сирогидрохлорин феррохелатаза | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
ЕС нет. | 4.99.1.4 | |||||||
Базы данных | ||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | |||||||
BRENDA | BRENDA запись | |||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | |||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | |||||||
MetaCyc | метаболический путь | |||||||
ПРИАМ | профиль | |||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | |||||||
|
В энзимологии , A sirohydrochlorin феррохелатазы ( ЕС 4.99.1.4 ) представляет собой фермент , который катализирует в химическую реакцию
- сирогидрохлорин + Fe 2+ сирогем + 2H +
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются сирогидрохлорин и Fe2 + , а двумя его продуктами являются сирогем и H + . [1] [2] [3]
Этот фермент принадлежит к семейству лиаз , а именно к «универсальному» классу лиаз, которые не подходят ни к какому другому подклассу. Систематическое название данного фермента класса сирогем ферро-лиазы (sirohydrochlorin образующих). Фермент также известен как SirB и присутствует во всех растениях, а также в бактериях, ассимилирующих / диссимилирующих нитраты и сульфаты. Сирогем является кофактором как ассимиляторных, так и диссимиляторных нитрит- и сульфитредуктаз. Сирогем синтезируется из центральной тетрапиррольной молекулы уропорфириногена III, которая образует первую точку разветвления пути биосинтеза тетрапиррола, а другой ветвью является ветвь гем / хлорофилл. Ветвь сирогема состоит из трех стадий: метилирования, дегидрирования и феррохелирования, причем последняя стадия осуществляется феррохелатазой сирогидрохлорин.
Сирогидрохлоринферрохелатаза является хелатазой класса II, т.е. для ее активности не требуется АТФ, в отличие от хелатаз класса I, таких как Mg-хелатаза . У E. coli все три стадии биосинтеза сирогема выполняются одним многофункциональным ферментом CysG, тогда как у дрожжей Saccharomyces cerevisiae последние две стадии выполняются бифункциональным ферментом Met8p. CysG и Met8p имеют общие складки, но не связаны с SirB и составляют так называемую хелатазу класса III. SirB принадлежит к белку семейства CbiX, а растение SirB составляет половину длины бактериального SirB и совпадает с его N- и C-концевыми половинами, что позволяет предположить, что более длинная форма возникла в результате дупликации гена и слияния более короткой формы.
Сирогидрохлоринферрохелатаза всех наземных растений и некоторых зеленых водорослей, но не бактерий или других водорослей, состоит из кластера железной серы , который может переключаться между формами [2Fe-2S] и [4Fe-4S] в зависимости от окислительно-восстановительного статуса клеточной среды. Хотя точно не определено, какую роль может играть это переключение кластера, предполагается, что оно участвует в критической окислительно-восстановительной регуляции биосинтеза сирогема.
Ссылки [ править ]
- ^ Саха, Кошик; Уэбб, Майкл Э .; Ригби, Стивен Э.Дж.; Пиявка, Хелен К .; Уоррен, Мартин Дж .; Смит, Элисон Г. (2012). «Характеристика эволюционно консервативного железо-серного кластера сирогидрохлорин феррохелатазы из Arabidopsis thaliana». Биохимический журнал . 444 (2): 227–237. DOI : 10.1042 / BJ20111993 . ISSN 0264-6021 . PMID 22414210 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ Уоррен MJ; Raux, E; Бриндли, АА; Пиявка, HK; Уилсон, Канзас; Хилл, CP; Уоррен, MJ (2002). «Структура Met8p Saccharomyces cerevisiae, бифункциональной дегидрогеназы и феррохелатазы» . EMBO J . 21 (9): 2068–75. DOI : 10.1093 / emboj / 21.9.2068 . PMC 125995 . PMID 11980703 .
- ^ Уоррен MJ, Raux E, Schubert HL, Escalante-Semerena JC (2002). «Биосинтез аденозилкобаламина (витамин B12)». Nat. Prod. Rep . 19 (4): 390–412. DOI : 10.1039 / b108967f . PMID 12195810 .