Частиц распознавания сигнала ( SRP ) представляет собой обильный, цитозольный, повсеместно сохраняется рибонуклеопротеиновый ( белок - РНК - комплекс) , который распознает и целевой специфические белки к эндоплазматическому ретикулуму в эукариоте и плазматической мембране в прокариоте . [1]
сигнал распознавания частиц 9kDa | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||
Символ | SRP9 | |||||
Ген NCBI | 6726 | |||||
HGNC | 11304 | |||||
OMIM | 600707 | |||||
RefSeq | NM_003133 | |||||
UniProt | P49458 | |||||
Прочие данные | ||||||
Locus | Chr. 1 квартал 42,12 | |||||
|
сигнал распознавания частицы 14kDa | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||
Символ | SRP14 | |||||
Ген NCBI | 6727 | |||||
HGNC | 11299 | |||||
OMIM | 600708 | |||||
RefSeq | NM_003134 | |||||
UniProt | P37108 | |||||
Прочие данные | ||||||
Locus | Chr. 15 q22 | |||||
|
сигнальная частица распознавания 19kDa | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||
Символ | SRP19 | |||||
Ген NCBI | 6728 | |||||
HGNC | 11300 | |||||
OMIM | 182175 | |||||
RefSeq | NM_003135 | |||||
UniProt | P09132 | |||||
Прочие данные | ||||||
Locus | Chr. 5 q21-q22 | |||||
|
Частица распознавания сигнала 54kDa | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||
Символ | SRP54 | |||||
Ген NCBI | 6729 | |||||
HGNC | 11301 | |||||
OMIM | 604857 | |||||
RefSeq | NM_003136 | |||||
UniProt | P61011 | |||||
Прочие данные | ||||||
Locus | Chr. 14 q13.2 | |||||
|
Частица распознавания сигнала 68kDa | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||
Символ | SRP68 | |||||
Ген NCBI | 6730 | |||||
HGNC | 11302 | |||||
OMIM | 604858 | |||||
RefSeq | NM_014230 | |||||
UniProt | Q9UHB9 | |||||
Прочие данные | ||||||
Locus | Chr. 17 q25.1 | |||||
|
Частица распознавания сигнала 72kDa | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||
Символ | SRP72 | |||||
Ген NCBI | 6731 | |||||
HGNC | 11303 | |||||
OMIM | 602122 | |||||
RefSeq | NM_006947 | |||||
UniProt | O76094 | |||||
Прочие данные | ||||||
Locus | Chr. 4 q11 | |||||
|
Белок частицы распознавания сигнала | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||
Организм | ||||||
Символ | ffh | |||||
Альт. символы | p48, Srp54 | |||||
UniProt | P0AGD7 | |||||
|
История
Функция SRP была обнаружена при изучении процессированных и необработанных секреторных белков, в частности легких цепей иммуноглобулина ; [2] и бычий препролактин. Недавно синтезированные белки у эукариот несут N-концевые гидрофобные сигнальные последовательности , которые связываются с помощью SRP, когда они выходят из рибосомы . [3] [4]
Механизм
У эукариот SRP связывается с сигнальной последовательностью вновь синтезированного пептида, когда он выходит из рибосомы . [1] Это связывание приводит к замедлению синтеза белка , известный как «удлинение», арест законсервированная функция из SRP , что облегчает связывание белки перевод и белка транслокацию процессы. [5] SRP затем направляет весь этот комплекс (комплекс рибосомы с растущей цепью ) в проводящий белок канал, также известный как транслокон , в мембране эндоплазматического ретикулума (ER). Это происходит посредством взаимодействия и стыковки SRP с родственным ему рецептором SRP [6], который расположен в непосредственной близости от транслокона.
