Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Пептидаза_A22B
Идентификаторы
СимволПептидаза_A22B
PfamPF04258
Клан пфамCL0130
ИнтерПроIPR007369
МЕРОПЫA22
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumрезюме структуры
Пептидаза_A24
Идентификаторы
СимволПептидаза_A24
PfamPF01478
Клан пфамCL0130
ИнтерПроIPR000045
МЕРОПЫA24
OPM суперсемейство244
Белок OPM3s0x
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumрезюме структуры

В молекулярной биологии сигнальная пептид-пептидаза (SPP) - это тип белка, который специфически расщепляет части других белков. Это внутримембранная аспартилпротеаза с консервативными мотивами активного сайта «YD» и «GxGD» в соседних трансмембранных доменах (TMD). Его последовательности высоко консервативны у разных видов позвоночных. SPP расщепляет остаточные сигнальные пептиды, оставшиеся в мембране под действием сигнальной пептидазы [1], а также играет ключевую роль в иммунном надзоре и созревании некоторых вирусных белков . [2]

Биологическая функция [ править ]

Физиологически SPP обрабатывает сигнальные пептиды классических препротеинов MHC класса I. Фрагмент расщепления длиной девять аминокислот затем представляется на рецепторах HLA-E и модулирует активность естественных клеток-киллеров . [3]

SPP также играет патофизиологическую роль; он расщепляет структурный белок нуклеокапсида (также известный как основной белок) вируса гепатита C и, таким образом, влияет на скорость размножения вируса. [4]

У мышей неамерный пептид, происходящий из белка SPP, служит второстепенным антигеном гистосовместимости HM13, который играет роль в отторжении трансплантата [5] [6]

Гомологичные протеазы SPPL2A и SPPL2B способствуют внутримембранному расщеплению TNFα в активированных дендритных клетках и могут играть иммуномодулирующую роль. [7] [8] Для SPPL2c и SPPL3 подложки неизвестны.

SPP не требуют кофакторов, что продемонстрировано экспрессией в бактериях и очисткой протеолитически активной формы. С-концевой участок определяет функциональный домен, который сам по себе достаточен для протеолитической активности. [9]

Лидерская пептидаза IV типа [ править ]

Другое семейство сигнальных аспарагиновых эндопептидаз было обнаружено у бактерий. Бактерии продуцируют ряд предшественников белков, которые подвергаются посттрансляционному метилированию и протеолизу перед секрецией в качестве активных белков. Лидерные пептидазы препилина типа IV представляют собой ферменты, которые опосредуют этот тип посттрансляционной модификации . Пилин IV типа - это белок, обнаруженный на поверхности синегнойной палочки , Neisseria gonorrhoeae и других грамотрицательных патогенов. Субъединицы пилина прикрепляют инфекционный организм к поверхности хозяина.эпителиальные клетки . Они синтезируются в виде субъединиц препилина, которые отличаются от зрелого пилина тем, что содержат лидерный пептид из 6-8 остатков, состоящий из заряженных аминокислот . Зрелые пилины типа IV также содержат метилированный N-концевой остаток фенилаланина .

Бифункциональный фермент prepilin пептидазы (PILD) от синегнойной палочки является ключевым фактором , определяющим в обоих типа IV пилей биогенезе и внеклеточной секреции белка, в его роли в качестве лидера пептидазы и метил - трансферазы (МТАазы). Он отвечает за эндопептидное расщепление уникальных лидерных пептидов, которые характеризуют предшественники пилина IV типа, а также белков с гомологичными лидерными последовательностями, которые являются важными компонентами общего пути секреции, обнаруженного у различных грамотрицательных патогенов.. После удаления лидерных пептидов тот же фермент отвечает за вторую посттрансляционную модификацию, которая характеризует пилины типа IV и их гомологи, а именно за N-метилирование вновь экспонированного N-концевого аминокислотного остатка . [10]

См. Также [ править ]

  • Лидер пептидаза А
  • Пресенилин

Ссылки [ править ]

  1. ^ Weihofen A, Биннз K, Лемберг MK, Ashman K, Martoglio B (2002). «Идентификация сигнальной пептидной пептидазы, аспарагиновой протеазы пресенилинового типа». Наука . 296 (5576): 2215–8. Bibcode : 2002Sci ... 296.2215W . DOI : 10.1126 / science.1070925 . PMID  12077416 . S2CID  45633906 .
  2. ^ Martoglio B, Golde TE (октябрь 2003). «Интрамембранно-расщепляющие аспарагиновые протеазы и болезнь: пресенилины, сигнальные пептидные пептидазы и их гомологи» . Гм. Мол. Genet . 12 Спецификация № 2: R201-6. DOI : 10,1093 / HMG / ddg303 . PMID 12966028 . 
  3. ^ Лемберг М.К., Блэнда Ф., Weihofen А, Брауд В.М., Martoglio В (2001). «Интрамембранный протеолиз сигнальных пептидов: важный шаг в генерации эпитопов HLA-E» . J. Immunol . 167 (11): 6441–6. DOI : 10.4049 / jimmunol.167.11.6441 . PMID 11714810 . 
  4. ↑ Okamoto K, Mori Y, Komoda Y, Okamoto T, Okochi M, Takeda M, Suzuki T, Moriishi K, Matsuura Y (2008). «Интрамембранный процессинг сигнальной пептидной пептидазой регулирует мембранную локализацию корового белка вируса гепатита С и распространение вируса» . J. Virol . 82 (17): 8349–61. DOI : 10,1128 / JVI.00306-08 . PMC 2519675 . PMID 18562515 .  
  5. ^ Снелл GD, Cudkowicz G, Бункер HP (июнь 1967). «Гены гистосовместимости мышей. VII. H-13, новый локус гистосовместимости в пятой группе сцепления». Трансплантация . 5 (3): 492–503. DOI : 10.1097 / 00007890-196705000-00011 . PMID 5340356 . S2CID 31345625 .  
  6. ^ «Энтрез Ген: гистосовместимость H13 (незначительная) 13» .
  7. ^ Friedmann E, Hauben E, Maylandt K и др. (2006). «SPPL2a и SPPL2b способствуют внутримембранному протеолизу TNFα в активированных дендритных клетках, чтобы запустить продукцию IL-12». Nat. Cell Biol . 8 (8): 843–8. DOI : 10.1038 / ncb1440 . PMID 16829952 . S2CID 129089 .  
  8. ^ Флюрер Р., Граммер Г., Израиль Л. и др. (2006). «Подобное гамма-секретазе внутримембранное расщепление TNFalpha с помощью аспартил протеазы GxGD SPPL2b» . Nat. Cell Biol . 8 (8): 894–6. DOI : 10.1038 / ncb1450 . PMID 16829951 . S2CID 23712486 .  
  9. Перейти ↑ Narayanan S, Sato T, Wolfe MS (июль 2007 г.). «С-концевой участок сигнальной пептидной пептидазы определяет функциональный домен для внутримембранного катализа аспарагиновой протеазой» . J. Biol. Chem . 282 (28): 20172–9. DOI : 10.1074 / jbc.M701536200 . PMID 17517891 . 
  10. ↑ Lory S, Strom MS (июнь 1997 г.). «Взаимосвязь между структурой и функцией препилинпептидазы IV типа Pseudomonas aeruginosa - обзор». Джин . 192 (1): 117–21. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (96) 00830-X . PMID 9224881 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Paetzel M, Karla A, Strynadka NC, Dalbey RE (2002). «Сигнальные пептидазы». Chem. Ред . 102 (12): 4549–80. DOI : 10.1021 / cr010166y . PMID  12475201 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: SPP: A22.003 , SPPL2a: A22.007 , SPPL2b: A22.004 , SPPL2c: A22.006 , SPPL3: A22.005
  • UMich Ориентация белков в мембранах семейства / суперсемейство-178 - Расчетное пространственное положение сигнальной пептидазы типа 1 в мембране
  • сигнал + пептид + пептидаза в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)