Редуктазы класса IB не ингибируются dATP, поскольку им не хватает примерно 50 N-концевых аминокислот, необходимых для сайта аллостерической активности. [20] Кроме того, важно, чтобы активность рибонуклеотидредуктазы находилась под транскрипционным и посттранскрипционным контролем, поскольку синтез ДНК без повреждений зависит от сбалансированного пула дезоксирибонуклеотидов. [21] Эукариотические клетки с редуктазами класса IA ​​имеют механизм отрицательного контроля, чтобы отключить синтез dNTP по мере их накопления. Этот механизм защищает клетку от токсических и мутагенных эффектов, которые могут возникнуть в результате перепроизводства dNTP, поскольку изменения в сбалансированных пулах dNTP приводят к повреждению ДНК и гибели клеток. [22] [23]Хотя избыточная продукция dNTP или их несбалансированная поставка может привести к неправильному включению нуклеотидов в ДНК, поставка dNTPs может способствовать репарации ДНК. p53R2 представляет собой небольшую субъединицу рибонуклеотидредуктазы, которая может вызывать такую ​​репарацию. Изменения в этом гомологе R2, индуцированном p53, могут вызывать истощение митохондриальной ДНК, и, следовательно, p53R2 служит основным фактором поставки dNTP. [24]

RNR может использовать морфеиновую модель аллостерической регуляции . [25]

Ингибиторы RNR1 и RNR2 [ править ]

Обычно ингибиторы RNR класса I можно разделить на три основные группы: ингибиторы трансляции, которые блокируют синтез фермента; ингибиторы димеризации, которые предотвращают ассоциацию двух субъединиц RNR (R1 и R2); и каталитические ингибиторы, которые инактивируют субъединицу R1 и / или субъединицу R2. [18]

RNR класса I может ингибироваться пептидами, подобными C-концу RNR2. Эти пептиды могут конкурировать с RNR2 за связывание с RNR1, и в результате RNR1 не образует ферментативно активного комплекса с RNR2. [26] [27] Хотя C-конец белков RNR2 отличается у разных видов, RNR2 может взаимодействовать с RNR1 у разных видов. [28] Когда C-конец RNR2 мыши был заменен на C-концевые (7 или 33) аминокислотные остатки RNR2 E. coli , химерная субъединица RNR2 все еще связывалась с субъединицами RNR1 мыши. Однако им не хватает ферментативной активности, вероятно, из-за удаления остатков, участвующих в переносе свободнорадикального электрона от RNR2 к субъединице RNR1. [27]

Небольшие пептиды могут специфически ингибировать связывание субъединиц RNR2 с RNR1, когда они имеют значительное сходство с С-концом нормального RNR2. [29] Это ингибирование связывания RNR2 с RNR1 было успешно протестировано на RNR вируса простого герпеса (HSV). Когда в конкурентных анализах использовали олигомер из 7 аминокислот (GAVVNDL), укороченный от С-конца субъединицы RNR2, это препятствовало образованию ферментативно активного комплекса с RNR1 нормальным RNR2. [30] Другие небольшие пептидные ингибиторы, подобные С-концу RNR2, также успешно применялись для ингибирования ферментативной активности RNR HSV и, следовательно, репликации HSV. [31] На моделях стромального кератита и неоваскуляризации роговицы на мышах (ВПГ глазного заболевания ), небольшой C-концевой аналог RNR2 BILD 1263, как сообщается, ингибирует RNR и эффективен для предотвращения этих заболеваний. [32] В некоторых случаях, хотя лечение небольшими аналогами С-конца не может остановить распространение болезни, они все же могут помочь в исцелении. Сообщается, что в отношении резистентного к ацикловиру HSV (PAAr5) небольшой пептидный ингибитор BILD 1633 в 5-10 раз более эффективен, чем BILD 1263, против кожной инфекции PAAr5. [33] Комбинированная терапия (BILD 1633 и ацикловир) более эффективна для лечения местных повреждений у мышей. Эти данные предполагают, что небольшие пептидные ингибиторы, которые конкурируют с RNR2 за связывание с RNR1, полезны для предотвращения распространения HSV.

