Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TSFM
Белок TSFM PDB 2cp9.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2CP9

Идентификаторы
ПсевдонимыTSFM , EFTS, EFTSMT, фактор элонгации трансляции Ts, митохондриальный
Внешние идентификаторыOMIM: 604723 MGI: 1913649 HomoloGene: 4184 GeneCards: TSFM
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение TSFM
Геномное расположение TSFM
Группа12q14.1Начинать57 782 761 п.н. [1]
Конец57 808 071 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 10 (мышь)
Chr.Хромосома 10 (мышь) [2]
Хромосома 10 (мышь)
Геномное расположение TSFM
Геномное расположение TSFM
Группа10 | 10 D3Начинать127 011 572 п.н. [2]
Конец127 030 840 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TSFM 214332 s в формате fs.png

PBB GE TSFM 212656 в формате fs.png

PBB GE TSFM 214331 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция• активность фактора элонгации трансляции
• связывание РНК
• связывание с белком GO: 0001948
Сотовый компонент• митохондриальный матрикс
• внутриклеточный
• митохондрия
• ядро клетки
Биологический процесс• трансляционная элонгация
• регуляция транскрипции, элонгации по шаблону ДНК
• биосинтез белков
• трансляционная элонгация митохондрий
• регуляция митохондриальной трансляции
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

10102

66399

Ансамбль

ENSG00000123297

ENSMUSG00000040521

UniProt

P43897

Q9CZR8

RefSeq (мРНК)

NM_005726
NM_001172695
NM_001172696
NM_001172697

NM_025537

RefSeq (белок)

NP_001166166
NP_001166167
NP_001166168
NP_005717

NP_079813

Расположение (UCSC)Chr 12: 57,78 - 57,81 МбChr 10: 127.01 - 127.03 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор элонгации Ts, митохондриальная является белком , который в организме человека кодируется TSFM гена . Это гомолог EF-Ts . [5] [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000123297 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040521 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Xin Н, Woriax В, Беркхарт Вт, Spremulli LL (август 1995 г.). «Клонирование и экспрессия митохондриального фактора трансляционного удлинения Ts из бычьей и человеческой печени» . J Biol Chem . 270 (29): 17243–9. DOI : 10.1074 / jbc.270.29.17243 . PMID 7615523 . 
  6. ^ «Ген Entrez: фактор удлинения трансляции TSFM Ts, митохондрии» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Смейтинк Я.А., Эльпелег О., Антоницка Х. и др. (2006). «Отчетливые клинические фенотипы, связанные с мутацией фактора элонгации митохондриальной трансляции EFT» . Являюсь. J. Hum. Genet . 79 (5): 869–77. DOI : 10.1086 / 508434 . PMC  1698578 . PMID  17033963 .
  • Антоника Х., Сасарман Ф., Кеннауэй Н.Г., Шубридж Э.А. (2006). «Молекулярная основа тканевой специфичности дефицита окислительного фосфорилирования у пациентов с мутациями митохондриального фактора трансляции EFG1» . Гм. Мол. Genet . 15 (11): 1835–46. DOI : 10,1093 / HMG / ddl106 . PMID  16632485 .
  • Максимов В.В., Арман И.П., Тарантул В.З. (2006). «[Идентификация белков, взаимодействующих с нейропротекторным пептидом гуманином в дрожжевой двугибридной системе]». Генетика . 42 (2): 274–7. PMID  16583711 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Вернон Дж. Л., Берр П. К., Вили Дж. Э., Фарвелл Массачусетс (2000). «Отнесение гена фактора элонгации трансляции митохондрий (TSFM) к полосам q13 → q14 хромосомы 12 человека путем гибридизации in situ и с гибридами соматических клеток». Cytogenet. Cell Genet . 89 (3–4): 145–6. DOI : 10.1159 / 000015596 . PMID  10965106 . S2CID  201991811 .
  • Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Genome Res . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Бенковски Л.А., Такемото С., Отт Г. и др. (1996). «Взаимодействие факторов элонгации митохондрий Tu.Ts с аминоацил-тРНК». Nucleic Acids Symp. Сер. (33): 163–6. PMID  8643359 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение человеческого гена TSFM в браузере генома UCSC .
  • Подробная информация о генах человека TSFM в браузере генома UCSC .