Вариант, вызывающий озабоченность

Термин «вызывающий беспокойство вариант» ( VOC ) - это категория, используемая при первоначальной оценке вновь возникшего варианта вируса. До этого появляющийся вариант мог быть обозначен как «интересующий вариант». ^[1] Во время или после более полной оценки как «вариант, вызывающий озабоченность», вариант обычно присваивается к линии в системе номенклатуры PANGOLIN ^[2] и к классам в системах Nextstrain ^[3] и GISAID ^[4] .

Во время пандемии коронавирусного заболевания 2019 года (COVID-19) наблюдалось, что вирус тяжелого острого респираторного синдрома коронавирус 2 (SARS-CoV-2) мутировал, причем некоторые комбинации конкретных точечных мутаций оказались более опасными, чем другие. ^[5] Это было главным образом по причинам трансмиссивности и вирулентности , а также в связи с возможным появлением ускользающих мутаций .

Критерии, учитываемые во время COVID-19 [ править ]

Несколько национальных и международных организаций здравоохранения (например, Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) (США), Общественное здравоохранение Англии (PHE) и Консорциум COVID-19 Genomics UK для Великобритании, а также Канадская сеть геномики COVID (CanCOGeN)). некоторые или все из следующих критериев для оценки вариантов: ^[6]^[7]

Повышенная проницаемость
Повышенная заболеваемость
Повышенная смертность
Повышенный риск «длительного COVID»
Возможность уклоняться от обнаружения диагностическими тестами
Сниженная восприимчивость к противовирусным препаратам (если и когда такие препараты доступны)
Снижение восприимчивости к нейтрализующим антителам, либо терапевтическим (например, плазма выздоравливающих или моноклональные антитела), либо в лабораторных экспериментах
Способность избежать естественного иммунитета (например, вызвать повторное заражение)
Возможность заражения вакцинированных лиц
Повышенный риск определенных состояний, таких как мультисистемный воспалительный синдром или длительный COVID.
Повышенное сродство к определенным демографическим или клиническим группам, таким как дети или люди с ослабленным иммунитетом.

Терминология [ править ]

Варианты, которые соответствуют одному или нескольким из этих критериев, могут быть помечены как «представляющие интерес варианты» или «варианты, находящиеся в процессе исследования» («VUI») в ожидании проверки и подтверждения этих свойств. После проверки интересующие варианты / VUI могут быть переименованы в «вызывающие озабоченность варианты» контролирующими организациями, такими как CDC. ^[5]^[1]^[8]

Примеры [ править ]

Великобритания [ править ]

По состоянию на 5 марта 2021 г. в «списке наблюдения» Великобритании имеется восемь вариантов, 4 со статусом «VOC» и 4 с оценкой «VUI», при этом PHE добавляет четвертый VUI после того, как 16 человек дали положительный результат на него в даты, начинающиеся с 15 февраля. ^[9] Последний вариант - VUI-202102/04 (Lineage B.1.1.318), 24 февраля он был обозначен как VUI. Другие VUI - это P.2, VUI-202102/01 (A.23.1 с E484K) и B.1.525, а VOC - это Lineage B.1.1.7 , вариант 501.V2 (также известный как Lineage B.1.351), Lineage P. 1 и VOC-202102/02 («B.1.1.7 с E484K»). ^[10]^[11]

США [ править ]

В США в феврале 2021 года в статье в JAMA были описаны три «вызывающих беспокойство варианта», а именно: B.1.1.7, B.1.351 (также известный как вариант 501.V2) и P.1, где говорилось, что они «заслуживают пристального внимания». '. ^[12]

Ссылки [ править ]

^ ^a ^b «Варианты: распределение данных по делам» . GOV.UK . 28 января 2021 г. В разделе «Различия между вариантом, вызывающим озабоченность, и вариантом, находящимся на рассмотрении» . Проверено 19 февраля 2021 года . Варианты SARS-CoV-2, если считается, что они обладают эпидемиологическими, иммунологическими или патогенными свойствами, подлежат официальному расследованию. На этом этапе они обозначены как Variant Under Investigation (VUI) с годом, месяцем и номером. После оценки рисков с соответствующим экспертным комитетом они могут быть обозначены как вызывающий озабоченность вариант (VOC).
^ Rambaut, A .; Холмс, ЕС; О'Тул, Б .; и другие. (2020). «Предложение по динамической номенклатуре для линий SARS-CoV-2 в помощь геномной эпидемиологии» . Природная микробиология . 5 (11): 1403–1407. DOI : 10.1038 / s41564-020-0770-5 . PMID 32669681 . S2CID 220544096 . Цитируется у Alm et al.
^ Бедфорд, Тревор; Ходкрофт, Эмма Б; Неер, Ричард А. (6 января 2021 г.). «Обновленная стратегия именования кладов Nextstrain SARS-CoV-2» . nextstrain.org/blog . Проверено 19 января 2021 года .
^ "кладовое дерево (от 'Номенклатура кладов и родословных')" . www.gisaid.org . 4 июля 2020 . Проверено 7 января 2021 года .
^ а б Гриффитс, Эмма; Таннер, Дженнифер; Нокс, Натали; Сяо, Уилл; Ван Домселаар, Гэри (15 января 2021 г.). «Промежуточные рекомендации CanCOGeN по наименованию, выявлению и сообщению о вызывающих озабоченность вариантах SARS-CoV-2» (PDF) . CanCOGeN (nccid.ca) . Проверено 25 февраля 2021 года .
^ Участник, IDSA (2 февраля 2021 г.). «Мега-вариант COVID» и восемь критериев для шаблона для оценки всех вариантов » . Наука говорит: Global ID News . Проверено 20 февраля 2021 года .
^ CDC. «Новые варианты SARS-CoV-2» . Центры по контролю и профилактике заболеваний . Проверено 4 января 2021 года . Эта статья включает текст из этого источника, который находится в общественном достоянии .
^ Расследование вызывающих озабоченность вариантов SARS-CoV-2 в Англии Технический брифинг 6 13 февраля 2021 г. (См. Раздел: Номенклатура вариантов в Великобритании, стр. 3 ) assets.publishing.service.gov.uk , по состоянию на 27 февраля 2021 г.
^ Covid-19: еще один новый вариант добавлен в список наблюдения Великобритании Мишель Робертс, 4 марта 2021 г. www.bbc.com , по состоянию на 5 марта 2021 г.
^ Варианты, вызывающие озабоченность, или находящиеся в стадии расследования: данные до 3 марта 2021 г. 4 марта 2021 г. www.gov.uk , по состоянию на 5 марта 2021 г.
^ Последнее обновление: новый вариант находится в стадии расследования, назначенный в Великобритании 4 марта 2021 г. www.gov.uk , по состоянию на 5 марта 2021 г.
^ SARS-CoV-2 Варианты, вызывающие озабоченность в Соединенных Штатах - проблемы и возможности, 17 февраля 2021 г., jamanetwork.com , по состоянию на 5 марта 2021 г.

[VDoCD-1] «Варианты: распределение данных по делам» . GOV.UK . 28 января 2021 г. В разделе «Различия между вариантом, вызывающим озабоченность, и вариантом, находящимся на рассмотрении» . Проверено 19 февраля 2021 года . Варианты SARS-CoV-2, если считается, что они обладают эпидемиологическими, иммунологическими или патогенными свойствами, подлежат официальному расследованию. На этом этапе они обозначены как Variant Under Investigation (VUI) с годом, месяцем и номером. После оценки рисков с соответствующим экспертным комитетом они могут быть обозначены как вызывающий озабоченность вариант (VOC).

[RambautETAL.-2] Rambaut, A .; Холмс, ЕС; О'Тул, Б .; и другие. (2020). «Предложение по динамической номенклатуре для линий SARS-CoV-2 в помощь геномной эпидемиологии» . Природная микробиология . 5 (11): 1403–1407. DOI : 10.1038 / s41564-020-0770-5 . PMID 32669681 . S2CID 220544096 . Цитируется у Alm et al.

[nextstrain-amendation-3] Бедфорд, Тревор; Ходкрофт, Эмма Б; Неер, Ричард А. (6 января 2021 г.). «Обновленная стратегия именования кладов Nextstrain SARS-CoV-2» . nextstrain.org/blog . Проверено 19 января 2021 года .

[GCTree-4] "кладовое дерево (от 'Номенклатура кладов и родословных')" . www.gisaid.org . 4 июля 2020 . Проверено 7 января 2021 года .

[CanSum-5] а б Гриффитс, Эмма; Таннер, Дженнифер; Нокс, Натали; Сяо, Уилл; Ван Домселаар, Гэри (15 января 2021 г.). «Промежуточные рекомендации CanCOGeN по наименованию, выявлению и сообщению о вызывающих озабоченность вариантах SARS-CoV-2» (PDF) . CanCOGeN (nccid.ca) . Проверено 25 февраля 2021 года .

[6] Участник, IDSA (2 февраля 2021 г.). «Мега-вариант COVID» и восемь критериев для шаблона для оценки всех вариантов » . Наука говорит: Global ID News . Проверено 20 февраля 2021 года .

[:3-7] CDC. «Новые варианты SARS-CoV-2» . Центры по контролю и профилактике заболеваний . Проверено 4 января 2021 года . Эта статья включает текст из этого источника, который находится в общественном достоянии .

[8] Расследование вызывающих озабоченность вариантов SARS-CoV-2 в Англии Технический брифинг 6 13 февраля 2021 г. (См. Раздел: Номенклатура вариантов в Великобритании, стр. 3 ) assets.publishing.service.gov.uk , по состоянию на 27 февраля 2021 г.

[9] Covid-19: еще один новый вариант добавлен в список наблюдения Великобритании Мишель Робертс, 4 марта 2021 г. www.bbc.com , по состоянию на 5 марта 2021 г.

[10] Варианты, вызывающие озабоченность, или находящиеся в стадии расследования: данные до 3 марта 2021 г. 4 марта 2021 г. www.gov.uk , по состоянию на 5 марта 2021 г.

[11] Последнее обновление: новый вариант находится в стадии расследования, назначенный в Великобритании 4 марта 2021 г. www.gov.uk , по состоянию на 5 марта 2021 г.

[12] SARS-CoV-2 Варианты, вызывающие озабоченность в Соединенных Штатах - проблемы и возможности, 17 февраля 2021 г., jamanetwork.com , по состоянию на 5 марта 2021 г.

[1]