Галлий ингибирует RNR2, замещая Fe 3+ в активном центре. Мальтолат галлия представляет собой пероральную биодоступную форму галлия, которая использует эту ингибирующую активность для лечения рака, инфекций и других заболеваний. [34]

Препараты гидроксимочевина [35] и гадолиний мотексафин препятствуют действию этого фермента. [36]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Elledge SJ, Zhou Z, Аллен JB (март 1992). «Рибонуклеотидредуктаза: регуляция, регуляция, регуляция». Направления биохимических наук . 17 (3): 119–23. DOI : 10.1016 / 0968-0004 (92) 90249-9 . PMID  1412696 .
  2. ^ Sneeden JL, Loeb LA (сентябрь 2004). «Мутации в субъединице R2 рибонуклеотидредуктазы, которые придают устойчивость к гидроксимочевине» . Журнал биологической химии . 279 (39): 40723–8. DOI : 10.1074 / jbc.M402699200 . PMID 15262976 . 
  3. ^ Torrents E, Aloy P, Гиберт I, Родригес-Треллес F (август 2002). «Рибонуклеотидредуктазы: дивергентная эволюция древнего фермента». Журнал молекулярной эволюции . 55 (2): 138–52. DOI : 10.1007 / s00239-002-2311-7 . PMID 12107591 . S2CID 24603578 .  
  4. ^ Геррик J, Sclavi B (январь 2007). «Рибонуклеотидредуктаза и регуляция репликации ДНК: старая история и древнее наследие» . Молекулярная микробиология . 63 (1): 22–34. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.2006.05493.x . PMID 17229208 . S2CID 9473163 .  
  5. ↑ a b Эклунд Х, Эрикссон М., Улин Ю., Нордлунд П., Логан Д. (август 1997 г.). «Рибонуклеотидредуктаза - структурные исследования радикального фермента». Биологическая химия . 378 (8): 821–5. DOI : 10.1515 / bchm.1997.378.8.815 . PMID 9377477 . 
  6. ^ Штубе Дж, Риггс-Gelasco P (ноябрь 1998 года). «Использование свободных радикалов: образование и функция тирозильного радикала в рибонуклеотидредуктазе». Направления биохимических наук . 23 (11): 438–43. DOI : 10.1016 / S0968-0004 (98) 01296-1 . PMID 9852763 . 
  7. ^ Fairman JW, Wijerathna SR, Ahmad MF, Xu H, Nakano R, Jha S, Prendergast J, Welin RM, Flodin S, Roos A, Nordlund P, Li Z, Walz T, Dealwis CG (март 2011 г.). «Структурная основа аллостерической регуляции рибонуклеотидредуктазы человека путем нуклеотид-индуцированной олигомеризации» . Структурная и молекулярная биология природы . 18 (3): 316–22. DOI : 10.1038 / nsmb.2007 . PMC 3101628 . PMID 21336276 .  
  8. Перейти ↑ Larsson KM, Jordan A, Eliasson R, Reichard P, Logan DT, Nordlund P (ноябрь 2004 г.). «Структурный механизм регуляции специфичности аллостерического субстрата в рибонуклеотидредуктазе». Структурная и молекулярная биология природы . 11 (11): 1142–9. DOI : 10.1038 / nsmb838 . PMID 15475969 . S2CID 1025702 .  
  9. ^ a b c d e f g h Джордан А, Райхард П. (1998). «Рибонуклеотидредуктазы» . Ежегодный обзор биохимии . 67 (1): 71–98. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.67.1.71 . PMID 9759483 . 
  10. ^ a b PDB : 1PEU ; Uppsten M, Färnegårdh M, Jordan A, Eliasson R, Eklund H, Uhlin U (июнь 2003 г.). «Структура большой субъединицы рибонуклеотидредуктазы Ib класса из Salmonella typhimurium и ее комплексов с аллостерическими эффекторами». Журнал молекулярной биологии . 330 (1): 87–97. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (03) 00538-2 . PMID 12818204 . 
  11. ↑ a b Uhlin U, Eklund H (август 1994). «Структура белка рибонуклеотидредуктазы R1». Природа . 370 (6490): 533–9. DOI : 10.1038 / 370533a0 . PMID 8052308 . S2CID 8940689 .  
