Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Lactococcus Lactis является грамположительные бактерии широко используются в производстве кефира и сыра , [1] , но также стал известен как первый генетически модифицированный организм для использованияживых для лечения заболеваний человека. [2] Клетки L. lactis представляют собой кокки, которые группируются парами и короткими цепочками и, в зависимости от условий роста, выглядят яйцевидными с типичной длиной 0,5–1,5  мкм . L. lactis не образует споры ( неспорообразующие ) и не подвижны ( неподвижны).). У них гомоферментативный метаболизм, то есть они производят молочную кислоту из сахаров. Сообщается также, что они производят эксклюзивную L - (+) - молочную кислоту . [3] Однако [4] сообщается, что D - (-) - молочная кислота может продуцироваться при культивировании при низком pH. Способность производить молочную кислоту - одна из причин, почему L. lactis является одним из самых важных микроорганизмов в молочной промышленности. [5] , основываясь на своей истории в пищевой брожения, Л. Лактис имеет в целом признан безопасным (GRAS) статус, [6] [7] с несколько тематических докладов ему быть оппортунистических патогеном. [8][9] [10]

L. lactis имеет решающее значение для производства молочных продуктов, таких как пахта и сыры. Когда L. lactis ssp. lactis добавляется в молоко, бактерия использует ферменты для производства молекул энергии ( АТФ ) из лактозы . Побочным продуктом производства энергии АТФ является молочная кислота. Молочная кислота, вырабатываемая бактериями, свертывает молоко, которое затем разделяется, образуя творог, который используется для производства сыра. [11] Другие способы применения этой бактерии, о которых сообщалось, включают производство маринованных овощей , пива или вина, некоторых видов хлеба и других ферментированных пищевых продуктов, таких как соевый кефир , пахта и другие.[12] L. lactis - одна из наиболее охарактеризованных грамположительных бактерий с низким ГК, обладающая детальными знаниями в области генетики, метаболизма и биоразнообразия. [13] [14]

L. lactis в основном выделяется либо из молочной среды, либо из растительного материала. [15] [16] [17] Предполагается, что молочные изоляты произошли от растительных изолятов в результате процесса, в котором гены, не приносящие пользы в жирном молоке, были потеряны или подавлены. [14] [18] Этот процесс, также называемый эрозией генома или восстановительной эволюцией, также описан у нескольких других молочнокислых бактерий . [19] [20]Предлагаемый переход от растительной к молочной среде был воспроизведен в лаборатории путем экспериментальной эволюции растительного изолята, который культивировался в молоке в течение длительного периода. В соответствии с результатами сравнительной геномики (см. Ссылки выше) это привело к тому, что L. lactis утратила или подавляла гены, которые необходимы в молоке, и повышала регуляцию транспорта пептидов. [21]

Сотни новых малых РНК были идентифицированы Meulen et al. в геноме L. lactis MG1363 . Один из них: LLnc147, как было показано, участвует в поглощении углерода и метаболизме. [22]

Производство сыра [ править ]

L. lactis subsp. lactis (ранее Streptococcus lactis ) [23] используется на ранних стадиях производства многих сыров, включая бри , камамбер , чеддер , колби , грюйер , пармезан и рокфор . [24] Ассамблея штата Висконсин , который также является штатом номер один в Соединенных Штатах по производству сыра, проголосовала в 2010 году за то, чтобы назвать эту бактерию официальным микробом штата ; это было бы первое и единственное такое определение законодательным собранием штата в стране [25].однако закон не был принят Сенатом. [26] Закон был внесен в ноябре 2009 года в виде Законопроекта № 556 представителей Хебла, Врувинка, Уильямса, Паша, Дану и Филдса; коспонсором выступил сенатор Тейлор. [27] Законопроект был принят Ассамблеей 15 мая 2010 г. и отклонен Сенатом 28 апреля. [27]

Использование L. lactis на молочных фабриках сопряжено с определенными проблемами. Бактериофаги, специфичные для L. lactis, ежегодно вызывают значительные экономические потери, не позволяя бактериям полностью метаболизировать молочный субстрат. [24] Несколько эпидемиологических исследований показали, что фаги, в основном ответственные за эти потери, происходят из видов 936 , c2 и P335 (все из семейства Siphoviridae ). [28]

