AP1B1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
4HMY , 4P6Z

Идентификаторы

Псевдонимы

AP1B1 , ADTB1, AP105A, BAM22, CLAPB2, субъединица 1 бета 1 адапторного белкового комплекса, 1 субъединица бета 1 адапторного белкового комплекса, KIDAR

Внешние идентификаторы

OMIM : 600157 MGI : 1096368 HomoloGene : 21972 GeneCards : AP1B1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 22 (человека) ^[1]

Группа	22q12.2	Начинать	29 327 680 п.н. ^[1]
Группа	22q12.2	Конец	29 423 179 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 11 (мышь) ^[2]

Группа	11 \| 11 A1	Начинать	4 986 824 п.н. ^[2]
Группа	11 \| 11 A1	Конец	5 042 791 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• активность транспортера • связывание с белком GO: 0001948 • связывание с протеинкиназой • связывание с клатрином
Сотовый компонент	• транс-Гольджи сеть мембрана • мембраны • Гольджи мембраны • лизосомальная мембрана • клатриновая везикула мембрана • Мембрана покрытия • цитоплазматической мембрана везикула • цитоплазматические везикулы • клатрин адаптер комплекс • Гольджи • цитозоль • внутриклеточной мембранная ограниченные органеллы
Биологический процесс	• процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • регулирование защитного ответа на вирус вирусом • развитие сердца • определение левой / правой симметрии • транспорт белка • внутриклеточный транспорт белка • транспорт, опосредованный везикулами
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


162


11764

Ансамбль


ENSG00000100280


ENSMUSG00000009090

UniProt


Q10567


O35643

RefSeq (мРНК)


NM_145730 NM_001127 NM_001166019


NM_001243043 NM_001243044 NM_007454 NM_001355659 NM_001355660

RefSeq (белок)

NP_001118 NP_001159491 NP_663782 NP_001365491 NP_001365492
NP_001365493 NP_001365494 NP_001365495


NP_001229972 NP_001229973 NP_031480 NP_001342588 NP_001342589

Расположение (UCSC)

Chr 22: 29.33 - 29.42 Мб

Chr 11: 4.99 - 5.04 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

AP-1 комплекс субъединица бета-1 представляет собой белок , который у человека кодируется AP1B1 гена . ^[5]^[6]^[7]