  12. ^ Нордлунд Р, Эклунд Н (июль 1993). «Структура и функция белка R2 рибонуклеотидредуктазы Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии . 232 (1): 123–64. DOI : 10.1006 / jmbi.1993.1374 . PMID 8331655 . 
  13. ^ Högbom M, Andersson ME, Nordlund P (март 2001). «Кристаллические структуры окисленных биядерных центров марганца в Mn-замещенной рибонуклеотидредуктазе класса I из Escherichia coli: карбоксилатные сдвиги с последствиями для активации O2 и генерации радикалов». Журнал биологической неорганической химии . 6 (3): 315–23. DOI : 10.1007 / s007750000205 . PMID 11315567 . S2CID 20748553 .  
  14. ^ a b c d Pham DQ, Blachuta BJ, Nichol H, Winzerling JJ (сентябрь 2002 г.). «Субъединицы рибонуклеотидредуктазы комара желтой лихорадки, Aedes aegypti: клонирование и экспрессия». Биохимия и молекулярная биология насекомых . 32 (9): 1037–44. DOI : 10.1016 / S0965-1748 (02) 00041-3 . PMID 12213240 . 
  15. Перейти ↑ Chang MC, Yee CS, Stubbe J, Nocera DG (май 2004 г.). «Включение рибонуклеотидредуктазы с помощью инициируемого светом образования аминокислотных радикалов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (18): 6882–7. DOI : 10.1073 / pnas.0401718101 . PMC 406436 . PMID 15123822 .  
  16. Перейти ↑ Cox M, Nelson DR (2008). Принципы биохимии Ленингера . Сан-Франциско: WH Freeman. ISBN 978-0-7167-7108-1.
  17. ^ Cerqueira Н.М., Fernandes П.А., Eriksson Л.А., Рамос MJ (декабрь 2004). «Активация рибонуклеотидов ферментом рибонуклеотидредуктазой: понимание роли фермента». Журнал вычислительной химии . 25 (16): 2031–7. DOI : 10.1002 / jcc.20127 . PMID 15481089 . S2CID 19665974 .  
  18. ^ a b Cerqueira NM, Pereira S, Fernandes PA, Ramos MJ (2005). «Обзор ингибиторов рибонуклеотидредуктазы: привлекательная мишень в противоопухолевой терапии». Современная лекарственная химия . 12 (11): 1283–94. DOI : 10.2174 / 0929867054020981 . PMID 15974997 . 
  19. ^ Cerqueira Н.М., Fernandes П.А., Eriksson Л.А., Рамос MJ (март 2006). «Дегидратация рибонуклеотидов, катализируемая рибонуклеотидредуктазой: роль фермента» . Биофизический журнал . 90 (6): 2109–19. DOI : 10.1529 / biophysj.104.054627 . PMC 1386789 . PMID 16361339 .  
  20. ^ Eliasson R, Pontis E, Иордания A, Рейхард P (октябрь 1996). «Аллостерическая регуляция третьей рибонуклеотидредуктазы (фермент NrdEF) из энтеробактерий» . Журнал биологической химии . 271 (43): 26582–7. DOI : 10.1074 / jbc.271.43.26582 . PMID 8900130 . 
  21. ^ Thelander L (июнь 2007). «Рибонуклеотидредуктаза и синтез митохондриальной ДНК». Генетика природы . 39 (6): 703–4. DOI : 10.1038 / ng0607-703 . PMID 17534360 . S2CID 22565931 .  
  22. Перейти ↑ Kunz BA (1988). «Мутагенез и дисбаланс пула дезоксирибонуклеотидов». Мутационные исследования . 200 (1-2): 133–47. DOI : 10.1016 / 0027-5107 (88) 90076-0 . PMID 3292903 . 
  23. ^ Meuth M (апрель 1989). «Молекулярная основа мутаций, вызванных дисбалансом пула дезоксирибонуклеозидтрифосфата в клетках млекопитающих». Экспериментальные исследования клеток . 181 (2): 305–16. DOI : 10.1016 / 0014-4827 (89) 90090-6 . PMID 2647496 . 
  24. ↑ Бурдон А., Минай Л., Серр В., Джейс Дж. П., Сарзи Е., Обер С., Кретьен Д., де Лонле П., Паки-Флюклингер В., Аракава Н., Накамура Ю., Мюнних А., Рётиг А. (июнь 2007 г.). «Мутация RRM2B, кодирующей p53-контролируемую рибонуклеотидредуктазу (p53R2), вызывает серьезное истощение митохондриальной ДНК». Генетика природы . 39 (6): 776–80. DOI : 10.1038 / ng2040 . PMID 17486094 . S2CID 22103978 .  
