Икосаэдрический вирус 1 с башней Sulfolobus (ранее известный как икосаэдрический вирус с башней Sulfolobus ) представляет собой разновидность вируса, поражающего архей Sulfolobus solfataricus . [2] [3] [4]
Икосаэдрический вирус 1 с башней Sulfolobus | |
---|---|
Структура 4,5 Å икосаэдрического вируса 1 с турелью Sulfolobus, определенная с помощью криоЭМ. EMDB запись EMD-1569 , PDB запись 3j31 . [1] | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Вариднавирия |
Королевство: | Bamfordvirae |
Тип: | Preplasmiviricota |
Класс: | Tectiliviricetes |
Заказ: | Белфривиралес |
Семья: | Turriviridae |
Род: | Альфатурривирус |
Разновидность: | Икосаэдрический вирус 1 с башней Sulfolobus |
История
Этот вирус был выделен из горячего источника в Кролике Крик тепловой области , которая находится в Midway Гейзер бассейне в Йеллоустонском национальном парке . [5]
Вирусология
Это икосаэдрически симметричный вирус с уникальным триангуляционным числом (T), равным 31. В 12 пятеричных позициях икосаэдра выступают «башни», которые выступают на 13 нанометров (нм) над поверхностью капсида . Башенки имеют средний диаметр 24 нм. В центре каждой турели находится канал длиной ~ 3 нм. Функция этого канала неизвестна, но он может обеспечивать доступ между внутренней и внешней частью вириона. Похоже, что на каждом конце канала есть плотность, указывающая на то, что канал может быть заблокирован, и предполагающая возможную регулирующую роль, связанную с этой плотностью.
Существует пять структурных белков: основной белок 37 килодальтон (кДа) и несколько второстепенных белков с предполагаемой массой 75, 25, 12,5 и 10 кДа. Основной белок капсида преимущественно β-листовой .
Геном представляет собой кольцевую двухцепочечную ДНК длиной 17,663 килобаз с 36 открытыми рамками считывания. В геноме содержание G + C составляет 36%.
В отличие от других вирусов, которые либо лизируют, либо отпочковываются от своих хозяев, этот вирус вызывает уникальную пирамидальную структуру на поверхности хозяина, от которой он отпочковывается.
Рекомендации
- ^ Veesler, D .; Ng, T. -S .; Сендамараи, AK; Эйлерс, Б.Дж.; Лоуренс, CM; Лок, С. -М .; Янг, MJ; Джонсон, Дж. Э .; Фу, С. -Ю. (2013). «Атомная структура икосаэдрического вируса Sulfolobus с экстремофильным размером 75 МДа, определенная методами криоЭМ и рентгеновской кристаллографии» . Труды Национальной академии наук . 110 (14): 5504–5509. DOI : 10.1073 / pnas.1300601110 . PMC 3619359 . PMID 23520050 .
- ^ Предложения ICTV 2013.002a-gB et al. , «Создайте семейство Turriviridae , включающее новый род, Alphaturrivirus , и два новых вида», Марк Янг и др.
- ^ Таксономия вирусов: выпуск 2014 г. , Международный комитет по таксономии вирусов . Доступ на сайте 25 ноября 2015 г.
- ^ Happonen, LJ; Реддер, П; Пэн, X; Рейгстад, LJ; Прангишвили, Д; Мясник, SJ (2010). «Семейные отношения в гипертермо- и ацидофильных архейных вирусах» . Журнал вирусологии . 84 (9): 4747–4754. DOI : 10,1128 / JVI.02156-09 . PMC 2863766 . PMID 20164227 ..
- ^ Райс, Г. (2004). «Структура термофильного вируса архей показывает тип капсида вируса с двухцепочечной ДНК, который охватывает все области жизни» . Труды Национальной академии наук . 101 (20): 7716–7720. DOI : 10.1073 / pnas.0401773101 . PMC 419672 . PMID 15123802 .