Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Saccharomyces paradoxus
Научная классификация редактировать
Королевство:Грибы
Разделение:Аскомикота
Класс:Сахаромицеты
Заказ:Saccharomycetales
Семья:Saccharomycetaceae
Род:Сахаромицеты
Разновидность:
С. парадокс
Биномиальное имя
Saccharomyces paradoxus
Бачинская, А.А., 1914 г.

Saccharomyces paradoxus - это дикие дрожжи, наиболее близкие к пекарским дрожжам Saccharomyces cerevisiae из известных видов. Он используется в популяционной геномике и филогенетических исследованиях для сравнения его диких характеристик с лабораторными дрожжами. [1]

Экология [ править ]

Saccharomyces paradoxus в основном выделяется на лиственных деревьях (дуб, клен, береза), а в некоторых редких случаях - на насекомых и фруктах. [2] [3] [4] [5] Часто встречается в симпатрии с другими видами Saccharomyces . [6] [7] [8] Как и Saccharomyces cerevisiae , он имеет всемирное распространение и является мезофильным , что ограничивает его естественное распространение низкими широтами. Однако Saccharomyces paradoxus обычно растет при более низких температурах, чем Saccharomyces cerevisiae., что привело к небольшому смещению его распространения в сторону более прохладных регионов, таких как Британские острова и Восточная Канада. [2] [8] [9]

Биогеография [ править ]

Распространение Saccharomyces paradoxus по всему миру. Популяции представлены разными цветами. Зеленые звездочки указывают на недавние интродукции европейского типа.
Филогения основных популяций Saccharomyces paradoxus . [10]

В отличие от большинства других видов Saccharomyces , нет никаких доказательств того, что Saccharomyces paradoxus был одомашнен людьми. [3] [11] Соответственно, его биогеография в основном отмечена естественными процессами, такими как ограниченная миграция, [3] ледниковые рефугиумы [12] и адаптация к климату. [10] Не менее четырех генетически и фенотипически различных популяций Saccharomyces paradoxus.определены, соответствующие основным географическим подразделениям: Европа (включая Западную Сибирь), Дальневосточную Азию (Япония, Восточная Сибирь), Северная Америка (восточное и западное побережье Северной Америки, район Великих озер) и Северо-Восточная Америка (полуостров Гаспе, Долина Святого Лаврентия и Аппалачи) соответственно. [3] [9] [10] [11] Репрезентативные штаммы этих популяций демонстрируют частичную постзиготическую изоляцию . [12] [13] Пятая популяция представлена ​​одиночным изолятом с Гавайев. [3] [11] Некоторые штаммы европейского населения встречаются в Северной Америке и Новой Зеландии и, вероятно, являются результатом недавних событий колонизации. [14] [15]Два изолята из Южной Америки, описанные как Saccharomyces cariocanus , [16] генетически неотличимы, но демонстрируют постзиготическую изоляцию при скрещивании со штаммами из американской популяции из-за хромосомных транслокаций . [13]

Воспроизведение [ править ]

Saccharomyces paradoxus естественно homothallic , и встречается в основном в диплоидных в окружающей среде. Размножение в основном клональное, и 99% полового размножения происходит между спорами одного и того же аска . [17] Это очищает рецессивные вредные мутации, накопившиеся во время клональной экспансии, в процессе, известном как «обновление генома». [18] [19] Постзиготическая изоляция между штаммами Saccharomyces paradoxus обычно наблюдается и может быть связана либо с генетической дивергенцией между популяциями, либо с хромосомными изменениями.внутри популяций. [12] [13]

Как и у других видов Saccharomyces , гетероталлизм можно восстановить с помощью стандартных генетических инструментов, чтобы получить стабильные гаплоидные штаммы для экспериментальных целей.

Ссылки [ править ]

