Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ADAMTS12
Идентификаторы
ПсевдонимыADAMTS12 , PRO4389, металлопептидаза ADAM с мотивом тромбоспондина 1 типа 12
Внешние идентификаторыOMIM : 606184 MGI : 2146046 HomoloGene : 12808 GeneCards : ADAMTS12
Расположение гена ( человек )
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человека) [1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение ADAMTS12
Геномное расположение ADAMTS12
Группа5п13.3-п13.2Начинать33 523 535 п.н. [1]
Конец33 892 019 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 15 (мышь)
Chr.Хромосома 15 (мышь) [2]
Хромосома 15 (мышь)
Геномное расположение ADAMTS12
Геномное расположение ADAMTS12
Группа15 | 15 A1Начинать11 064 790 п.н. [2]
Конец11 349 231 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ADAMTS12 221421 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание ионов металлов
• активность пептидазы
• связывание с белками GO: 0001948
• активность металлоэндопептидазы
• активность гидролазы
• активность металлопептидазы
• связывание ионов цинка
Сотовый компонент• внеклеточная область
• внеклеточный матрикс
• внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс• регуляция морфогенеза эндотелиальной трубки
• катаболический процесс протеогликанов
• негативная регуляция сигнального пути рецептора фактора роста гепатоцитов
• негативная регуляция клеточного ответа на стимул сосудистого эндотелиального фактора роста
• клеточный ответ на фактор некроза опухоли
• клеточный ответ на стимул BMP
• негативная регуляция клеточного ответ на стимул фактора роста гепатоцитов
• протеолиз
• негативная регуляция дифференцировки хондроцитов
• клеточный ответ на интерлейкин-1
• регуляция воспалительного ответа
• протеолиз, участвующий в катаболическом процессе клеточного белка
• адгезия клеточного матрикса
• миграция клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

81792

239337

Ансамбль

ENSG00000151388
ENSG00000281690

ENSMUSG00000047497

UniProt

P58397

Q811B3

RefSeq (мРНК)

NM_030955
NM_001324511
NM_001324512

NM_175501

RefSeq (белок)

NP_001311440
NP_001311441
NP_112217

NP_780710

Расположение (UCSC)Chr 5: 33,52 - 33,89 МбChr 15: 11.06 - 11.35 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Дизинтегрин и металлопротеиназа с тромбоспондин мотивов 12 представляет собой фермент , который у человека кодируется ADAMTS12 геном . [5]

Этот ген кодирует член семейства белков ADAMTS (дезинтегрин и металлопротеиназа с тромбоспондиновыми мотивами). Члены этого семейства имеют несколько отдельных белковых модулей, включая пропептидную область, домен металлопротеиназы, дезинтегрин-подобный домен и мотив тромбоспондина типа 1 (TS-1). Отдельные члены этого семейства различаются по количеству С-концевых мотивов TS-1, а некоторые имеют уникальные С-концевые домены. Фермент, кодируемый этим геном, содержит восемь мотивов TS-1. Он может играть роль в легочных клетках во время развития плода или в опухолевых процессах благодаря своей протеолитической активности или как молекула, потенциально участвующая в регуляции адгезии клеток. [5]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c ENSG00000281690 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000151388, ENSG00000281690 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000047497 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Entrez: металлопептидаза ADAMTS12 ADAM с мотивом тромбоспондина типа 1, 12» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Тан БЛ (2001). «ADAMTS: новое семейство протеаз внеклеточного матрикса». Int. J. Biochem. Cell Biol . 33 (1): 33–44. DOI : 10.1016 / S1357-2725 (00) 00061-3 . PMID  11167130 .
  • Llamazares M, Obaya AJ, Moncada-Pazos A, et al. (2008). «Металлопротеиназа ADAMTS12 проявляет противоопухолевые свойства за счет модуляции Ras-зависимого пути передачи сигнала ERK» . J. Cell Sci . 120 (Pt 20): 3544–52. DOI : 10,1242 / jcs.005751 . PMID  17895370 .
  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .
  • Лю CJ, Kong W, Xu K и др. (2006). «ADAMTS-12 связывает и разрушает белок олигомерного матрикса хряща» . J. Biol. Chem . 281 (23): 15800–8. DOI : 10.1074 / jbc.M513433200 . PMC  1483932 . PMID  16611630 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемых белков (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики» . Genome Res . 13 (10): 2265–70. DOI : 10.1101 / gr.1293003 . PMC  403697 . PMID  12975309 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Shotgun секвенирование человеческого транскриптома с помощью тегов последовательности, экспрессируемой ORF» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (7): 3491–6. DOI : 10.1073 / pnas.97.7.3491 . PMC  16267 . PMID  10737800 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: M12.237
  • Расположение генома человека ADAMTS12 и страница сведений о гене ADAMTS12 в браузере генома UCSC .


  • v
  • т
  • е