Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлен с 30S )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Атомная структура субъединицы 30S из Thermus thermophilus . Белки показаны синим цветом, а одиночная цепь РНК - оранжевым. [1]

Прокариотической небольшая рибосомальной субъединицей , или 30 S субъединицей , тем меньше субъединицей 70S рибосомы найдены в прокариот . Это комплекс 16S рибосомальной РНК (рРНК) и 19 белков . [1] Этот комплекс участвует в связывании транспортной РНК с информационной РНК (мРНК). [2] Маленькая субъединица отвечает за связывание и считывание мРНК во время трансляции . Маленькая субъединица, как рРНК, так и ее белки, объединяются с большой 50S субъединицей с образованием 70Sпрокариотические рибосомы в прокариотических клетках. Затем эта 70S рибосома используется для трансляции мРНК в белки.

Функция [ править ]

Субъединица 30S является неотъемлемой частью трансляции мРНК . Он связывает три фактора инициации прокариот : IF-1, IF-2 и IF-3. [3]

Часть 30S субъединицы ( 16S рРНК ) направляет инициирующий стартовый кодон (5 ') - AUG- (3') мРНК в положение, узнавая последовательность Шайна-Дальгарно , комплементарный сайт связывания примерно на 8 пар оснований выше стартовый кодон. [4] Это гарантирует, что рибосома начинает трансляцию в правильном месте. Плотность связи между последовательностью Шайна-Далгарно на мРНК и 16S рРНК определяет, насколько эффективно происходит трансляция. [4] Как только 16S рРНК распознает стартовый кодон мРНК , связывается специальная транспортная РНК , f-Met -тРНК, и начинается трансляция белка. [5]Сайт связывания f-Met-тРНК на 30S рибосомной субъединице называется «D-сайтом» [6]. Этот этап необходим для осуществления синтеза белка . Тогда большая рибосомная субъединица свяжется, и синтез белка продолжится. [7] Связывание большой субъединицы вызывает конформационные изменения в 70S, что открывает другой сайт для трансляции белка. [6]

Чтобы образовать трансляционный комплекс с субъединицей 50S, субъединица 30S должна связывать IF-1, IF-2, IF-3, мРНК и f-met-тРНК. Далее, 50й субъединицы связывает и гуанозинтрифосфат будут расщеплен до гуанозиндифосфата и неорганического фосфата , таким образом , диссоциация факторы инициации и в результате трансляции белка. [8] [5] Этот процесс называется «инициированием» и является самым медленным процессом перевода. [5]

Структура [ править ]

Маленькая рибосомная субъединица состоит из 16S рРНК и 19 полных белков. [9] Существует также одна полипептидная цепь , состоящая из 26 аминокислот . [10] Обычно рРНК маркируют «H #», чтобы указать номер спирали на изображениях с высоким разрешением. Белки помечены «S #» для обозначения различных пептидов, участвующих в стабилизации рРНК. S11 и H45 расположены рядом с сайтом связывания Шайна-Далгарно, который также находится рядом с сайтом связывания IF-3. Белки S3, S4, S5 и S12, наряду с H18, расположены рядом с каналом, в котором мРНК присутствует в 30S-субъединице. [1]

Запрещение [ править ]

Субъединица 30S является мишенью для антибиотиков, таких как тетрациклин и гентамицин . [11] Эти антибиотики специально нацелены на прокариотические рибосомы, поэтому их можно использовать для лечения бактериальных инфекций у эукариот . Тетрациклин взаимодействует с H27 в малой субъединице, а также связывается с A-сайтом в большой субъединице. [11] Пуромицин является ингибитором рибосомной трансляции. [6] Пактамицин прерывает связывание в области связывания Шайна-Дальгарно в малой субъединице, тем самым нарушая активность. Гигромицин Bтакже взаимодействует с H44 и подавляет перемещение транслокации, которое необходимо во время синтеза белка. [11]

См. Также [ править ]

  • Прокариотическая большая рибосомная субъединица (50S)
  • Рибосомная РНК
  • Антибиотики

