Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Unipept - это исследовательский инструмент с открытым исходным кодом для анализа биоразнообразия образцов метапротеомики . Он также содержит инструмент для выбора пептидов для использования в качестве биомаркера и инструмент для сравнения генома организмов на основе содержания в них белка. [2] [3] Программное обеспечение разработано в Гентском университете .

Unipept состоит из веб-приложения и автономного инструмента командной строки. Веб-приложение использует интерактивные визуализации данных для изучения наборов данных. Инструмент командной строки содержит те же функции, но предназначен для использования в конвейерах автоматической обработки данных. [4]

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Unipept Releases" . Проверено 14 апреля 2019 года . CS1 maint: discouraged parameter (link)
  2. ^ Месуере, Барт; Девриз, Барт; Дебизер, Гриет; Aerts, Маартен; Вандамм, Питер; Давиндт, Питер (2012). «Unipept: анализ биоразнообразия образцов метапротеома на основе триптических пептидов». Журнал протеомных исследований . 11 (12): 5773–80. DOI : 10.1021 / pr300576s . ISSN 1535-3893 . PMID 23153116 .  
  3. ^ Месуере, Барт; Дебизер, Гриет; Aerts, Маартен; Девриз, Барт; Вандамм, Питер; Давиндт, Питер (2015). «Конвейер метапротеомического анализа Unipept». Протеомика . 15 (8): 1437–1442. DOI : 10.1002 / pmic.201400361 . ISSN 1615-9853 . PMID 25477242 . S2CID 43820480 .   
  4. ^ "Документация Unipept CLI" . Проверено 24 августа 2015 года . CS1 maint: discouraged parameter (link)

Внешние ссылки [ править ]

  • Домашняя страница Unipept
  • Инструмент командной строки unipept
  • Открытый проект Unipept