Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
AP1G1
Белок AP1G1 PDB 1gyu.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1IU1

Идентификаторы
ПсевдонимыAP1G1 , ADTG, CLAPG1, адапторный белковый комплекс 1, субъединица гамма 1, адапторный белковый комплекс 1, субъединица, гамма 1
Внешние идентификаторыOMIM : 603533 MGI : 101919 HomoloGene : 47995 GeneCards : AP1G1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человека) [1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение AP1G1
Геномное расположение AP1G1
Группа16q22.2Начинать71 729 000 б.п. [1]
Конец71 809 201 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 8 (мышь)
Chr.Хромосома 8 (мышь) [2]
Хромосома 8 (мышь)
Геномное расположение AP1G1
Геномное расположение AP1G1
Группа8 D3 | 8 57,26 смНачинать109 778 554 п.н. [2]
Конец109 864 204 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE AP1G1 203350 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность транспортера
• GTP-зависимое связывание с белками
• связывание с Rab GTPase
• связывание с белком GO: 0001948
• связывание с кинезином
Сотовый компонент• утилизация эндосома
• клатриновых эндоцитотической везикулы мембрана
• Гольджи
• транс-Гольджи сеть мембрана
• мембраны
• внутриклеточной мембранная ограниченная органелл
• Гольджи мембраны
• лизосомальная мембрана
• AP-мембранного тип пальто адаптер комплекс
• клатриновых везикула мембрана
• мембранного слой
• мембрана цитоплазматических везикул
• цитоплазматическая везикула
• везикула, покрытая клатрином
• адаптерный комплекс клатрина
• цитоплазма
• цитозоль
• Адаптерный комплекс АП-1
Биологический процесс• обработка антигена и презентация класса экзогенного пептида антигена через MHC II
• регулирование защитной реакцию на вирус вирусом
• Гольджи к лизосомам транспорта
• положительной регуляции клеточной дегрануляции естественных киллеров
• меланос организации
• эндосых к меланосу транспорту
• транспорт белка
• внутриклеточного транспорт белка
• положительное регулирование опосредованной естественных киллеров цитотоксичности
• пузырек-опосредованный транспорт
• транспорт
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

164

11765

Ансамбль

ENSG00000166747

ENSMUSG00000031731

UniProt

O43747

P22892

RefSeq (мРНК)

NM_001128
NM_001030007

NM_001301211
NM_009677

RefSeq (белок)

NP_001025178
NP_001119

NP_001288140
NP_033807

Расположение (UCSC)Chr 16: 71.73 - 71.81 МбChr 8: 109,78 - 109,86 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

AP-1 комплекс субъединица гамма-1 представляет собой белок , который у человека кодируется AP1G1 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Адаптины являются важными компонентами покрытых клатрином везикул, транспортирующих комплексы лиганд-рецептор от плазматической мембраны или от транс-сети Гольджи к лизосомам. Семейство белков адаптинов состоит из четырех классов молекул, называемых альфа-, бета-, бета- и гамма-адаптинами. Адаптины вместе со средними и малыми субъединицами образуют гетеротетрамерный комплекс, называемый адаптером, роль которого состоит в том, чтобы способствовать образованию ямок и пузырьков, покрытых клатрином. Белок, кодируемый этим геном, является белком гамма-адаптина и принадлежит к семейству больших субъединиц адапторных комплексов. Для этого гена обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что AP1G1 взаимодействует с:

