Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Эта статья о роде. Для модельного организма см. Arabidopsis thaliana .

Арабидопсис
Arabidopsis thaliana sl12.jpg
Тале кресс ( Arabidopsis thaliana )
Научная классификация е
Королевство:Plantae
Клэйд :Трахеофиты
Клэйд :Покрытосеменные
Клэйд :Eudicots
Клэйд :Росиды
Заказ:Brassicales
Семья:Brassicaceae
Род:Arabidopsis
Heynh. в Holl & Heynh.
Типовой вид
Arabis thaliana
Л.
Разновидность

См. Текст

Arabidopsis ( рок-кресс ) - это род семейства Brassicaceae . Это небольшие цветковые растения, относящиеся к капусте и горчице . Этот род представляет большой интерес, поскольку он содержит кресс-салат ( Arabidopsis thaliana ), один из модельных организмов, используемых для изучения биологии растений, и первое растение, чей геном полностью секвенирован. Изменения в кресс-салате легко заметить, что делает его очень полезной моделью.

Статус [ изменить ]

В настоящее время род Arabidopsis насчитывает девять видов и еще восемь признанных подвидов. Это разграничение произошло совсем недавно и основано на морфологической и молекулярной филогении О'Кейна и Аль-Шехбаза [1] [2] и других.

Их находки подтверждают, что виды, ранее входившие в состав Arabidopsis, сделали его полифилетическим . Самые последние шаги реклассификации два вида ранее размещенные в Cardaminopsis и Hylandra и трех видов Arabis в Arabidopsis , но не включает 50 , которые были перемещены в новые роды Берингия , Crucihimalaya , Ianhedgea , Olimarabidopsis и Pseudoarabidopsis .

Все виды Arabidopsis являются аборигенами Европы , а два вида имеют широкие ареалы, простирающиеся также в Северную Америку и Азию .

В последние два десятилетия Arabidopsis thaliana вызвала большой интерес научного сообщества как модельный организм для исследований по многочисленным аспектам биологии растений. Информационный ресурс по арабидопсису (TAIR) - это кураторский онлайн-источник информации о генетических и молекулярных биологических исследованиях Arabidopsis thaliana , а «Книга арабидопсиса» - это онлайн-сборник приглашенных глав по биологии Arabidopsis thaliana . В Европе ресурсный центр модельных организмов для гермоплазмы , биоинформатики и молекулярной биологии Arabidopsis thaliana (включая GeneChips)) - это Ноттингемский фондовый центр арабидопсиса - NASC , в то время как в Северной Америке услуги по выращиванию зародышевой плазмы предоставляются Центром биологических ресурсов арабидопсиса (ABRC) при Государственном университете Огайо . Система заказа для ABRC была включена в базу данных информационного ресурса Arabidopsis (TAIR) в июне 2001 года, в то время как NASC всегда (с 1991 года) размещал свою собственную систему заказа и браузер генома.

В 1982 году экипаж советской космической станции Салют-7 вырастил несколько арабидопсисов, став первым растением, которое зацвело и произвело семена в космосе . У них была продолжительность жизни 40 дней. [3] Семена Arabidopsis thaliana были доставлены на Луну на спускаемом аппарате Chang'e 4 в 2019 году в рамках студенческого эксперимента.

Arabidopsis очень похож на род Boechera .

Список видов и подвидов [ править ]

