Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ATF6
Идентификаторы
ПсевдонимыATF6 , ATF6A, ACHM7, активирующий фактор транскрипции 6
Внешние идентификаторыOMIM : 605537 MGI : 1926157 HomoloGene : 32015 GeneCards : ATF6
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение ATF6
Геномное расположение ATF6
Группа1q23.3Начинать161 766 320 п.н. [1]
Конец161 964 070 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 1 (мышь)
Chr.Хромосома 1 (мышь) [2]
Хромосома 1 (мышь)
Геномное расположение ATF6
Геномное расположение ATF6
Группа1 H3 | 1 76,96 смНачинать170 704 674 п.н. [2]
Конец170 867 771 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ATF6 203952 в формате fs.png

PBB GE ATF6 217550 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание ДНК
• РНК - полимераза регуляторной область последовательности-специфическая ДНК II связывания
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающего фактор активности транскрипции
• ГО: 0001105 транскрипции коактиватор активность
• транскрипция регуляторной область последовательность конкретного ДНК - связывающий
• GO: связывание белка 0001948
• идентичный белок связывания
• гетеродимеризация активность белка
• убиквитин белка лигазы связывания
• элемент ответа на цАМФ связывание
• GO: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторную последовательность ДНК-связывающий конкретного региона
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая
• Последовательно-специфическое связывание ДНК
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК -связывающая активность фактора транскрипции, специфическая к РНК-полимеразе II
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• Гольджи
• ядерная оболочка
• мембрана
• эндоплазматический ретикулум мембраны
• Гольджи мембраны
• нуклеоплазма
• интегральный компонент эндоплазматического ретикулума мембраны
• эндоплазматического ретикулума
• клетки ядра
• цитозоль
Биологический процесс• развитие глаз
• регуляция транскрипции, ДНК-темплейт
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, ДНК-шаблон
• ответ развернутого белка эндоплазматического ретикулума
• ATF6 -опосредованный развернутый ответ белка
• ответа на развернутый белок
• сворачивания белка
• трансдукцию сигнала
• визуальное восприятие
• положительного регулирования процесса апоптоза
• транскрипции от РНКА - полимераза II промотора
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция опосредованного ATF6 ответа развернутого белка
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

22926

226641

Ансамбль

ENSG00000118217

ENSMUSG00000026663

UniProt

P18850

F6VAN0

RefSeq (мРНК)

NM_007348

NM_001081304

RefSeq (белок)

NP_031374

NP_001074773

Расположение (UCSC)Chr 1: 161.77 - 161.96 МбChr 1: 170,7 - 170,87 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Активация фактора транскрипции 6 , также известный как ATF6 , является белком , который, в организме человека, кодируется ATF6 гена [5] [6] [7] и участвует в разложенном ответ белка .

Функция [ править ]

ATF6 представляет собой регулируемый стрессом трансмембранный транскрипционный фактор эндоплазматического ретикулума (ER), который активирует транскрипцию молекул ER. [8] Накопление неправильно свернутых белков в эндоплазматической сети приводит к протеолитическому расщеплению ATF6. Цитозольная часть ATF6 переместится в ядро ​​и будет действовать как фактор транскрипции, вызывая транскрипцию шаперонов ER.

См. Также [ править ]

