Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ATOH1
Идентификаторы
ПсевдонимыATOH1 , ATH1, HATH1, MATH-1, bHLHa14, атональный фактор транскрипции bHLH 1
Внешние идентификаторыOMIM : 601461 MGI : 104654 HomoloGene : 31297 GeneCard : ATOH1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение ATOH1
Геномное расположение ATOH1
Группа4q22.2Начинать93 828 753 п.н. [1]
Конец93 830 966 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 6 (мышь)
Chr.Хромосома 6 (мышь) [2]
Хромосома 6 (мышь)
Геномное расположение ATOH1
Геномное расположение ATOH1
Группа6 C1 | 6 30,03 смНачинать64 729 125 п.н. [2]
Конец64 731 245 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ATOH1 221336 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное
для последовательности
• Активность димеризации белков
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая
• GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II Связывание ДНК, специфичное для последовательности
• Связывание хроматина с ДНК
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК -связывающая активность фактора транскрипции, специфическая к РНК-полимеразе II
Сотовый компонент• ядро клетки
Биологический процесс• Путь передачи сигналов Notch
• регуляция дифференцировки нейронов
• определение судьбы слуховых рецепторных клеток
• дифференцировка клеток
• позитивная регуляция дифференцировки слуховых рецепторных клеток
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция дифференцировки рецепторных клеток внутреннего уха
• негативная регуляция апоптотического процесса
• миграция нейронов
• спецификация судьбы слуховых рецепторных клеток
• транскрипция, ДНК-шаблон
• развитие нервной системы
• управление аксонами
• Развитие многоклеточного организма
• центральное развитие нервной системы
• развитие мозга
• слуховой дифференциация клеток рецепторов
• внутренний морфогенез уха
• положительного регулирование нейрон дифференциация
• нейрон дифференциация
• Кора головного мозг развитие
• Развитие внутреннего уха
• положительной регуляция транскрипции с РНК - полимераза II , промотор
• транскрибирования Промотор РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

474

11921

Ансамбль

ENSG00000172238

ENSMUSG00000073043

UniProt

Q92858

P48985

RefSeq (мРНК)

NM_005172

NM_007500

RefSeq (белок)

NP_005163

NP_031526

Расположение (UCSC)Chr 4: 93,83 - 93,83 МбChr 6: 64,73 - 64,73 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок атональное гомолог 1 представляет собой белок , который у человека кодируется Atoh1 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Этот белок принадлежит к семейству основных факторов транскрипции спираль-петля-спираль (BHLH) . Он активирует E-box- зависимую транскрипцию вместе с TCF3 (E47). [6] ATOH1 необходим для образования как нервных, так и ненейронных типов клеток. Используя генетическую делецию у мышей, было показано, что Atoh1 необходим для образования нейронов гранул мозжечка , волосковых клеток внутреннего уха , интернейронов спинного мозга , клеток Меркеля кожи и секреторных клеток кишечника ( бокаловидных , энтероэндокринных и клеток Панета).). ATOH1 является гомологом атонального гена Drosophila melanogaster у млекопитающих . ATOH1 считается частью сигнального пути Notch .

