КАБИНА1

Доступные конструкции

Поиск человеческого UniProt: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1N6J

Идентификаторы

Псевдонимы

CABIN1 , CAIN , PPP3IN, KB-318B8.7, кальциневрин-связывающий белок 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 604251 MGI : 1298375 HomoloGene : 49307 GeneCards : CABIN1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 22 (человека) ^[1]

Группа	22q11.23	Начинать	24 011 192 п.н. ^[1]
Группа	22q11.23	Конец	24 178 628 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 10 (мышь) ^[2]

Группа	10 C1 \| 10 38,56 см	Начинать	75 646 112 п.н. ^[2]
Группа	10 C1 \| 10 38,56 см	Конец	75 764 341 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• активность ингибитора протеинфосфатазы • связывание нуклеосом
Сотовый компонент	• агресома • ядро • нуклеоплазма • цитозоль
Биологический процесс	• Сборка нуклеосом, не зависящая от репликации ДНК • Путь передачи сигналов рецептора клеточной поверхности • отрицательная регуляция активности фосфопротеинфосфатазы • организация хроматина
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


23523


104248

Ансамбль


ENSG00000099991 ENSG00000281670


ENSMUSG00000020196

UniProt


Q9Y6J0


н / д

RefSeq (мРНК)


NM_001199281 NM_001201429 NM_012295


NM_172549

RefSeq (белок)


NP_001186210 NP_001188358 NP_036427


н / д

Расположение (UCSC)

Chr 22: 24.01 - 24.18 Мб

Chr 10: 75.65 - 75.76 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Calcineurin-связывающий белок кабина-1 представляет собой белка , который у человека кодируется CABIN1 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция [ править ]

Кальциневрин играет важную роль в пути передачи сигнала, опосредованном Т-клеточными рецепторами. Белок, кодируемый этим геном, специфически связывается с активированной формой кальциневрина и ингибирует опосредованную кальциневрином передачу сигнала. Кодируемый белок находится в ядре и содержит домен лейциновой молнии, а также несколько мотивов PEST, последовательностей, которые обеспечивают целенаправленную деградацию тех белков, которые их содержат. Для этого гена было обнаружено по крайней мере четыре транскрипта с альтернативным сплайсингом, но полноразмерная природа большинства из них не установлена. ^[7]

Взаимодействия [ править ]

CABIN1 взаимодействует с:

Амфифизин , ^[8]
MEF2B , ^[9]^[10]
MEF2D , ^[10]^[11] и
SIN3A . ^[11]

Ссылки [ править ]