  • Активирующий фактор транскрипции

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что ATF6 взаимодействует с YY1 [9] и фактором ответа сыворотки . [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000118217 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026663 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Хай TW, Лю Ф, Coukos WJ, Грин MR (декабрь 1989). «Клоны кДНК фактора транскрипции ATF: обширное семейство белков лейциновой молнии, способных избирательно образовывать ДНК-связывающие гетеродимеры» . Genes Dev . 3 (12B): 2083–90. DOI : 10,1101 / gad.3.12b.2083 . PMID 2516827 . 
  6. ^ а б Чжу С., Йохансен Ф. Э., Приуэс Р. (сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие ATF6 и сывороточного фактора ответа» . Мол. Клетка. Биол . 17 (9): 4957–66. DOI : 10,1128 / MCB.17.9.4957 . PMC 232347 . PMID 9271374 .  
  7. ^ Meex SJ, ван Greevenbroek М.М., Ауби Т.А., Vlietinck R, ван Влита-Ostaptchouk СП, Hofker MH, Vermeulen В.М., Schalkwijk CG, Feskens EJ, Бур JM, Stehouwer CD, ван дер Каллен CJ де Bruin TW (июль 2007) . «Активирующие полиморфизмы и гаплотипы фактора транскрипции 6 связаны с нарушением гомеостаза глюкозы и диабетом 2 типа у голландских кавказцев» . J. Clin. Эндокринол. Метаб . 92 (7): 2720–5. DOI : 10.1210 / jc.2006-2280 . PMID 17440018 . 
  8. ^ «Энтрез Ген: ATF6, активирующий фактор транскрипции 6» .
  9. ↑ Li M, Baumeister P, Roy B, Phan T, Foti D, Luo S, Lee AS (2000). «ATF6 как активатор транскрипции стрессового элемента эндоплазматического ретикулума: изменения, вызванные стрессом тапсигаргина, и синергетические взаимодействия с NF-Y и YY1» . Мол. Клетка. Биол . 20 (14): 5096–106. DOI : 10.1128 / MCB.20.14.5096-5106.2000 . PMC 85959 . PMID 10866666 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хай Т., Хартман М.Г. (2001). «Молекулярная биология и номенклатура активирующего фактора транскрипции / cAMP-чувствительного элемента связывающего семейства факторов транскрипции: активирующие белки фактора транскрипции и гомеостаз». Джин . 273 (1): 1–11. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (01) 00551-0 . PMID  11483355 .
  • Хай Т.В., Лю Ф., Кукос В.Дж., Грин М.Р. (1990). «Клоны кДНК фактора транскрипции ATF: обширное семейство белков лейциновой молнии, способных избирательно образовывать ДНК-связывающие гетеродимеры» . Genes Dev . 3 (12B): 2083–90. DOI : 10,1101 / gad.3.12b.2083 . PMID  2516827 .
  • Чжу Ц., Йохансен Ф. Е., Приуэс Р. (1997). «Взаимодействие ATF6 и сывороточного фактора ответа» . Мол. Клетка. Биол . 17 (9): 4957–66. DOI : 10,1128 / MCB.17.9.4957 . PMC  232347 . PMID  9271374 .
  • Йошида Х., Хейз К., Янаги Х., Юра Т., Мори К. (1999). «Идентификация цис-действующего элемента стрессового ответа эндоплазматического ретикулума, ответственного за индукцию транскрипции регулируемых глюкозой белков млекопитающих. Вовлечение основных факторов транскрипции лейциновой молнии» . J. Biol. Chem . 273 (50): 33741–9. DOI : 10.1074 / jbc.273.50.33741 . PMID  9837962 .
  • Хейз К., Йошида Х, Янаги Х, Юра Т, Мори К. (1999). «Фактор транскрипции млекопитающих ATF6 синтезируется как трансмембранный белок и активируется протеолизом в ответ на стресс эндоплазматической сети» . Мол. Биол. Cell . 10 (11): 3787–99. DOI : 10.1091 / mbc.10.11.3787 . PMC  25679 . PMID  10564271 .
  • Ли М., Баумейстер П., Рой Б., Фан Т., Фоти Д., Ло С., Ли А.С. (2000). «ATF6 как активатор транскрипции стрессового элемента эндоплазматической ретикулума: стресс-индуцированные изменения тапсигаргина и синергетические взаимодействия с NF-Y и YY1» . Мол. Клетка. Биол . 20 (14): 5096–106. DOI : 10.1128 / MCB.20.14.5096-5106.2000 . PMC  85959 . PMID  10866666 .
  • Ёсида Х., Окада Т., Хейз К., Янаги Х., Юра Т., Негиси М., Мори К. (2001). «Стресс-индуцированное эндоплазматическим ретикулумом образование комплекса факторов транскрипции ERSF, включающего NF-Y (CBF) и активирующие факторы транскрипции 6α и 6β, которые активируют ответ развернутого белка млекопитающих» . Мол. Клетка. Биол . 21 (4): 1239–48. DOI : 10.1128 / MCB.21.4.1239-1248.2001 . PMC  99577 . PMID  11158310 .
