СОРБС3

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
2CT3 , 2DLM , 2NWM , 2YUP

Идентификаторы

Псевдонимы

SORBS3 , SCAM-1, SCAM1, SH3D4, сорбин и домен SH3, содержащий 3

Внешние идентификаторы

OMIM: 610795 MGI: 700013 HomoloGene: 4218 Генные карты : SORBS3

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 8 (человека) ^[1]

Группа	8p21.3	Начинать	22 544 986 п.н. ^[1]
Группа	8p21.3	Конец	22 575 788 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 14 (мышь) ^[2]

Группа	14 D2 \| 14 36,27 см	Начинать	70 180 468 п.н. ^[2]
Группа	14 D2 \| 14 36,27 см	Конец	70 211 989 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• винкулин связывания • транскрипционный фактор связывания • структурную составляющую цитоскелета • GO: 0001948 связывание белка
Сотовый компонент	• цитоплазма • цитозоль • соединение клеток • цитоскелет • ядро клетки • очаговая адгезия
Биологический процесс	• адгезия клеток к субстрату • адгезия клеток • сокращение мышц • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция сборки стрессовых волокон • позитивная регуляция организации цитоскелета • позитивная регуляция каскада MAPK • организация актиновых филаментов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


10174


20410

Ансамбль


ENSG00000120896


ENSMUSG00000022091

UniProt


O60504


Q9R1Z8

RefSeq (мРНК)


NM_001018003 NM_005775


NM_001271407 NM_001271408 NM_001271409 NM_011366

RefSeq (белок)


NP_001018003 NP_005766


NP_001258336 NP_001258337 NP_001258338 NP_035496

Расположение (UCSC)

