Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с SLC16A2 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
SLC16A2
Идентификаторы
ПсевдонимыSLC16A2 , DXS128, DXS128E, MCT 7, MCT 8, MCT7, MCT8, MRX22, XPCT, AHDS, семейство носителей растворенного вещества 16, член 2
Внешние идентификаторыOMIM : 300095 MGI : 1203732 HomoloGene : 39495 GeneCards : SLC16A2
Расположение гена ( человек )
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человека) [1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение SLC16A2
Геномное расположение SLC16A2
ГруппаXq13.2Начинать74 421 493 п.н. [1]
Конец74 533 917 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Х-хромосома (мышь)
Chr.Х-хромосома (мышь) [2]
Х-хромосома (мышь)
Геномное расположение SLC16A2
Геномное расположение SLC16A2
ГруппаXD | X 46,29 смНачинать103 697 414 п.н. [2]
Конец103 821 983 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE SLC16A2 204462 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Симпортер активность
• монокарбоновые кислоты активность переносчика трансмембранный
• Транспортер активность
• гормон щитовидной железы , трансмембранный переносчик активность
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• неотъемлемый компонент плазматической мембраны
• мембрана
• плазматическая мембрана
Биологический процесс• транспорт монокарбоновой кислоты
• транспорт тироидных гормонов
• трансмембранный транспорт
• натрий-независимый транспорт органических анионов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6567

20502

Ансамбль

ENSG00000147100

ENSMUSG00000033965

UniProt

P36021

O70324

RefSeq (мРНК)

NM_006517

NM_009197

RefSeq (белок)

NP_006508

NP_033223

Расположение (UCSC)Chr X: 74,42 - 74,53 МбChr X: 103,7 - 103,82 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Монокарбоксилата транспортер 8 ( MCT8 ) является активным переносчик белок , который у человека кодируется SLC16A2 геном . [5] [6] [7] [8]

Функция [ править ]

MCT8 активно транспортирует различные йодотиронины, включая гормоны щитовидной железы Т 3 и Т 4 . [6]

Клиническое значение [ править ]

Генетическое заболевание (обнаруженное в 2003 г. [6] и 2004 г. [9] ) вызвано мутацией переносчика гормона щитовидной железы, MCT8, также известного как SLC16A2, считается причиной значительной части недиагностированных неврологических нарушений (обычно приводящие к гипотоническим / гибким младенцам с отсроченными вехами). Этот генетический дефект был известен как синдром Аллана-Херндона-Дадли (с 1944 г.), но его истинная причина не была известна . Было показано, что он мутировал в случаях Х-сцепленной лейкоэнцефалопатии . [10] Вот некоторые из симптомов этого расстройства: нормальный или слегка повышенный ТТГ , повышенный Т 3 и пониженный Т 4.(отношение Т 3 / Т 4 примерно в два раза выше нормального значения). Нормальный вид при рождении и в течение первых нескольких лет гипотонический (гибкий), особенно затрудненное удержание головы, возможно, трудности с ростом, возможно, с отсроченной миелинизацией (если так, то в некоторых случаях сообщается о МРТ, аналогичном паттерну Пелицея-Мерцбахера. заболевание , известное как PMD [11] ), возможно, со снижением активности митохондриальных ферментов, возможно, с колебаниями уровня лактата . У пациентов настороженное лицо, ограниченный IQ, пациенты могут никогда не разговаривать / ходить, 50% нуждаются в питании через зонд, у пациентов нормальная продолжительность жизни. Это заболевание можно исключить с помощью простого теста щитовидной железы на ТТГ / Т 4 / Т 3 .

Модельные организмы [ править ]

Нокаутный по Slc16a2 фенотип мыши
Характерная чертаФенотип
Жизнеспособность гомозиготОбычный
ПлодородиеОбычный
Вес телаОбычный
БеспокойствоОбычный
Неврологическое обследованиеОбычный
Сила захватаОбычный
Горячая тарелкаОбычный
ДисморфологияОбычный
Косвенная калориметрияОбычный
Тест толерантности к глюкозеАномальный [12]
Слуховой ответ ствола мозгаОбычный
DEXAОбычный
РентгенографияОбычный
Температура телаОбычный
Морфология глазаОбычный
Клиническая химияАномально [13]
ГематологияОбычный
Микроядерный тестОбычный
Вес сердцаОбычный
Сальмонеллезная инфекцияАномальный [14]
Citrobacter инфекцияНормальный [15]
Все тесты и анализ из [16] [17]

Мыши [ править ]

Линия условно нокаутных мышей , названная Slc16a2 tm1a (KOMP) Wtsi [18] [19], была создана в рамках программы International Knockout Mouse Consortium - проекта высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых. [20] [21] [22]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения эффектов делеции. [16] [23] Двадцать один тест был проведен на мутантных мышах, и были обнаружены три значительных отклонения от нормы. [16] Женские гомозиготные мутанты имели пониженный уровень глюкозы в крови. Гемизиготные мутанты мужского пола имели повышенную восприимчивость к бактериальной инфекции . У обоих полов были различные аномальные химические параметры плазмы. [16]

Данио [ править ]

Нокаут данио линия была сгенерирована в 2014 году с использованием цинк-пальца нуклеазы (ZFN) -опосредованного целевой ген редактирования системы. [24] Как и у человека, данио личинки выставлены неврологические и поведенческие недостатки. Они продемонстрировали снижение двигательной активности, изменение генов, связанных с миелином, и нейрон-специфические недостатки в формировании цепей. [25]

Xenopus [ править ]

Экспрессия mct8 была охарактеризована у Xenopus laevis [26] и Xenopus tropicalis . [27]

См. Также [ править ]

  • Семейство носителей растворенных веществ

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000147100 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033965 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Lafrenière Р.Г., Кэррел л, Уиллард КВ (июль 1994). «Новый трансмембранный транспортер, кодируемый геном XPCT в Xq13.2». Молекулярная генетика человека . 3 (7): 1133–9. DOI : 10.1093 / HMG / 3.7.1133 . PMID 7981683 . 
  6. ^ a b c Friesema EC, Ganguly S, Abdalla A, Manning Fox JE, Halestrap AP, Visser TJ (октябрь 2003 г.). «Идентификация переносчика монокарбоксилата 8 в качестве переносчика специфических гормонов щитовидной железы» . Журнал биологической химии . 278 (41): 40128–35. DOI : 10.1074 / jbc.M300909200 . PMID 12871948 . 
  7. ↑ Schwartz CE, May MM, Carpenter NJ, Rogers RC, Martin J, Bialer MG, Ward J, Sanabria J, Marsa S, Lewis JA, Echeverri R, Lubs HA, Voeller K, Simensen RJ, Stevenson RE (июль 2005 г.). «Синдром Аллана-Херндона-Дадли и ген транспортера монокарбоксилата 8 (MCT8)» . Американский журнал генетики человека . 77 (1): 41–53. DOI : 10.1086 / 431313 . PMC 1226193 . PMID 15889350 .  
  8. ^ «Ген Entrez: семейство 16 переносчиков растворенных веществ SLC16A2, член 2 (переносчик монокарбоновых кислот 8)» .
  9. ^ Dumitrescu AM, Ляо XH, Лучший TB, Брокман K, Refetoff S (январь 2004). «Новый синдром, сочетающий щитовидную железу и неврологические нарушения, связан с мутациями в гене переносчика монокарбоксилатов» . Американский журнал генетики человека . 74 (1): 168–75. DOI : 10.1086 / 380999 . PMC 1181904 . PMID 14661163 .  
  10. ^ Tsurusaki Y, Осака Н, Hamanoue Н, Shimbo Н, Тсуджи М, Doi Н, Saitsu Н, Мацумото N, N Miyake (сентябрь 2011). «Быстрое обнаружение мутации, вызывающей Х-сцепленную лейкоэнцефалопатию, путем секвенирования экзома». Журнал медицинской генетики . 48 (9): 606–9. DOI : 10.1136 / jmg.2010.083535 . PMID 21415082 . S2CID 1157351 .  
  11. ^ Vaurs-Барьер С, Девилль М, Sarret С, Жиро G, Де - Portes В, Пратс-Виньяса Ю.М., Де Микеле G, Dan B, Brady А.Ф., Boespflug-Танги О, Турэн Р (январь 2009). «Болезнь Пелицея-Мерцбахера у мутировавших в MCT8 субъектов мужского пола». Анналы неврологии . 65 (1): 114–8. DOI : 10.1002 / ana.21579 . PMID 19194886 . S2CID 27740314 .  
  12. ^ «Данные теста на толерантность к глюкозе для Slc16a2» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  13. ^ «Данные клинической химии для Slc16a2» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  14. ^ « Данные о заражении сальмонеллой для Slc16a2» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  15. ^ « Данные о заражении Citrobacter для Slc16a2» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  16. ^ а б в г Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 . 
  17. ^ Портал ресурсов мыши , Wellcome Trust Sanger Institute.
  18. ^ "Международный Консорциум Нокаут-Мышей" .
  19. ^ "Информатика генома мыши" .
  20. ^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс с условным нокаутом для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .  
  21. ^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 . 
  22. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .  
  23. ↑ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма» . Геномная биология . 12 (6): 224. DOI : 10.1186 / GB-2011-12-6-224 . PMC 3218837 . PMID 21722353 .  
  24. ^ Заде D, Tovin А, Лерер-Гольдштейн Т, Vatine Г.Д., Аппелбаум л (сентябрь 2014). «Измененные поведенческие характеристики и живое изображение нейронных дефектов цепи в модели рыбок данио для психомоторной отсталости» . PLOS Genetics . 10 (9): e1004615. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1004615 . PMC 4177677 . PMID 25255244 .  
  25. ^ Заде D, Tovin А, Лерер-Гольдштейн Т, Vatine Г.Д., Аппелбаум л (сентябрь 2014). «Измененные поведенческие характеристики и живое изображение нейронных дефектов цепи в модели рыбок данио для психомоторной отсталости» . PLOS Genetics . 10 (9): e1004615. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1004615 . PMC 4177677 . PMID 25255244 .  
  26. ^ Mughal, Bilal B .; Лиманс, Мишель; Лима де Соуза, Элейн К.; Ле Мевель, Себастьян; Спирханзлова, Петра; Visser, Theo J .; Фини, Жан-Батист; Деменеикс, Барбара А. (2017-08-01). «Функциональная характеристика переносчиков тироидных гормонов Xenopus mct8 и oatp1c1» . Эндокринология . 158 (8): 2694–2705. DOI : 10.1210 / en.2017-00108 . ISSN 1945-7170 . PMID 28591769 .  
  27. ^ Коннорс, Кристин А .; Корте, Джозеф Дж .; Андерсон, Грант У .; Дегитц, Зигмунд Дж. (01.08.2010). «Характеристика экспрессии транспортера тироидных гормонов во время тканеспецифических метаморфических событий у Xenopus tropicalis». Общая и сравнительная эндокринология . 168 (1): 149–159. DOI : 10.1016 / j.ygcen.2010.04.015 . ISSN 1095-6840 . PMID 20417208 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Halestrap AP, Мередит Д. (февраль 2004 г.). «Семейство генов SLC16 - от переносчиков монокарбоксилатов (МСТ) до переносчиков ароматических аминокислот и не только». Pflügers Archiv . 447 (5): 619–28. DOI : 10.1007 / s00424-003-1067-2 . PMID  12739169 . S2CID  15498611 .
  • Friesema EC, Jansen J, Heuer H, Trajkovic M, Bauer K, Visser TJ (сентябрь 2006 г.). «Механизмы заболевания: задержка психомоторного развития и высокие уровни Т3, вызванные мутациями в транспортере монокарбоксилата 8». Природа Клиническая практика Эндокринология и метаболизм . 2 (9): 512–23. DOI : 10.1038 / ncpendmet0262 . PMID  16957765 . S2CID  25232696 .
  • Грютерс А (2007). «Дефекты транспортера тироидных гормонов». Эндокринное развитие . 10 : 118–26. DOI : 10.1159 / 000106823 . ISBN 978-3-8055-8296-4. PMID  17684393 .
  • Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. DOI : 10.1006 / abio.1996.0138 . PMID  8619474 .
  • Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. DOI : 10.1101 / gr.7.4.353 . PMC  139146 . PMID  9110174 .
  • Прайс Н.Т., Джексон В.Н., Halestrap AP (январь 1998 г.). «Клонирование и секвенирование четырех новых гомологов переносчиков монокарбоксилата (MCT) млекопитающих подтверждает существование семейства переносчиков с древним прошлым» . Биохимический журнал . 329 (2): 321–8. DOI : 10.1042 / bj3290321 . PMC  1219047 . PMID  9425115 .
  • Дебранд Э., Херд Э, Авнер П. (март 1998 г.). «Клонирование и локализация мышиного гена Xpct: свидетельство сложных перестроек во время эволюции области вокруг гена Xist». Геномика . 48 (3): 296–303. DOI : 10.1006 / geno.1997.5173 . PMID  9545634 .
  • Думитреску AM, Ляо XH, Best TB, Brockmann K, Refetoff S (январь 2004 г.). «Новый синдром, сочетающий щитовидную железу и неврологические нарушения, связан с мутациями в гене переносчика монокарбоксилатов» . Американский журнал генетики человека . 74 (1): 168–75. DOI : 10.1086 / 380999 . PMC  1181904 . PMID  14661163 .
  • Friesema EC, Grueters A, Biebermann H, Krude H, von Moers A, Reeser M, Barrett TG, Mancilla EE, Svensson J, Kester MH, Kuiper GG, Balkassmi S, Uitterlinden AG, Koehrle J, Rodien P, Halestrap AP, Visser TJ (2004). «Связь между мутациями переносчика гормонов щитовидной железы и тяжелой Х-сцепленной психомоторной отсталостью». Ланцет . 364 (9443): 1435–7. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (04) 17226-7 . PMID  15488219 . S2CID  37520843 .
  • Heuer H, Maier MK, Iden S, Mittag J, Friesema EC, Visser TJ, Bauer K (апрель 2005 г.). «Транспортер монокарбоксилата 8, связанный с задержкой психомоторного развития человека, высоко экспрессируется в популяциях нейронов, чувствительных к гормонам щитовидной железы» . Эндокринология . 146 (4): 1701–6. DOI : 10.1210 / en.2004-1179 . PMID  15661862 .
  • Brockmann K, Dumitrescu AM, Best TT, Hanefeld F, Refetoff S (июнь 2005 г.). «Х-сцепленная пароксизмальная дискинезия и тяжелая глобальная отсталость, вызванная дефектным геном MCT8». Журнал неврологии . 252 (6): 663–6. DOI : 10.1007 / s00415-005-0713-3 . PMID  15834651 . S2CID  31994320 .
  • Friesema EC, Kuiper GG, Jansen J, Visser TJ, Kester MH (ноябрь 2006 г.). «Транспорт тироидных гормонов человеческим транспортером монокарбоксилата 8 и его лимитирующая роль во внутриклеточном метаболизме» . Молекулярная эндокринология . 20 (11): 2761–72. DOI : 10.1210 / me.2005-0256 . PMID  16887882 .
  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .
  • Jansen J, Friesema EC, Kester MH, Milici C, Reeser M, Grüters A, Barrett TG, Mancilla EE, Svensson J, Wemeau JL, Busi da Silva Canalli MH, Lundgren J, McEntagart ME, Hopper N, Arts WF, Visser TJ (Июнь 2007 г.). «Функциональный анализ мутаций монокарбоксилатного транспортера 8, выявленных у пациентов с Х-сцепленной психомоторной задержкой и повышенным уровнем трийодтиронина в сыворотке» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 92 (6): 2378–81. DOI : 10.1210 / jc.2006-2570 . PMID  17356046 .