Адаптерный белковый комплекс 1 обнаруживается на цитоплазматической стороне покрытых везикул, расположенных в комплексе Гольджи, где он опосредует как рекрутирование клатрина на мембрану, так и распознавание сигналов сортировки в цитозольных хвостах трансмембранных рецепторов. Этот комплекс представляет собой гетеротетрамер, состоящий из двух больших, одной средней и одной малой субъединиц адаптина. Белок, кодируемый этим геном, служит одной из крупных субъединиц этого комплекса и является членом семейства белков адаптинов. Этот ген является геном-кандидатом менингиомы . Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы, и существуют варианты, использующие альтернативные сигналы полиаденилирования. ^[7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что AP1B1 взаимодействует с KIF13A ^[8] и AP1G1 . ^[9]^[10]^[11]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000100280 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009090 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пейрар М, Fransson я, Се YG, Хан ФГ, Ruttledge MH, Сван S, Коллинз JE, Данхэм я, Коллинз В.П., Dumanski JP (январь 1995). «Характеристика нового члена семейства генов бета-адаптина человека из хромосомы 22q12, гена-кандидата менингиомы». Hum Mol Genet . 3 (8): 1393–9. DOI : 10.1093 / HMG / 3.8.1393 . PMID 7987321 .
^ Пейрар М, пан HQ, Kedra D, Fransson я, Сван S, Хартман К, Клифтон СВ, Роу Б.А., Dumanski JP (февраль 1997 г.). «Структура промотора и геномная организация гена бета-адаптина человека (BAM22) из хромосомы 22q12». Геномика . 36 (1): 112–7. DOI : 10.1006 / geno.1996.0431 . PMID 8812422 .
^ a b «Ген Entrez: AP1B1-родственный белковый комплекс 1, субъединица бета-1» .
^ Накагава, Т; Setou M; Seog D; Огасавара К; Dohmae N; Такио К; Хирокава Н. (ноябрь 2000 г.). «Новый мотор, KIF13A, транспортирует маннозо-6-фосфатный рецептор к плазматической мембране посредством прямого взаимодействия с комплексом AP-1». Cell . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 103 (4): 569–81. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6 . ISSN 0092-8674 . PMID 11106728 .
^ Такацу, H; Sakurai M; Шин HW; Мураками К; Накаяма К. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика новых белков, связанных с адаптером клатрина» . J. Biol. Chem . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 273 (38): 24693–700. DOI : 10.1074 / jbc.273.38.24693 . ISSN 0021-9258 . PMID 9733768 .
^ Fölsch, H; Оно H; Bonifacino JS; Меллман I (октябрь 1999 г.). «Новый адаптерный комплекс клатрина обеспечивает базолатеральное нацеливание в поляризованных эпителиальных клетках». Cell . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 99 (2): 189–98. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5 . ISSN 0092-8674 . PMID 10535737 .
^ Пейдж, ЖЖ; Робинсон М.С. (ноябрь 1995 г.). «Направляющие сигналы и взаимодействия субъединиц в адапторных комплексах везикул» . J. Cell Biol . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 131 (3): 619–30. DOI : 10,1083 / jcb.131.3.619 . ISSN 0021-9525 . PMC 2120623 . PMID 7593184 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Кирххаузен Т (2000). «Клатрин». Анну. Rev. Biochem . 69 : 699–727. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.69.1.699 . PMID 10966473 .
Гейер М., Факлер О. Т., Петерлин Б. М. (2001). «Структурно-функциональные отношения в ВИЧ-1 Неф» . EMBO Rep . 2 (7): 580–5. DOI : 10.1093 / embo-reports / kve141 . PMC 1083955 . PMID 11463741 .
Бенишу С., Бенмера А. (2003). «[Nef ВИЧ и белки K3 / K5 вируса Капоши-саркомы:« паразиты »пути эндоцитоза]» . Med Sci (Париж) . 19 (1): 100–6. DOI : 10.1051 / medsci / 2003191100 . PMID 12836198 .
Лим Д.С., Кирш Д.Г., Канман С.Е. и др. (1998). «ATM связывается с бета-адаптином в цитоплазматических пузырьках» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (17): 10146–51. DOI : 10.1073 / pnas.95.17.10146 . PMC 21476 . PMID 9707615 .
Такацу Х., Сакураи М., Шин Х.В. и др. (1998). «Идентификация и характеристика новых белков, связанных с адаптером клатрина» . J. Biol. Chem . 273 (38): 24693–700. DOI : 10.1074 / jbc.273.38.24693 . PMID 9733768 .
Крейг Х.М., Пандори М.В., Гуателли Дж.С. (1998). «Взаимодействие Nef ВИЧ-1 с клеточным путем сортировки на основе дилейцина необходимо для подавления CD4 и оптимальной вирусной инфекционности» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (19): 11229–34. DOI : 10.1073 / pnas.95.19.11229 . PMC 21624 . PMID 9736718 .
Бреснахан П.А., Йонемото В., Феррелл С. и др. (1999). «Дилейциновый мотив в Nef ВИЧ-1 действует как сигнал интернализации для подавления регуляции CD4 и связывает адаптер клатрина AP-1». Curr. Биол . 8 (22): 1235–8. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (07) 00517-9 . PMID 9811606 .
Гринберг М., ДеТуллео Л., Рапопорт И. и др. (1999). «Дилейциновый мотив в Nef ВИЧ-1 необходим для сортировки ямок, покрытых клатрином, и для подавления CD4». Curr. Биол . 8 (22): 1239–42. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (07) 00518-0 . PMID 9811611 .
Laporte SA, Oakley RH, Zhang J, et al. (1999). «Комплекс бета2-адренергический рецептор / бетааррестин привлекает клатриновый адаптер AP-2 во время эндоцитоза» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (7): 3712–7. DOI : 10.1073 / pnas.96.7.3712 . PMC 22359 . PMID 10097102 .
Fölsch H, Ohno H, Bonifacino JS, Mellman I (1999). «Новый адаптерный комплекс клатрина обеспечивает базолатеральное нацеливание в поляризованных эпителиальных клетках». Cell . 99 (2): 189–98. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5 . PMID 10535737 .
Ким С.Т., Лим Д.С., Канман CE, Кастан МБ (2000). «Субстратные особенности и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства киназ ATM» . J. Biol. Chem . 274 (53): 37538–43. DOI : 10.1074 / jbc.274.53.37538 . PMID 10608806 .
Лай М.М., Луо Х.Р., Бернетт П.Е. и др. (2000). «Кальциневрин-связывающий белок каин является негативным регулятором эндоцитоза синаптических везикул» . J. Biol. Chem . 275 (44): 34017–20. DOI : 10.1074 / jbc.C000429200 . PMID 10931822 .
Накагава Т., Сетоу М., Сог Д. и др. (2001). «Новый мотор, KIF13A, транспортирует маннозо-6-фосфатный рецептор к плазматической мембране посредством прямого взаимодействия с комплексом AP-1». Cell . 103 (4): 569–81. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6 . PMID 11106728 .
Такацу Х., Футацумори М., Йошино К. и др. (2001). «Подобные взаимодействия субъединиц способствуют сборке адаптерных комплексов клатрина и комплекса COPI: анализ с использованием дрожжевой трехгибридной системы». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 284 (4): 1083–9. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.5081 . PMID 11409905 .
Дорей Б., Корнфельд С. (2001). «Гамма-субъединица адапторного комплекса AP-1 связывает клатрин: значение для кооперативного связывания в сборке покрытых везикул» . Мол. Биол. Cell . 12 (7): 1925–35. DOI : 10.1091 / mbc.12.7.1925 . PMC 55640 . PMID 11451993 .
Джардин Х, Макни В., Дональдсон К., Рахман I (2002). «Молекулярный механизм трансформирующего фактора роста (TGF) -beta1-индуцированного истощения глутатиона в альвеолярных эпителиальных клетках. Участие AP-1 / ARE и Fra-1» . J. Biol. Chem . 277 (24): 21158–66. DOI : 10.1074 / jbc.M112145200 . PMID 11912197 .