  25. ^ Selwood T, Джаффе EK (март 2012). «Динамические диссоциирующие гомоолигомеры и контроль функции белка» . Архивы биохимии и биофизики . 519 (2): 131–43. DOI : 10.1016 / j.abb.2011.11.020 . PMC 3298769 . PMID 22182754 .  
  26. ^ Климент I, Sjöberg Б.М., Huang CY (май 1991). «Карбоксиконцевые пептиды в качестве зондов для взаимодействия субъединиц рибонуклеотидредуктазы Escherichia coli: кинетический анализ исследований ингибирования». Биохимия . 30 (21): 5164–71. DOI : 10.1021 / bi00235a008 . PMID 2036382 . 
  27. ^ a b Hamann CS, Lentainge S, Li LS, Salem JS, Yang FD, Cooperman BS (март 1998 г.). «Химерные ингибиторы малых субъединиц рибонуклеотидредуктазы млекопитающих: двойная функция С-конца R2?» . Белковая инженерия . 11 (3): 219–24. DOI : 10,1093 / белок / 11.3.219 . PMID 9613846 . 
  28. ^ Косентино G, Lavallée Р, Rakhit S, R Плант, Gaudette Y, Lawetz С, Уайтхед PW, Duceppe JS, Лепин-Френетт С, Н Dansereau (январь 1991). «Специфическое ингибирование рибонуклеотидредуктаз пептидами, соответствующими С-концу их второй субъединицы». Биохимия и клеточная биология . 69 (1): 79–83. DOI : 10.1139 / o91-011 . PMID 2043345 . 
  29. ^ Куперман Б. (2003). «Олигопептидное ингибирование рибонуклеотидредуктаз класса I». Биополимеры . 71 (2): 117–31. DOI : 10.1002 / bip.10397 . PMID 12767114 . S2CID 25196379 .  
  30. ^ Филатов Д, Ingemarson R, Gräslund А, Thelander л (август 1992 г.). «Роль карбоксильного конца малой субъединицы рибонуклеотидредуктазы вируса простого герпеса во взаимодействии субъединиц и формировании структуры железо-тирозильного центра» . Журнал биологической химии . 267 (22): 15816–22. PMID 1322407 . 
  31. ^ Cohen EA, Гудро P, P Brazeau, Ланжелье Y (1986). «Специфическое ингибирование рибонуклеотидредуктазы вируса герпеса нонапептидом, происходящим от карбоксиконца субъединицы 2». Природа . 321 (6068): 441–3. DOI : 10.1038 / 321441a0 . PMID 3012360 . S2CID 4238076 .  
  32. ↑ Brandt CR, Spencer B, Imesch P, Garneau M, Déziel R (май 1996). «Оценка ингибитора пептидомиметической рибонуклеотидредуктазы на мышиной модели глазного заболевания вируса простого герпеса 1 типа» . Противомикробные препараты и химиотерапия . 40 (5): 1078–84. DOI : 10.1128 / aac.40.5.1078 . PMC 163269 . PMID 8723444 .  
  33. ^ Дуань Дж, Лиуцци М, Париж Вт, Ламберт М, Lawetz С, Н Мосс, Джарамилло J, J Готье, Déziel R, Cordingley МГ (июль 1998 г.). «Противовирусная активность селективного ингибитора рибонуклеотидредуктазы против ацикловир-резистентного вируса простого герпеса типа 1 in vivo» . Противомикробные препараты и химиотерапия . 42 (7): 1629–35. DOI : 10.1128 / aac.42.7.1629 . PMC 105657 . PMID 9660995 .  
  34. Перейти ↑ Bernstein LR (декабрь 1998 г.). «Механизмы терапевтического действия галлия» (PDF) . Фармакологические обзоры . 50 (4): 665–82. PMID 9860806 .  
  35. ^ «Информация о EC 1.17.4.1 - рибонуклеозиддифосфатредуктаза» . Бренда . Проверено 25 июля 2015 года .
  36. ^ Hashemy SI, Ungerstedt JS, Захеди аввал F, Хольмгрен A (апрель 2006). «Мотексафин гадолиний, опухоль-селективный препарат, нацеленный на тиоредоксинредуктазу и рибонуклеотидредуктазу» . Журнал биологической химии . 281 (16): 10691–7. DOI : 10.1074 / jbc.M511373200 . PMID 16481328 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Рибонуклеотид + редуктазы в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • База данных рибонуклеотидредуктазы (RNRdb)