Лечебные преимущества [ править ]

Возможность использования молочнокислых бактерий (LAB) в качестве функциональных векторов доставки белков широко исследовалась. [29] Lactococcus lactis оказался многообещающим кандидатом для доставки функциональных белков из-за его неинвазивных и непатогенных характеристик. [30] Многие различные системы экспрессии L. lactis были разработаны и используются для экспрессии гетерологичных белков. [31] [32] [33]

Ферментация лактозы В исследовании Шуичи Накамура, Юсуке В. Маримото и Сейши Кудо они стремились доказать, что ферментация, производимая L. lactis, может препятствовать подвижности патогенных бактерий. Подвижность штаммов Pseudomonas , Vibrio и Leptospira также серьезно нарушалась из-за утилизации лактозы L. lactis . [34]

Используя Salmonella flagellar в качестве экспериментальной группы, команда Накамуры обнаружила, что продукт ферментации лактозы является причиной нарушения подвижности сальмонелл . Предполагается, что супернатант L. lactis в основном влияет на подвижность сальмонелл через нарушение вращения жгутиков, но не через необратимое повреждение морфологии и физиологии. Ферментация лактозы L. lactis производит ацетат, который снижает внутриклеточный pH сальмонелл, что, в свою очередь, замедляет вращение их жгутиков. [35] [36] Эти результаты подчеркивают потенциальное использование L. lactis.для предотвращения инфекций, вызываемых несколькими видами бактерий.

Секреция интерлейкина-10 Генетически модифицированная L. lactis может секретировать цитокин интерлейкин-10 (ИЛ-10) для лечения воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК), поскольку ИЛ-10 играет центральную роль в подавлении воспалительных каскадов [37] и матрикса. металлопротеиназы . [38] Исследование Лотара Стейдлера и Вольфганга Ханса [39] показывает, что этот синтез IL-10 in situ с помощью генно-инженерной L. lactis требует гораздо более низких доз, чем системные методы лечения, такие как антитела к фактору некроза опухоли (TNF) или рекомбинация IL- 10.

Авторы предлагают два возможных пути, с помощью которых IL-10 может достичь своей терапевтической мишени. Генно-инженерный L. lactis может продуцировать мышиный IL-10 в просвете , а белок может диффундировать к чувствительным клеткам эпителия или собственной пластинки . Другой маршрут включает в себя Л. Lactis поглощается клетками М из - за его бактериального размера и формы, а также большую часть эффекта может быть связано с рекомбинантной продукции IL-10 на месте в лимфоидной ткани кишечника. Оба пути могут включать механизмы параклеточного транспорта , которые усиливаются при воспалении.. После транспортировки IL-10 может непосредственно подавлять воспаление. В принципе, этот метод может быть полезен для доставки в кишечник других белковых терапевтических средств, которые нестабильны или трудно продуцировать в больших количествах, и является альтернативой системному лечению ВЗК.

Подавление опухоли посредством пептида, ингибирующего метастазирование опухоли, KISS1 В другом исследовании под руководством Чжана Б. был создан штамм L. lactis, который поддерживает плазмиду, содержащую пептид, ингибирующий метастазирование опухоли, известный как KISS1 . [40] L. lactis NZ9000, как было продемонстрировано, является клеточной фабрикой для секреции биологически активного белка KiSS1, оказывающего ингибирующее действие на клетки HT-29 колоректального рака человека.

KiSS1, секретируемый рекомбинантным штаммом L. lactis, эффективно подавлял экспрессию матриксных металлопротеиназ (MMP-9) - решающего ключа в инвазии, метастазировании и регуляции сигнальных путей, контролирующих рост опухолевых клеток , выживание, инвазию, воспаление и ангиогенез . [41] [42] [43] Причина этого в том, что KiSS1, экспрессируемый в L. lactis, активирует путь MAPK через передачу сигналов GPR54, подавляя связывание NFκB с промотором MMP-9 и, таким образом, подавляя экспрессию MMP-9. [44] Это, в свою очередь, снижает выживаемость, тормозит метастазирование.и вызывает покой раковых клеток.