  1. ^ Данэм, MJ; Луи, ЭД (2011). «Эволюция дрожжей и экология встречаются с геномикой» . EMBO Reports . 12 (1): 8–10. DOI : 10.1038 / embor.2010.204 . PMC  3024138 . PMID  21151040 .
  2. ^ а б Чаррон, G; Leducq, JB; Бертин, C (2014). «Изучение северной границы распространения Saccharomyces cerevisiae и Saccharomyces paradoxus в Северной Америке» . FEMS Yeast Research . 14 (2): 281–8. DOI : 10.1111 / 1567-1364.12100 . PMID 24119009 . 
  3. ^ a b c d e Hyma, KE; Джей, JC (2013). «Смешение экотипов виноградников и дубов Saccharomyces cerevisiae на виноградниках Северной Америки» . Молекулярная экология . 22 (11): 2917–30. DOI : 10.1111 / mec.12155 . PMC 3620907 . PMID 23286354 .  
  4. ^ Маганти, H; Bartfai, D; Сюй, Дж (2012). «Экологическое структурирование дрожжей, связанных с деревьями вокруг Гамильтона, Онтарио, Канада» . FEMS Yeast Research . 12 (1): 9–19. DOI : 10.1111 / j.1567-1364.2011.00756.x . PMID 22029478 . 
  5. ^ Sniegowski, PD; Домбровский П.Г .; Fingerman, E (2002). «Saccharomyces cerevisiae и Saccharomyces paradoxus сосуществуют в естественном лесном массиве в Северной Америке и демонстрируют разные уровни репродуктивной изоляции от европейских сородичей» . FEMS Yeast Research . 1 (4): 299–306. DOI : 10.1111 / j.1567-1364.2002.tb00048.x . PMID 12702333 . 
  6. ^ Наумов, Г.И.; Наумова Е.С.; Сниговский, П.Д. (1998). «Saccharomyces paradoxus и Saccharomyces cerevisiae связаны с экссудатами североамериканских дубов». Канадский журнал микробиологии . 44 (11): 1045–50. DOI : 10.1139 / w98-104 . PMID 10029999 . 
  7. ^ Сампайо, JP; Гонсалвес, П. (2008). «Природные популяции Saccharomyces kudriavzevii в Португалии связаны с корой дуба и симпатичны S. cerevisiae и S. paradoxus» (PDF) . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (7): 2144–52. DOI : 10,1128 / AEM.02396-07 . PMC 2292605 . PMID 18281431 .   
  8. ^ а б Суини, JY; Kuehne, HA; Сниговский, П.Д. (2004). «Симпатрические природные популяции Saccharomyces cerevisiae и S. paradoxus имеют разные тепловые профили роста» . FEMS Yeast Research . 4 (4–5): 521–5. DOI : 10.1016 / s1567-1356 (03) 00171-5 . PMID 14734033 . 
  9. ^ a b Джонсон, LJ; Куфопану, В. Годдард, MR (2004). «Популяционная генетика диких дрожжей Saccharomyces paradoxus» . Генетика . 166 (1): 43–52. DOI : 10.1534 / genetics.166.1.43 . PMC 1470673 . PMID 15020405 .  
  10. ^ a b c Leducq, JB; Charron, G; Самани, П. (2014). «Местная климатическая адаптация у широко распространенного микроорганизма» . Труды Королевского общества B: биологические науки . 281 (1777): 20132472. DOI : 10.1098 / rspb.2013.2472 . PMC 3896012 . PMID 24403328 .  
  11. ^ а б в Лити, Г; Картер, DM; Моисей, AM (2009). «Популяционная геномика домашних и диких дрожжей» . Природа . 458 (7236): 337–41. Bibcode : 2009Natur.458..337L . DOI : 10,1038 / природа07743 . PMC 2659681 . PMID 19212322 .  
  12. ^ а б в Чаррон, G; Leducq, JB; Ландри, CR (2014). «Хромосомные вариации сегрегируют внутри зарождающихся видов и коррелируют с репродуктивной изоляцией». Молекулярная экология . 23 (17): 4362–4372. DOI : 10.1111 / mec.12864 . PMID 25039979 . 
  13. ^ а б в Лити, Г; Бартон, ДБ; Луис, EJ (2006). «Разнообразие последовательностей, репродуктивная изоляция и видовые концепции Saccharomyces» . Генетика . 174 (2): 839–850. DOI : 10.1534 / genetics.106.062166 . PMC 1602076 . PMID 16951060 .  
  14. ^ Kuehne, HA; Мерфи, штат Гавайи; Фрэнсис, Калифорния (2007). «Аллопатрическая дивергенция, вторичный контакт и генетическая изоляция в популяциях диких дрожжей». Текущая биология . 17 (5): 407–11. DOI : 10.1016 / j.cub.2006.12.047 . PMID 17306538 . S2CID 18301950 .  
  15. ^ Чжан, штат Джорджия; Скелтон, А; Гарднер, RC (2010). «Saccharomyces paradoxus и Saccharomyces cerevisiae обитают на дубах в Новой Зеландии: свидетельства миграции из Европы и межвидовых гибридов» . FEMS Yeast Research . 10 (7): 941–7. DOI : 10.1111 / j.1567-1364.2010.00681.x . PMID 20868381 . 
  16. ^ Наумов, Г.И.; Джеймс, SA; Наумова, Е.С. (2000). «Три новых вида в комплексе Saccharomyces sensu stricto: Saccharomyces cariocanus, Saccharomyces kudriavzevii и Saccharomyces mikatae» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (5): 1931–42. DOI : 10.1099 / 00207713-50-5-1931 . PMID 11034507 . 
  17. ^ Цай, Эй Джей; Bensasson, D; Берт, А (2008). «Популяционная геномика диких дрожжей Saccharomyces paradoxus: количественная оценка жизненного цикла» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (12): 4957–62. Bibcode : 2008PNAS..105.4957T . DOI : 10.1073 / pnas.0707314105 . PMC 2290798 . PMID 18344325 .  
  18. ^ Мортимер, Роберт К .; Романо, Патриция; Суззи, Джованна; Полсинелли, Марио (декабрь 1994). «Обновление генома: новый феномен, выявленный в результате генетического исследования 43 штаммов Saccharomyces cerevisiae, полученных в результате естественного брожения виноградного сусла». Дрожжи . 10 (12): 1543–1552. DOI : 10.1002 / yea.320101203 . PMID 7725789 . 
  19. ^ Масел, Джоанна ; Литтл, Дэвид Н. (декабрь 2011 г.). «Последствия редкого полового размножения посредством самоопыления у других видов, размножающихся клонами» . Теоретическая популяционная биология . 80 (4): 317–322. DOI : 10.1016 / j.tpb.2011.08.004 . PMC 3218209 . PMID 21888925 .