У эукариот есть три домена между SRP и его рецептором, которые участвуют в связывании и гидролизе гуанозинтрифосфата (GTP). Они расположены в двух связанных субъединицах рецептора SRP (SRα и SRβ) [7] и белка SRP54 (известного как Ffh у бактерий). [8] Было показано, что скоординированное связывание GTP между SRP и рецептором SRP является предпосылкой для успешного нацеливания SRP на рецептор SRP. [9] [10]
После стыковки формирующаяся пептидная цепь вставляется в канал транслокона, где она входит в ER. Синтез белка возобновляется по мере высвобождения SRP из рибосомы. [11] [12] Рецепторный комплекс SRP-SRP диссоциирует посредством гидролиза GTP, и цикл SRP-опосредованной транслокации белка продолжается. [13]
Оказавшись внутри ER, сигнальная последовательность отщепляется от корового белка сигнальной пептидазой . Следовательно, сигнальные последовательности не являются частью зрелых белков.
Состав
Несмотря на то, что функция SRP аналогична у всех организмов, ее состав сильно различается. Ядро РНК SRP54- SRP с активностью GTPase является общим для всей клеточной жизни, но некоторые полипептиды субъединиц специфичны для эукариот.
Эукариот | Архей | Бактерии |
---|---|---|
SRP9 | Нет | Нет |
SRP14 | Нет | Нет |
SRP19 | да | Нет |
SRP54 | да | Ffh |
SRP72 | Нет | Нет |
7SL РНК | да | 6SL |
SRP19-7S.S.S SRP РНК-комплекс из M. jannaschii [14]
S-домен человеческого SRP [15]
Аутоантитела
Антитела против частиц распознавания сигнала в основном связаны с полимиозитом , но не очень специфичны для него . [16] У людей с полимиозитом наличие антител к SRP связано с более выраженной мышечной слабостью и атрофией. [16]
Смотрите также
- Сигнал распознавания частицы РНК
Рекомендации
- ^ a b Тисдейл S, Пеллиццони L (2017-01-01). «Глава 7 - Дисфункция обработки РНК при спинальной мышечной атрофии». В Sumner CJ, Paushkin S, KO CP (ред.). Спинальная мышечная атрофия . Академическая пресса. С. 113–131. DOI : 10.1016 / b978-0-12-803685-3.00007-0 . ISBN 978-0-12-803685-3.
- ^ Мильштейн С., Браунли Г.Г., Харрисон Т.М., Мэтьюз МБ (сентябрь 1972 г.). «Возможный предшественник легких цепей иммуноглобулина». Природа . 239 (91): 117–20. DOI : 10.1038 / newbio239117a0 . PMID 4507519 .
- ^ Вальтер П., Ибрагими И., Блобель Г. (ноябрь 1981 г.). «Транслокация белков через эндоплазматический ретикулум. I. Белок распознавания сигналов (SRP) связывается с собранными in vitro полисомами, синтезирующими секреторный белок» . Журнал клеточной биологии . 91 (2 Pt 1): 545–50. DOI : 10,1083 / jcb.91.2.545 . PMC 2111968 . PMID 7309795 .
- ^ Блобель Г., Добберштейн Б. (декабрь 1975 г.). «Перенос белков через мембраны. I. Присутствие протеолитически процессированных и необработанных образующихся легких цепей иммуноглобулинов на мембраносвязанных рибосомах миеломы мыши» . Журнал клеточной биологии . 67 (3): 835–51. DOI : 10,1083 / jcb.67.3.835 . PMC 2111658 . PMID 811671 .
- ^ Вальтер П., Блобель Г. (декабрь 1983 г.). «Субклеточное распределение сигнала распознавания частицы и 7SL-РНК, определенное с помощью полипептид-специфичных антител и комплементарного ДНК-зонда» . Журнал клеточной биологии . 97 (6): 1693–9. DOI : 10,1083 / jcb.97.6.1693 . PMC 2112735 . PMID 6196367 .
- ^ Гилмор Р., Блобель Г., Уолтер П. (ноябрь 1982 г.). «Транслокация белка через эндоплазматический ретикулум. I. Обнаружение в микросомальной мембране рецептора для частицы распознавания сигнала» . Журнал клеточной биологии . 95 (2 Pt 1): 463–9. DOI : 10,1083 / jcb.95.2.463 . PMC 2112970 . PMID 6292235 .
- ^ Рапейко П.Дж., Гилмор Р. (май 1992 г.). «Транслокация белка через ER требует функционального сайта связывания GTP в альфа-субъединице рецептора сигнальной частицы» . Журнал клеточной биологии . 117 (3): 493–503. DOI : 10,1083 / jcb.117.3.493 . PMC 2289435 . PMID 1315314 .
- ^ Фрейманн Д.М., Кинан Р.Дж., Страуд Р.М., Уолтер П. (январь 1997 г.). «Структура консервативного домена GTPase частицы распознавания сигнала». Природа . 385 (6614): 361–4. Bibcode : 1997Natur.385..361F . DOI : 10.1038 / 385361a0 . PMID 9002524 . S2CID 4238766 .
- ^ Миллер Дж. Д., Вильгельм Х., Гираш Л., Гилмор Р., Уолтер П. (ноябрь 1993 г.). «Связывание GTP и гидролиз частицей распознавания сигнала во время инициации транслокации белка». Природа . 366 (6453): 351–4. Bibcode : 1993Natur.366..351M . DOI : 10.1038 / 366351a0 . PMID 8247130 . S2CID 4326097 .
- ^ Грудник П., Банге Г., Sinning I (август 2009 г.). «Нацеливание на белок с помощью частицы распознавания сигнала». Биологическая химия . 390 (8): 775–82. DOI : 10.1515 / BC.2009.102 . PMID 19558326 . S2CID 36611716 .
- ^ Lütcke H (март 1995 г.). «Частица распознавания сигнала (SRP), повсеместный инициатор транслокации белков» . Европейский журнал биохимии . 228 (3): 531–50. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1995.0531m.x . PMID 7737147 .[ мертвая ссылка ]
- ^ Люиринк Дж., Грех I (ноябрь 2004 г.). «SRP-опосредованное нацеливание на белок: пересмотр структуры и функции» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток . 1694 (1–3): 17–35. DOI : 10.1016 / j.bbamcr.2004.03.013 . PMID 15546655 .
- ^ Шан С.О., Уолтер П. (февраль 2005 г.). «Ко-трансляционное нацеливание на белок с помощью частицы распознавания сигнала» . Письма FEBS . 579 (4): 921–6. DOI : 10.1016 / j.febslet.2004.11.049 . PMID 15680975 . S2CID 46046514 .
- ^ Хайнцл Т., Хуанг С., Зауэр-Эрикссон А.Е. (июнь 2002 г.). «Структура комплекса РНК SRP19 и значение для сборки частиц распознавания сигнала». Природа . 417 (6890): 767–71. Bibcode : 2002Natur.417..767H . DOI : 10,1038 / природа00768 . PMID 12050674 . S2CID 2509475 .
- ^ Kuglstatter A, Oubridge C, Nagai K (октябрь 2002 г.). «Вызванные структурные изменения 7SL РНК во время сборки человеческих сигнальных частиц». Структурная биология природы . 9 (10): 740–4. DOI : 10.1038 / nsb843 . PMID 12244299 . S2CID 9543041 .
- ^ а б Као А.Х., Лакомис Д., Лукас М., Фертиг Н., Оддис CV (январь 2004 г.). «Аутоантитела к частицам распознавания сигнала у пациентов с идиопатической воспалительной миопатией и пациентов без нее» . Артрит и ревматизм . 50 (1): 209–15. DOI : 10.1002 / art.11484 . PMID 14730618 .
Внешние ссылки
- Signal + Recognition + Particle в Национальной медицинской библиотеке США по предметным заголовкам по медицинским предметам (MeSH)
- База данных частиц для распознавания сигналов
- www.dnaTube.com видео, показывающее SRP в действии
- Еще одно видео SRP на www.dnaTube.com
- Нобелевская премия по физиологии и медицине 1999 г. «за открытие того, что белки обладают внутренними сигналами, которые регулируют их транспорт и локализацию в клетке» Гюнтеру Блобелю, США. Пресс-релиз, иллюстрированная презентация, презентационная речь