В 2009 году ATOH1 был идентифицирован как ген "выключения рака". [1] [7] [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000172238 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000073043 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Ben-Arie N, McCall AE, Berkman S, Eichele G, Bellen HJ, Zoghbi HY (сентябрь 1996 г.). «Эволюционная консервация последовательности и экспрессии белка Atonal bHLH предполагает консервативную роль в нейрогенезе» . Молекулярная генетика человека . 5 (9): 1207–16. DOI : 10.1093 / HMG / 5.9.1207 . PMID 8872459 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: атональный гомолог 1 ATOH1 (Drosophila)» .
  7. ^ "Обнаружен ген" выключения "рака" . 2009-02-24. Архивировано из оригинала на 2009-02-27.
  8. ^ Bossuyt W, Kazanjian A, De Geest N, Van Kelst S, De Hertogh G, Geboes K и др. (Февраль 2009 г.). «Атональный гомолог 1 представляет собой ген-супрессор опухоли» . PLoS Биология . 7 (2): e39. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1000039 . PMID 19243219 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хелмс А.В., Джонсон Дж. Э. (март 1998 г.). «Прародители дорсальных комиссуральных интернейронов определяются экспрессией MATH1». Развитие . 125 (5): 919–28. PMID  9449674 .
  • Dintilhac A, Bernués J (март 2002 г.). «HMGB1 взаимодействует со многими очевидно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности» (PDF) . Журнал биологической химии . 277 (9): 7021–8. DOI : 10.1074 / jbc.M108417200 . PMID  11748221 . S2CID  39560486 .
  • Браун Н.Л., Дагене С.Л., Чен С.М., Глейзер Т. (февраль 2002 г.). «Молекулярная характеристика и картирование ATOH7, человеческого атонального гомолога с предполагаемой ролью в развитии ганглиозных клеток сетчатки» . Геном млекопитающих . 13 (2): 95–101. DOI : 10.1007 / s00335-001-2101-3 . PMC  2262845 . PMID  11889557 .
  • Леонард Дж. Х., Кук А. Л., Ван Геле М., Бойл Г. М., Инглис К. Дж., Спелеман Ф., Штурм Р. А. (сентябрь 2002 г.). «Экспрессия пронейральных и пронейроэндокринных факторов транскрипции в кожных механорецепторных (Меркель) клетках и клеточной карциноме Меркеля». Международный журнал рака . 101 (2): 103–10. DOI : 10.1002 / ijc.10554 . PMID  12209986 . S2CID  20592545 .
  • Газит Р., Крижановский В., Бен-Арье Н. (февраль 2004 г.). «Math1 контролирует дифференцировку гранулярных клеток мозжечка, регулируя множество компонентов пути передачи сигналов Notch» . Развитие . 131 (4): 903–13. DOI : 10.1242 / dev.00982 . PMID  14757642 .
  • Леоу С.К., Полакис П., Гао В.К. (ноябрь 2005 г.). «Роль Hath1, фактора транскрипции bHLH, в аденокарциноме толстой кишки». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 1059 (1): 174–83. Bibcode : 2005NYASA1059..174L . DOI : 10.1196 / анналы.1339.048 . PMID  16382053 . S2CID  21443239 .
  • Секин А., Акияма Ю., Янагихара К., Юаса Ю. (июнь 2006 г.). «Hath1 регулирует экспрессию гена муцина желудка в клетках желудка». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 344 (4): 1166–71. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2006.03.238 . PMID  16647036 .
  • Муто Х., Сакамото Х., Хаякава Х., Арао Й., Сато К., Нокуби М., Сугано К. (июль 2006 г.). «Специфический для кишечника гомеобоксный ген Cdx2 индуцирует экспрессию основного транскрипционного фактора спираль-петля-спираль Math1». Дифференциация; Исследования в области биологического разнообразия . 74 (6): 313–21. DOI : 10.1111 / j.1432-0436.2006.00074.x . PMID  16831200 .
  • Park ET, Oh HK, Gum JR, Crawley SC, Kakar S, Engel J и др. (Сентябрь 2006 г.). «Экспрессия HATH1 при муцинозном раке толстой кишки и родственных поражениях» . Клинические исследования рака . 12 (18): 5403–10. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-06-0573 . PMID  17000673 .
  • Цутия К., Накамура Т., Окамото Р., Канаи Т., Ватанабэ М. (январь 2007 г.). «Взаимное нацеливание Hath1 и бета-катенина с помощью киназы гликогенсинтазы 3beta Wnt при раке толстой кишки человека». Гастроэнтерология . 132 (1): 208–20. DOI : 10,1053 / j.gastro.2006.10.031 . PMID  17241872 .
  • Du X, Jensen P, Goldowitz D, Hamre KM (май 2007 г.). «Клетки дикого типа спасают генотипически Math1-нулевые волосковые клетки во внутреннем ухе химерных мышей». Биология развития . 305 (2): 430–8. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2007.02.028 . PMID  17397818 .
  • Вестерман Б.А., Брейер Р.Х., Поутсма А., Чхатта А., Нордейн Л.А., Кулен М.Г. и др. (2007). «Основное профилирование факторов транскрипции спираль-петля-спираль при опухолях легких показывает аберрантную экспрессию атонального гомолога 1 пронейрального гена (ATOH1, HATH1, MATH1) в нейроэндокринных опухолях». Международный журнал биологических маркеров . 22 (2): 114–23. DOI : 10.1177 / 172460080702200205 . PMID  17549667 . S2CID  208043955 .
  • Шеффер Д., Сейдж С., Кори Д.П., Пинго V (октябрь 2007 г.). «Профили экспрессии генов идентифицируют Hes6 как транскрипционную мишень ATOH1 в волосковых клетках улитки» . Письма FEBS . 581 (24): 4651–6. DOI : 10.1016 / j.febslet.2007.08.059 . PMID  17826772 . S2CID  13986512 .
  • Шройер Н.Ф., Хельмрат М.А., Ван В.Ю., Анталфи Б., Хеннинг С.Дж., Зогби HY (июнь 2007 г.). «Специфичное для кишечника удаление мышиного атонального гомолога 1 (Math1) выявляет роль в клеточном гомеостазе». Гастроэнтерология . 132 (7): 2478–88. DOI : 10,1053 / j.gastro.2007.03.047 . PMID  17570220 .

Внешние ссылки [ править ]

  • ATOH1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • ATOH1 и подавление рака
  • Расположение генома человека ATOH1 и страница сведений о гене ATOH1 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , которая находится в свободном доступе .