Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
THBD
Белок THBD PDB 1adx.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1ADX , 1DQB , 1DX5 , 1EGT , 1FGD , 1FGE , 1HLT , 1TMR , 1ZAQ , 2ADX , 3GIS

Идентификаторы
ПсевдонимыTHBD , AHUS6, BDCA3, CD141, THPH12, THRM, TM, тромбомодулин
Внешние идентификаторыOMIM : 188040 MGI : 98736 HomoloGene : 308 GeneCards : THBD
Расположение гена ( человек )
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человека) [1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное местоположение THBD
Геномное местоположение THBD
Группа20p11.21Начинать23 045 633 п.н. [1]
Конец23 049 672 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное местоположение THBD
Геномное местоположение THBD
Группа2 G3 | 2 73,45 смНачинать148 404 466 п.н. [2]
Конец148 408 188 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание с ионами кальция
• связывание с белком GO: 0001948
• активность трансмембранного сигнального рецептора
• активность сигнального рецептора
Сотовый компонент• составной компонент мембраны
• поверхность клетки
• клеточная мембрана
• составной компонент плазматической мембраны
• мембрана
• апиколатеральная плазматическая мембрана
• вакуолярная мембрана
• внеклеточная
Биологический процесс• гемостаз
• беременность у женщин
• негативная регуляция активации тромбоцитов
• реакция на липополисахарид
• ответ на цАМФ
• негативная регуляция фибринолиза
• свертывание крови
• ответ на рентгеновские лучи
• передача сигнала
• негативная регуляция свертывания крови
• миграция лейкоцитов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7056

21824

Ансамбль

ENSG00000178726

ENSMUSG00000074743

UniProt

P07204

P15306

RefSeq (мРНК)

NM_000361

NM_009378

RefSeq (белок)

NP_000352

NP_033404

Расположение (UCSC)Chr 20: 23.05 - 23.05 МбChr 2: 148,4 - 148,41 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Тромбомодулин ( ТМ ), CD - 141 или BDCA-3 представляет собой интегральный белок мембраны экспрессируется на поверхности эндотелиальных клеток и служат в качестве кофактора для тромбина . Он снижает свертываемость крови , превращая тромбин в антикоагулянтный фермент из прокоагулянтного фермента. [5] Тромбомодулин также экспрессируется на мезотелиальных клетках человека , [6] моноцитах и дендритных клетках .

Генетика и структура [ править ]

В организме человека, тромбомодулин кодируется THBD гена . [7] Этот белок имеет молекулярную массу 74K Да , и состоит из одной цепи с шесть тандемно повторяющихся EGF-подобных доменами , A серина / треонин -богатого спейсер и трансмембранный доменом. [8] Он является членом семейства лектиновых доменов С-типа (CTLD) группы 14. [9]

Функция [ править ]

Тромбомодулин действует как кофактор в индуцированной тромбином активации протеина C в антикоагулянтном пути, образуя стехиометрический комплекс 1: 1 с тромбином. Это увеличивает скорость активации протеина С в тысячу раз. Связанный с тромбомодулином тромбин одновременно оказывает прокоагулянтное действие, ингибируя фибринолиз, расщепляя активируемый тромбином ингибитор фибринолиза (TAFI, также известный как карбоксипептидаза B2) в его активную форму. [ необходима цитата ]

Тромбомодулин - это гликопротеин на поверхности эндотелиальных клеток, который, помимо связывания тромбина, регулирует инактивацию C3b фактором I. Сообщалось также, что мутации в гене тромбомодулина (THBD) связаны с атипичным гемолитико-уремическим синдромом (aHUS). [ необходима цитата ]

Антиген описан как BDCA-3 [10] оказалось , что он идентичен тромбомодулина. [11] Таким образом, было обнаружено, что эта молекула также встречается в очень редкой (0,02%) подгруппе дендритных клеток человека, называемой MDC2. Его функция на эти клетки неизвестна. [ необходима цитата ]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что тромбомодулин взаимодействует с тромбином . [12] [13]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000178726 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074743 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ IPR001491 Тромбомодулин, доступ 19 января 2012 г.
  6. ^ Verhagen HJ, Heijnen-Снайдер GJ, Pronk A, Врум Т.М., ван Vroonhoven TJ, Eikelboom BC, Sixma JJ, де Гроот PG (декабрь 1996). «Активность тромбомодулина на мезотелиальных клетках: перспективы мезотелиальных клеток как альтернативы эндотелиальным клеткам для посева клеток на сосудистые трансплантаты». Британский журнал гематологии . 95 (3): 542–9. DOI : 10.1046 / j.1365-2141.1996.d01-1935.x . PMID 8943899 . S2CID 8417511 .  
  7. ^ Вэнь ДЗ, Dittman WA, Е. Р. Д., Deaven Л.Л., Majerus PW, Sadler JE (июль 1987). «Человеческий тромбомодулин: полная последовательность кДНК и хромосомная локализация гена». Биохимия . 26 (14): 4350–7. DOI : 10.1021 / bi00388a025 . PMID 2822087 . 
  8. ↑ Sadler JE (июль 1997 г.). «Структура и функции тромбомодулина». Тромбоз и гемостаз . 78 (1): 392–5. DOI : 10,1055 / с-0038-1657558 . PMID 9198185 . 
  9. ^ Хан KA, МакМюррей JL, Мохаммед FM, Бикнелл R (2019). «Белки группы 14 лектинового домена С-типа в биологии сосудов, раке и воспалении» . Журнал FEBS . 286 (17): 3299–3332. DOI : 10.1111 / febs.14985 . PMC 6852297 . PMID 31287944 .  CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  10. ^ Dzionek А, Фукс А, Шмидт Р, Кремер S, Zysk М, Miltenyi S, Бак DW, Schmitz J (декабрь 2000). «BDCA-2, BDCA-3 и BDCA-4: три маркера для различных подмножеств дендритных клеток в периферической крови человека» . Журнал иммунологии . 165 (11): 6037–46. DOI : 10.4049 / jimmunol.165.11.6037 . PMID 11086035 . 
  11. ^ Dzionek А, Инагаки У, Окава К, Nagafune Дж, Röck Дж, Sohma Y, Винкельс G, Zysk М, Yamaguchi Y, Schmitz J (декабрь 2002). «Плазмацитоидные дендритные клетки: от специфических поверхностных маркеров до специфических клеточных функций». Иммунология человека . 63 (12): 1133–48. DOI : 10.1016 / S0198-8859 (02) 00752-8 . PMID 12480257 . 
  12. ^ Bajzar л, Morser Дж, Несхейм М (июль 1996). «TAFI, или прокарбоксипептидаза B плазмы, связывает каскады свертывания и фибринолиза через комплекс тромбин-тромбомодулин» . Журнал биологической химии . 271 (28): 16603–8. DOI : 10.1074 / jbc.271.28.16603 . PMID 8663147 . 
  13. ^ Якубовский HV, Owen WG (июль 1989). «Детерминанты макромолекулярной специфичности тромбина для фибриногена и тромбомодулина». Журнал биологической химии . 264 (19): 11117–21. PMID 2544585 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Esmon CT (июль 1995 г.). «Тромбомодулин как модель молекулярных механизмов, которые модулируют специфичность протеазы и функцию на поверхности сосудов». Журнал FASEB . 9 (10): 946–55. DOI : 10.1096 / fasebj.9.10.7615164 . PMID  7615164 . S2CID  19565674 .
  • Олин А.К., Норлунд Л., Марлар Р.А. (июль 1997 г.). «Вариации гена тромбомодулина и тромбоэмболическая болезнь». Тромбоз и гемостаз . 78 (1): 396–400. DOI : 10,1055 / с-0038-1657559 . PMID  9198186 .
  • Ван де Ваувер М., Коллен Д., Конвей Е.М. (август 2004 г.). «Система тромбомодулин-белок C-EPCR: интегрирована для регулирования свертывания и воспаления» . Артериосклероз, тромбоз и биология сосудов . 24 (8): 1374–83. DOI : 10.1161 / 01.ATV.0000134298.25489.92 . PMID  15178554 .
  • Боффа М.С., Джекман Р.В., Пейри Н., Боффа Дж. Ф., Джордж Б. (1991). «Тромбомодулин в центральной нервной системе». Nouvelle Revue Française d'Hématologie . 33 (6): 423–9. PMID  1667949 .
  • Джекман Р.В., Билер Д.Л., Фритц Л., Софф Г., Розенберг Р.Д. (1987). «Ген тромбомодулина человека истощен по интрону: последовательности нуклеиновых кислот кДНК и гена предсказывают структуру белка и предполагают участки регуляторного контроля» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 84 (18): 6425–9. Bibcode : 1987PNAS ... 84.6425J . DOI : 10.1073 / pnas.84.18.6425 . PMC  299089 . PMID  2819876 .
  • Suzuki K, Kusumoto H, Deyashiki Y, Nishioka J, Maruyama I, Zushi M, Kawahara S, Honda G, Yamamoto S, Horiguchi S (июль 1987 г.). «Структура и экспрессия человеческого тромбомодулина, рецептора тромбина на эндотелии, действующего как кофактор для активации протеина С» . Журнал EMBO . 6 (7): 1891–187. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1987.tb02448.x . PMC  553573 . PMID  2820710 .
  • Вен Д. З., Диттман В. А., Йе Р. Д., Девен Л. Л., Майерус П. В., Сэдлер Д. Е. (июль 1987 г.). «Человеческий тромбомодулин: полная последовательность кДНК и хромосомная локализация гена». Биохимия . 26 (14): 4350–7. DOI : 10.1021 / bi00388a025 . PMID  2822087 .
  • Шираи Т., Сиодзири С., Ито Х., Ямамото С., Кусумото Х., Деяшики Ю., Маруяма И., Сузуки К. (февраль 1988 г.). «Генная структура тромбомодулина человека, кофактора для активации протеина С, катализируемой тромбином». Журнал биохимии . 103 (2): 281–5. CiteSeerX  10.1.1.1006.6759 . DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a122261 . PMID  2836377 .
  • Ёнэдзава С., Маруяма И., Танака С., Накамура Т., Сато Э. (август 1988 г.). «Иммуногистохимическая локализация тромбомодулина при хорионических заболеваниях матки и хориокарциноме желудка. Сравнительное исследование с распределением хорионического гонадотропина человека» . Рак . 62 (3): 569–76. DOI : 10.1002 / 1097-0142 (19880801) 62: 3 <569 :: АИД-CNCR2820620322> 3.0.CO; 2-Т . PMID  2839283 .
  • Исии H, Majerus PW (декабрь 1985 г.). «Тромбомодулин присутствует в плазме и моче человека» . Журнал клинических исследований . 76 (6): 2178–81. DOI : 10.1172 / JCI112225 . PMC  424339 . PMID  3001144 .
  • Адлер М., Сето М.Х., Нитеки Д.Е., Лин Дж. Х., Лайт Д. Р., Морсер Дж. (Октябрь 1995 г.). «Структура фрагмента из 19 остатков С-петли четвертого эпидермального фактора роста-подобного домена тромбомодулина» . Журнал биологической химии . 270 (40): 23366–72. DOI : 10.1074 / jbc.270.40.23366 . PMID  7559494 .
  • Олин А.К., Марлар Р.А. (январь 1995 г.). «Первая мутация, выявленная в гене тромбомодулина у 45-летнего мужчины с тромбоэмболической болезнью» . Кровь . 85 (2): 330–6. DOI : 10.1182 / blood.V85.2.330.330 . PMID  7811989 .
  • Сринивасан Дж., Ху С., Грабал Р., Чжу Й., Комивес Е.А., Ни Ф (ноябрь 1994 г.). «Связанная с тромбином структура субдомена EGF из человеческого тромбомодулина, определяемая перенесенными ядерными эффектами Оверхаузера». Биохимия . 33 (46): 13553–60. DOI : 10.1021 / bi00250a007 . PMID  7947766 .
  • Герлитц Б., Хасселл Т., Влахос С.Дж., Паркинсон Дж.Ф., Банг Нью-Йорк, Гриннелл Б.В. (октябрь 1993 г.). «Идентификация преобладающего сайта связывания гликозаминогликанов в растворимом рекомбинантном человеческом тромбомодулине: потенциальное регулирование функциональности за счет конкуренции гликозилтрансферазы за серин474» . Биохимический журнал . 295 (1): 131–40. DOI : 10.1042 / bj2950131 . PMC  1134829 . PMID  8216207 .
  • Ясуда К., Эспиноза Р., Дэвис Э.М., Ле Бо М.М., Белл Г.И. (сентябрь 1993 г.). «Гены рецепторов соматостатина человека: локализация SSTR5 в хромосоме 20p11.2 человека». Геномика . 17 (3): 785–6. DOI : 10.1006 / geno.1993.1410 . PMID  8244401 .
  • Ямамото С., Мидзогути Т., Тамаки Т., Окути М., Кимура С., Аоки Н. (апрель 1993 г.). «Тромбомодулин в моче, его выделение и характеристика» . Журнал биохимии . 113 (4): 433–40. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124063 . PMID  8390446 .
  • Майнингер Д.П., Хантер М.Дж., Комивес Е.А. (сентябрь 1995 г.). «Синтез, активность и предварительная структура четвертого EGF-подобного домена тромбомодулина» . Белковая наука . 4 (9): 1683–95. DOI : 10.1002 / pro.5560040904 . PMC  2143218 . PMID  8528067 .
  • Маглотт Д.Р., Фельдблюм Т.В., Дуркин А.С., Нирман В.К. (май 1996 г.). «Радиационное гибридное картирование SNAP, PCSK2 и THBD (хромосома человека 20p)». Геном млекопитающих . 7 (5): 400–1. DOI : 10.1007 / s003359900120 . PMID  8661740 . S2CID  34951074 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись об атипичном гемолитико-уремическом синдроме
  • Записи OMIM об атипичном гемолитико-уремическом синдроме