Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ACTB
Белок ACTB PDB 1atn.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3БЫХ , 3Д2У , 3ДЖ82 , 3ЛУЭ

Идентификаторы
ПсевдонимыACTB , BRWS1, PS1TP5BP1, бета-актина, актин, бета, бета актина
Внешние идентификаторыOMIM : 102630 MGI : 87904 HomoloGene : 110648 GeneCards : ACTB
Расположение гена ( человек )
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек) [1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение ACTB
Геномное расположение ACTB
Группа7p22.1Начинать5 527 148 п.н. [1]
Конец5 563 784 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное расположение ACTB
Геномное расположение ACTB
Группа5 G2 | 5 81,8 смНачинать142 903 115 п.н. [2]
Конец142 906 754 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ACTB 213867 x at fs.png

PBB GE ACTB 200801 x в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ГО: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторной области последовательности-специфической ДНК связывания
• нуклеотид связывания
• азотно-оксида азота связывания
• связывание Tat белок
• структурную составляющую цитоскелета
• GO: связывание 0001948 белок
• Kinesin связывания
• связывания идентичных белковых
• нуклеосомной ДНК связывание
• связывание АТФ
Сотовый компонент• цитоплазма
• микрочастицы крови
• мембраны
• фокальной адгезии
• NuA4 гистонацетилтрансфераза комплекс
• клеточная мембрана
• нуклеоплазма
• дерного хроматина
• цитоплазматический рибонуклеопротеиновый гранулу
• внеклеточного экзосом
• цитоскелета
• плотное тело
• кортикального цитоскелета
• цитозоль
• миелиновой оболочки
• внеклеточным
Биологический процесс• позитивная регуляция экспрессии генов, эпигенетика
• движение клетки или субклеточного компонента
• развитие черной субстанции
• сигнальный путь рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе
• путь передачи сигналов рецептора эфрина
• АТФ-зависимое ремоделирование хроматина
• гомеостаз сетчатки
• передача сигналов рецептора фактора роста эндотелия сосудов путь
• агрегация тромбоцитов
• сборка межклеточных соединений
• организация цитоскелета
• деубиквитинирование белка
• организация мембраны
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

60

11461

Ансамбль

ENSG00000075624

ENSMUSG00000029580

UniProt

P60709

P60710

RefSeq (мРНК)

NM_001101

NM_007393

RefSeq (белок)

NP_001092

NP_031419

Расположение (UCSC)Chr 7: 5.53 - 5.56 МбChr 5: 142,9 - 142,91 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Бета-актин (человеческий ген и сокращение белка ACTB / ACTB ) является одной из шести различных изоформ актина, которые были идентифицированы у людей. Это один из двух немышечных актинов цитоскелета . Актины - это высококонсервативные белки [5] [6] , которые участвуют в подвижности, структуре и целостности клеток. Альфа-актины - основная составляющая сократительного аппарата. [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что бета-актин взаимодействует с SPTBN2 . [8] [9] Кроме того, было обнаружено , что РНК-связывающий белок Sam68 взаимодействует с мРНК, кодирующей β-актин, который регулирует синаптическое образование дендритных шипов с его цитоскелетными компонентами.

Было показано , что бета-актин активирует eNOS , тем самым увеличивая продукцию NO. Было показано, что восемь аминокислотных остатков (326-333) в актине опосредуют взаимодействие между актином и eNOS [10]

Клиническая значимость [ править ]

Повторяющиеся мутации в этом гене были связаны со случаями диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы . [11]

Приложения [ править ]

Бета-актин часто используется при вестерн-блоттинге в качестве контроля загрузки , чтобы нормализовать общее количество белка и проверить возможное разложение белка в образцах. Его транскрипт также обычно используется в качестве стандарта домашнего гена в КПЦР . Его молекулярная масса составляет примерно 42 кДа.

