 | Эта статья может быть слишком технической, чтобы ее могло понять большинство читателей . ( Август 2017 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения ) |
Атипичные SLC представляют собой новые вероятные вторичные активные или способствующие белки-переносчики, которые имеют общие предки с известными переносчиками растворенных веществ . Однако им не было присвоено имя в соответствии с корневой системой SLC и они не были отнесены к какому-либо из существующих семейств SLC. [1] [2]
Атипичное суперсемейство главных фасилитаторов] транспортные семьи [ править ]
Большинство атипичных SLC - это семьи внутри суперсемейства основных фасилитаторов (MFS). [3] Эти атипичные SLC являются вероятными вторичными активными или способствующими белками-переносчиками, которые имеют общие предки с известными переносчиками растворенных веществ . [1] [2] [4] Однако они не имеют названий в соответствии с корневой системой SLC и не относятся ни к одному из существующих семейств SLC. [1] ATMF классифицируются на основе сходства их последовательностей и филогенетической близости. [3]
| AMTF | Члены семьи | Семья SLC |
|---|---|---|
| AMTF1 | MFSD9, MFSD10, MFSD14A, MFSD14B | SLC46 |
| AMTF2 | MFSD8 | |
| AMTF3 | MFSD4A, MFSD4B | |
| AMTF4 | CLN3 | |
| AMTF5 | MFSD7 | SLC49 |
| AMTF6 | MFSD1, MFSD5 | |
| AMTF7 | MFSD12 | |
| AMTF8 | MFSD2A, MFSD2B | |
| AMTF9 | SV2A, SV2B, SV2C, SVOP, SVOPL | SLC22 |
| AMTF10 | MFSD11, UNC93A, UNC93B1 | |
| AMTF11 | СПНС1, СПНС2, СПНС3 | |
| AMTF12 | MFSD13A | |
| AMTF13 | MFSD6 | |
| AMTF14 | MFSD6L | |
| AMTF15 | MFSD3 |
Некоторые Атипичные СЖК типа МФС являются: oca2 , CLN3 , SPNS1, SPNS2 , SPNS3, SV2A , SV2B , SV2C, СВОП, SVOPL, MFSD1 , MFSD2A , MFSD2B, MFSD3 , MFSD4A, [5] MFSD4B, MFSD5 , MFSD6, MFSD6L, MFSD8 , MFSD9 , [5] MFSD10, MFSD11 , MFSD12, MFSD13A, MFSD14A , MFSD14B , UNC93A [6] и UNC93B1 . Все это нетипичные SLC, обнаруженные в суперсемействе Major-фасилитаторов.. Также TMEM104 (клан APC), OCA2 (клан IT) и CLN3 (не имеющий клана) являются атипичными SLC у людей.
Транспортные семейства без MFS [ править ]
Хотя большинство атипичных SLC происходят от главного суперсемейства фасилитаторов, есть исключения: TMEM104 ( суперсемейство APC ), OCA2 (надсемейство IT) и CLN3 (неизвестное суперсемейство). [1]
Ссылки [ править ]
- ^ a b c d Перланд, Эмели; Фредрикссон, Роберт (март 2017 г.). «Системы классификации вторичных активных транспортеров». Направления фармакологических наук . 38 (3): 305–315. DOI : 10.1016 / j.tips.2016.11.008 . ISSN 1873-3735 . PMID 27939446 .
- ^ a b Сридхаран, Смита; Стефанссон, Ольга; Schiöth, Helgi B .; Фредрикссон, Роберт (01.06.2011). «Длительная эволюционная консервация и значительная тканевая специфичность нескольких атипичных переносчиков растворенных веществ». Джин . 478 (1-2): 11-18. DOI : 10.1016 / j.gene.2010.10.011 . ISSN 1879-0038 . PMID 21044875 .
- ^ а б Перланд, Эмели; Багчи, Сончита; Клаессон, Аксель; Фредрикссон, Роберт (01.09.2017). «Характеристики 29 новых атипичных носителей растворенных веществ из суперсемейства основных фасилитаторов: эволюционная консервация, предсказанная структура и совместная экспрессия нейронов» . Открытая биология . 7 (9): 170142. DOI : 10.1098 / rsob.170142 . ISSN 2046-2441 . PMC 5627054 . PMID 28878041 .
- ^ Höglund, Pär J .; Нордстрём, Карл СП; Schiöth, Helgi B .; Фредрикссон, Роберт (апрель 2011 г.). «Семейства носителей растворенных веществ имеют удивительно долгую историю эволюции, при этом большинство человеческих семейств присутствовало до расхождения видов Bilaterian» . Молекулярная биология и эволюция . 28 (4): 1531–1541. DOI : 10.1093 / molbev / msq350 . ISSN 1537-1719 . PMC 3058773 . PMID 21186191 .
- ^ а б Перланд, Эмели; Хеллстен, Софи Виктория; Швейцер, Надин; Арапи, Василики; Резайи, Фатема; Бушра, Мона; Фредрикссон, Роберт (2017). «Структурное предсказание двух новых человеческих атипичных транспортеров SLC, MFSD4A и MFSD9, и их нейроанатомическое распределение у мышей» . PLOS ONE . 12 (10): e0186325. Bibcode : 2017PLoSO..1286325P . DOI : 10.1371 / journal.pone.0186325 . ISSN 1932-6203 . PMC 5648162 . PMID 29049335 .
- ^ Седер, Микаэла М .; Лекхольм, Эмилия; Hellsten, Софи В .; Перланд, Эмели; Фредрикссон, Роберт (2017). «Связанный с нейронами и периферической мембраной UNC93A отвечает на доступность питательных веществ у мышей» . Границы молекулярной неврологии . 10 : 351. DOI : 10,3389 / fnmol.2017.00351 . ISSN 1662-5099 . PMC 5671512 . PMID 29163028 .
