В молекулярной биологии убиквитин-взаимодействующий мотив ( UIM ) или « LALAL-мотив » представляет собой мотив последовательности из примерно 20 аминокислотных остатков, который впервые был описан в 26S протеасомной субъединице PSD4 / RPN-10, которая, как известно, распознает убиквитин. [1] [2] Кроме того, UIM обнаруживается, часто в тандемных или триплетных массивах, во множестве белков, которые либо участвуют в убиквитинировании и метаболизме убиквитина, либо, как известно, взаимодействуют с убиквитин-подобными модификаторами. Среди белков UIMпредставляют собой две разные подгруппы семейства деубиквитинирующих ферментов UBP (убиквитинкарбоксиконцевую гидролазу), один белок F-бокса, одно семейство HECT-содержащих убиквитин-лигаз (E3s) растений и несколько белков, содержащих убиквитин-ассоциированные UBA и / или домены UBX . [3] В большинстве этих белков UIM встречается в нескольких копиях и в ассоциации с другими доменами, такими как UBA ( INTERPRO ), UBX ( INTERPRO ), домен ENTH , EH ( INTERPRO ), VHS ( INTERPRO ), домен SH3 , HECT. , VWFA ( INTERPRO ), EF-связывающий кальций, WD-40 , F-бокс ( INTERPRO ), LIM , протеинкиназа , анкирин , PX , фосфатидилинозитол- 3- и 4-киназы ( INTERPRO ), домен C2 , OTU ( INTERPRO ), Домен DnaJ ( INTERPRO ), RING-finger ( INTERPRO ) или FYVE-finger ( INTERPRO ). Было показано, что UIM связывают убиквитин и служат в качестве специфического сигнала нацеливания, важного для моноубиквитинирования. Таким образом, UIM могут выполнять несколько функций в метаболизме убиквитина, каждая из которых может требовать разного количества UIM. [4] [5] [6]
UIM | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | UIM | |||||||
Pfam | PF02809 | |||||||
ИнтерПро | IPR003903 | |||||||
SCOP2 | 1п9д / СФЕРА / СУПФАМ | |||||||
|
Маловероятно, что UIM образует независимый белковый домен . Вместо этого, исходя из расстояния между консервативными остатками, мотив, вероятно, образует короткую альфа-спираль, которая может быть встроена в различные белковые складки . [2] Некоторые белки, о которых известно, что они содержат UIM, перечислены ниже:
- Эукариотический PSD4 / RPN-10 / S5, мультиубиквитин- связывающая субъединица протеасомы 26S.
- Белок 1 болезни Мачадо-Джозефа позвоночных (Атаксин-3), который действует как связывающий гистон белок, регулирующий транскрипцию; дефекты Атаксина-3 вызывают нейродегенеративное заболевание Мачадо-Джозеф (MJD).
- Эпсин и эпсин позвоночных 2.
- Субстрат тирозинкиназы (HRS), регулируемый фактором роста гепатоцитов позвоночных .
- Субстрат 15 рецептора эпидермального фактора роста млекопитающих (EPS15), который участвует в регуляции роста клеток .
- Субстрат рецептора эпидермального фактора роста млекопитающих EPS15R.
- Drosophila melanogaster (плодовая муха) жидкие фасетки (lqf), эпсин.
- Вакуолярный сортирующий белок дрожжей VPS27, который необходим для мембранного движения к вакуоли.
Рекомендации
- ^ Young P, Q Деверо, Бил RE, Pickart CM, Rechsteiner M (март 1998). «Характеристика двух сайтов связывания полиубиквитина в субъединице 5a 26 S протеазы» . J. Biol. Chem . 273 (10): 5461–7. DOI : 10.1074 / jbc.273.10.5461 . PMID 9488668 .
- ^ а б Хофманн К., Фальке Л. (июнь 2001 г.). «Взаимодействующий с убиквитином мотив, консервативный в компонентах протеасомной и лизосомной систем деградации белков». Trends Biochem. Sci . 26 (6): 347–50. DOI : 10.1016 / s0968-0004 (01) 01835-7 . PMID 11406394 .
- ^ Бухбергер А (май 2002 г.). «От UBA к UBX: новые слова в лексиконе убиквитина». Trends Cell Biol . 12 (5): 216–21. DOI : 10.1016 / S0962-8924 (02) 02269-9 . PMID 12062168 .
- ^ Oldham CE, Mohney RP, Miller SL, Hanes RN, O'Bryan JP (июль 2002 г.). «Взаимодействующие с убиквитином мотивы нацелены на эндоцитарный адаптерный белок эпсин для убиквитинирования». Curr. Биол . 12 (13): 1112–6. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (02) 00900-4 . PMID 12121618 .
- ^ Рицман Х (март 2002 г.). «Клеточная биология: связь убиквитина» . Природа . 416 (6879): 381–3. DOI : 10.1038 / 416381a . PMID 11919614 .
- ^ Рис DE, Барнетт MJ, Коннорс JM, Fairey RN, Fay JW, Greer JP, Herzig GP, Herzig RH, Klingemann HG, LeMaistre CF (октябрь 1991 г.). «Интенсивная химиотерапия циклофосфамидом, кармустином и этопозидом с последующей трансплантацией аутологичного костного мозга при рецидиве болезни Ходжкина». J. Clin. Онкол . 9 (10): 1871–9. PMID 1919637 .