Семейство холинов T4 ( TC# 1.E.8 ) представляет собой группу предполагаемых порообразующих белков, которая не принадлежит ни к одному из семи суперсемейств холинов. Т-четные фаги, такие как Т4, используют холин-эндолизиновую систему для лизиса клеток -хозяев . Хотя эндолизин фага Т4, кодируемый геном e (лизоцим E), был идентифицирован в 1961 г., холин (продукт гена t, называемый Т-холином) не был охарактеризован до 2001 г. [1] Репрезентативный список белков, принадлежащих к Семейство холинов T4 можно найти в базе данных Transporter Classification . [2]
Холин Т4 довольно большой, около 218 аминокислотных остатков (а.о.) в длину. Белок очень гидрофильный с 49 кислотными и основными остатками, распределенными по его длине, и единственным предполагаемым трансмембранным сегментом (TMS) вблизи его N-конца , оставляя большую часть белка в периплазме . [3]
Большой периплазматический домен является основной детерминантой временного механизма и участвует в ингибировании лизиса (LIN). [4] LIN включает антихолиновый белок rI Т4 (см. TC# 1.E.8.1.1 ). [5] Ингибирование лизиса является эффективной стратегией для координации времени лизиса с созреванием фаговых частиц и для исключения других фагов. [6] С-концевой периплазматический домен холина Т4 связывается с периплазматическим доменом антихолина Т4 (RI; 97 а.о.), который, как и холин, пересекает мембрану один раз. [3] Т-холин фага Т4 образует комплекс 1:1 с ингибитором RI, который блокирует агрегацию и образование пор. [7]
Т-холин фага Т4 ( лизирующий белок ) идентичен холину фага К3 и почти идентичен холину фага ARI. Остатки 35-96 на 28% идентичны остаткам 436-495 белка захвата K + Lactococcus lactis (gbAAK04721; TC# 2.A.72 ; KUP), что предполагает эволюционную связь между холином и переносчиком. Холины имеют от 1 до 4 TMS и короткий С-концевой домен, богатый основными остатками.
Начиная с этого редактирования , в этой статье используется контент из «1.E.8 The T4 Holin (T4 Holin) Family» , лицензированный таким образом, что разрешается повторное использование в соответствии с лицензией Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , но не в соответствии с ГФДЛ . Необходимо соблюдать все соответствующие условия.