  • Arabidopsis arenicola (Richardson ex Hook.) Al-Shehbaz, Elven, DF Murray & SI Warwick-арктический каменный кресс(Гренландия,Лабрадор,Нунавут,Квебек,Онтарио,Манитоба,Саскачеван)
  • Arabidopsis arenosa (L.) Lawalrée-кресс-салат
    • A. arenosa subsp. arenosa (Европа: уроженец Австрии, Беларуси, Боснии и Герцеговины, Болгарии, Хорватии, Чехии, северо-восточной Франции, Германии, Венгрии, Северной Италии, Латвии, Литвы, Македонии, Польши, Румынии, Словакии, Словении, Швейцарии и Украины; натурализованный в Бельгии, Дании, Эстонии, Финляндии, Нидерландах, Норвегии, России и Западной Сибири и Швеции; отсутствует в Албании, Греции, Италии и Турции)
    • A. arenosa subsp. borbasii ( Восточная Бельгия, Чехия, Северо-Восточная Франция, Германия, Венгрия, Польша, Румыния, Словакия, Швейцария, Украина. Сомнительно встречается в Дании)
  • Arabidopsis cebennensis (DC)(ЮВФранция)
  • Arabidopsis croatica (Schott)(Босния,Хорватия)
  • Arabidopsis halleri (L.)
    • A. halleri subsp. halleri (Австрия, Хорватия, Чехия, Германия, Северная и Центральная Италия, Польша, Румыния, Словакия, Словения, Швейцария и Южная Украина. Вероятно, завезен на севере Франции и вымер в Бельгии)
    • A. halleri subsp. ovirensis (Wulfen) (Албания, Австрия, северо-восток Италии, Румыния, Словакия, Словения, юго-запад Украины, Югославия)
    • A. halleri subsp. gemmifera (Matsumura) (Дальний Восток России, Северо-Восточный Китай, Корея, Япония и Тайвань)
  • Arabidopsis lyrata (L.) O'Kane & Al-Shehbaz-песчаный кресс-салат
    • A. lyrata subsp. lyrata (северо-восток европейской части России, Аляска, Канада (запад Онтарио в Британскую Колумбию), а также юго-восток и центральная часть Соединенных Штатов (Вермонт на юг в северную Джорджию и Миссисипи на север в Миссури и Миннесоту))
    • A. lyrata subsp. petraea (Linnaeus) O'Kane & Al-Shehbaz (Австрия, Чехия, Англия, Германия, Венгрия, Исландия, Ирландия, Северная Италия, Норвегия, Россия (Северо-запад России, Сибирь и Дальний Восток), Шотландия, Швеция, Украина, северная северная Америка (Аляска и Юкон). В Польше видимо вымершие)
    • A. lyrata subsp. kamchatica (Fischer ex DC) O'Kane & Al-Shehbaz (северная Аляска, Канада (Юкон, округ Маккензи, Британская Колумбия, север Саскачевана), Алеутские острова, Восточная Сибирь, Дальний Восток России, Корея, северный Китай, Япония и Тайвань)
  • Arabidopsis neglecta (Schultes) (Карпаты(Польша, Румыния, Словакия и прилегающая Украина))
  • Arabidopsis pedemontana (Boiss.)(Северо-запад Италии и, предположительно, вымерший, в соседней юго-западной Швейцарии)
  • Arabidopsis suecica (Fries) Norrlin, Meddel. (Фенноскандинавия и Балтийский регион)
  • Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. -тале-кресс(родной ареал почти от всей Европы до Центральной Азии, теперь натурализованный по всему миру)

Реклассифицированные виды [ править ]

Следующие виды, ранее помещенные в Arabidopsis , в настоящее время не считаются частью этого рода.

  • A. bactriana → Dielsiocharis bactriana
  • A. brevicaulis → Crucihimalaya himalaica
  • A. bursifolia → Beringia bursifolia
  • A. campestris → Crucihimalaya wallichii
  • A. dentata → Murbeckiella pinnatifida
  • A. drassiana →
  • A. erysimoides → Erysimum hedgeanum
  • A. eseptata → Olimarabidopsis umbrosa
  • А. гамосепала → Neotorularia gamosepala
  • A. glauca → Thellungiella salsuginea
  • A. griffithiana → Olimarabidopsis pumila
  • A. himalaica → Круцихимальная гималайская
  • A. huetii → Murbeckiella huetii
  • A. Kneuckeri → Crucihimalaya Kneuckeri
  • А. Коршинский → Olimarabidopsis cabulica
  • A. lasiocarpa → Crucihimalaya lasiocarpa
  • A. minutiflora → Ianhedgea minutiflora
  • A. mollis → Beringia bursifolia
  • A. mollissima → Crucihimalaya mollissima
  • A. monachorum → Crucihimalaya lasiocarpa
  • A. mongolica → Crucihimalaya mongolica
  • A. multicaulis → Arabis tibetica
  • A. novae-anglicae → Neotorularia humilis
  • A. nuda → Drabopsis nuda
  • A. ovczinnikovii → Crucihimalaya mollissima
  • A. parvula → Thellungiella parvula
  • A. pinnatifida → Murbeckiella pinnatifida
  • A. pumila → Olimarabidopsis pumila
  • A. qiranica → Sisymbriopsis mollipila
  • A. richardsonii → Neotorularia humilis
  • A. russeliana → Crucihimalaya wallichii '
  • A. salsugineum → Eutrema salsugineum
  • A. sarbalica → Crucihimalaya wallichii
  • A. schimperi → Robeschia schimperi
  • A. stenocarpa → Beringia bursifolia
  • A. stewartiana → Olimarabidopsis pumila
  • A. stricta → Crucihimalaya stricta
  • A. taraxacifolia → Crucihimalaya wallichii
  • A. tenuisiliqua → Arabis tenuisiliqua
  • A. tibetica → Crucihimalaya himalaica
  • A. tibetica → Arabis tibetica
  • A. toxophylla → Pseudoarabidopsis toxophylla
  • A. trichocarpa → Neotorularia humilis
  • A. trichopoda → Beringia bursifolia
  • A. tschuktschorum → Beringia bursifolia
  • A. tuemurnica → Neotorularia humilis
  • A. verna → Drabopsis nuda
  • A. virgata → Beringia bursifolia
  • A. wallichii → Crucihimalaya wallichii
  • A. yadungensis →

Цитогенетика [ править ]

Цитогенетический анализ показал, что число гаплоидных хромосом (n) варьируется в зависимости от вида в роде: [4]

A. thaliana имеет n = 5 [5], и секвенирование ДНК этого вида было завершено в 2001 году. A. lyrata имеет n = 8, но некоторые подвиды или популяции являются тетраплоидными. [6] Различные подвиды A. arenosa имеют n = 8, но могут быть 2n (диплоид) или 4n (тетраплоид). [7] A. suecica имеет n = 13 (5 + 8) и является амфидиплоидным видом, возникшим в результате гибридизации между A. thaliana и диплоидным A. arenosa . [8]

A. neglecta имеет n = 8, как и различные подвиды A. halleri . [7]

По данным на 2005 г., A. cebennensis , A. croatica и A. pedemontana цитологически не исследовались.

