Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Тобамовирус - это род вирусов с положительной цепью РНК семейства Virgaviridae . [2] Многие растения, в том числе табак , картофель , помидоры и кабачки , служат естественными хозяевами. Заболевания, связанные с этим родом, включают: некротические поражения на листьях. [2] [3] Название Tobamovirus происходит от хозяина и симптомов первого обнаруженного вируса ( вирус табачной мозаики ). [4]

Есть четыре неофициальных подгрупп в пределах рода: это tobamoviruses , которые заражают крестоцветные , тыквенные , мальвовую и пасленовые растения. Основными различиями между этими группами являются последовательности генома и соответствующий диапазон растений-хозяев. [ необходима цитата ] В настоящее время существует 37 видов этого рода, включая типовой вид вируса табачной мозаики . [5]

Структура [ править ]

Тобамовирусы не имеют оболочки, имеют спиральную геометрию стержня и спиральную симметрию. Диаметр составляет около 18 нм, длина - 300–310 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 6,3–6,5 килобайт. [2] [3]

Геном [ править ]

Геном РНК кодирует по крайней мере четыре полипептида : [2] это неструктурный белок и продукт считывания, которые участвуют в репликации вируса (РНК-зависимая РНК-полимераза, RdRp); белок движения (МП) , который необходим для вируса для перемещения между клетками и белком оболочки (СР). Считываемая часть RdRp может быть экспрессирована в TMV как отдельный белок. [6] Вирус способен размножаться без движения или белков оболочки, но два других важны. Неструктурный белок имеет домены, предполагающие, что он участвует в кэппировании РНК, а продукт считывания имеет мотив РНК-полимеразы. Белки движения образуются на очень ранних этапах цикла инфекции и локализуются в плазмодесматах , они, вероятно, участвуют в специфичности хозяина, поскольку, как полагают, взаимодействуют с некоторыми факторами клетки-хозяина. [ необходима цитата ]

Жизненный цикл [ править ]

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается путем проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Перевод происходит путем подавления прекращения. Вирус покидает клетку-хозяина за счет одностороннего вирусного движения, не управляемого канальцами. Растения служат естественным хозяином. Пути передачи механические. [2] [3]

Пути заражения [ править ]

Инфекция изначально локализована, но если вирус не будет поражен, он будет распространяться через сосудистую систему в системную инфекцию. Точный механизм вирус использует для перемещения по всему растению, неизвестно , но взаимодействие пектина methylesterase , клеточный фермент важен для клеточной стенки обмена веществ и развития растений, с белком движения было вовлечен. [7]

Эволюция [ править ]

Считается, что эти вирусы произошли от общего предка со своими хозяевами. [8] Существует по крайней мере 3 отдельные клады тобамовирусов, которые до некоторой степени соответствуют диапазону хозяев: то есть есть один вид, заражающий пасленовые ; второй - тыквенные и бобовые, а третий - крестоцветные. [9]

Классификация [ править ]

Виды [ править ]

Филогенетическое дерево тобамовируса
  • Вирус мозаики болгарского перца (BPeMV)
  • Вирус легкой крапчатости бругмансии
  • Вирус легкой крапчатости кактуса (CMMoV) [10]
  • Вирус желтой крапинки клитории
  • Вирус крапчатой ​​мозаики плодов огурца
  • Вирус зеленой крапчатой ​​мозаики огурца (CGMMV)
  • Вирус крапчатости огурца
  • Вирус мозаики франжипани (FrMV)
  • Скрытый вирус гибискуса Форт-Пирса (HLFPV)
  • Латентный сингапурский вирус гибискуса (HLSV)
  • Кюри вирус зеленой крапчатой ​​мозаики
  • Вирус мозаики маракуйя (MarMV)
  • Вирус перца Обуда (ObPV)
  • Вирус кольцевой пятнистости Odontoglossum (ORSV)
  • Вирус хлоротичной кольцевой пятнистости опунции
  • Вирус мелкой крапчатости паприки
  • Вирус мозаики маракуйи
  • Вирус легкой крапчатости перца (PMMoV)
  • Вирус мозаики плюмерии
  • Вирус, ассоциированный с некрозом кактусов Rattail (RCNaV)
  • Вирус мозаики Рехманнии
  • Вирус мозаики рибграсс (ВСР)
  • Вирус опунции Саммона (SOV)
  • Вирус ломки цветков Streptocarpus
  • Вирус мозаики солнечной и конопли (SHMV)
  • Латентный вирус табака
  • Вирус табачной мягкой зеленой мозаики
  • Вирус коричневой морщинистости помидоров (ToBRFV)
  • Вирус мозаики томатов (ToMV)
  • Вирус табачной мозаики (T2MV) - тип Виды
  • Вирус крапчатой ​​мозаики томатов
  • Вирус тропической содовой мозаики яблони
  • Вирус очищения вен репы (TVCV)
  • Вирус легкой крапчатости Ullucus
  • Вирус крапчатости васаби (WMoV)
  • Вирус легкой крапчатости желтого хвостового цветка
  • Вирус мозаики Youcai (YoMV), он же вирус мозаики масличного рапса (ORMV)
  • Вирус зеленой крапчатой ​​мозаики кабачков [11]

Предлагаемые члены [ править ]

Предлагаемые, но в настоящее время нераспознанные представители этого рода включают: [11]

  • Вирус Chara corallina (CCV)
  • Вирус мозаики Nicotiana velutina (NVMV)

Ссылки [ править ]

  1. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2018b» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2019 . Проверено 18 марта 2019 .
  2. ^ a b c d e "Интернет-отчет ICTV Virgaviridae" .
  3. ^ a b c «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .
  4. ^ https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/Ratification_1975.pdf
  5. ^ ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Проверено 15 июня 2015 года .
  6. ^ Creager А.Н., Scholthof KB, Citovsky V, Scholthof HB (март 1999). «Вирус табачной мозаики. Новаторские исследования за столетие» . Растительная клетка . 11 (3): 301–8. DOI : 10.1105 / tpc.11.3.301 . PMC 1464663 . PMID 10072391 .  
  7. ^ Chen MH, Citovsky V (август 2003). «Системное перемещение тобамовируса требует пектинметилэстеразы клетки-хозяина». Заводской журнал . 35 (3): 386–92. DOI : 10.1046 / j.1365-313X.2003.01818.x . PMID 12887589 . 
  8. ^ Stobbe AH, Мелчер U, Palmer МВт, Roossinck MJ, Шен G (февраль 2012). «Ко-дивергенция и переключение хозяев в эволюции тобамовирусов» . Журнал общей вирусологии . 93 (Pt 2): 408–18. DOI : 10.1099 / vir.0.034280-0 . PMID 22049092 . 
  9. ^ Lartey RT, Восс TC, Мелчер U (декабрь 1996). «Эволюция тобамовируса: перекрытия генов, рекомбинация и таксономические последствия» (PDF) . Молекулярная биология и эволюция . 13 (10): 1327–38. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025579 . PMID 8952077 .  
  10. Мин Би, Чунг Б. Н., Ким М. Дж., Ха Дж. Х., Ли Б., Рю К. Х. (январь 2006 г.). «Вирус легкой крапчатости кактусов - новый тобамовирус, поражающий кактусы». Архив вирусологии . 151 (1): 13–21. DOI : 10.1007 / s00705-005-0617-7 . PMID 16132178 . S2CID 40760030 .  
  11. ^ a b "Описание вирусов растений: группа тобамовирусов" . Ассоциация прикладных биологов (AAB).

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хагивара Ю., Комода К., Яманака Т., Тамай А., Меши Т., Фунада Р., Цутия Т., Наито С., Исикава М. (январь 2003 г.). «Субклеточная локализация белков-хозяев и вирусных белков, связанных с репликацией тобамовирусной РНК» . Журнал EMBO . 22 (2): 344–53. DOI : 10,1093 / emboj / cdg033 . PMC  140108 . PMID  12514140 .

Внешние ссылки [ править ]

  • ICTV Online (10-е) Репот: Virgaviridae
  • Viralzone: Tobamovirus