Малая РНК имеет длину <200 нуклеотидов и обычно не является кодирующими молекулами РНК . [1] РНК-молчание часто является функцией этих молекул, причем наиболее распространенным и хорошо изученным примером является РНК-интерференция (РНКи), в которой эндогенно экспрессируемая микроРНК (миРНК) или малая интерферирующая РНК (миРНК) индуцирует деградацию комплементарная информационная РНК . Были идентифицированы другие классы малых РНК, включая piwi-взаимодействующую РНК (piRNA) и ее подвиды, связанные с малой интерферирующей РНК (rasiRNA). [2]Малая РНК «неспособна индуцировать только РНКи, и для выполнения поставленной задачи она должна формировать ядро РНК-белкового комплекса, называемого РНК-индуцированным комплексом сайленсинга (RISC), особенно с белком аргонавта». [3]
Малые РНК были обнаружены или секвенированы с использованием ряда методов, в том числе непосредственно путем секвенирования MicroRNA на нескольких платформах секвенирования [4] [5] [6] или косвенно посредством секвенирования и анализа генома. [7] Идентификация miRNAs была оценена при обнаружении болезней человека, таких как рак груди. [5] Оценка малой РНК полезна для определенных видов исследований, потому что ее молекулы «не нужно фрагментировать перед приготовлением библиотеки». [8]
Виды малых РНК включают:
- микроРНК (миРНК)
- Piwi-взаимодействующая РНК (piRNA)
- малая интерферирующая РНК (миРНК)
- малая ядрышковая РНК (мяРНК)
- малая РНК на основе тРНК (цРНК)
- малая РНК-производная РНК (мрРНК) [9]
- малая ядерная РНК , также обычно называемая U-РНК
Рекомендации
- ^ Storz, G (17 мая 2002). «Расширяющаяся вселенная некодирующих РНК». Наука . 296 (5571): 1260–3. DOI : 10.1126 / science.1072249 . PMID 12016301 .
- ^ Gunawardane LS, Saito K, Nishida KM, Miyoshi K, Kawamura Y, Nagami T., Siomi H, Siomi MC (март 2007 г.). «Опосредованный срезом механизм образования 5'-конца siRNA, связанного с повтором, у дрозофилы». Наука . 315 (5818): 1587–90. DOI : 10.1126 / science.1140494 . PMID 17322028 .
- ^ Роберт А. Мейерс, Эпигенетическая регуляция и эпигеномика (2012), стр. 366.
- ^ Лу, С; Тедж, СС; Луо, S; Haudenschild, CD; Мейерс, Британская Колумбия; Грин, Пи Джей (2 сентября 2005 г.). «Выяснение малой РНК-составляющей транскриптома» . Наука . 309 (5740): 1567–9. DOI : 10.1126 / science.1114112 . PMID 16141074 .
- ^ а б У Цянь; Лу, Зухун; Ли, приветствую; Лу, Цзяфэн; Го, Ли; Гэ, Qinyu (2011). «Секвенирование нового поколения микроРНК для обнаружения рака груди» . Журнал биомедицины и биотехнологии . 2011 : 1–7. DOI : 10.1155 / 2011/597145 . ISSN 1110-7243 . PMC 3118289 . PMID 21716661 .
- ^ Руби, Дж. Грэм; Ян, Кальвин; Игрок, Кристофер; Axtell, Майкл Дж .; Ли, Уильям; Нусбаум, Чад; Ге, Хуэй; Бартель, Дэвид П. (2006). «Крупномасштабное секвенирование выявляет 21U-РНК, дополнительные микроРНК и эндогенные миРНК у C. elegans». Cell . 127 (6): 1193–1207. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.10.040 . ISSN 0092-8674 . PMID 17174894 .
- ^ Виттен, Даниэла; Тибширани, Роберт; Гу, Сэм; Огонь, Андрей; Луи, Вен-Онн (2010). «Сверхвысокопроизводительное секвенирование, основанное на обнаружении малых РНК и дискретном статистическом анализе биомаркеров в коллекции опухолей шейки матки и подобранных контролях» . BMC Biology . 8 (1): 58. DOI : 10.1186 / 1741-7007-8-58 . ISSN 1741-7007 . PMC 2880020 . PMID 20459774 .
- ^ Роберт А. Мейерс, Эпигенетическая регуляция и эпигеномика (2012), стр. 162.
- ^ Wei, H; Чжоу, B; Чжан, Ф; Вт, Й; Ху, Y; Чжан, Б; Чжай, Q (2013). «Профилирование и идентификация малых РНК, полученных из рДНК, и их потенциальных биологических функций» . PLOS One . 8 (2): e56842. DOI : 10.1371 / journal.pone.0056842 . PMC 3572043 . PMID 23418607 .