ACADSB - это человеческий ген , кодирующий ацил-КоА-дегидрогеназу (SBCAD), специфичную для коротких / разветвленных цепей , фермент из семейства ацил-КоА-дегидрогеназ .
Это может вызвать дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью . [4]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура
2 Функция
3 Клиническое значение
4 ссылки
5 Внешние ссылки
Структура [ править ]
Ген ACADSB человека расположен на 10-й хромосоме ; его точная локализация была определена как 10q25-q26. [5] открытая рамка считывания (ORF) , котора кодирует белок - предшественник , который содержит 431 аминокислот ; посттрансляционный процессинг приводит к зрелому белку с 399 аминокислотами. КДНК в значительной степени похожа на кДНК других членов семейства ацил-КоА-дегидрогеназ; его структура наиболее близка к короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназе. [6]Структура каталитического кармана также была изучена; положение 104 на дне кармана для связывания субстрата было идентифицировано как важное для определения длины первичной углеродной цепи, которая может быть размещена. Было показано, что изменение остатков в положениях 105 и 177 влияет на скорость реакций дегидрирования . [7]
Функция [ править ]
Ацил-КоА-дегидрогеназа с короткой / разветвленной цепью (ACADSB) является членом семейства ферментов ацил-КоА-дегидрогеназы, которые катализируют дегидрирование производных ацил-КоА в метаболизме жирных кислот или аминокислот с разветвленной цепью. Субстратная специфичность - это основная характеристика, используемая для определения членов этого семейства генов. Продукт гена ACADSB имеет наибольшую активность по отношению к короткой разветвленной цепью производного ацил-СоА, (S) -2-метилбутирил-КоА, но и значительно реагирует с другими 2-метил- с разветвленной цепью субстратов и с короткой прямой цепью ацил СоА . [8] Кодируемый белок также участвует в катаболизме L- лейцина . [9]
Клиническое значение [ править ]
Мутации в гене ACADSB были связаны с дефицитом 2-метилбутирил-КоА дегидрогеназы (SBCADD, также известным как MBD), аутосомно- рецессивным метаболическим расстройством, связанным с нарушением деградации изолейцина . [10] Было идентифицировано множество мутаций в 10 экзонах гена, которые вызывают пропуск экзонов и другие ошибки транскрипции и трансляции. Заболевание может быть обнаружено с помощью стандартного скрининга новорожденных на основе МС / МС из-за повышенного присутствия 2-метилбутирилкарнитина в образцах тканей. [11] [12] Заболевание также можно выявить с помощью анализа мочи на органические кислоты, обнаружив присутствие 2-метилбутирила.глицинурия . [9] Хотя многие люди с мутацией в этом гене могут протекать бессимптомно, у некоторых пациентов симптомы появляются в раннем младенчестве. Младенцы могут испытывать приступы апноэ , общую атрофию мышц , гипотонию , летаргию , судороги и задержку моторного развития. Пациенты также могут испытывать метаболические симптомы, такие как переохлаждение и гипогликемия . [13] Наконец, генетические полиморфизмы гена ACADSB также могут быть вовлечены в развитие гипертонии в популяции Японии. [14]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196177 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Андресен Б.С., Кристенсен Э., Коридон Т.Дж., Бросс П., Пилгаард Б., Вандерс Р.Дж., Руйтер Дж.П., Симонсен Х., Винтер В., Кнудсен И., Шредер Л.Д., Грегерсен Н., Сковби Ф. (ноябрь 2000 г.). «Изолированная 2-метилбутирилглицинурия, вызванная дефицитом ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью: идентификация нового ферментативного дефекта, разрешение его молекулярной основы и доказательства различных ацил-КоА-дегидрогеназ в метаболизме изолейцина и валина» . Американский журнал генетики человека . 67 (5): 1095–103. DOI : 10.1086 / 303105 . PMC 1288551 . PMID 11013134 .
^ Arden KC, Viars CS, Fu K, Розен R (февраль 1995). «Локализация ацил-CoA дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью (ACADSB) на хромосоме 10 человека». Геномика . 25 (3): 743–5. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80023-f . PMID 7759115 .