Кроме того, было продемонстрировано, что рост опухоли может подавляться самим штаммом LAB [45] [46] из-за способности LAB продуцировать экзополисахариды. [47] [48] Это исследование показывает, что L. lactisNZ9000 может сам по себе подавлять пролиферацию HT-29 и индуцировать апоптоз клеток. Успешное создание этого штамма помогло подавить миграцию и разрастание раковых клеток, показывая, что секреторные свойства L. lactis этого конкретного пептида могут служить новым инструментом для лечения рака в будущем. [49]

Ссылки [ править ]

  1. Madigan M, Martinko J (редакторы). (2005). Брок Биология микроорганизмов (11-е изд.). Прентис Холл. ISBN 978-0-13-144329-7.
  2. ^ Браат H, Роттиерс P, Hommes DW, Huyghebaert N, Remaut E, Remon JP, van Deventer SJ, Neirynck S, Peppelenbosch MP, Steidler L (2006). «Испытание фазы I с трансгенными бактериями, экспрессирующими интерлейкин-10 при болезни Крона». Клин Гастроэнтерол Гепатол . 4 (6): 754–759. DOI : 10.1016 / j.cgh.2006.03.028 . PMID 16716759 . 
  3. ^ ROISSART, H. и Luquet FM Bactéries lactiques: основы и технологии. Урьяж, Лорика, Франция, 1994, т. 1, стр. 605. ISBN 2-9507477-0-1 
  4. ^ Åkerberg, C .; Hofvendahl, K .; Zacchi, G .; Хан-Ха; Гердал Б. (1998). «Моделирование влияния pH, температуры, концентрации глюкозы и молочной кислоты на кинетику продукции молочной кислоты Lactococcus lactis ssp. Lactis ATCC 19435 в цельнозерновой муке». Прикладная микробиология и биотехнология . 49 (6): 682–690. DOI : 10.1007 / s002530051232 . S2CID 46383610 . CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  5. ^ Integr8 - Результаты поиска видов:
  6. ^ FDA. «История списка GRAS и обзоров SCOGS» . FDA . Проверено 11 мая 2012 года .
  7. ^ Wessels S, Axelsson L, Bech Hansen E, De Vuyst L, Laulund S, Lähteenmäki L, Lindgren S и др. (Ноябрь 2004 г.). «Молочнокислые бактерии, пищевая цепь и их регулирование». Тенденции в пищевой науке и технологиях . 15 (10): 498–505. DOI : 10.1016 / j.tifs.2004.03.003 .
  8. Перейти ↑ Aguirre M, Collins MD (август 1993). «Молочнокислые бактерии и клиническая инфекция человека». J. Appl. Бактериол . 75 (2): 95–107. DOI : 10.1111 / j.1365-2672.1993.tb02753.x . PMID 8407678 . 
  9. ^ Facklam RR, Пиготт NE, Коллинз MD. Идентификация видов Lactococcus из человеческих источников. Материалы XI Международного симпозиума Лансфилда по стрептококкам и стрептококковым заболеваниям, Сиена, Италия. Штутгарт: Густав Фишер Верлаг; 1990: 127
  10. ^ Мэннион PT, Rothburn MM (ноябрь 1990). «Диагностика бактериального эндокардита, вызванного Streptococcus lactis, с помощью иммуноблоттинга сывороточных антител». J. Infect . 21 (3): 317–8. DOI : 10.1016 / 0163-4453 (90) 94149-Т . PMID 2125626 . 
  11. ^ Lactococcus_lactis
  12. ^ Lactococcus lactis использует
  13. ^ Кок - J, G Buist, Зомер А.Л., ван Hijum С.А., Кёйперс ОП (2005). «Сравнительная и функциональная геномика лактококков» . FEMS Microbiology Reviews . 29 (3): 411–33. DOI : 10.1016 / j.femsre.2005.04.004 . PMID 15936843 . 
  14. ^ a b van Hylckama Vlieg JE, Rademaker, JL, Bachmann H, Molenaar D, Kelly WJ, Siezen RJ (2006). «Природное разнообразие и адаптивные реакции Lactococcus lactis ». Текущее мнение в области биотехнологии . 17 (2): 183–90. DOI : 10.1016 / j.copbio.2006.02.007 . PMID 16517150 . 
  15. ^ Келли WJ, Уорд LJ, Лихи SC (2010). «Хромосомное разнообразие Lactococcus lactis и происхождение молочных заквасок» . Геномная биология и эволюция . 2 : 729–44. DOI : 10.1093 / GbE / evq056 . PMC 2962554 . PMID 20847124 .  
  16. ^ Пассерини D, Beltramo С, Coddeville М, Квентин Y, Ritzenthaler Р, Daveran-Менгот М.Л., Мещанин P (2010). «Гены, но не геномы обнаруживают бактериальную одомашнивание Lactococcus Lactis» . PLOS ONE . 5 (12): e15306. Bibcode : 2010PLoSO ... 515306P . DOI : 10.1371 / journal.pone.0015306 . PMC 3003715 . PMID 21179431 .  
  17. ^ Радемейкер JL, Herbet H, Старренбург MJ, Naser SM, Gevers D, Kelly WJ, Hugenholtz J, et al. (2007). «Анализ разнообразия молочных и немолочных изолятов Lactococcus lactis с использованием новой схемы анализа мультилокусных последовательностей и (GTG) 5-PCR fingerprinting» . Прикладная и экологическая микробиология . 73 (22): 7128–37. DOI : 10,1128 / AEM.01017-07 . PMC 2168189 . PMID 17890345 .  
  18. ^ Siezen RJ, Starrenburg МДж, Boekhorst Дж, Renckens В, D Моленаар, ван Hylckama Vlieg JE (2008). «Соответствие генотипа и фенотипа двух изолятов Lactococcus lactis от растений в масштабе генома определяет механизмы адаптации к нише растений» . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (2): 424–36. DOI : 10,1128 / AEM.01850-07 . PMC 2223259 . PMID 18039825 .  
  19. Bolotin A, Quinquis B, Renault P, Sorokin A, Ehrlich SD, Kulakauskas S, Lapidus A и др. (2004). «Полная последовательность и сравнительный анализ генома молочной бактерии Streptococcus thermophilus » . Природа Биотехнологии . 22 (12): 1554–8. DOI : 10.1038 / nbt1034 . PMC 7416660 . PMID 15543133 .  
  20. ^ Ван де Guchte M, S, Пено Гримальди C, Барб V, Bryson K, P Николя, Роберт С. и др. (2006). «Полная последовательность генома Lactobacillus bulgaricus показывает обширную и продолжающуюся редуктивную эволюцию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (24): 9274–9. Bibcode : 2006PNAS..103.9274V . DOI : 10.1073 / pnas.0603024103 . PMC 1482600 . PMID 16754859 .  
  21. ^ Bachmann Н, Starrenburg МДж, Моленаар Д, Kleerebezem М, ван Hylckama Vlieg JE (2012). «Признаки одомашнивания микробов Lactococcus lactis могут быть воспроизведены экспериментальной эволюцией» . Геномные исследования . 22 (1): 115–24. DOI : 10.1101 / gr.121285.111 . PMC 3246198 . PMID 22080491 .  
  22. ^ Meulen, Sjoerd B. van der; Йонг, Энн де; Кок, Ян (2016-03-03). «Транскриптомный ландшафт Lactococcus lactis обнаруживает множество новых РНК, включая небольшую регуляторную РНК, участвующую в поглощении углерода и метаболизме» . Биология РНК . 13 (3): 353–366. DOI : 10.1080 / 15476286.2016.1146855 . ISSN 1547-6286 . PMC 4829306 . PMID 26950529 .   
  23. ^ Шлейфер КН, Краус Дж, Дворжак С, Kilpper-Бальц Р, Коллинз М. Д., Фишер W (1985). «Перенос Streptococcus lactis и родственных стрептококков в род Lactococcus gen. Nov» (PDF) . Систематическая и прикладная микробиология . 6 (2): 183–195. DOI : 10.1016 / S0723-2020 (85) 80052-7 . ISSN 0723-2020 - через Elsevier Science Direct.  
  24. ^ а б Коффи А., Росс Р.П. (2002). «Системы устойчивости к бактериофагам в молочных заквасках: молекулярный анализ к применению». Антони ван Левенгук . 82 (1–4): 303–21. DOI : 10,1023 / A: 1020639717181 . PMID 12369198 . S2CID 7217985 .  
  25. Дэйви, Моника (15 апреля 2010 г.). «А теперь - государственный микроб» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 19 апреля 2010 года .
  26. ^ «Нет государственного микроба для Висконсина» . Национальное общественное радио . Проверено 28 октября 2011 года .
  27. ^ Б «2009 Билл 556 Ассамблея» . docs.legis.wisconsin.gov . Проверено 29 ноября 2017 .
  28. ^ Madera C, Monjardin C, Суарес JE (2004). «Загрязнение молока и устойчивость к условиям обработки определяют судьбу бактериофагов Lactococcus lactis на молочных фермах» . Appl Environ Microbiol . 70 (12): 7365–71. DOI : 10,1128 / AEM.70.12.7365-7371.2004 . PMC 535134 . PMID 15574937 .  
  29. ^ Wyszyńska А, Kobierecka Р, Bardowski Дж, Jagusztyn-Крыницка Е. К. (2015). «Молочнокислые бактерии - 20 лет изучения их потенциала в качестве живых переносчиков для вакцинации слизистых оболочек» . Appl Microbiol Biotechnol . 99 (7): 2967–2977. DOI : 10.1007 / s00253-015-6498-0 . PMC 4365182 . PMID 25750046 .  
  30. ^ Варма Н.Р., Toosa Н, Foo HL, Alitheen Н.Б., Нор Шамсудин М, Арбаб А.С., Yusoff К, Абдул Рахим R (2013). «Отображение вирусных эпитопов на Lactococcus lactis: модель пищевой вакцины против EV71» . Biotechnology Research International . 2013 (11): 4032–4036. DOI : 10.1155 / 2013/431315 . PMC 431315 . PMID 1069289 .  
  31. ^ Mierau I, Kleerebezem M (2005). «10 лет низин-контролируемой системе экспрессии генов (NICE) в Lactococcus lactis». Appl Microbiol Biotechnol . 68 (6): 705–717. DOI : 10.1007 / s00253-005-0107-6 . PMID 16088349 . S2CID 24151938 .  
  32. Перейти ↑ Desmond C, Fitzgerald G, Stanton C, Ross R (2004). «Повышение стрессоустойчивости GroESL-продуцирующего Lactococcus lactis и пробиотика Lactobacillus paracasei NFBC 338» . Appl Environ Microbiol . 70 (10): 5929–5936. DOI : 10,1128 / AEM.70.10.5929-5936.2004 . PMC 522070 . PMID 15466535 .  
  33. ^ Benbouziane В, Ribelles Р, Обри С, Мартин Р, Р Харрат, Riazi А, Ланджелла Р, Бермудез-Humaran LG (2013). «Разработка системы контролируемой экспрессии, индуцируемой стрессом (SICE), в Lactococcus lactis для производства и доставки терапевтических молекул на поверхности слизистых оболочек». J. Biotechnol . 168 (2): 120–129. DOI : 10.1016 / j.jbiotec.2013.04.019 . PMID 23664884 . 
  34. Перейти ↑ Nakamura S, Morimoto YV, Kudo S (2015). «Продукт ферментации лактозы, продуцируемый Lactococcus lactis subsp. Lactis, ацетат, подавляет подвижность жгутиковых патогенных бактерий» . Микробиология . 161 (4): 701–707. DOI : 10.1099 / mic.0.000031 . PMID 25573770 . S2CID 109572 .  
  35. ^ Кихара M, Макнаб RM (1981). «Цитоплазматический pH опосредует таксис pH и таксис бактерий, отпугивающий слабые кислоты» . J Bacteriol . 145 (3): 1209–1221. DOI : 10.1128 / JB.145.3.1209-1221.1981 . PMC 217121 . PMID 7009572 .  
  36. ^ Repaske DR, Адлер J (1981). «Изменение внутриклеточного pH Escherichia coli опосредует хемотаксический ответ на определенные аттрактанты и репелленты» . J Bacteriol . 145 (3): 1196–1208. DOI : 10.1128 / JB.145.3.1196-1208.1981 . PMC 217120 . PMID 7009571 .  
  37. ^ Stordeur P, M Goldman (1998). «Интерлейкин-10 как регуляторный цитокин, индуцированный клеточным стрессом: молекулярные аспекты». Int. Rev. Immunol . 16 (5–6): 501–522. DOI : 10.3109 / 08830189809043006 . PMID 9646174 . 
  38. ^ Pender SL, et al. (1998). «Подавление опосредованного Т-клетками повреждения кишечника человека интерлейкином 10: роль матриксных металлопротеиназ». Гастроэнтерология . 115 (3): 573–583. DOI : 10.1016 / S0016-5085 (98) 70136-2 . PMID 9721154 . 
  39. ^ Steidler L, Hans W, Schotte L, Neirynck S, Obermeier F, Falk W, Fiers W, Remaut E (2000). «Лечение колита мышей с помощью Lactococcus lactis, секретирующего интерлейкин-10». Наука . 289 (5483): 1352–1355. Bibcode : 2000Sci ... 289.1352S . DOI : 10.1126 / science.289.5483.1352 . PMID 10958782 . 
  40. Перейти ↑ Zhang B, Li A, Zuo F, Yu R, Zeng Z, Ma H, Chen S (2016). «Рекомбинантный Lactococcus lactis NZ9000 секретирует биоактивный кисспептин, который ингибирует пролиферацию и миграцию клеток карциномы толстой кишки HT-29» . Фабрики микробных клеток . 15 (1): 102. DOI : 10,1186 / s12934-016-0506-7 . PMC 4901401 . PMID 27287327 .  
  41. ^ Bauvois B (2012). «Новые аспекты матричных металлопротеиназ MMP-2 и MMP-9 как преобразователей клеточной поверхности: передача сигналов извне внутрь и связь с прогрессированием опухоли». Biochim Biophys Acta . 1825 (1): 29–36. DOI : 10.1016 / j.bbcan.2011.10.001 . PMID 22020293 . 
  42. ^ Kessenbrock К, Плакс В, Werb Z (2010). «Матричные металлопротеиназы: регуляторы микросреды опухоли» . Cell . 141 (1): 52–67. DOI : 10.1016 / j.cell.2010.03.015 . PMC 2862057 . PMID 20371345 .  
  43. Перейти ↑ Klein T, Bischoff R (2011). «Физиология и патофизиология матриксных металлопротеиназ» . Аминокислоты . 41 (2): 271–290. DOI : 10.1007 / s00726-010-0689-х . PMC 3102199 . PMID 20640864 .  
  44. ^ Nash KT, Welch DR (2006). «Подавитель метастазов KISS1: механистические идеи и клиническое применение» . Front Biosci . 11 : 647–659. DOI : 10.2741 / 1824 . PMC 1343480 . PMID 16146758 .  
  45. ^ Горбач SL (1990). «Молочнокислые бактерии и здоровье человека». Ann Med . 22 (1): 37–41. DOI : 10.3109 / 07853899009147239 . PMID 2109988 . 
  46. Перейти ↑ Hirayama K, Rafter J (1999). «Роль молочнокислых бактерий в профилактике рака толстой кишки: механистические соображения». Антони ван Левенгук . 76 (1–4): 391–394. DOI : 10.1007 / 978-94-017-2027-4_25 . ISBN 978-90-481-5312-1. PMID  10532395 .
  47. ^ Ruas-Madiedo Р, Hugenholtz Дж, Зун Р (2002). «Обзор функциональных возможностей экзополисахаридов, продуцируемых молочнокислыми бактериями». Int J Dairy . 12 (2–3): 163–171. DOI : 10.1016 / S0958-6946 (01) 00160-1 .
  48. ^ Looijesteijn PJ, Trapet л, де Фриз Е, Abee Т, Hugenholtz J (2001). «Физиологическая функция экзополисахаридов, продуцируемых Lactococcus lactis». Int J Food Microbiol . 64 (1-2): 71–80. DOI : 10.1016 / S0168-1605 (00) 00437-2 . PMID 11252513 . 
  49. ^ Ji К, Е. L, Руге F, Hargest R, Мэйсон MD, Цзян WG (2014). «Влияние гена-супрессора метастазов, Kiss-1 и его рецептора Kiss-1R в колоректальный рак» . BMC Рак . 14 : 723. DOI : 10.1186 / 1471-2407-14-723 . PMC 4190326 . PMID 25260785 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Типовой штамм Lactococcus lactis в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию