• цитоплазма • тельце Кахаля • ядерное пятнышко • три-snRNP комплекс U4 / U6 x U5 • нуклеоплазма • U4 / U6 snRNP • U6atac snRNP • U4atac / U6atac snRNP • ядро клетки • комплекс ASAP
Биологический процесс
• сплайсинг мРНК, с помощью сплайсосома • нуклеосом сборки • РНК обработка • spliceosomal три-snRNP комплекс сборки • гомеостаз количества клеток • положительное регулирование гистона deubiquitination • гемопоэтических пролиферации стволовых клеток • мРНК обработки • spliceosomal snRNP сборки • клеток морфогенез • РНК сплайсинг • регуляция экспрессии генов • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
9733
53890
Ансамбль
ENSG00000075856
ENSMUSG00000018974
UniProt
Q15020
Q9JLI8
RefSeq (мРНК)
NM_014706
NM_016926 NM_001356621 NM_001356623
RefSeq (белок)
NP_055521
NP_058622 NP_001343550 NP_001343552
Расположение (UCSC)
Chr 12: 108,52 - 108,56 Мб
Chr 5: 113.74 - 113.77 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Плоскоклеточный рак антиген , распознаваемый Т-клетками 3 представляет собой белок , который у человека кодируется SART3 гена . [5] [6] [7]
Белок , кодируемый этим геном является РНК-связывающий ядерный белок , который представляет собой опухоль-отторжение антигена . Этот антиген обладает опухолевыми эпитопами, способными индуцировать HLA-A24- ограниченные и опухолеспецифические цитотоксические Т-лимфоциты у онкологических больных, и может быть полезен для специфической иммунотерапии . Было обнаружено, что этот генный продукт является важным клеточным фактором экспрессии гена ВИЧ-1 и репликации вируса. Он также временно связывается с U6 и U4 / U6 snRNPs во время фазы рециклирования цикла сплайсосом . Считается, что этот кодируемый белок участвует в регуляции мРНК.сращивание. [7]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что SART3 взаимодействует с RNPS1 [8] и рецептором андрогенов . [9]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000075856 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018974 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т, Н Секи, Танака А, Ишикава К, Nomura Н (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . Исследования ДНК . 2 (4): 167–74, 199–210. DOI : 10.1093 / dnares / 2.4.167 . PMID 8590280 .
Перейти ↑ Harada K, Yamada A, Mine T, Kawagoe N, Takasu H, Itoh K (февраль 2000 г.). «Мышиный гомолог человеческого гена SART3, кодирующего антиген отторжения опухоли» . Японский журнал исследований рака . 91 (2): 239–47. DOI : 10.1111 / j.1349-7006.2000.tb00937.x . PMC 5926322 . PMID 10761712 .
^ a b «Ген Entrez: антиген плоскоклеточной карциномы SART3, распознаваемый Т-клетками 3» .
^ Харада K, Ямада A, D Ян, Ито К, Shichijo S (сентябрь 2001). «Связывание антигена отторжения опухоли SART3 с пре-мРНК фактором сплайсинга RNPS1: возможное регулирование сплайсинга путем образования комплекса» . Международный журнал рака . 93 (5): 623–8. DOI : 10.1002 / ijc.1391 . PMID 11477570 . S2CID 24724555 .
Перейти ↑ Liu Y, Kim BO, Kao C, Jung C, Dalton JT, He JJ (май 2004 г.). «Tip110, Tat-взаимодействующий белок вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) массой 110 кДа в качестве негативного регулятора транскрипционной активации андрогенного рецептора (AR)» . Журнал биологической химии . 279 (21): 21766–73. DOI : 10.1074 / jbc.M314321200 . PMID 15031286 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Ян Д., Накао М., Ситидзё С., Сасатоми Т., Такасу Х., Мацумото Х., Мори К., Хаяси А., Ямана Х., Широузу К., Ито К. (август 1999 г.). «Идентификация гена, кодирующего белок, обладающий общими опухолевыми эпитопами, способными индуцировать HLA-A24-ограниченные цитотоксические Т-лимфоциты у онкологических больных». Исследования рака . 59 (16): 4056–63. PMID 10463607 .
Танака С., Цуда Н., Кавано К., Сакамото М., Нисида Т., Хашимото Т., Ситидзё С., Камура Т., Ито К. (ноябрь 2000 г.). «Экспрессия антигенов отторжения опухоли при гинекологических раках» . Японский журнал исследований рака . 91 (11): 1177–84. DOI : 10.1111 / j.1349-7006.2000.tb00902.x . PMC 5926290 . PMID 11092984 .
Харада К., Ямада А., Ян Д., Ито К., Шичиджо С. (сентябрь 2001 г.). «Связывание антигена отторжения опухоли SART3 с пре-мРНК фактором сплайсинга RNPS1: возможное регулирование сплайсинга путем образования комплекса» . Международный журнал рака . 93 (5): 623–8. DOI : 10.1002 / ijc.1391 . PMID 11477570 . S2CID 24724555 .
Sasatomi T, Suefuji Y, Matsunaga K, Yamana H, Miyagi Y, Araki Y, Ogata Y, Itoh K, Shirouzu K (март 2002 г.). «Экспрессия антигенов отторжения опухоли в колоректальных карциномах» . Рак . 94 (6): 1636–41. DOI : 10.1002 / cncr.10421 . PMID 11920522 . S2CID 33045822 .
Лю Ю., Ли Дж., Ким Б.О., Пейс Б.С., Хе Дж.Дж. (июнь 2002 г.). «Опосредованная белком Tat ВИЧ-1 трансактивация промотора длинных концевых повторов ВИЧ-1 усиливается новым ядерным белком, взаимодействующим с Tat 110 кДа, Tip110» . Журнал биологической химии . 277 (26): 23854–63. DOI : 10.1074 / jbc.M200773200 . PMID 11959860 .
Белл М., Шрейнер С., Дамианов А., Редди Р., Биндерайф А. (июнь 2002 г.). «p110, новый белок snRNP U6 человека и фактор рециклинга snRNP U4 / U6» . Журнал EMBO . 21 (11): 2724–35. DOI : 10.1093 / emboj / 21.11.2724 . PMC 126028 . PMID 12032085 .
Ноттротт С., Урлауб Х., Люрманн Р. (октябрь 2002 г.). «Иерархические кластерные взаимодействия белков с мяРНК U4 / U6: биохимическая роль белков U4 / U6» . Журнал EMBO . 21 (20): 5527–38. DOI : 10,1093 / emboj / cdf544 . PMC 129076 . PMID 12374753 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (ноябрь 2002 г.). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геномные исследования . 12 (11): 1773–84. DOI : 10.1101 / gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
Станук Д., Рейдер С.Д., Клингауф М., Нойгебауэр К.М. (февраль 2003 г.). «Нацеливание фактора сборки малых ядерных RNP U4 / U6 SART3 / p110 на тельца Кахаля» . Журнал клеточной биологии . 160 (4): 505–16. DOI : 10,1083 / jcb.200210087 . PMC 2173746 . PMID 12578909 .
Дамианов А., Шрейнер С., Биндерайф А. (февраль 2004 г.). «Для рециклирования сплайсосомы типа U12 требуется p110, компонент snRNP U6atac» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (4): 1700–8. DOI : 10.1128 / MCB.24.4.1700-1708.2004 . PMC 344176 . PMID 14749385 .
Лю Ю., Ким Б.О., Као С., Юнг С., Далтон Дж. Т., Хе Дж. Дж. (Май 2004 г.). «Tip110, Tat-взаимодействующий белок вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) массой 110 кДа в качестве негативного регулятора транскрипционной активации андрогенного рецептора (AR)» . Журнал биологической химии . 279 (21): 21766–73. DOI : 10.1074 / jbc.M314321200 . PMID 15031286 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку человеческих ES-клеток». Природа Биотехнологии . 22 (6): 707–16. DOI : 10,1038 / NBT971 . PMID 15146197 . S2CID 27764390 .
Medenbach J, Schreiner S, Liu S, Lührmann R, Bindereif A (сентябрь 2004 г.). «Человеческий фактор рециклинга мяРНП U4 / U6 p110: мутационный анализ показывает функцию повторного домена тетратрикопептида в рециклинге» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (17): 7392–401. DOI : 10.1128 / MCB.24.17.7392-7401.2004 . PMC 506986 . PMID 15314151 .
Станук Д., Нойгебауэр К.М. (сентябрь 2004 г.). «Обнаружение промежуточных продуктов сборки snRNP в тельцах Кахаля путем флуоресцентного резонансного переноса энергии» . Журнал клеточной биологии . 166 (7): 1015–25. DOI : 10.1083 / jcb.200405160 . PMC 2172029 . PMID 15452143 .