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000075624 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029580 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Gunning PW, Ghoshdastider U Уитакер S, D Попп, Robinson RC (июнь 2015). «Эволюция композиционно и функционально различных актиновых филаментов» . Журнал клеточной науки . 128 (11): 2009–2019. DOI : 10,1242 / jcs.165563 . PMID 25788699 . 
  6. ^ Hanukoglu I, Tanese N, Fuchs E (февраль 1983). «Комплементарная последовательность ДНК цитоплазматического актина человека. Межвидовая дивергенция 3'-некодирующих областей». Журнал молекулярной биологии . 163 (4): 673–8. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (83) 90117-1 . PMID 6842590 . 
  7. ^ "Энтрез Ген: ACTB актин, бета" .
  8. ^ Мао В, Ву Вт, Li Y, Hoppe D, Stannek Р, Глинка А, Niehrs С (май 2001 г.). «Белок 6, связанный с рецептором ЛПНП, является рецептором для белков Диккопфа». Природа . 411 (6835): 321–5. Bibcode : 2001Natur.411..321M . DOI : 10.1038 / 35077108 . PMID 11357136 . S2CID 4323027 .  
  9. ^ Холлеран Е.А., Ligon Л.А., Tokito M, Stankewich MC, Morrow JS, Holzbaur EL (сентябрь 2001). «Спектрин бета III связывается с субъединицей динактина Arp1» . Журнал биологической химии . 276 (39): 36598–605. DOI : 10.1074 / jbc.M104838200 . PMID 11461920 . 
  10. ^ Кондриков D, Фонсека FV, вязами S, Фултон D, черный SM, блок ER, Су Y (февраль 2010). «Связь бета-актина с эндотелиальной синтазой оксида азота модулирует образование оксида азота и супероксида из фермента» . Журнал биологической химии . 285 (7): 4319–27. DOI : 10.1074 / jbc.M109.063172 . PMC 2836036 . PMID 19946124 .  
  11. ^ Лор Ю.Г., Стоянов Р, Лоуренс М.С., Auclair D, Chapuy В, Sougnez С, Круз-Гордилло Р, Knoechel В, Асманн YW, Slager SL, Новак AJ, Доган А, Ansell С.М., Ссылка ВК, Цзоу л, Гулд J , Саксена Дж., Странски Н., Ранжел-Эскареньо С., Фернандес-Лопес Дж. К., Идальго-Миранда А., Мелендес-Зайгла Дж., Эрнандес-Лемус Е., Шварц-Крус и Селис А., Имаз-Россхандлер И., Охесина А. И., Юнг Дж., Pedamallu CS, Lander ES, Habermann TM, Cerhan JR, Shipp MA, Getz G, Golub TR (март 2012 г.). «Открытие и определение приоритетности соматических мутаций в диффузной большой B-клеточной лимфоме (DLBCL) путем секвенирования всего экзома» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (10): 3879–84. Bibcode : 2012PNAS..109.3879L .DOI : 10.1073 / pnas.1121343109 . PMC  3309757 . PMID  22343534 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Человек ACTB место генома и ACTB ген подробно страницу в браузере УСК генома .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P60709 (Актин, цитоплазматический 1) в PDBe-KB .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Vandekerckhove J, Leavitt J, Kakunaga T, Weber K (1980). «Совместная экспрессия мутантного бета-актина и двух нормальных бета- и гамма-цитоплазматических актинов в стабильно трансформированной линии клеток человека». Cell . 22 (3): 893–9. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (80) 90566-8 . PMID  6893954 . S2CID  54299848 .
  • Ливитт Дж., Ганнинг П., Поррека П., Нг С.Ю., Лин С.С., Кедес Л. (1984). «Молекулярное клонирование и характеристика мутантных и дикого типа генов бета-актина человека» . Молекулярная и клеточная биология . 4 (10): 1961–9. DOI : 10.1128 / mcb.4.10.1961 . PMC  369012 . PMID  6095033 .
  • Нг С.Ю., Ганнинг П., Эдди Р., Понте П., Ливитт Дж., Шоу Т., Кедес Л. (1985). «Эволюция функционального человеческого гена бета-актина и его мульти-псевдогенного семейства: сохранение некодирующих областей и хромосомная дисперсия псевдогенов» . Молекулярная и клеточная биология . 5 (10): 2720–32. DOI : 10.1128 / mcb.5.10.2720 . PMC  367010 . PMID  3837182 .
  • Snásel J, Pichová I (1997). «Расщепление белков клетки-хозяина протеазой ВИЧ-1». Folia Biologica . 42 (5): 227–30. DOI : 10.1007 / BF02818986 . PMID  8997639 . S2CID  7617882 .
  • Ганнинг П., Вайнбергер Р., Джеффри П. (апрель 1997 г.). «Изоформы актина и тропомиозина в морфогенезе». Анатомия и эмбриология . 195 (4): 311–5. DOI : 10.1007 / s004290050050 . PMID  9108196 . S2CID  9692297 .
  • Кимура Т., Хашимото И., Нисикава М., Фудзисава Д.И. (1997). «Роль Rev в ассоциации мРНК ВИЧ-1 gag с цитоскелетным бета-актином и экспрессией вирусного белка». Биохимия . 78 (11–12): 1075–80. DOI : 10.1016 / S0300-9084 (97) 86732-6 . PMID  9150887 .
  • Сентирмай М.Н., Савадого М. (май 2000 г.). «Пространственная организация транскрипции РНК-полимеразы II в ядре» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (10): 2019–25. DOI : 10.1093 / nar / 28.10.2019 . PMC  105382 . PMID  10773068 .
  • Андерсон Дж. Л., Надежда Т. Дж. (Апрель 2004 г.). «Вспомогательные белки ВИЧ и выживание в клетке-хозяине». Текущие отчеты о ВИЧ / СПИДе . 1 (1): 47–53. DOI : 10.1007 / s11904-004-0007-х . PMID  16091223 . S2CID  34731265 .
  • Pederson T, Aebi U (ноябрь 2005 г.). «Ядерный актин расширяется без видимого сокращения» . Молекулярная биология клетки . 16 (11): 5055–60. DOI : 10,1091 / mbc.E05-07-0656 . PMC  1266405 . PMID  16148048 .
  • Перрин Б.Дж., Эрвасти Дж.М. (октябрь 2010 г.). «Семейство генов актина: функция следует изоформе» . Цитоскелет . 67 (10): 630–4. DOI : 10.1002 / cm.20475 . PMC  2949686 . PMID  20737541 .

См. Также [ править ]

  • Актин
  • ACTA1


  • v
  • т
  • е