Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Таксономическая база данных являются базой данных созданы для информации удержания , связанной с биологическими таксонами - например , группы организмов , организованных названием вида или другим таксономическим идентификатором - для эффективного управления данными и поиска информации по мере необходимости. Сегодня таксономические базы данных обычно используются для автоматизированного создания биологических контрольных списков, таких как флоры и фауны , как для печатных публикаций, так и в Интернете; для поддержки работы сетевых систем информации о видах; как часть управления биологической коллекцией (например, в музеях и гербариях)); а также обеспечение, в некоторых случаях, компонента управления таксонами в более широких научных или биологических информационных системах. Они также являются фундаментальным вкладом в дисциплину информатики биоразнообразия .

Цель [ править ]

Целью таксономической базы данных является (или должно быть) точное моделирование представляющих интерес характеристик, относящихся к организмам, которые находятся в пределах предполагаемого охвата и использования системы. Например, базы данных грибов , водорослей , мохообразных и высших растений должны будут кодировать соглашения из Международного кодекса ботанической номенклатуры, в то время как их аналоги для животных и большинства простейших будут кодировать эквивалентные правила из Международного кодекса зоологической номенклатуры ; в обоих случаях моделирование соответствующей таксономической иерархии для любого таксона естественным образом согласуется среляционная модель используется почти во всех системах баз данных. Помимо кодирования идентификаторов организмов (чаще всего сочетание научного названия, автора и - для зоологических таксонов - года первоначальной публикации), таксономическая база данных может часто включать дополнительную таксономическую информацию, такую ​​как синонимы и таксономические мнения, литературные источники или цитаты, плюс ряд биологических атрибутов по желанию для каждого таксона, таких как географическое распространение, экология, описательная информация, угрожаемый или уязвимый статус и т. д.

История [ править ]

Возможно, самое раннее задокументированное управление таксономической информацией в компьютеризированной форме заключалось в системе таксономического кодирования, разработанной Ричардом Шварцем и др. в Институте морских наук о биоте Чесапикского залива Вирджинии и описана в опубликованном отчете в 1972 году. [1] Эта работа прямо или косвенно привела к другим проектам с большим профилем, включая систему Таксономического кодекса NODC [2], которая прошла через 8 версий до прекращения их выпуска в 1996 г., которые должны быть включены и преобразованы в действующую Интегрированную систему таксономической информации.(ЭТО). Ряд других таксономических баз данных, специализирующихся на определенных группах организмов, которые появились в 1970-х годах по настоящее время, совместно участвуют в проекте Species 2000, который с 2001 года сотрудничает с ITIS для создания комбинированного продукта - Каталога жизни . В то время как Каталог жизни в настоящее время сосредоточен на сборе базовой информации о названиях в качестве глобального контрольного списка видов, многочисленные другие проекты таксономических баз данных, такие как Fauna Europaea , Австралийский справочник фауны [3] и другие, предоставляют обширную вспомогательную информацию, включая описания, иллюстрации, карты и более. Многие проекты таксономических баз данных в настоящее время перечислены на сайте TDWG «Мировые информационные проекты по биоразнообразию». [4]

Проблемы [ править ]

Представление таксономической информации в машинно-кодируемой форме вызывает ряд проблем, которые не встречаются в других областях, таких как варианты способов цитирования одного и того же вида или другого названия таксона, одно и то же название, используемое для нескольких таксонов ( омонимов ), несколько устаревших названия одного и того же таксона ( синонимы ), изменения названия и определения концепции таксона с течением времени и многое другое. Одним из форумов, способствующих обсуждению и возможным решениям этих и связанных с ними проблем с 1985 года, является Рабочая группа по таксономическим базам данных .

См. Также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Сварц, RC., Wass ML., Бош DF. (1972). Таксономический код биоты Чесапикского залива. Специального научного отчета нет. 62 Института морских наук Вирджинии (PDF) . Глостер-Пойнт, Вирджиния: Институт морских наук Вирджинии. п. 117.CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  2. ^ "Таксономический код NODC" . Проверено 6 августа 2009 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  3. ^ "Австралийский справочник фауны" . Проверено 6 августа 2009 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  4. ^ База данных мировых информационных проектов по биоразнообразию "TDWG" . Проверено 6 августа 2009 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )

Внешние ссылки [ править ]

  • Веб-сайт TDWG (Рабочая группа по таксономическим базам данных)