^ Розен R, Vockley J, Чжоу L, R Милош, Уиллард Дж, фу К, Vicanek С, с низким Нанг л, Торбан Е, Фурнье Б (ноябрь 1994 года). «Выделение и экспрессия кДНК, кодирующей предшественник нового члена (ACADSB) семейства генов ацил-CoA дегидрогеназы». Геномика . 24 (2): 280–7. DOI : 10.1006 / geno.1994.1617 . PMID 7698750 .
^ Он M, Burghardt TP, Vockley J (сентябрь 2003). «Новый подход к характеристике субстратной специфичности ацил-CoA дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью» . Журнал биологической химии . 278 (39): 37974–86. DOI : 10.1074 / jbc.M306882200 . PMID 12855692 .
^ a b Андресен Б.С., Кристенсен Э., Коридон Т.Дж., Бросс П., Пилгаард Б., Вандерс Р.Дж., Руйтер Дж.П., Симонсен Х., Винтер В., Кнудсен И., Шредер Л.Д., Грегерсен Н., Сковби Ф. (ноябрь 2000 г.). «Изолированная 2-метилбутирилглицинурия, вызванная дефицитом ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью: идентификация нового ферментативного дефекта, разрешение его молекулярной основы и доказательства различных ацил-КоА-дегидрогеназ в метаболизме изолейцина и валина» . Американский журнал генетики человека . 67 (5): 1095–103. DOI : 10.1086 / 303105 . PMC 1288551 . PMID 11013134 .
^ Sass JO, Ensenauer R, Röschinger W, Reich H, Steuerwald U, Schirrmacher O, Engel K, Häberle J, Andresen BS, Mégarbané A, Lehnert W, Zschocke J (январь 2008 г.). «Дефицит дегидрогеназы 2-метилбутирил-кофермента А: функциональные и молекулярные исследования дефекта катаболизма изолейцина». Молекулярная генетика и метаболизм . 93 (1): 30–5. DOI : 10.1016 / j.ymgme.2007.09.002 . PMID 17945527 .
^ Madsen PP, Kibaek M, Roca X, Sachidanandam R, Krainer AR, Christensen E, Steiner RD, Gibson К.М., Corydon TJ, Кнудсен I, Вандерс RJ, Ruiter JP, Грегерсен N, Andresen BS (февраль 2006). «Дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью из-за мутации IVS3 + 3A> G, которая вызывает пропуск экзона». Генетика человека . 118 (6): 680–90. DOI : 10.1007 / s00439-005-0070-4 . PMID 16317551 . S2CID 22861705 .
^ Alfardan Дж, Мохсен AW, Copeland S, J Эллисона, Кеппен-Дэвис л, Робах М, Пауэлл БР, Гиллис Дж, Matern Д, Кант Дж, Vockley J (август 2010 г.). «Характеристика новых мутаций в последовательности гена ACADSB и клинических проявлений у пациентов с 2-метилбутирилглицинурией, выявленных при скрининге новорожденных» . Молекулярная генетика и метаболизм . 100 (4): 333–8. DOI : 10.1016 / j.ymgme.2010.04.014 . PMC 2906669 . PMID 20547083 .
^ Гибсон KM, Burlingame TG, Hogema B, Jakobs C, Schutgens RB, Millington D, Roe CR, Roe DS, Sweetman L, Steiner RD, Linck L, Pohowalla P, Sacks M, Kiss D, Rinaldo P, Vockley J (Jun 2000). «Дефицит дегидрогеназы 2-метилбутирил-кофермента А: новая врожденная ошибка метаболизма L-изолейцина» . Педиатрические исследования . 47 (6): 830–3. DOI : 10.1203 / 00006450-200006000-00025 . PMID 10832746 .
^ Kamide К, Кокубо У, Ян Дж, Matayoshi Т, Инамото Н, Takiuchi S, Хорьо Т, Мива Y, Йошии М, Tomoike Н, Танака С, Банно М, Окуда Т, Кавано Y, Miyata Т (январь 2007). «Ассоциация генетических полиморфизмов ACADSB и COMT с гипертонией человека». Журнал гипертонии . 25 (1): 103–10. DOI : 10.1097 / HJH.0b013e3280103a40 . PMID 17143180 . S2CID 40885244 .
Внешние ссылки [ править ]
Расположение генома человека ACADSB и страница сведений о гене ACADSB в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P45954 (Ацил-КоА-дегидрогеназа, специфичная для коротких / разветвленных цепей, митохондриальная) в PDBe-KB .