Chr 8: 22,54 - 22,58 Мб

Chr 14: 70.18 - 70.21 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Vinexin является белком , который в организме человека кодируется SORBS3 геном . ^[5]^[6]^[7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что SORBS3 взаимодействует с DLG5 ^[8] и MAPK1 . ^[9]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000120896 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022091 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Киока N; Sakata S; Kawauchi T; Amachi T; Akiyama SK; Окадзаки К; Yaen C; Yamada KM; Aota S (март 1999 г.). «Винексин: новый винкулин-связывающий белок с множеством SH3-доменов, усиливает актиновую организацию цитоскелета» . J Cell Biol . 144 (1): 59–69. DOI : 10.1083 / jcb.144.1.59 . PMC 2148117 . PMID 9885244 .
^ Kioka N (январь 2003). «[Новое семейство адаптерных белков, регулирующих организацию цитоскелета и передачу сигналов - винексин, CAP / ponsin, ArgBP2]». Сэйкагаку . 74 (11): 1356–60. PMID 12510380 .
^ «Entrez Gene: сорбин SORBS3 и домен SH3, содержащий 3» .
^ Вакабаяши, Makoto; Ито Такуя; Мицусима Масару; Айзава Санаэ; Уэда Казумицу; Амачи Теруо; Киока Нориюки (июнь 2003 г.). «Взаимодействие lp-dlg / KIAA0583, мембранно-ассоциированного белка семейства гуанилаткиназ, с винексином и бета-катенином в местах межклеточного контакта» . J. Biol. Chem . 278 (24): 21709–14. DOI : 10.1074 / jbc.M211004200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12657639 .
^ Мицусима, Масару; Сува Акира; Амачи Теруо; Уэда Казумицу; Киока Нориюки (август 2004 г.). «Киназа, регулируемая внеклеточными сигналами, активируется эпидермальным фактором роста и клеточной адгезией, взаимодействует с винексином и фосфорилирует его» . J. Biol. Chem . 279 (33): 34570–7. DOI : 10.1074 / jbc.M402304200 . ISSN 0021-9258 . PMID 15184391 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Акамацу М., Аота С., Сува А. и др. (2000). «Винексин образует сигнальный комплекс с Sos и модулирует активность N-концевой киназы c-Jun / стресс-активируемой протеинкиназы, индуцированную эпидермальным фактором роста» . J. Biol. Chem . 274 (50): 35933–7. DOI : 10.1074 / jbc.274.50.35933 . PMID 10585480 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Вакабаяси М., Ито Т., Мицусима М. и др. (2003). «Взаимодействие lp-dlg / KIAA0583, мембранно-ассоциированного белка семейства гуанилаткиназ, с винексином и бета-катенином в местах межклеточного контакта» . J. Biol. Chem . 278 (24): 21709–14. DOI : 10.1074 / jbc.M211004200 . PMID 12657639 .
Таунсон С.М., Добжицкая К.М., Ли А.В. и др. (2003). «SAFB2, новый гомолог фактора прикрепления каркаса и корепрессор рецептора эстрогена» . J. Biol. Chem . 278 (22): 20059–68. DOI : 10.1074 / jbc.M212988200 . PMID 12660241 .
Мицусима М., Сува А., Амачи Т. и др. (2004). «Киназа, регулируемая внеклеточными сигналами, активируется эпидермальным фактором роста и клеточной адгезией, взаимодействует с винексином и фосфорилирует его» . J. Biol. Chem . 279 (33): 34570–7. DOI : 10.1074 / jbc.M402304200 . PMID 15184391 .
Мартенс Н., Уери М., Ван П. и др. (2004). «Супрессор передачи сигналов цитокинов (SOCS) -7 взаимодействует с актиновым цитоскелетом через винексин». Exp. Cell Res . 298 (1): 239–48. DOI : 10.1016 / j.yexcr.2004.04.002 . PMID 15242778 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . DOI : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Bour G, Plassat JL, Bauer A и др. (2005). «Винексин бета взаимодействует с нефосфорилированным доменом AF-1 ретиноидного рецептора гамма (RARgamma) и подавляет транскрипцию, опосредованную RARgamma» . J. Biol. Chem . 280 (17): 17027–37. DOI : 10.1074 / jbc.M501344200 . PMID 15734736 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Mitsushima M; Ueda K; Киока Н (2006). «Винексин бета регулирует фосфорилирование рецептора эпидермального фактора роста на поверхности клетки» . Гены клеток . 11 (9): 971–82. DOI : 10.1111 / j.1365-2443.2006.00995.x . PMID 16923119 . S2CID 24238810 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. DOI : 10,1038 / НБТ1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Мизутани К., Ито Х., Ивамото И. и др. (2007). «Важнейшие роли ERK-опосредованного фосфорилирования винексина в распространении клеток, миграции и независимом от закрепления росте» . Онкоген . 26 (50): 7122–31. DOI : 10.1038 / sj.onc.1210512 . PMID 17486060 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение человеческого гена SORBS3 в браузере генома UCSC .
Подробная информация о человеческом гене SORBS3 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на хромосоме 8 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000120896 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022091 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9885244-5] Киока N; Sakata S; Kawauchi T; Amachi T; Akiyama SK; Окадзаки К; Yaen C; Yamada KM; Aota S (март 1999 г.). «Винексин: новый винкулин-связывающий белок с множеством SH3-доменов, усиливает актиновую организацию цитоскелета» . J Cell Biol . 144 (1): 59–69. DOI : 10.1083 / jcb.144.1.59 . PMC 2148117 . PMID 9885244 .

[pmid12510380-6] Kioka N (январь 2003). «[Новое семейство адаптерных белков, регулирующих организацию цитоскелета и передачу сигналов - винексин, CAP / ponsin, ArgBP2]». Сэйкагаку . 74 (11): 1356–60. PMID 12510380 .

[entrez-7] «Entrez Gene: сорбин SORBS3 и домен SH3, содержащий 3» .

[pmid12657639-8] Вакабаяши, Makoto; Ито Такуя; Мицусима Масару; Айзава Санаэ; Уэда Казумицу; Амачи Теруо; Киока Нориюки (июнь 2003 г.). «Взаимодействие lp-dlg / KIAA0583, мембранно-ассоциированного белка семейства гуанилаткиназ, с винексином и бета-катенином в местах межклеточного контакта» . J. Biol. Chem . 278 (24): 21709–14. DOI : 10.1074 / jbc.M211004200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12657639 .

[pmid15184391-9] Мицусима, Масару; Сува Акира; Амачи Теруо; Уэда Казумицу; Киока Нориюки (август 2004 г.). «Киназа, регулируемая внеклеточными сигналами, активируется эпидермальным фактором роста и клеточной адгезией, взаимодействует с винексином и фосфорилирует его» . J. Biol. Chem . 279 (33): 34570–7. DOI : 10.1074 / jbc.M402304200 . ISSN 0021-9258 . PMID 15184391 .

[1]