Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ШЕСТЬ5
Идентификаторы
ПсевдонимыSIX5 , BOR2, DMAHP, SIX homeobox 5
Внешние идентификаторыOMIM: 600963 MGI: 106220 HomoloGene: 72248 Генные карты : SIX5
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человека) [1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение для SIX5
Геномное расположение для SIX5
Группа19q13.32Начинать45 764 785 п.н. [1]
Конец45 769 252 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 7 (мышь)
Chr.Хромосома 7 (мышь) [2]
Хромосома 7 (мышь)
Геномное расположение для SIX5
Геномное расположение для SIX5
Группа7 A3 | 7 9,46 смНачинать19 094 594 п.н. [2]
Конец19 098 549 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• ГО: 0000980 РНК - полимераза область ДНК-последовательность конкретных II цис-регуляторных связывания
• ДНК связывания
• последовательность ДНК-специфическое связывание
• ГО: связывание 0001948 белок
• ГО: 0001200, ГО: 0001133, ГО: 0001201 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции, Специфическая
для РНК-полимеразы II • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205, ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• ядро клетки
• цитоплазма
• комплекс регуляторов транскрипции
Биологический процесс• развитие многоклеточных организмов
• негативная регуляция клеточной пролиферации
• развитие хрусталика в глазу
камерного типа • негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II промотор
• развитие сперматид
• негативная регуляция пролиферации сателлитных клеток скелетных мышц
• развитие анатомической структуры
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

147912

20475

Ансамбль

ENSG00000177045

ENSMUSG00000040841

UniProt

Q8N196

P70178

RefSeq (мРНК)

NM_175875

NM_011383

RefSeq (белок)

NP_787071

NP_035513

Расположение (UCSC)Chr 19: 45.76 - 45.77 МбChr 7: 19.09 - 19.1 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гомеобоксные белки SIX5 является белком , который в организме человека кодируется SIX5 геном . [5] [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000177045 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040841 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Boucher CA, King SK, Carey N, Krahe R, Winchester CL, Rahman S, Creavin T, Meghji P, Bailey ME, Chartier FL (апрель 1996). «Новый ген, кодирующий гомеодомен, связан с большим островком CpG, прерванным n-повтором нестабильной миотонической дистрофии (CTG)». Hum Mol Genet . 4 (10): 1919–25. DOI : 10,1093 / hmg / 4.10.1919 . PMID 8595416 . 
  6. ^ «Энтрез Ген: гомолог 5 гомеобокса sine oculis SIX5 (Drosophila)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Мураками И, Ото Х, Икеда У, Шимада К., Момои Т., Каваками К. (1999). «Промотор mDMAHP / Six5: дифференциальное использование множества сайтов инициации транскрипции и положительных / отрицательных регуляторных элементов» . Гм. Мол. Genet . 7 (13): 2103–12. DOI : 10.1093 / HMG / 7.13.2103 . PMID  9817928 .
  • Винчестер К.Л., Ферриер Р.К., Сермони А., Кларк Б.Дж., Джонсон К.Дж. (1999). «Характеристика экспрессии DMPK и SIX5 в человеческом глазу и значение для патогенеза миотонической дистрофии» . Гм. Мол. Genet . 8 (3): 481–92. DOI : 10.1093 / HMG / 8.3.481 . PMID  9949207 .
  • Ото Х, Камада С., Таго К., Томинага С.И., Одзаки Х., Сато С., Каваками К. (2000). «Сотрудничество Шести и Eya в активации их генов-мишеней посредством ядерной транслокации Eya» . Мол. Клетка. Биол . 19 (10): 6815–24. DOI : 10.1128 / mcb.19.10.6815 . PMC  84678 . PMID  10490620 .
  • Харрис С.Е., Винчестер С.Л., Джонсон К.Дж. (2000). «Функциональный анализ гомеодоменного белка SIX5» . Nucleic Acids Res . 28 (9): 1871–8. DOI : 10.1093 / NAR / 28.9.1871 . PMC  103302 . PMID  10756185 .
  • Винчестер С., Робертсон С., МакЛауд Т., Джонсон К., Томас М. (2000). «Экспрессия гена гомеобокса (SIX5) в пограничных опухолях яичников» . J. Clin. Патол . 53 (3): 212–7. DOI : 10.1136 / jcp.53.3.212 . PMC  1731149 . PMID  10823141 .
  • Dintilhac A, Bernués J (2002). «HMGB1 взаимодействует со многими очевидно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности» . J. Biol. Chem . 277 (9): 7021–8. DOI : 10.1074 / jbc.M108417200 . PMID  11748221 .
  • Сато С., Накамура М., Чо Д.Х., Тапскотт С.Дж., Одзаки Х., Каваками К. (2002). «Идентификация транскрипционных мишеней для Six5: значение для патогенеза миотонической дистрофии 1 типа» . Гм. Мол. Genet . 11 (9): 1045–58. DOI : 10.1093 / HMG / 11.9.1045 . PMID  11978764 .
  • Фужерусс Ф, Дюран М, Лопес С., Суэль ​​Л., Деминьон Дж., Торнтон С., Одзаки Х., Каваками К., Барбет П., Бекманн Дж. С., Мэйр П. (2003). «Экспрессия Six и Eya во время сомитогенеза человека и активация семейства генов MyoD». J. Muscle Res. Клетка. Мотил . 23 (3): 255–64. DOI : 10,1023 / A: 1020990825644 . PMID  12500905 . S2CID  42497614 .
  • Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Cell . 125 (4): 801–14. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569 . S2CID  13709685 .
  • Хоскинс Б.Э., Крамер С.Х., Сильвиус Д., Зоу Д., Раймонд Р.М., Ортен Д.Дж., Кимберлинг В.Дж., Смит Р.Дж., Вейл Д., Пети С., Отто Е.А., Сюй П.Х., Хильдебрандт Ф. (2007). «Фактор транскрипции SIX5 мутирует у пациентов с синдромом бранхио-ото-почек» . Являюсь. J. Hum. Genet . 80 (4): 800–4. DOI : 10.1086 / 513322 . PMC  1852719 . PMID  17357085 .

Внешние ссылки [ править ]

  • FactorBook SIX5