Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
SNTG1
Идентификаторы
ПсевдонимыSNTG1 , G1SYN, SYN4, синтрофин гамма 1
Внешние идентификаторыOMIM: 608714 MGI: 1918346 HomoloGene: 56834 Генные карты : SNTG1
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человека) [1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение SNTG1
Геномное расположение SNTG1
Группа8q11.21Начинать49 909 789 п.н. [1]
Конец50 796 692 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 1 (мышь)
Chr.Хромосома 1 (мышь) [2]
Хромосома 1 (мышь)
Геномное расположение SNTG1
Геномное расположение SNTG1
Группа1 | 1 A1-A2Начинать8 361 475 п.н. [2]
Конец9 299 878 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE SNTG1 220405 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• актина связывания
• связывающий белок С-конец
• структурной активности молекулы
Сотовый компонент• цитоплазма
• взъерошенная мембрана
• синтрофиновый комплекс
• цитоскелет
• клеточное ядро
• дистрофин-ассоциированный гликопротеиновый комплекс
Биологический процесс• сотовая связь
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

54212

71096

Ансамбль

ENSG00000147481

ENSMUSG00000025909

UniProt

Q9NSN8

Q925E1

RefSeq (мРНК)
NM_001287813
NM_001287814
NM_018967
NM_001321773
NM_001321775

NM_001321776
NM_001321777
NM_001321778

NM_001290390
NM_001290392
NM_001290393
NM_027671

RefSeq (белок)
NP_001274742
NP_001274743
NP_001308702
NP_001308704
NP_001308705

NP_001308706
NP_001308707
NP_061840
NP_001274742.1
NP_061840.1
NP_001308702.1

NP_001277319
NP_001277321
NP_001277322
NP_081947

Расположение (UCSC)Chr 8: 49.91 - 50.8 МбChr 1: 8,36 - 9,3 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гамма-1-syntrophin является белком , который в организме человека кодируется SNTG1 гена . [5] [6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства синтрофинов . Синтрофины представляют собой белки цитоплазматической периферической мембраны, которые обычно содержат 2 домена гомологии плекстрина (PH), домен PDZ, который делит пополам первый домен PH, и C-концевой домен, который опосредует связывание дистрофина . Этот ген специфически экспрессируется в головном мозге . Были описаны варианты транскриптов этого гена, но их полноразмерная природа не определена. [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000147481 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025909 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Piluso G, Мирабелла М, Риччи Е, Belsito А, Abbondanza С, Servidei S, Puca А.А., TONALI Р, Puca Г.А., Nigro В (июнь 2000). «Гамма1- и гамма2-синтрофины, два новых белка, связывающих дистрофин, локализованные в нейрональных клетках» . J Biol Chem . 275 (21): 15851–60. DOI : 10.1074 / jbc.M000439200 . PMID 10747910 . 
  6. ^ a b «Ген Энтреса: синтрофин SNTG1, гамма 1» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Genome Res . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC  310948 . PMID  11076863 .
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Genome Res . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC  311072 . PMID  11230166 .
  • Хоган А., Шеперд Л., Шабо Дж. И др. (2001). «Взаимодействие гамма-1-синтрофина с диацилглицерин-киназой-дзета. Регуляция ядерной локализации посредством взаимодействий PDZ» . J. Biol. Chem . 276 (28): 26526–33. DOI : 10.1074 / jbc.M104156200 . PMID  11352924 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Видберг Ч., Брайант Н. Дж., Джиротти М. и др. (2003). «Tomosyn взаимодействует с t-SNAREs syntaxin4 и SNAP23 и играет роль в стимулированной инсулином транслокации GLUT4» . J. Biol. Chem . 278 (37): 35093–101. DOI : 10.1074 / jbc.M304261200 . PMID  12832401 .
  • Бакстон П., Чжан Х.М., Уолш Б. и др. (2004). «Идентификация и характеристика Snapin как повсеместно экспрессируемого SNARE-связывающего белка, который взаимодействует с SNAP23 в ненейрональных клетках» . Biochem. Дж . 375 (Pt 2): 433–40. DOI : 10.1042 / BJ20030427 . PMC  1223698 . PMID  12877659 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Genome Res . 14 (10B): 2136–44. DOI : 10.1101 / gr.2576704 . PMC  528930 . PMID  15489336 .
  • Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука . 307 (5715): 1621–5. DOI : 10.1126 / science.1105776 . PMID  15761153 . S2CID  39457788 .
  • Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Nucleic Acids Res . 34 (выпуск базы данных): D415–8. DOI : 10.1093 / NAR / gkj139 . PMC  1347501 . PMID  16381901 .
  • Chen Z, Hague C, Hall RA, Minneman KP (2006). «Синтрофины регулируют альфа1D-адренорецепторы посредством взаимодействия, опосредованного доменом PDZ» . J. Biol. Chem . 281 (18): 12414–20. DOI : 10.1074 / jbc.M508651200 . PMID  16533813 .