  • Йе Дж., Роусон РБ, Комуро Р, Чен Х, Даве УП, Приуэс Р, Браун М.С., Гольдштейн Дж. Л. (2001). «ER стресс вызывает расщепление мембраносвязанного ATF6 теми же протеазами, которые обрабатывают SREBP». Мол. Cell . 6 (6): 1355–64. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 00133-7 . PMID  11163209 .
  • Паркер Р., Фан Т., Баумейстер П., Рой Б., Черият В., Рой А.Л., Ли А.С. (2001). «Идентификация TFII-I как фактора связывания элемента стрессовой реакции эндоплазматической ретикулума ERSF: его ауторегуляция под действием стресса и взаимодействия с ATF6» . Мол. Клетка. Биол . 21 (9): 3220–33. DOI : 10.1128 / MCB.21.9.3220-3233.2001 . PMC  86961 . PMID  11287625 .
  • Гото Т., Оядомари С., Мори К., Мори М. (2002). «Апоптоз, индуцированный оксидом азота в макрофагах RAW 264.7, опосредуется путем стресса эндоплазматического ретикулума с участием ATF6 и CHOP» . J. Biol. Chem . 277 (14): 12343–50. DOI : 10.1074 / jbc.M107988200 . PMID  11805088 .
  • Чен Х, Шен Дж, Привес Р. (2002). «Люминальный домен ATF6 ощущает стресс эндоплазматического ретикулума (ER) и вызывает транслокацию ATF6 из ER в Golgi» . J. Biol. Chem . 277 (15): 13045–52. DOI : 10.1074 / jbc.M110636200 . PMID  11821395 .
  • Thuerauf DJ, Моррисон LE, Hoover H, Glembotski CC (2002). «Координация опосредованной ATF6 транскрипции и деградации ATF6 с помощью домена, который является общим с фактором вирусной транскрипции, VP16» . J. Biol. Chem . 277 (23): 20734–9. DOI : 10.1074 / jbc.M201749200 . PMID  11909875 .
  • Окада Т., Ёсида Х, Акадзава Р., Негиси М., Мори К. (2002). «Различная роль активирующего фактора транскрипции 6 (ATF6) и двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы-подобной киназы эндоплазматического ретикулума (PERK) в транскрипции во время ответа на развёрнутый белок млекопитающих» . Биохим. Дж . 366 (Pt 2): 585–94. DOI : 10.1042 / BJ20020391 . PMC  1222788 . PMID  12014989 .
  • Луо С., Ли А.С. (2002). «Необходимость сигнального пути митоген-активируемой протеинкиназы p38 для индукции 78 кДа глюкозо-регулируемого белка / белка, связывающего тяжелую цепь иммуноглобулина, азетидиновым стрессом: активация фактора транскрипции 6 в качестве мишени для индуцированного стрессом фосфорилирования» . Биохим. Дж . 366 (Pt 3): 787–95. DOI : 10.1042 / BJ20011802 . PMC  1222838 . PMID  12076252 .
  • Тардиф К.Д., Мори К., Сиддики А. (2002). «Субгеномные реплики вируса гепатита С вызывают стресс эндоплазматического ретикулума, активируя внутриклеточный сигнальный путь» . J. Virol . 76 (15): 7453–9. DOI : 10,1128 / JVI.76.15.7453-7459.2002 . PMC  136367 . PMID  12097557 .
  • Шуда М., Кондо Н., Имазеки Н., Танака К., Окада Т., Мори К., Хада А., Араи М., Вакацуки Т., Мацубара О, Ямамото Н., Ямамото М. (2004). «Активация генов ATF6, XBP1 и grp78 в гепатоцеллюлярной карциноме человека: возможное участие пути стресса ER в гепатоканцерогенезе». J. Hepatol . 38 (5): 605–14. DOI : 10.1016 / S0168-8278 (03) 00029-1 . PMID  12713871 .
  • Окада Т., Хейз К., Наданака С., Ёсида Х., Сейда Н.Г., Хирано И., Сато Р., Негиси М., Мори К. (2003). «Ингибитор сериновой протеазы предотвращает вызванное стрессом эндоплазматического ретикулума расщепление, но не переносит мембраносвязанный фактор транскрипции ATF6» . J. Biol. Chem . 278 (33): 31024–32. DOI : 10.1074 / jbc.M300923200 . PMID  12782636 .
  • Ньюман Дж. Р., Китинг А. Э. (2003). «Всесторонняя идентификация человеческих взаимодействий bZIP с массивами спиральных катушек». Наука . 300 (5628): 2097–101. Bibcode : 2003Sci ... 300.2097N . DOI : 10.1126 / science.1084648 . PMID  12805554 . S2CID  36715183 .

Внешние ссылки [ править ]

  • ATF6 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Расположение генома человека ATF6 и страница сведений о гене ATF6 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .



  • v
  • т
  • е