Тобамовирус | |
---|---|
Диаграмма вируса табачной мозаики (TMV) и электронная микрофотография вирионов | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Kitrinoviricota |
Класс: | Alsuviricetes |
Заказ: | Мартелливиралес |
Семья: | Virgaviridae |
Род: | Тобамовирус |
Типовой вид | |
Вирус табачной мозаики |
Тобамовирус - это род вирусов с положительной цепью РНК семейства Virgaviridae . [2] Многие растения, в том числе табак , картофель , помидоры и кабачки , служат естественными хозяевами. Заболевания, связанные с этим родом, включают: некротические поражения на листьях. [2] [3] Название Tobamovirus происходит от хозяина и симптомов первого обнаруженного вируса ( вирус табачной мозаики ). [4]
Есть четыре неофициальных подгрупп в пределах рода: это tobamoviruses , которые заражают крестоцветные , тыквенные , мальвовую и пасленовые растения. Основными различиями между этими группами являются последовательности генома и соответствующий диапазон растений-хозяев. [ необходима цитата ] В настоящее время существует 37 видов этого рода, включая типовой вид вируса табачной мозаики . [5]
Структура [ править ]
Тобамовирусы не имеют оболочки, имеют спиральную геометрию стержня и спиральную симметрию. Диаметр составляет около 18 нм, длина - 300–310 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 6,3–6,5 килобайт. [2] [3]
Геном [ править ]
Геном РНК кодирует по крайней мере четыре полипептида : [2] это неструктурный белок и продукт считывания, которые участвуют в репликации вируса (РНК-зависимая РНК-полимераза, RdRp); белок движения (МП) , который необходим для вируса для перемещения между клетками и белком оболочки (СР). Считываемая часть RdRp может быть экспрессирована в TMV как отдельный белок. [6] Вирус способен размножаться без движения или белков оболочки, но два других важны. Неструктурный белок имеет домены, предполагающие, что он участвует в кэппировании РНК, а продукт считывания имеет мотив РНК-полимеразы. Белки движения образуются на очень ранних этапах цикла инфекции и локализуются в плазмодесматах , они, вероятно, участвуют в специфичности хозяина, поскольку, как полагают, взаимодействуют с некоторыми факторами клетки-хозяина. [ необходима цитата ]
Жизненный цикл [ править ]
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается путем проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Перевод происходит путем подавления прекращения. Вирус покидает клетку-хозяина за счет одностороннего вирусного движения, не управляемого канальцами. Растения служат естественным хозяином. Пути передачи механические. [2] [3]
Пути заражения [ править ]
Инфекция изначально локализована, но если вирус не будет поражен, он будет распространяться через сосудистую систему в системную инфекцию. Точный механизм вирус использует для перемещения по всему растению, неизвестно , но взаимодействие пектина methylesterase , клеточный фермент важен для клеточной стенки обмена веществ и развития растений, с белком движения было вовлечен. [7]
Эволюция [ править ]
Считается, что эти вирусы произошли от общего предка со своими хозяевами. [8] Существует по крайней мере 3 отдельные клады тобамовирусов, которые до некоторой степени соответствуют диапазону хозяев: то есть есть один вид, заражающий пасленовые ; второй - тыквенные и бобовые, а третий - крестоцветные. [9]
Классификация [ править ]
Виды [ править ]
- Вирус мозаики болгарского перца (BPeMV)
- Вирус легкой крапчатости бругмансии
- Вирус легкой крапчатости кактуса (CMMoV) [10]
- Вирус желтой крапинки клитории
- Вирус крапчатой мозаики плодов огурца
- Вирус зеленой крапчатой мозаики огурца (CGMMV)
- Вирус крапчатости огурца
- Вирус мозаики франжипани (FrMV)
- Скрытый вирус гибискуса Форт-Пирса (HLFPV)
- Латентный сингапурский вирус гибискуса (HLSV)
- Кюри вирус зеленой крапчатой мозаики
- Вирус мозаики маракуйя (MarMV)
- Вирус перца Обуда (ObPV)
- Вирус кольцевой пятнистости Odontoglossum (ORSV)
- Вирус хлоротичной кольцевой пятнистости опунции
- Вирус мелкой крапчатости паприки
- Вирус мозаики маракуйи
- Вирус легкой крапчатости перца (PMMoV)
- Вирус мозаики плюмерии
- Вирус, ассоциированный с некрозом кактусов Rattail (RCNaV)
- Вирус мозаики Рехманнии
- Вирус мозаики рибграсс (ВСР)
- Вирус опунции Саммона (SOV)
- Вирус ломки цветков Streptocarpus
- Вирус мозаики солнечной и конопли (SHMV)
- Латентный вирус табака
- Вирус табачной мягкой зеленой мозаики
- Вирус коричневой морщинистости помидоров (ToBRFV)
- Вирус мозаики томатов (ToMV)
- Вирус табачной мозаики (T2MV) - тип Виды
- Вирус крапчатой мозаики томатов
- Вирус тропической содовой мозаики яблони
- Вирус очищения вен репы (TVCV)
- Вирус легкой крапчатости Ullucus
- Вирус крапчатости васаби (WMoV)
- Вирус легкой крапчатости желтого хвостового цветка
- Вирус мозаики Youcai (YoMV), он же вирус мозаики масличного рапса (ORMV)
- Вирус зеленой крапчатой мозаики кабачков [11]
Предлагаемые члены [ править ]
Предлагаемые, но в настоящее время нераспознанные представители этого рода включают: [11]
- Вирус Chara corallina (CCV)
- Вирус мозаики Nicotiana velutina (NVMV)
Ссылки [ править ]
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2018b» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2019 . Проверено 18 марта 2019 .
- ^ a b c d e "Интернет-отчет ICTV Virgaviridae" .
- ^ a b c «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .
- ^ https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/Ratification_1975.pdf
- ^ ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Проверено 15 июня 2015 года .
- ^ Creager А.Н., Scholthof KB, Citovsky V, Scholthof HB (март 1999). «Вирус табачной мозаики. Новаторские исследования за столетие» . Растительная клетка . 11 (3): 301–8. DOI : 10.1105 / tpc.11.3.301 . PMC 1464663 . PMID 10072391 .
- ^ Chen MH, Citovsky V (август 2003). «Системное перемещение тобамовируса требует пектинметилэстеразы клетки-хозяина». Заводской журнал . 35 (3): 386–92. DOI : 10.1046 / j.1365-313X.2003.01818.x . PMID 12887589 .
- ^ Stobbe AH, Мелчер U, Palmer МВт, Roossinck MJ, Шен G (февраль 2012). «Ко-дивергенция и переключение хозяев в эволюции тобамовирусов» . Журнал общей вирусологии . 93 (Pt 2): 408–18. DOI : 10.1099 / vir.0.034280-0 . PMID 22049092 .
- ^ Lartey RT, Восс TC, Мелчер U (декабрь 1996). «Эволюция тобамовируса: перекрытия генов, рекомбинация и таксономические последствия» (PDF) . Молекулярная биология и эволюция . 13 (10): 1327–38. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025579 . PMID 8952077 .
- ↑ Мин Би, Чунг Б. Н., Ким М. Дж., Ха Дж. Х., Ли Б., Рю К. Х. (январь 2006 г.). «Вирус легкой крапчатости кактусов - новый тобамовирус, поражающий кактусы». Архив вирусологии . 151 (1): 13–21. DOI : 10.1007 / s00705-005-0617-7 . PMID 16132178 . S2CID 40760030 .
- ^ a b "Описание вирусов растений: группа тобамовирусов" . Ассоциация прикладных биологов (AAB).
Дальнейшее чтение [ править ]
- Хагивара Ю., Комода К., Яманака Т., Тамай А., Меши Т., Фунада Р., Цутия Т., Наито С., Исикава М. (январь 2003 г.). «Субклеточная локализация белков-хозяев и вирусных белков, связанных с репликацией тобамовирусной РНК» . Журнал EMBO . 22 (2): 344–53. DOI : 10,1093 / emboj / cdg033 . PMC 140108 . PMID 12514140 .
Внешние ссылки [ править ]
Викискладе есть медиафайлы по теме тобамовируса . |
Wikispecies содержит информацию о тобамовирусе . |
- ICTV Online (10-е) Репот: Virgaviridae
- Viralzone: Tobamovirus