Ссылки [ править ]

  1. ^ О'Кейн, Стив Л .; Аль-Шехбаз, Ихсан А. (1997). «Краткий обзор Arabidopsis (Brassicaceae)» . Новон . 7 (3): 323. DOI : 10,2307 / 3391949 . JSTOR  3391949 .
  2. ^ О'Кейн, Стив Л .; Аль-Шехбаз, Ихсан А. (2003). «Филогенетическое положение и родовые ограничения Arabidopsis (Brassicaceae) на основе последовательностей ядерной рибосомной ДНК». Анналы Ботанического сада Миссури . 90 (4): 603. DOI : 10,2307 / 3298545 . JSTOR 3298545 . S2CID 85316468 .  
  3. ^ "Первый вид растений, чтобы зацвести в космосе" . Книга рекордов Гиннеса . Проверено 10 марта 2017 .
  4. ↑ Al-Shehbaz, Ihsan A .; О'Кейн-младший, Стив Л. (2002). «Таксономия и филогения Arabidopsis (Brassicaceae)». Книга арабидопсиса. Том 1 . Книга арабидопсиса . 1 . Американское общество биологов растений. стр. e0001. DOI : 10,1199 / tab.0001 . PMC 3243115 . PMID 22303187 .  
  5. ^ Лысак, М. А; Берр, А; Печинка, А; Schmidt, R; МакБрин, К; Шуберт, я (2006). «Механизмы уменьшения числа хромосом у Arabidopsis thaliana и родственных видов Brassicaceae» . Труды Национальной академии наук . 103 (13): 5224–5229. Bibcode : 2006PNAS..103.5224L . DOI : 10.1073 / pnas.0510791103 . PMC 1458822 . PMID 16549785 .  
  6. ^ Дарт, Сара; Крон, Пол; Мейбл, Барбара К (2004). «Характеристика полиплоидии Arabidopsis lyrata с использованием подсчета хромосом и проточной цитометрии». Канадский журнал ботаники . 82 (2): 185. DOI : 10,1139 / b03-134 .
  7. ^ a b Джоли, Саймон; Шмикль, Росвита; Пол, Джурадж; Кляйн, Йоханнес; Мархольд, Кароль; Кох, Маркус А. (2012). "Эволюционная история комплекса Arabidopsis arenosa : разнообразные тетраплоиды маскируют Западный Карпатский центр видов и генетического разнообразия" . PLOS ONE . 7 (8): e42691. Bibcode : 2012PLoSO ... 742691S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0042691 . ISSN 1932-6203 . PMC 3411824 . PMID 22880083 .   
  8. ^ Якобссон, Маттиас; Хагенблад, Дженни; Таваре, Симон; Сэлль, Торбьорн; Холлден, Кристер; Линд-Халлден, Кристина; Нордборг, Магнус (2006). «Уникальное недавнее происхождение аллотетраплоидных видов Arabidopsis suecica : данные ядерных маркеров ДНК» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (6): 1217–31. DOI : 10.1093 / molbev / msk006 . PMID 16549398 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Аль-Шехбаз, И.А., О'Кейн, Стив Л. (2002). Таксономия и филогения Arabidopsis (Brassicaceae). Книга Arabidopsis : 1-22. онлайн-версия .
  • Чеккато, Лука; Мазиеро, Симона; Синха Рой, Дола; Бенчивенга, Стефано; Ройг-Вилланова, Ирма; Дитенгу, Франк Анисет; Пальме, Клаус; Саймон, Рюдигер; Коломбо, Люсия (17.06.2013). Поганка, Маркус (ред.). « Материнский контроль PIN1 необходим для развития женского гаметофита у Arabidopsis ». PLoS ONE . 8 (6): e66148. DOI : 10.1371 / journal.pone.0066148. ISSN  1932-6203. PMC  3684594. PMID  23799075.
  • О'Кейн-младший, С.Л., я Аль-Шехбаз, ИА (1997). Краткий обзор Arabidopsis (Brassicaceae): Novon 7: 323–327.
  • О'Кейн младший, SL, я Аль-Шехбаз, ИА (2003). Филогенетическое положение и общие ограничения Arabidopsis (Brassicaceae) на основе последовательностей ядерной рибосомной ДНК: Annals of the Missouri Botanical Garden 90 (4): 603–612.