^ a b c ENSG00000281670 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000099991, ENSG00000281670 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020196 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Sun L, Youn HD, Loh C, Stolow M, He W, Liu JO (июнь 1998 г.). «Кабина 1, негативный регулятор передачи сигналов кальциневрина в Т-лимфоцитах». Иммунитет . 8 (6): 703–11. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80575-0 . PMID 9655484 .
^ Нагасе Т, Ишикав К, Д Накаджима, Охир М, Секите Н, Миядзима Н, Танака А, Котань Н, Nomura N, O Охара (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследования ДНК . 4 (2): 141–50. DOI : 10.1093 / dnares / 4.2.141 . PMID 9205841 .
^ a b «Ген Entrez: белок 1, связывающий кальциневрин CABIN1» .
Перейти ↑ Lai MM, Luo HR, Burnett PE, Hong JJ, Snyder SH (ноябрь 2000). «Кальциневрин-связывающий белок каин является негативным регулятором эндоцитоза синаптических везикул» . Журнал биологической химии . 275 (44): 34017–20. DOI : 10.1074 / jbc.C000429200 . PMID 10931822 .
Перейти ↑ Han A, Pan F, Stroud JC, Youn HD, Liu JO, Chen L (апрель 2003 г.). «Последовательно-специфическое рекрутирование транскрипционного корепрессора Cabin1 с помощью фактора-2 энхансера миоцитов». Природа . 422 (6933): 730–4. DOI : 10,1038 / природа01555 . PMID 12700764 .
^ a b Youn HD, Sun L, Prywes R, Liu JO (октябрь 1999 г.). «Апоптоз Т-клеток, опосредованный Са2 + -индуцированным высвобождением фактора транскрипции MEF2». Наука . 286 (5440): 790–3. DOI : 10.1126 / science.286.5440.790 . PMID 10531067 .
^ a b Youn HD, Лю Джо (июль 2000 г.). «Cabin1 подавляет MEF2-зависимую экспрессию Nur77 и апоптоз Т-клеток, контролируя ассоциацию гистондеацетилаз и ацетилаз с MEF2». Иммунитет . 13 (1): 85–94. DOI : 10.1016 / s1074-7613 (00) 00010-8 . PMID 10933397 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Лю Джо (ноябрь 2003 г.). «Эндогенные белковые ингибиторы кальциневрина». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 311 (4): 1103–9. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2003.10.020 . PMID 14623296 .
Laherty CD, Ян В.М., Сун Дж. М., Дэви-младший, Сето Э., Эйзенман Р. Н. (май 1997 г.). «Гистоновые деацетилазы, связанные с корепрессором mSin3, опосредуют безумную репрессию транскрипции». Cell . 89 (3): 349–56. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80215-9 . PMID 9150134 .
Youn HD, Sun L, Prywes R, Liu JO (октябрь 1999 г.). «Апоптоз Т-клеток, опосредованный Са2 + -индуцированным высвобождением фактора транскрипции MEF2». Наука . 286 (5440): 790–3. DOI : 10.1126 / science.286.5440.790 . PMID 10531067 .
Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Биэр Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. DOI : 10.1038 / 990031 . PMID 10591208 .
Youn HD, Grozinger CM, Liu JO (июль 2000 г.). «Кальций регулирует репрессию транскрипции фактора усиления миоцитов 2 гистондеацетилазой 4» . Журнал биологической химии . 275 (29): 22563–7. DOI : 10.1074 / jbc.C000304200 . PMID 10825153 .
Лай М.М., Луо Х.Р., Бернетт ЧП, Хонг Дж.Дж., Снайдер С.Х. (ноябрь 2000 г.). «Кальциневрин-связывающий белок каин является негативным регулятором эндоцитоза синаптических везикул» . Журнал биологической химии . 275 (44): 34017–20. DOI : 10.1074 / jbc.C000429200 . PMID 10931822 .
Youn HD, Лю Джо (июль 2000 г.). «Cabin1 подавляет MEF2-зависимую экспрессию Nur77 и апоптоз Т-клеток, контролируя ассоциацию гистондеацетилаз и ацетилаз с MEF2». Иммунитет . 13 (1): 85–94. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 00010-8 . PMID 10933397 .
Исау К., Бос М., Юн Х.Д., Таттерсон Л., Лю Джо, Чен Дж. (Ноябрь 2001 г.). «Делеция домена связывания кальциневрина и фактора усиления миоцитов 2 (MEF2) в Cabin1 приводит к усиленной экспрессии генов цитокинов в Т-клетках» . Журнал экспериментальной медицины . 194 (10): 1449–59. DOI : 10,1084 / jem.194.10.1449 . PMC 2193671 . PMID 11714752 .
Хан А., Пан Ф, Страуд Джей Си, Юн HD, Лю Джо, Чен Л. (апрель 2003 г.). «Последовательно-специфическое рекрутирование транскрипционного корепрессора Cabin1 с помощью фактора-2 энхансера миоцитов». Природа . 422 (6933): 730–4. DOI : 10,1038 / природа01555 . PMID 12700764 .
Tagami H, Ray-Gallet D, Almouzni G, Nakatani Y (январь 2004 г.). «Комплексы гистонов H3.1 и H3.3 опосредуют пути сборки нуклеосом, зависимые или независимые от синтеза ДНК». Cell . 116 (1): 51–61. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (03) 01064-X . PMID 14718166 .
Родригес А., Мартинес-Мартинес С., Лопес-Мадеруэло, доктор медицины, Ортега-Перес I, Редондо Дж. М. (март 2005 г.). «Линкерная область, соединяющая каталитический и регуляторный домены CnA, важна для связывания с NFAT» . Журнал биологической химии . 280 (11): 9980–4. DOI : 10.1074 / jbc.C400401200 . PMID 15671033 .
Ли XN, Ли YL, Лю Г.Б., Дин YQ (январь 2005 г.). «Отбор генов, ассоциированных с хориокарциномой, с использованием биоинформатики». Ди 1 июня И Да Сюэ Сюэ Бао = Академический журнал Первого медицинского колледжа НОАК . 25 (1): 1–6. PMID 15683985 .
Пан Ф, Средство AR, Лю Джо (июнь 2005 г.). «Кальмодулин-зависимая протеинкиназа IV регулирует ядерный экспорт Cabin1 во время активации Т-клеток» . Журнал EMBO . 24 (12): 2104–13. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600685 . PMC 1150881 . PMID 15902271 .
Jang H, Cho EJ, Youn HD (июль 2007 г.). «Новый домен ингибирования кальциневрина в Cabin1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 359 (1): 129–35. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2007.05.066 . PMID 17531200 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CABIN1 и страница сведений о гене CABIN1 в браузере генома UCSC .
Расположение генома человека KB-318B8.7 и страница сведений о гене KB-318B8.7 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на 22-й хромосоме человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000281670 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000099991, ENSG00000281670 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020196 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9655484-5] Sun L, Youn HD, Loh C, Stolow M, He W, Liu JO (июнь 1998 г.). «Кабина 1, негативный регулятор передачи сигналов кальциневрина в Т-лимфоцитах». Иммунитет . 8 (6): 703–11. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80575-0 . PMID 9655484 .

[pmid9205841-6] Нагасе Т, Ишикав К, Д Накаджима, Охир М, Секите Н, Миядзима Н, Танака А, Котань Н, Nomura N, O Охара (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследования ДНК . 4 (2): 141–50. DOI : 10.1093 / dnares / 4.2.141 . PMID 9205841 .

[entrez-7] «Ген Entrez: белок 1, связывающий кальциневрин CABIN1» .

[pmid10931822-8] Перейти ↑ Lai MM, Luo HR, Burnett PE, Hong JJ, Snyder SH (ноябрь 2000). «Кальциневрин-связывающий белок каин является негативным регулятором эндоцитоза синаптических везикул» . Журнал биологической химии . 275 (44): 34017–20. DOI : 10.1074 / jbc.C000429200 . PMID 10931822 .

[pmid12700764-9] Перейти ↑ Han A, Pan F, Stroud JC, Youn HD, Liu JO, Chen L (апрель 2003 г.). «Последовательно-специфическое рекрутирование транскрипционного корепрессора Cabin1 с помощью фактора-2 энхансера миоцитов». Природа . 422 (6933): 730–4. DOI : 10,1038 / природа01555 . PMID 12700764 .

[pmid10531067-10] Youn HD, Sun L, Prywes R, Liu JO (октябрь 1999 г.). «Апоптоз Т-клеток, опосредованный Са2 + -индуцированным высвобождением фактора транскрипции MEF2». Наука . 286 (5440): 790–3. DOI : 10.1126 / science.286.5440.790 . PMID 10531067 .

[pmid10933397-11] Youn HD, Лю Джо (июль 2000 г.). «Cabin1 подавляет MEF2-зависимую экспрессию Nur77 и апоптоз Т-клеток, контролируя ассоциацию гистондеацетилаз и ацетилаз с MEF2». Иммунитет . 13 (1): 85–94. DOI : 10.1016 / s1074-7613 (00) 00010-8 . PMID 10933397 .

[1]