Внешние ссылки [ править ]

Человек AP1B1 место генома и AP1B1 ген подробно страницу в браузере УСК генома .

Эта статья о гене на 22-й хромосоме человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000100280 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009090 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7987321-5] Пейрар М, Fransson я, Се YG, Хан ФГ, Ruttledge MH, Сван S, Коллинз JE, Данхэм я, Коллинз В.П., Dumanski JP (январь 1995). «Характеристика нового члена семейства генов бета-адаптина человека из хромосомы 22q12, гена-кандидата менингиомы». Hum Mol Genet . 3 (8): 1393–9. DOI : 10.1093 / HMG / 3.8.1393 . PMID 7987321 .

[pmid8812422-6] Пейрар М, пан HQ, Kedra D, Fransson я, Сван S, Хартман К, Клифтон СВ, Роу Б.А., Dumanski JP (февраль 1997 г.). «Структура промотора и геномная организация гена бета-адаптина человека (BAM22) из хромосомы 22q12». Геномика . 36 (1): 112–7. DOI : 10.1006 / geno.1996.0431 . PMID 8812422 .

[entrez-7] «Ген Entrez: AP1B1-родственный белковый комплекс 1, субъединица бета-1» .

[pmid11106728-8] Накагава, Т; Setou M; Seog D; Огасавара К; Dohmae N; Такио К; Хирокава Н. (ноябрь 2000 г.). «Новый мотор, KIF13A, транспортирует маннозо-6-фосфатный рецептор к плазматической мембране посредством прямого взаимодействия с комплексом AP-1». Cell . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 103 (4): 569–81. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6 . ISSN 0092-8674 . PMID 11106728 .

[pmid9733768-9] Такацу, H; Sakurai M; Шин HW; Мураками К; Накаяма К. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика новых белков, связанных с адаптером клатрина» . J. Biol. Chem . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 273 (38): 24693–700. DOI : 10.1074 / jbc.273.38.24693 . ISSN 0021-9258 . PMID 9733768 .

[pmid10535737-10] Fölsch, H; Оно H; Bonifacino JS; Меллман I (октябрь 1999 г.). «Новый адаптерный комплекс клатрина обеспечивает базолатеральное нацеливание в поляризованных эпителиальных клетках». Cell . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 99 (2): 189–98. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5 . ISSN 0092-8674 . PMID 10535737 .

[pmid7593184-11] Пейдж, ЖЖ; Робинсон М.С. (ноябрь 1995 г.). «Направляющие сигналы и взаимодействия субъединиц в адапторных комплексах везикул» . J. Cell Biol . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 131 (3): 619–30. DOI : 10,1083 / jcb.131.3.619 . ISSN 0021-9525 . PMC 2120623 . PMID 7593184 .

[1]