Тканевые микроматрицы (также ТМА ) состоят из парафиновых блоков, в которых до 1000 [1] отдельных ядер ткани собраны в виде массива, что позволяет проводить мультиплексный гистологический анализ .
История
Основные ограничения молекулярно- клинического анализа тканей включают громоздкость процедур, ограниченную доступность диагностических реагентов и ограниченный размер выборки пациентов. Для решения этих проблем была разработана технология тканевого микрочипа.
Мульти-тканевые блоки были впервые представлены Х. Баттифора в 1986 году с его так называемым «многоопухолевым (колбасным) тканевым блоком» и модифицированы в 1990 году его усовершенствованием, «клетчатым тканевым блоком». В 1998 году Дж. Кононен с сотрудниками разработали современная техника, в которой используется новый подход к отбору проб для получения тканей правильного размера и формы, которые можно расположить более плотно и точно.
Процедура
В методе тканевого микрочипа полая игла используется для удаления сердцевин ткани диаметром всего 0,6 мм из представляющих интерес областей в залитых парафином тканях, таких как клинические биопсии или образцы опухоли . Эти сердечники ткани затем вставляются в парафиновый блок реципиента в виде массива с точными интервалами. Срезы из этого блока вырезают с помощью микротома , устанавливают на предметное стекло микроскопа и затем анализируют любым методом стандартного гистологического анализа. Каждый блок микрочипа можно разрезать на 100-500 секций, которые могут быть подвергнуты независимым испытаниям. Тесты, обычно используемые в тканевых микроматрицах, включают иммуногистохимию и флуоресцентную гибридизацию in situ . Тканевые микроматрицы особенно полезны при анализе образцов рака .
Один из вариантов - это массив замороженных тканей .
Использование в исследованиях
Использование тканевых микрочипов в сочетании с иммуногистохимией было предпочтительным методом для изучения и проверки биомаркеров рака в различных определенных когортах больных раком . Возможность собрать большое количество репрезентативных образцов рака из определенной когорты пациентов, которая также имеет соответствующую клиническую базу данных, обеспечивает мощный ресурс для изучения того, как различные паттерны экспрессии белка коррелируют с различными клиническими параметрами. Поскольку образцы пациентов собраны в один блок, срезы можно окрашивать по одному и тому же протоколу, чтобы избежать экспериментальной вариативности и технических артефактов. Когорты пациентов с клиническим раком и соответствующие наборы тканевых микрочипов использовались для изучения диагностических, прогностических и лечебных биомаркеров рака при большинстве форм рака, включая рак легких, молочной железы, колоректального и почечно-клеточного рака. [2] [3] [4] [5]
Иммуногистохимия в сочетании с тканевыми микрочипами также успешно использовалась в крупномасштабных усилиях по созданию карты экспрессии белков в более глобальном масштабе. [6]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ "Средство микрочипа основной ткани Йельского университета" . Архивировано из оригинального 10 мая 2009 года.
- ^ Гремель, Габриэла; Бергман, Юлия; Джуреинович, Дияна; Эдквист, Пер-Хенрик; Майндад, Викас; Bharambe, Bhavana M; Хан, Васиф Али З.А.; Навани, Санджай; Элебро, Джейкоб (01.01.2014). «Систематический анализ обычно используемых антител в диагностике рака». Гистопатология . 64 (2): 293–305. DOI : 10.1111 / his.12255 . ISSN 1365-2559 . PMID 24330150 .
- ^ Кэмп, Роберт Л .; Neumeister, Veronique; Римм, Дэвид Л. (2008-12-01). «Десятилетие тканевых микрочипов: прогресс в открытии и подтверждении биомаркеров рака». Журнал клинической онкологии . 26 (34): 5630–5637. DOI : 10.1200 / jco.2008.17.3567 . ISSN 0732-183X . PMID 18936473 .
- ^ Фредхольм, Ханна; Магнуссон, Кристина; Lindström, Linda S .; Гармо, Ганс; Фелт, Соня Икер; Линдман, Хенрик; Берг, Джонас; Холмберг, Ларс; Понтен, Фредрик (1 ноября 2016 г.). «Долгосрочные результаты у молодых женщин с раком груди: популяционное исследование» . Исследование и лечение рака груди . 160 (1): 131–143. DOI : 10.1007 / s10549-016-3983-9 . ISSN 0167-6806 . PMC 5050247 . PMID 27624330 .
- ^ Гремель, Габриэла; Джуреинович, Дияна; Ниинивирта, Марджут; Лэрд, Александр; Юнгквист, Оскар; Йоханнессон, Хенрик; Бергман, Юлия; Эдквист, Пер-Хенрик; Навани, Санджай (04.01.2017). «Стратегия систематического поиска определяет кубилин как независимый прогностический маркер почечно-клеточного рака» . BMC Рак . 17 (1): 9. DOI : 10,1186 / s12885-016-3030-6 . ISSN 1471-2407 . PMC 5215231 . PMID 28052770 .
- ^ Кампф, Кэролайн; Olsson, IngMarie; Риберг, Урбан; Шёстедт, Эвелина; Понтен, Фредрик (31 мая 2012 г.). «Производство тканевых микрочипов, иммуногистохимическое окрашивание и цифровизация в Атласе белков человека» . Журнал визуализированных экспериментов (63): e3620. DOI : 10.3791 / 3620 . ISSN 1940-087X . PMC 3468196 . PMID 22688270 .
- Battifora H: Многопухолевый (колбасный) тканевый блок: новый метод иммуногистохимического тестирования на антитела. Lab Invest 1986, 55: 244-248.
- Баттифора Х., Мехта П.: тканевый блок в шахматном порядке. Улучшенный многотканевый блок управления. Lab Invest 1990, 63: 722-724.
- Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Тканевые микроматрицы для высокопроизводительного молекулярного профилирования образцов опухолей. Нат Мед 1998, 4: 844-847.
Внешние ссылки
- СМИ, связанные с микрочипом тканей на Викискладе?
- Программа исследования тканевого массива Национального института рака