Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Сукцинатдегидрогеназы сложного фактора 2 сборки , ранее известный как SDH5 , а также известный как фактор сборки ОЙ 2 или SDHAF2 является белком , который в организме человека кодируется SDHAF2 геном . Этот ген кодирует митохондриальный белок, необходимый для флавинирования субъединицы комплекса сукцинатдегидрогеназы, необходимой для активности комплекса. Мутации в этом гене связаны с феохромоцитомой и параганглиомой . [5]

Структура [ править ]

SDHAF2 расположен на д руке от хромосомы 11 в положении 12.2 и пролеты 16642 пары оснований. [5] Ген SDHAF2 продуцирует белок 6,7 кДа, состоящий из 65 аминокислот. [6] [7] Этот высококонсервативный белок является кофактором флавинадениндинуклеотида (FAD). [8] Структура представляет собой пучок из пяти спиралей с областью четко определенных консервативных поверхностных остатков. Эта консервативная область включает отрицательно заряженную периферию и положительно заряженную поверхность, а также участок, который является гидрофобным . Область расположена в α-спиралях I, II и соединительной полосе. [9]

Функция [ править ]

Ген SDHAF2 кодирует митохондриальный белок, связанный с комплексом сукцинатдегидрогеназы (SDH) (митохондриальный комплекс II) в дыхательной цепи митохондрий , который играет важную роль как в цепи переноса электронов, так и в цикле Кребса (трикарбоновой кислоты) . SDHAF2 является неотъемлемой частью собственно функции комплекса SDH , главным образом в SDH-зависимом дыхании, и взаимодействует с каталитической субъединицей комплекса. SDHAF2 участвует во флавинации SDH1 (SDHA), другой субъединицы комплекса SDH . Это достигается путем включения кофактора флавинадениндинуклеотида (FAD) вSDHA . Такая флавинация необходима для полнофункционального комплекса SDH . Нокдаун SDHAF2 приводит к потере функции комплекса SDH , снижению стабильности ферментного комплекса и существенному снижению всех субъединиц. Было также обнаружено, что SDHAF2 действует как супрессор опухолей . [10] [11] [12] [13]

Клиническое значение [ править ]

SDHAF2 - это ген-супрессор опухоли . Конституционные мутации в этом гене вызывают наследственную параганглиому , нейроэндокринную опухоль, которая, как ранее было известно, связана с мутациями субъединицы SDH. параганглиома - это опухоль нервного гребня, обычно происходящая из хеморецепторной ткани параганглиона , и может развиваться на различных участках тела, включая голову, шею, грудную клетку и брюшную полость . Чаще всего они располагаются в области головы и шеи, особенно в области бифуркации сонной артерии , яремного отверстия , блуждающего нерва и в области блуждающего нерва.среднее ухо . [14] Фенотипы включают чрезмерную гипертензию , вызванную катехоламинами , дисфункцию крупных кровеносных сосудов и черепных нервов , значительную болезненность , потоотделение и учащенное сердцебиение . При экстраадреналовой локализации опухоль может стать метастатической и агрессивной. Утрата функции комплекса SDH , как известно, является причиной параганглиомы . [12] [11] [10] Мутации в этом гене обнаруживаются в ДНК только небольшой части пациентов с этим заболеванием. [11]

Взаимодействия [ править ]

SDHAF2 взаимодействует с SDHA внутри каталитического димера SDH. Помимо SDHA , SDHAF2 имеет 17 белок-белковых взаимодействий , включая взаимодействия с такими белками, как IMMT , SUCLG2 , UBINEDDSUMO1 , SSX2IP и другими. [15]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000167985 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024668 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Энтреза: фактор сборки комплекса сукцинатдегидрогеназы 2» .
  6. Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss Дж., Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины с помощью специализированной базы знаний» . Циркуляционные исследования . 113 (9): 1043–53. DOI : 10,1161 / CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .  
  7. Яо, Даниэль. "Атлас кардиоорганических белков" База знаний (COPaKB) - Информация о белках " . amino.heartproteome.org . Проверено 23 июля 2018 .
  8. ^ Старкер НЧ, Дельгадо-Вердаго А, Udelsman Р, Бьёрклунд Р, Т Карлинга (декабрь 2010). «Экспрессия и соматические мутации SDHAF2 (SDH5), нового гена-супрессора эндокринной опухоли в опухолях паращитовидной железы первичного гиперпаратиреоза». Эндокринная . 38 (3): 397–401. DOI : 10.1007 / s12020-010-9399-0 . PMID 20972721 . S2CID 25914943 .  
  9. ^ Елецкий А, Jeong MY, Ким H, Ли HW, Сяо R, Pagliarini DJ, Prestegard JH, Winge DR, Montelione GT, Szyperski T (октябрь 2012). «Структура ЯМР раствора дрожжевого фактора флавинилирования сукцинатдегидрогеназы Sdh5 выявляет предполагаемый сайт связывания Sdh1» . Биохимия . 51 (43): 8475–7. DOI : 10.1021 / bi301171u . PMC 3667956 . PMID 23062074 .  
  10. ^ а б Хао Х., Халимончук О., Шредерс М., Дефур Н., Бейли Дж. П., Кунст Х., Девили П., Кремерс С. В., Шиффман Д. Д., Бенц Б. Г., Гиги С. П., Winge DR, Кремер Х., Раттер Дж. (август 2009 г.). «SDH5, ген, необходимый для флавинирования сукцинатдегидрогеназы, мутирован в параганглиоме» . Наука . 325 (5944): 1139–42. Bibcode : 2009Sci ... 325.1139H . DOI : 10.1126 / science.1175689 . PMC 3881419 . PMID 19628817 .  
  11. ^ a b c Бэйли Дж. П., Кунст HP, Каскон А., Сампьетро М. Л., Гаал Дж, Корпершук Е., Хинохар-Гутьеррес А., Тиммерс Х. Дж., Хефслот Л. Х., Хермсен М. А., Суарес С., Хуссейн А. К., Вриндс А. Х., Хес Ф. Дж., Янсен Дж. К. , Tops CM, Corssmit EP, de Knijff P, Lenders JW, Cremers CW, Devilee P, Dinjens WN, de Krijger RR, Robledo M (апрель 2010 г.). «Мутации SDHAF2 в семейных и спорадических параганглиомах и феохромоцитомах». Ланцет. Онкология . 11 (4): 366–72. DOI : 10.1016 / S1470-2045 (10) 70007-3 . PMID 20071235 . 
  12. ^ a b Кугельберг Дж., Веландер Дж., Скьяви Ф., Фассина А., Бекдаль М., Ларссон С., Опочер Г., Седерквист П., Дахия П. Л., Нойманн HP, Гимм О. (март 2014 г.). «Роль SDHAF2 и SDHD в фон Хиппель-Линдау связанных феохромоцитом» . Всемирный журнал хирургии . 38 (3): 724–32. DOI : 10.1007 / s00268-013-2373-2 . PMID 24322175 . S2CID 11895429 .  
  13. ^ Пагон Р.А., Адам М.П., ​​Ардингер Х.Х. и др. (1993). «Наследственные синдромы параганглиомы-феохромоцитомы». PMID 20301715 .  Cite journal requires |journal= (help)
  14. ^ "SDHAF2 - фактор сборки 2 сукцинатдегидрогеназы, митохондрии" . www.uniprot.org . Проверено 18 июля 2018 .
  15. ^ Kerrien S, Alam-Faruque Y, Aranda B, Bancarz I, Bridge A, Derow C, Dimmer E, Feuermann M, Friedrichsen A, Huntley R, Kohler C, Khadake J, Leroy C, Liban A, Lieftink C, Montecchi- Palazzi L, Orchard S, Risse J, Robbe K, Roechert B, Thorneycroft D, Zhang Y, Apweiler R, Hermjakob H (январь 2007 г.). «IntAct - ресурс с открытым исходным кодом для данных о взаимодействии молекул» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (выпуск базы данных): D561-5. CiteSeerX 10.1.1.279.8196 . DOI : 10.1093 / NAR / gkl958 . PMC 1751531 . PMID 17145710 .   

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Байсал Б.Э., Фарр Дж. Э., Рубинштейн В. С., Галус Р. А., Джонсон К. А., Астон СЕ, Майерс Е. Н., Джонсон Дж. Т., Каррау Р., Киркпатрик С. Дж., Миссиорек Д., Сингх Д., Саха С., Голлин С. М., Эванс Г. А., Джеймс М. Р., Ричард К. В. (Январь 1997 г.). «Точное картирование импринтированного гена семейных нехромаффинных параганглиом на хромосоме 11q23» . Американский журнал генетики человека . 60 (1): 121–32. PMC  1712548 . PMID  8981955 .
  • Gaal J, Burnichon N, Korpershoek E, Roncelin I., Bertherat J, Plouin PF, de Krijger RR, Gimenez-Roqueplo AP, Dinjens WN (март 2010 г.). «Мутации изоцитратдегидрогеназы редки в феохромоцитомах и параганглиомах» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 95 (3): 1274–8. DOI : 10.1210 / jc.2009-2170 . PMID  19915015 .
  • Mariman EC, van Beersum SE, Cremers CW, Struycken PM, Ropers HH (январь 1995 г.). «Точное картирование предположительно импринтированного гена семейных нехромаффинных параганглиом на хромосому 11q13.1: свидетельство генетической гетерогенности». Генетика человека . 95 (1): 56–62. DOI : 10.1007 / bf00225075 . hdl : 2066/22047 . PMID  7814027 . S2CID  2324475 .
  • Кунст Х. П., Руттен М. Х., де Мённинк Дж. П., Хефслот Л. Х., Тиммерс Х. Дж., Маррес Х. А., Янсен Дж. К., Кремер Х., Бейли Дж. П., Кремерс С. В. (январь 2011 г.). «SDHAF2 (PGL2-SDH5) и наследственная параганглиома головы и шеи» . Клинические исследования рака . 17 (2): 247–54. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-10-0420 . PMID  21224366 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .