• Связывание ДНК • GO: 0070361, GO: 0070364, GO: 0070363, GO: 0070362 Связывание ДНК, специфичное для последовательности митохондриального промотора • Связывание с белками теплового шока • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Связывание с ДНК активность фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Связывание с хроматином • GO: 0000980 Последовательность цис-регуляторной области РНК-полимеразы II -специфическое связывание ДНК • Связывание с белком GO: 0001948 • Связывание коактиватора транскрипции • Связывание, изгибание ДНК • Связывание РНК • последовательное связывание ДНК
Сотовый компонент
• цитозоль • митохондриальный матрикс • митохондрия • митохондриальный нуклеоид • ядро клетки • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс
• ДНК-зависимая репликация ДНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • инициация транскрипции с митохондриального промотора • митохондриальная организация • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • митохондриальный респираторный комплекс сборки цепь • положительное регулирование транскрипции с РНК - полимеразы II промотора • транскрипции от РНК - полимеразы II промотора • транскрипции от промотора митохондриальной
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
7019
21780
Ансамбль
ENSG00000108064
ENSMUSG00000003923
UniProt
Q00059
P40630
RefSeq (мРНК)
NM_001270782 NM_003201 NM_012251
NM_009360
RefSeq (белок)
NP_001257711 NP_003192
NP_033386
Расположение (UCSC)
Chr 10: 58.39 - 58.4 Мб
Chr 10: 71.23 - 71.24 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Митохондриальной фактор транскрипции , сокращенно TFAM или mtTFA , является белком , который в организме человека кодируется TFAM гена . [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 взаимодействия
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
5 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Этот ген кодирует фактор митохондриальной транскрипции, который является ключевым активатором митохондриальной транскрипции, а также участником репликации митохондриального генома. TFAM связывает митохондриальную промоторную ДНК, чтобы способствовать транскрипции митохондриального генома. Исследования на мышах показали, что этот генный продукт необходим для регулирования числа копий митохондриального генома и необходим для эмбрионального развития . Модель на мышах для синдрома Кернса-Сейра была создана, когда экспрессия этого гена была устранена путем целенаправленного разрушения в клетках сердца и мышц. [6]
TFAM представляет собой двойной блок ДНК-связывающий и изгибающий белок с высокой подвижностью . [7] Это изгибающее действие важно для инициации митохондриальной транскрипции у млекопитающих, но не у дрожжей с гомологом Abf2. TFAM может также участвовать в упаковке митохондриального генома, поскольку его связывающая активность неспецифична для последовательности. [8]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что TFAM взаимодействует с TFB1M и [9] TFB2M . [10]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000108064 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003923 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Tiranti В, Росси Е, Руис-Каррильо А, Росси G, Rocchi М, ДиДонато S, Zuffardi О, Zeviani М (июль 1995). «Хромосомная локализация митохондриального фактора транскрипции A (TCF6), одноцепочечного ДНК-связывающего белка (SSBP) и эндонуклеазы G (ENDOG), трех генов домашнего хозяйства человека, участвующих в митохондриальном биогенезе». Геномика . 25 (2): 559–64. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80058-T . PMID 7789991 .
^ a b «Ген Entrez: фактор транскрипции TFAM, митохондрии» .
^ Murugesapillai D, МакКоли MJ, Maher LJ, Williams MC (15 ноября 2016). «Одномолекулярные исследования архитектурных изгибающих белков группы B с высокой подвижностью» . Биофизические обзоры . 9 (1): 17–40. DOI : 10.1007 / s12551-016-0236-4 . PMC 5331113 . PMID 28303166 .
^ Ngo, HB; Кайзер, JT; Чан, округ Колумбия (30 октября 2011 г.). «Фактор транскрипции и упаковки митохондрий Tfam вызывает разворот митохондриальной ДНК» . Структурная и молекулярная биология природы . 18 (11): 1290–6. DOI : 10.1038 / nsmb.2159 . PMC 3210390 . PMID 22037171 .
↑ McCulloch V, Shadel GS (август 2003 г.). «Фактор транскрипции митохондрий человека B1 взаимодействует с С-концевой областью активации h-mtTFA и стимулирует транскрипцию независимо от его активности РНК-метилтрансферазы» . Мол. Клетка. Биол . 23 (16): 5816–24. DOI : 10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003 . PMC 166325 . PMID 12897151 .
^ Хиллен, HS; Морозов Ю.И.; Сарфаллах, А; Темяков, Д; Крамер, П. (16 ноября 2017 г.). «Структурные основы инициации митохондриальной транскрипции» . Cell . 171 (5): 1072–1081.e10. DOI : 10.1016 / j.cell.2017.10.036 . PMC 6590061 . PMID 29149603 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Томинага К., Акияма С., Кагава Ю., Охта С. (1992). «Верхняя область геномного гена фактора транскрипции митохондрий человека 1». Биохим. Биофиз. Acta . 1131 (2): 217–9. DOI : 10.1016 / 0167-4781 (92) 90082-b . PMID 1610904 .
Фишер Р.П., Лисовский Т., Паризи М.А., Клейтон Д.А. (1992). «Обертывание и изгибание ДНК митохондриальным белком-активатором транскрипции, подобным группе высокой подвижности». J. Biol. Chem . 267 (5): 3358–67. PMID 1737790 .
Паризи М.А., Клейтон Д.А. (1991). «Сходство человеческого фактора транскрипции митохондрий 1 с белками группы высокой подвижности». Наука . 252 (5008): 965–9. Bibcode : 1991Sci ... 252..965P . DOI : 10.1126 / science.2035027 . PMID 2035027 .
Томинага К., Хаяси Дж., Кагава Ю., Охта С. (1993). «Меньшая изоформа фактора транскрипции митохондрий человека 1: ее широкое распространение и производство путем альтернативного сплайсинга». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 194 (1): 544–51. DOI : 10.1006 / bbrc.1993.1854 . PMID 8333869 .
Ларссон Н.Г., Олдфорс А., Гарман Д.Д., Барш Г.С., Клейтон Д.А. (1997). «Подавление митохондриального фактора транскрипции А во время сперматогенеза у человека» . Гм. Мол. Genet . 6 (2): 185–91. DOI : 10.1093 / HMG / 6.2.185 . PMID 9063738 .
Lezza AM, Pesce V, Cormio A, Fracasso F, Vecchiet J, Felzani G, Cantatore P, Gadaleta MN (2001). «Повышенная экспрессия митохондриального фактора транскрипции А и ядерного респираторного фактора-1 в скелетных мышцах у пожилых людей». FEBS Lett . 501 (1): 74–8. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (01) 02628-X . PMID 11457459 . S2CID 45160010 .
Такамацу К., Умеда С., Осато Т., Оно Т., Абэ Й., Фукуо А., Шинагава Х., Хамасаки Н., Кан Д. (2002). «Регулирование митохондриальных D-петель с помощью фактора транскрипции А и одноцепочечного ДНК-связывающего белка» . EMBO Rep . 3 (5): 451–6. DOI : 10.1093 / embo-reports / kvf099 . PMC 1084112 . PMID 11964388 .
Фалькенберг М. , Гаспари М., Рантанен А., Трифунович А., Ларссон Н. Г., Густафссон С. М. (2002). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». Nat. Genet . 31 (3): 289–94. DOI : 10.1038 / ng909 . PMID 12068295 . S2CID 11164308 .
Рейес А., Меззина М., Гадалета Г. (2002). «Человеческий митохондриальный фактор транскрипции А (mtTFA): структура гена и характеристика родственных псевдогенов». Джин . 291 (1-2): 223–32. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (02) 00600-5 . PMID 12095695 .
Йошида Й, Идзуми Х, Исэ Т, Урамото Х, Торигоэ Т, Исигучи Х, Мураками Т, Танабэ М, Накаяма Й, Ито Х, Касаи Х, Коно К. (2002). «Фактор транскрипции митохондрий человека А связывается преимущественно с окислительно поврежденной ДНК». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 295 (4): 945–51. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 00757-X . PMID 12127986 .
Гарридо Н., Грипарик Л., Йокитало Е., Вартиоваара Дж., Ван дер Блик А. М., Спелбринк Дж. Н. (2003). «Состав и динамика митохондриальных нуклеоидов человека» . Мол. Биол. Cell . 14 (4): 1583–96. DOI : 10.1091 / mbc.E02-07-0399 . PMC 153124 . PMID 12686611 .
Йошида Й, Идзуми Х, Торигоэ Т, Исигучи Х, Ито Х, Канг Д., Коно К. (2003). «P53 физически взаимодействует с митохондриальным фактором транскрипции А и по-разному регулирует связывание с поврежденной ДНК». Cancer Res . 63 (13): 3729–34. PMID 12839966 .
Маккалок V, Шадель GS (2003). «Фактор транскрипции митохондрий человека B1 взаимодействует с С-концевой областью активации h-mtTFA и стимулирует транскрипцию независимо от его активности РНК-метилтрансферазы» . Мол. Клетка. Биол . 23 (16): 5816–24. DOI : 10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003 . PMC 166325 . PMID 12897151 .
Дешауэр М., Кифер Р., Блейкли Е.Л., Хе Л., Зирц С., Тернбулл Д.М., Тейлор Р.В. (2003). «Новая мутация гена Twinkle при аутосомно-доминантной прогрессирующей внешней офтальмоплегии». Neuromuscul. Disord . 13 (7–8): 568–72. DOI : 10.1016 / S0960-8966 (03) 00071-3 . PMID 12921794 . S2CID 23020569 .
Гюнтер С., фон Хадельн К., Мюллер-Томсен Т., Альберичи А., Бинетти Г., Хок С., Нитч Р. М., Стоппе Г., Рейсс Дж., Гал А., Финк У. (2005). «Возможная ассоциация генотипа митохондриального фактора транскрипции А (TFAM) со спорадической болезнью Альцгеймера». Neurosci. Lett . 369 (3): 219–23. DOI : 10.1016 / j.neulet.2004.07.070 . PMID 15464268 . S2CID 25710306 .
Канки Т., Огаки К., Гаспари М., Густафссон С.М., Фукуо А., Сасаки Н., Хамасаки Н., Кан Д. (2004). «Архитектурная роль митохондриального фактора транскрипции А в поддержании митохондриальной ДНК человека» . Мол. Клетка. Биол . 24 (22): 9823–34. DOI : 10.1128 / MCB.24.22.9823-9834.2004 . PMC 525493 . PMID 15509786 .
Cam H, Balciunaite E, Blais A, Spektor A, Scarpulla RC, Young R, Kluger Y, Dynlacht BD (2004). «Общий набор генных регуляторных сетей связывает метаболизм и торможение роста». Мол. Cell . 16 (3): 399–411. DOI : 10.1016 / j.molcel.2004.09.037 . PMID 15525513 .
Внешние ссылки [ править ]
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q00059 (фактор транскрипции A, митохондрии) в PDBe-KB .
Эта статья о гене на хромосоме 10 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .