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Шлюенцен, Франк; Тоциль, Анте; Заривач, Раз; Хармс, Йорг; Глюеманн, Марко; Джанелл, Даниэла; Башан, Анат; Бартельс, Хайке; Агмон, Илана (2001-09-01). «Структура функционально активированной малой рибосомной субъединицы при разрешении 3,3 Å». Cell . 102 (5): 615–623. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 00084-2 . PMID 11007480 . 
  2. ^ Томпсон, Джон Ф .; Херст (1983). «Структурно-функциональные отношения в 16s РНК E. coli» (PDF) . Cell . 33 (1): 19–24. CiteSeerX 10.1.1.625.7760 . DOI : 10.1016 / 0092-8674 (83) 90330-6 . PMID 6380748 .   
  3. ^ L Золото; D Pribnow; Т. Шнайдер; S Shinedling; BS Singer; Стормо и Г. (1981). «Трансляционная инициация у прокариот». Ежегодный обзор микробиологии . 35 (1): 365–403. DOI : 10.1146 / annurev.mi.35.100181.002053 . PMID 6170248 . 
  4. ^ a b Малис, Наглис (01.01.2012). «Последовательность Шайна-Далгарно бактериофага Т4: GAGG преобладает в ранних генах». Отчеты по молекулярной биологии . 39 (1): 33–39. DOI : 10.1007 / s11033-011-0707-4 . ISSN 0301-4851 . PMID 21533668 .  
  5. ^ a b c Gualerzi, Claudio O .; Пон, Синтия Л. (1990). «Инициирование трансляции мРНК у прокариот». Биохимия . 29 (25): 5881–5889. DOI : 10.1021 / bi00477a001 . PMID 2200518 . 
  6. ^ a b c Игараси, Кадзуэй; Танака, Шигеаки; Кадзи, Акира (1971-02-11). «О сайте связывания аминоацил-тРНК 30-S субъединицы рибосомы и его связи с сайтом инициации цепи рибосомы». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Нуклеиновые кислоты и синтез белков . 228 (3): 728–731. DOI : 10.1016 / 0005-2787 (71) 90737-4 . PMID 4929429 . 
  7. ^ Слобин, Лоуренс I (декабрь 1972 г.). «Структурные и функциональные свойства рибосом, сшитых диметилсуберимидатом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 69 (12): 3769–3773. DOI : 10.1073 / pnas.69.12.3769 . PMC 389868 . PMID 4566460 .  
  8. ^ Милон Р, М Carotti, Коневег А.Л., Wintermeyer Вт, Роднина М.В., Gualerzi СО (2010). «Связанный с рибосомами фактор инициации 2 рекрутирует тРНК инициатора в комплекс инициации 30S» . EMBO Reports . 11 (4): 312–316. DOI : 10.1038 / embor.2010.12 . PMC 2854590 . PMID 20224578 .  
  9. ^ Циболи, Параскеви; Херфурт, Эльке; Чоли, Теодора (1994-11-01). «Очистка и характеристика 30S рибосомных белков из бактерии Thermus thermophilus». Европейский журнал биохимии . 226 (1): 169–177. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1994.0t169.x . ISSN 1432-1033 . 
  10. ^ Чоли Т, Р Франчески, Йонат А, Уиттманн-Liebold В (1993). «Выделение и характеристика нового рибосомального белка из термофильных эубактерий, Thermus thermophilus, T. aquaticus и T. flavus» (PDF) . Биологическая химия Хоппе-Зейлер . 374 (6): 377–383. DOI : 10.1515 / bchm3.1993.374.1-6.377 . PMID 8357533 .  
  11. ^ a b c Brodersen, Ditlev E .; Клемонс, Уильям М .; Картер, Эндрю П .; Морган-Уоррен, Роберт Дж .; Уимберли, Брайан Т .; Рамакришнан, В. (2000-12-22). «Структурные основы действия антибиотиков тетрациклина, пактамицина и гигромицина B на 30S субъединицу рибосомы». Cell . 103 (7): 1143–1154. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 00216-6 . PMID 11163189 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • 16S рРНК, BioMineWiki
  • http://pathmicro.med.sc.edu/mayer/antibiot.htm
  • 16S + рибосома + РНК в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)