  • AP1B1 , [6] [8] [9]
  • AP1GBP1 , [10] [11]
  • AP1M1 , [8] [9]
  • AP1S1 , [6] [8] [9]
  • NECAP2 , [12]
  • RABEP1 , [10] [13] и
  • Синаптофизин . [14]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000166747 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031731 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Пейрар M, Parveneh S, Lagercrantz S, M Экман, Fransson I, Sahlen S, Dumanski JP (июнь 1998). «Клонирование, паттерн экспрессии и хромосомная принадлежность к 16q23 гена гамма-адаптина человека (ADTG)». Геномика . 50 (2): 275–80. DOI : 10.1006 / geno.1998.5289 . PMID 9653655 . 
  6. ^ a b c Такацу Х., Сакурай М., Шин Х.В., Мураками К., Накаяма К. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика новых белков, связанных с адаптером клатрина» . Журнал биологической химии . 273 (38): 24693–700. DOI : 10.1074 / jbc.273.38.24693 . PMID 9733768 . 
  7. ^ "Entrez Gene: AP1G1 связанный с адаптером белковый комплекс 1, субъединица гамма 1" .
  8. ^ a b c Fölsch H, Ohno H, Bonifacino JS, Mellman I (октябрь 1999 г.). «Новый адаптерный комплекс клатрина обеспечивает базолатеральное нацеливание в поляризованных эпителиальных клетках». Cell . 99 (2): 189–98. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 81650-5 . PMID 10535737 . S2CID 15288582 .  
  9. ^ a b c Пейдж Л.Дж., Робинсон М.С. (ноябрь 1995 г.). «Направляющие сигналы и субъединичные взаимодействия в адапторных комплексах везикул» . Журнал клеточной биологии . 131 (3): 619–30. DOI : 10,1083 / jcb.131.3.619 . PMC 2120623 . PMID 7593184 .  
  10. ^ a b Ноги Т., Сиба Й, Кавасаки М., Сиба Т., Мацугаки Н., Игараси Н., Судзуки М., Като Р., Такацу Х., Накаяма К., Вакацуки С. (июль 2002 г.). «Структурная основа для рекрутирования дополнительных белков гамма-адаптином ушного домена». Структурная биология природы . 9 (7): 527–31. DOI : 10.1038 / nsb808 . PMID 12042876 . S2CID 42630285 .  
  11. ^ Takatsu H, Yoshino K, Накаяма K (май 2000). «Адаптерный домен гомологии уха гамма, законсервированный в белках гамма-адаптина и GGA, которые взаимодействуют с гамма-синергином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 271 (3): 719–25. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2700 . PMID 10814529 . 
  12. ^ Mattera R, Риттер В, Сидхе С.С., МакФерсон П.С., Bonifacino JS (февраль 2004 г.). «Определение консенсусного мотива, распознаваемого гамма-адаптивными доменами уха» . Журнал биологической химии . 279 (9): 8018–28. DOI : 10.1074 / jbc.M311873200 . PMID 14665628 . 
  13. ^ Mattera R, Arighi CN, R Lodge, Zerial M, Bonifacino JS (январь 2003). «Двухвалентное взаимодействие GGA с комплексом Rabaptin-5-Rabex-5» . Журнал EMBO . 22 (1): 78–88. DOI : 10,1093 / emboj / cdg015 . PMC 140067 . PMID 12505986 .  
  14. ^ Horikawa HP, Kneussel M, El Far O, Бец H (ноябрь 2002). «Взаимодействие синаптофизина с адаптерным белком AP-1 гамма-адаптином». Молекулярная и клеточная нейронауки . 21 (3): 454–62. DOI : 10.1006 / mcne.2002.1191 . PMID 12498786 . S2CID 54366866 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Берлиоз-Торрент С., Шаклетт Б.Л., Эрдтманн Л., Деламар Л., Бушарт И., Сониго П., Дохелар М.К., Бенарус Р. (февраль 1999 г.). «Взаимодействие цитоплазматических доменов ретровирусных трансмембранных белков человека и обезьян с компонентами адаптерных комплексов клатрина модулирует внутриклеточную и поверхностную экспрессию гликопротеинов оболочки» . Журнал вирусологии . 73 (2): 1350–61. DOI : 10,1128 / JVI.73.2.1350-1361.1999 . PMC  103959 . PMID  9882340 .
  • Пейдж LJ, Sowerby PJ, Луи WW, Робинсон MS (сентябрь 1999 г.). «Гамма-синергин: белок, содержащий домен ЕН, который взаимодействует с гамма-адаптином» . Журнал клеточной биологии . 146 (5): 993–1004. DOI : 10.1083 / jcb.146.5.993 . PMC  2169493 . PMID  10477754 .
  • Fölsch H, Ohno H, Bonifacino JS, Mellman I (октябрь 1999 г.). «Новый адаптерный комплекс клатрина обеспечивает базолатеральное нацеливание в поляризованных эпителиальных клетках». Cell . 99 (2): 189–98. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5 . PMID  10535737 . S2CID  15288582 .
  • Херст Дж., Луи В.В., Брайт Н.А., Тотти Н., Матрос М.Н., Робинсон М.С. (апрель 2000 г.). «Семейство белков с гамма-адаптином и доменами VHS, которые способствуют перемещению между сетью транс-Гольджи и вакуолью / лизосомой» . Журнал клеточной биологии . 149 (1): 67–80. DOI : 10,1083 / jcb.149.1.67 . PMC  2175106 . PMID  10747088 .
  • Такацу Х., Йошино К., Накаяма К. (май 2000 г.). «Адаптерный домен гомологии уха гамма, законсервированный в белках гамма-адаптина и GGA, которые взаимодействуют с гамма-синергином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 271 (3): 719–25. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2700 . PMID  10814529 .
  • Накагава Т., Сэтоу М., Сог Д., Огасавара К., Дохмаэ Н., Такио К., Хирокава Н. (ноябрь 2000 г.). «Новый мотор, KIF13A, транспортирует маннозо-6-фосфатный рецептор к плазматической мембране посредством прямого взаимодействия с комплексом AP-1». Cell . 103 (4): 569–81. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6 . PMID  11106728 . S2CID  18245989 .
  • Wyss S, Berlioz-Torrent C, Boge M, Blot G, Höning S, Benarous R, Thali M (март 2001 г.). «Высококонсервативный C-концевой мотив дилейцина в цитозольном домене гликопротеина оболочки вируса иммунодефицита человека типа 1 является критическим для его ассоциации с адаптером клатрина AP-1 [коррекция адаптера]» . Журнал вирусологии . 75 (6): 2982–92. DOI : 10,1128 / JVI.75.6.2982-2992.2001 . PMC  115924 . PMID  11222723 .
  • Crump CM, Xiang Y, Thomas L, Gu F, Austin C, Tooze SA, Thomas G (май 2001 г.). «Связывание PACS-1 с адаптерами необходимо для трафика белка, опосредованного кислотным кластером» . Журнал EMBO . 20 (9): 2191–201. DOI : 10.1093 / emboj / 20.9.2191 . PMC  125242 . PMID  11331585 .
  • Такацу Х., Футацумори М., Ёшино К., Ёсида Й., Шин Х.В., Накаяма К. (июнь 2001 г.). «Подобные взаимодействия субъединиц способствуют сборке адаптерных комплексов клатрина и комплекса COPI: анализ с использованием дрожжевой трехгибридной системы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 284 (4): 1083–9. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.5081 . PMID  11409905 .
  • Орзек Э., Лившиц Л., Лейт Дж., Охрименко Х., Райх В., Коэн С., Вайс А., Меламед-Бук Н, Лебендикер М., Альтшулер Ю., Ароэти Б. (август 2001 г.). «Взаимодействие между адаптерным белком-1 клатриновой оболочки и микротрубочками через белки, ассоциированные с микротрубочками типа 1a» . Журнал биологической химии . 276 (33): 31340–8. DOI : 10.1074 / jbc.M101054200 . PMID  11418592 .
  • Дорей Б., Корнфельд С. (июль 2001 г.). «Гамма-субъединица адапторного комплекса AP-1 связывает клатрин: значение для кооперативного связывания в сборке покрытых везикул» . Молекулярная биология клетки . 12 (7): 1925–35. DOI : 10.1091 / mbc.12.7.1925 . PMC  55640 . PMID  11451993 .
  • Шиба Ю., Такацу Х., Шин Х.В., Накаяма К. (март 2002 г.). «Гамма-адаптин напрямую взаимодействует с Рабаптином-5 через свой ушной домен». Журнал биохимии . 131 (3): 327–36. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a003107 . PMID  11872161 .
  • Остин С., Бём М., Туз С.А. (апрель 2002 г.). «Сайт-специфическое перекрестное связывание выявляет дифференциальное прямое взаимодействие факторов ADP-рибозилирования классов 1, 2 и 3 с комплексами адаптерных белков 1 и 3». Биохимия . 41 (14): 4669–77. DOI : 10.1021 / bi016064j . PMID  11926829 .
  • Eiraku M, Hirata Y, Takeshima H, Hirano T., Kengaku M (июль 2002 г.). «Рецептор, связанный с дельта / notch-подобным эпидермальным фактором роста (EGF), новый EGF-подобный повторяющийся белок, нацеленный на дендриты развивающихся и взрослых нейронов центральной нервной системы» . Журнал биологической химии . 277 (28): 25400–7. DOI : 10.1074 / jbc.M110793200 . PMID  11950833 .
  • Ноги Т., Сиба И., Кавасаки М., Сиба Т., Мацугаки Н., Игараси Н., Сузуки М., Като Р., Такацу Х., Накаяма К., Вакацуки С. (июль 2002 г.). «Структурная основа для рекрутирования дополнительных белков гамма-адаптином ушного домена». Структурная биология природы . 9 (7): 527–31. DOI : 10.1038 / nsb808 . PMID  12042876 . S2CID  42630285 .
  • Kalthoff C, Groos S, Kohl R, Mahrhold S, Ungewickell EJ (ноябрь 2002 г.). «Клинт: новый клатрин-связывающий белок с доменом ENTH в Гольджи» . Молекулярная биология клетки . 13 (11): 4060–73. DOI : 10.1091 / mbc.E02-03-0171 . PMC  133614 . PMID  12429846 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Человек AP1G1 место генома и AP1G1 ген подробно страницу в браузере УСК генома .